Нуклеопорин 153 - Nucleoporin 153

NUP153
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EBQ, 2EBR, 2EBV, 2GQE, 4U0C, 4U0D
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP153, HN153, нуклеопорин 153 кДа, нуклеопорин 153
Внешние идентификаторы	OMIM: 603948 MGI: 2385621 ГомолоГен: 68442 Генные карты: NUP153
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.3 Начинать 17,615,035 бп[1] Конец 17,706,834 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A5 Начинать 46,679,905 бп[2] Конец 46,727,940 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • якорь белковой мембраны • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание с последовательностью ядерной локализации • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры Сотовый компонент • не мембрана • ядерная периферия • мембрана • ядерная пора • нуклеоплазма • ядрышко • ядерное тело включения • ядерная пора ядерная корзина • ядро клетки • центральный транспортный канал ядерной поры • цитозоль • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • сборка ядерно-порового комплекса • проникновение вируса в ядро ​​хозяина • транспорт белка • вирусное проникновение • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция экспорта РНК из ядра • экспорт мРНК из ядра • импорт белка в ядро • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9972	218210
Ансамбль	ENSG00000124789	ENSMUSG00000021374
UniProt	P49790	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001278209 NM_001278210 NM_005124	NM_175749
RefSeq (белок)	NP_001265138 NP_001265139 NP_005115	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 6: 17,62 - 17,71 Мб	Chr 13: 46.68 - 46.73 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 153 (Nup153) представляет собой белок, который у человека кодируется NUP153 ген. Это важный компонент корзины ядерные поровые комплексы (NPC) у позвоночных и требуется для закрепления NPC. Он также действует как стыковочный узел для импортируемого кариоферина.^[5] На цитоплазматической стороне NPC Nup358 выполняет аналогичную роль.

Фон

Основная статья: Ядерная пора

Комплексы ядерных пор представляют собой чрезвычайно сложные структуры, которые обеспечивают регулируемое движение макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эти комплексы состоят по крайней мере из 100 различных полипептидных субъединиц, многие из которых принадлежат к семейству нуклеопоринов. Нуклеопорины представляют собой гликопротеины, специфичные для поровых комплексов, характеризующиеся цитоплазматически ориентированными О-связанными остатками N-ацетилглюкозамина и многочисленными повторами пентапептидной последовательности XFXFG.

Структура

Нуклеопорин 153 имеет массу 153 кДа (отсюда и его название). Он нитевидный и содержит три отдельных домена: N-концевую область, в которой был идентифицирован домен, нацеленный на поры, центральная область, содержащая несколько цинковый палец мотивов и С-концевой области, содержащей несколько повторов XFXFG.^[6]

Взаимодействия

NUP153 был показан взаимодействовать с SENP2^[7][8] и КПНБ1.^[9][10][11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124789 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021374 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (1997). «RanGTP-опосредованный ядерный экспорт кариоферина альфа включает его взаимодействие с нуклеопорином Nup153». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (18): 9699–704. Bibcode:1997PNAS ... 94.9699M. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9699. ЧВК  23253. PMID  9275187.
6. «Ген Entrez: NUP153 нуклеопорин 153 кДа».
7. Hang, Jun; Дассо Мэри (май 2002 г.). «Ассоциация человеческой протеазы SUMO-1 SENP2 с ядерной порой». J. Biol. Chem. 277 (22): 19961–6. Дои:10.1074 / jbc.M201799200. ISSN  0021-9258. PMID  11896061.
8. Чжан, Хун; Сайто Хисато; Матунис Майкл Дж (сентябрь 2002 г.). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в филаментах комплекса ядерных пор». Мол. Клетка. Биол. 22 (18): 6498–508. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002. ISSN  0270-7306. ЧВК  135644. PMID  12192048.
9. Накельный, S; Shaikh S; Берк Б; Дрейфус Дж. (Апрель 1999 г.). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом». EMBO J. 18 (7): 1982–95. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1982. ISSN  0261-4189. ЧВК  1171283. PMID  10202161.
10. Kehlenbach, RH; Джерас Л. (июнь 2000 г.). «Фосфорилирование ядерного транспортного механизма снижает импорт ядерного белка in vitro». J. Biol. Chem. 275 (23): 17848–56. Дои:10.1074 / jbc.M001455200. ISSN  0021-9258. PMID  10749866.
11. Бен-Эфраим, я; Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ISSN  0021-9525. ЧВК  2199621. PMID  11266456.

дальнейшее чтение

• Морояну Дж. (2000). «Пути импорта и экспорта ядерной энергии». J. Cell. Биохим. Дополнение 32–33: 76–83. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (1999) 75: 32+ <76 :: AID-JCB10> 3.0.CO; 2-Q. PMID  10629106.
• Адам С.А. (2002). «Ядерно-поровый комплекс». Геном Биол. 2 (9): ОБЗОРЫ0007. Дои:10.1186 / gb-2001-2-9-reviews0007. ЧВК  138961. PMID  11574060.
• МакМорроу I, Бастос Р., Хортон Х, Берк Б. (1994). «Анализ последовательности кДНК, кодирующей белок комплекса ядерных пор человека, hnup153». Биохим. Биофиз. Acta. 1217 (2): 219–23. Дои:10.1016 / 0167-4781 (94) 90040-Х. PMID  8110839.
• Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (9): 4451–6. Bibcode:1997PNAS ... 94.4451Y. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4451. ЧВК  20743. PMID  9114010.
• Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (1999). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev». Дж. Вирол. 73 (1): 120–7. Дои:10.1128 / JVI.73.1.120-127.1999. ЧВК  103815. PMID  9847314.
• Ульман К.С., Шах С., Пауэрс МА, Forbes DJ (1999). «Нуклеопорин nup153 играет решающую роль во многих типах ядерного экспорта». Мол. Биол. Клетка. 10 (3): 649–64. Дои:10.1091 / mbc.10.3.649. ЧВК  25193. PMID  10069809.
• Накельный С., Шейх С., Берк Б., Дрейфус Г. (1999). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом». EMBO J. 18 (7): 1982–95. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1982. ЧВК  1171283. PMID  10202161.
• Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж. П. и др. (2000). «C-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов». РНК. 6 (1): 136–58. Дои:10.1017 / S1355838200991994. ЧВК  1369901. PMID  10668806.
• Келенбах Р.Х., Джерас Л. (2000). «Фосфорилирование ядерного транспортного механизма снижает импорт ядерного белка in vitro». J. Biol. Chem. 275 (23): 17848–56. Дои:10.1074 / jbc.M001455200. PMID  10749866.
• Кутай У., Хартманн Э., Трейхель Н и др. (2001). «Идентификация двух новых RanGTP-связывающих белков, принадлежащих к суперсемейству импортина бета». J. Biol. Chem. 275 (51): 40163–8. Дои:10.1074 / jbc.M006242200. PMID  11024021.
• Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П. и др. (2000). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой». Мол. Клетка. Биол. 20 (23): 8996–9008. Дои:10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000. ЧВК  86553. PMID  11073998.
• Хофманн В., Райхарт Б., Эвальд А. и др. (2001). «Требования к кофактору для ядерного экспорта Rev response element (RRE) - и конститутивного транспортного элемента (CTE) -содержащих ретровирусных РНК. Неожиданная роль для актина». J. Cell Biol. 152 (5): 895–910. Дои:10.1083 / jcb.152.5.895. ЧВК  2198816. PMID  11238447.
• Бен-Эфраим I, Джерас Л. (2001). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ЧВК  2199621. PMID  11266456.
• Димаано К., Болл-младший, Прунуске А.Дж., Ульман К.С. (2002). «РНК-ассоциация определяет функционально консервативный домен в белке ядерной поры Nup153». J. Biol. Chem. 276 (48): 45349–57. Дои:10.1074 / jbc.M102592200. PMID  11567018.
• Вальтер Т.С., Форнерод М., Пикерсгилл Х. и др. (2001). «Нуклеопорин Nup153 необходим для образования корзины ядерных пор, заякоривания комплекса ядерных пор и импорта подмножества ядерных белков». EMBO J. 20 (20): 5703–14. Дои:10.1093 / emboj / 20.20.5703. ЧВК  125666. PMID  11598013.
• Браунуэлл AM, Макара И.Г. (2002). «Экспортин-5, новый кариоферин, опосредует ядерный экспорт двухцепочечных РНК-связывающих белков». J. Cell Biol. 156 (1): 53–64. Дои:10.1083 / jcb.200110082. ЧВК  2173575. PMID  11777942.
• Ханг Дж, Дассо М (2002). «Ассоциация человеческой протеазы SUMO-1 SENP2 с ядерной порой». J. Biol. Chem. 277 (22): 19961–6. Дои:10.1074 / jbc.M201799200. PMID  11896061.