Нуклеопорин 214 - Nucleoporin 214 - Wikipedia

NUP214
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2OIT, 3FHC, 3ФМО, 3FMP, 5DIS
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP214, CAIN, CAN, D9S46E, N214, p250, нуклеопорин 214 кДа, нуклеопорин 214, IIAE9
Внешние идентификаторы	OMIM: 114350 MGI: 1095411 ГомолоГен: 38008 Генные карты: NUP214
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q34.13 Начинать 131,125,586 бп[1] Конец 131,234,663 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 B | 2 21,97 см Начинать 31,974,436 бп[2] Конец 32,053,975 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность рецептора ядерного экспортного сигнала • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с последовательностью ядерной локализации • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры Сотовый компонент • цитозоль • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • очаговая адгезия • нуклеоплазма • ядро клетки • цитоплазматическая сторона ядерной поры • ядерная пора ядерная корзина • центральный транспортный канал ядерной поры • ядерная пора • ядерная оболочка • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • регуляция стабильности мРНК • регуляция клеточного цикла • экспорт белка из ядра • транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • импорт белка в ядро • Экспорт РНК из ядра • экспорт мРНК из ядра • регуляция ядерно-цитоплазматического транспорта • GO: 0007067 митотический клеточный цикл • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8021	227720
Ансамбль	ENSG00000126883	ENSMUSG00000001855
UniProt	P35658	Q80U93
RefSeq (мРНК)	NM_005085 NM_001318324 NM_001318325	NM_172268
RefSeq (белок)	NP_001305253 NP_001305254 NP_005076	NP_758472
Расположение (UCSC)	Chr 9: 131,13 - 131,23 Мб	Chr 2: 31.97 - 32.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 214 (Nup2014) это белок что у людей кодируется NUP214 ген.^[5][6][7]

Функция

В ядерная пора комплекс представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя шлюз, который регулирует поток макромолекулы между ядром и цитоплазма. Нуклеопорины являются основными компонентами ядерного порового комплекса в эукариотический клетки. Этот ген является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повтор. Белок, кодируемый этим геном, расположен на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор, где он необходим для правильного клеточный цикл прогрессия и ядерно-цитоплазматический транспорт. 3 'часть этого гена образует ген слияния с Ген DEK на хромосоме 6 в t (6,9) перемещение связана с острый миелоидный лейкоз и миелодиспластический синдром.^[7]

Структура

Структура N-концевой домен Nup214 обнаруживает бета-пропеллерную складку с семью лопастями, за которой следует 30-остаток C-терминал удлиненный пептидный сегмент (CTE). CTE складывается обратно на бета пропеллер и привязывается к его нижней грани.^[8] Структура NTD Nup214, связанного с геликазой Ddx19 в ее ADP-связанном состоянии, раскрывает молекулярную основу взаимодействия между двумя белками. Показано, что консервативный остаток Ddx19 имеет решающее значение для образования комплексов in vitro и in vivo. Поразительно, что поверхности взаимодействия демонстрируют сильно противоположные поверхностные потенциалы, при этом поверхность геликазы заряжена положительно, а поверхность Nup214 - отрицательно. Показано, что Ddx19 связывает РНК только в своем АТФ-связанном состоянии, а связывание РНК и NTD Nup214 является взаимоисключающим.^[9]

Взаимодействия

NUP214 был показан взаимодействовать с:

• DDX19,^[9]
• CRM1
• NXF1,^[10][11] и
• NXF2,^[10] и
• ZFP36.^[12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126883 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001855 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кремер Д., Возняк Р. В., Блобель Г., Раду А. (февраль 1994 г.). «Белок CAN человека, предполагаемый онкогенный продукт, связанный с миелоидным лейкемогенезом, представляет собой комплексный белок ядерных пор, обращенный к цитоплазме». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (4): 1519–23. Дои:10.1073 / пнас.91.4.1519. ЧВК  43191. PMID  8108440.
6. фон Линдерн М., Поустка А., Лерах Х., Гросвельд Г. (август 1990 г.). «Транслокация (6; 9) хромосомы, связанная с конкретным подтипом острого нелимфоцитарного лейкоза, приводит к аберрантной транскрипции целевого гена на 9q34». Молекулярная и клеточная биология. 10 (8): 4016–26. Дои:10.1128 / mcb.10.8.4016. ЧВК  360912. PMID  2370860.
7. «Ген Entrez: NUP214 нуклеопорин 214 кДа».
8. Napetschnig J, Blobel G, Hoelz A (2007). «Кристаллическая структура N-концевого домена протоонкогена человека Nup214 / CAN». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (6): 1783–8. Дои:10.1073 / pnas.0610828104. ЧВК  1794303. PMID  17264208.
9. Napetschnig J, Kassube SA, Debler EW, Wong RW, Blobel G, Hoelz A (2009). «Структурный и функциональный анализ взаимодействия нуклеопорина Nup214 с DEAD-бокс-геликазой Ddx19». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 106 (9): 3089–94. Дои:10.1073 / pnas.0813267106. ЧВК  2651337. PMID  19208808.
10. Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П., Браун И. К., Кутай Ю., Кармо-Фонсека М., Борк П., Изаурральде Е. (декабрь 2000 г.). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой». Молекулярная и клеточная биология. 20 (23): 8996–9008. Дои:10.1128 / mcb.20.23.8996-9008.2000. ЧВК  86553. PMID  11073998.
11. Шмитт I, Джерас Л. (ноябрь 2001 г.). «In vitro анализ ядерного транспорта, опосредованного C-концевым челночным доменом Tap». Журнал биологической химии. 276 (45): 42355–63. Дои:10.1074 / jbc.M103916200. PMID  11551912.
12. Карман Дж. А., Надлер С. Г. (март 2004 г.). «Прямая ассоциация тристетрапролина с нуклеопорином CAN / Nup214». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 315 (2): 445–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.01.080. PMID  14766228.

дальнейшее чтение

• Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (июнь 1999 г.). «Комплекс ядерных пор: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Текущее мнение в области клеточной биологии. 11 (3): 391–401. Дои:10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6. PMID  10395558.
• фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Йегле М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6; 9), связанная с конкретным подтипом острого миелоидного лейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и к экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can». Молекулярная и клеточная биология. 12 (4): 1687–97. Дои:10.1128 / mcb.12.4.1687. ЧВК  369612. PMID  1549122.
• Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси И., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), выведенные путем анализа случайно выбранных клонов кДНК из незрелых миелоидных клеток человека линии KG-1». ДНК исследования. 1 (1): 27–35. Дои:10.1093 / dnares / 1.1.27. PMID  7584026.
• Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси И., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), выведенные путем анализа случайно выбранных клонов кДНК из незрелых миелоидных клеток человека линии KG-1 (приложение)». ДНК исследования. 1 (1): 47–56. Дои:10.1093 / днарес / 1.1.47. PMID  7584028.
• Пилз А., Вудворд К., Пови С., Эбботт С. (январь 1995 г.). «Сравнительное картирование 50 локусов хромосомы 9 человека у лабораторных мышей». Геномика. 25 (1): 139–49. Дои:10.1016/0888-7543(95)80119-7. PMID  7774911.
• Штутц Ф., Изаурральде Э., Маттай И. В., Росбаш М. (декабрь 1996 г.). «Роль повторяющихся доменов нуклеопорина FG в экспорте белка Rev вируса иммунодефицита человека 1 типа и РНК из ядра». Молекулярная и клеточная биология. 16 (12): 7144–50. Дои:10.1128 / mcb.16.12.7144. ЧВК  231718. PMID  8943370.
• Форнерод М., ван Дерсен Дж., Ван Баал С., Рейнольдс А., Дэвис Д., Мурти К. Г., Франсен Дж., Гросвельд Г. (февраль 1997 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого CRM1 находится в динамическом подкомплексе с CAN / Nup214 и новым компонентом ядерной поры Nup88». Журнал EMBO. 16 (4): 807–16. Дои:10.1093 / emboj / 16.4.807. ЧВК  1169681. PMID  9049309.
• Ясин Н.Р., Блобель Г. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (9): 4451–6. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4451. ЧВК  20743. PMID  9114010.
• Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (10): 5055–60. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК  24630. PMID  9144189.
• Бастос Р., Рибас де Пуплана Л., Энарсон М., Бодур К., Берк Б. (июнь 1997 г.). «Nup84, новый нуклеопорин, который связан с CAN / Nup214 на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор». Журнал клеточной биологии. 137 (5): 989–1000. Дои:10.1083 / jcb.137.5.989. ЧВК  2136229. PMID  9166401.
• Бур Дж., Бонтен-Сюртель Дж., Гросвельд Дж. (Март 1998 г.). «Сверхэкспрессия нуклеопорина CAN / NUP214 вызывает остановку роста, дефекты ядерно-цитоплазматического транспорта и апоптоз». Молекулярная и клеточная биология. 18 (3): 1236–47. Дои:10.1128 / mcb.18.3.1236. ЧВК  108836. PMID  9488438.
• Богерд HP, Эчарри А., Росс TM, Каллен Б.Р. (ноябрь 1998 г.). «Ингибирование функции вируса иммунодефицита человека Rev и вируса Т-клеточного лейкоза человека Rex, но не активности конститутивного транспортного элемента вируса обезьян Мейсон-Пфайзер с помощью мутантного человеческого нуклеопорина, нацеленного на Crm1». Журнал вирусологии. 72 (11): 8627–35. Дои:10.1128 / JVI.72.11.8627-8635.1998. ЧВК  110274. PMID  9765402.
• Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (январь 1999 г.). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev». Журнал вирусологии. 73 (1): 120–7. Дои:10.1128 / JVI.73.1.120-127.1999. ЧВК  103815. PMID  9847314.
• Schmitt C, von Kobbe C, Bachi A, Panté N, Rodrigues JP, Boscheron C, Rigaut G, Wilm M, Séraphin B, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (август 1999). «Dbp5, белок DEAD-бокса, необходимый для экспорта мРНК, рекрутируется в цитоплазматические фибриллы комплекса ядерной поры посредством консервативного взаимодействия с CAN / Nup159p». Журнал EMBO. 18 (15): 4332–47. Дои:10.1093 / emboj / 18.15.4332. ЧВК  1171509. PMID  10428971.
• Бачи А., Браун И. К., Родригес Дж. П., Панте Н., Риббек К., фон Коббе С., Кутай Ю., Вильм М., Герлих Д., Кармо-Фонсека М., Изаурральде Е. (январь 2000 г.). «C-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов». РНК. 6 (1): 136–58. Дои:10.1017 / S1355838200991994. ЧВК  1369901. PMID  10668806.
• Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П., Браун И. К., Кутай Ю., Кармо-Фонсека М., Борк П., Изаурральде Е. (декабрь 2000 г.). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой». Молекулярная и клеточная биология. 20 (23): 8996–9008. Дои:10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000. ЧВК  86553. PMID  11073998.
• Hofmann W, Reichart B, Ewald A, Müller E, Schmitt I, Stauber RH, Lottspeich F, Jockusch BM, Scheer U, Hauber J, Dabauvalle MC (март 2001 г.). «Требования к кофактору для ядерного экспорта Rev response element (RRE) - и конститутивного транспортного элемента (CTE) -содержащих ретровирусных РНК. Неожиданная роль для актина». Журнал клеточной биологии. 152 (5): 895–910. Дои:10.1083 / jcb.152.5.895. ЧВК  2198816. PMID  11238447.