Нуклеопорин 160 - Nucleoporin 160

NUP160
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5A9Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP160, нуклеопорин 160, Nup160, 160 кДа, 2810011M03Rik, AA414952, AU020188, Gtl-13, Gtl1-13, Gtl13, mKIAA0197, NPHS19
Внешние идентификаторы	OMIM: 607614 MGI: 1926227 ГомолоГен: 32509 Генные карты: NUP160
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p11.2 Начинать 47,778,087 бп[1] Конец 47,848,555 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 E1 Начинать 90,677,215 бп[2] Конец 90,736,328 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры Сотовый компонент • цитозоль • ядерная оболочка • ядерная пора • внешнее кольцо ядерной поры • ядро клетки • кинетохора • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • экспорт мРНК из ядра • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • развитие нефрона • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23279	59015
Ансамбль	ENSG00000030066	ENSMUSG00000051329
UniProt	Q12769	Q9Z0W3
RefSeq (мРНК)	NM_015231 NM_001318399	NM_021512
RefSeq (белок)	NP_001305328 NP_056046	NP_067487
Расположение (UCSC)	Chr 11: 47,78 - 47,85 Мб	Chr 2: 90.68 - 90.74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 160 (Nup160) это белок что у людей кодируется NUP160 ген.^[5][6]

NUP160 - это 1 из 60 белков, составляющих 120-MD ядерная пора комплекс, который опосредует нуклеоплазматический транспорт. [поставляется OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000030066 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051329 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Васу С., Шах С., Орджало А., Парк М., Фишер WH, Forbes DJ (октябрь 2001 г.). «Новые нуклеопорины позвоночных Nup133 и Nup160 играют роль в экспорте мРНК». J Cell Biol. 155 (3): 339–54. Дои:10.1083 / jcb.200108007. ЧВК  2150853. PMID  11684705.
6. "Энтрез Ген: NUP160 нуклеопорин 160 кДа".

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Секи Н., Исикава К. и др. (1996). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. V. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0161-KIAA0200), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 3 (1): 17–24. Дои:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID  8724849.
• Бельгаре Н., Рабут Г., Бай С.В. и др. (2001). «Эволюционно консервативный субкомплекс NPC, который частично перераспределяется в кинетохоры в клетках млекопитающих». J. Cell Biol. 154 (6): 1147–60. Дои:10.1083 / jcb.200101081. ЧВК  2150808. PMID  11564755.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Loïodice I, Alves A, Rabut G, et al. (2005). «Весь комплекс Nup107-160, включая трех новых членов, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе». Мол. Биол. Клетка. 15 (7): 3333–44. Дои:10.1091 / mbc.E03-12-0878. ЧВК  452587. PMID  15146057.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Орджало А.В., Арнаутов А., Шен З. и др. (2006). «Нуклеопориновый комплекс Nup107-160 необходим для правильной сборки биполярного веретена». Мол. Биол. Клетка. 17 (9): 3806–18. Дои:10.1091 / mbc.E05-11-1061. ЧВК  1593160. PMID  16807356.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Главы Ю.С., Крутчинский А.Н., Кристя И.М. и др. (2007). «Зависимое от клеточного цикла фосфорилирование субкомплекса Nup107-160 ядерной поры». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (10): 3811–6. Дои:10.1073 / pnas.0700058104. ЧВК  1820666. PMID  17360435.
• Зукколо М., Алвес А., Гали В. и др. (2007). «Субкомплекс ядерных пор человека Nup107-160 способствует правильным функциям кинетохор». EMBO J. 26 (7): 1853–64. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601642. ЧВК  1847668. PMID  17363900.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для белка Nup160 ядерного комплекса пор человека