PLCE1 - PLCE1

PLCE1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2BYE, 2BYF, 2C5L
Идентификаторы
Псевдонимы	PLCE1, NPHS3, PLCE, PPLC, фосфолипаза C-эпсилон 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608414 MGI: 1921305 ГомолоГен: 9478 Генные карты: PLCE1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q23.33 Начните 94,030,812 бп[1] Конец 94,332,823 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C3 Начните 38,481,109 бп[2] Конец 38,785,030 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • активность преобразователя сигнала • GO: 0001948 связывание с белками • активность гидролазы сложного диэфира фосфорной кислоты • связывание ферментов • активность фосфолипазы C • гидролазная активность • активность фосфатидилинозитолфосфолипазы C • связывание ионов металлов • Связывание Ras GTPase Сотовый компонент • цитозоль • аппарат Гольджи • мембрана • Мембрана Гольджи • клеточная мембрана • цитоплазма Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста • регуляция сигнального пути белка рецептора, связанного с G-белком • регулирование сокращения гладких мышц • липидный обмен • положительное регулирование концентрации ионов кальция в цитозоле • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • регуляция передачи сигнала белка Ras • развитие клубочков • метаболический процесс инозитолфосфата • процесс биосинтеза диацилглицерина • липидный катаболический процесс • сигнальный путь рецептора, активирующего фосфолипазу C, связанного с G-белком • развитие сердца • активация активности MAPK • организация цитоскелета • регулирование роста клеток • регуляция активности протеинкиназы • клеточная пролиферация • инозитолфосфат-опосредованная передача сигналов • кальций-опосредованная передача сигналов • преобразование сигнала • Передача сигнала белка Ras • процесс биосинтеза инозита трифосфата • фосфатидилинозит-опосредованная передача сигналов • высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51196	74055
Ансамбль	ENSG00000138193	ENSMUSG00000024998
UniProt	Q9P212	Q8K4S1
RefSeq (мРНК)	NM_001165979 NM_001288989 NM_016341	NM_019588
RefSeq (белок)	NP_001159451 NP_001275918 NP_057425	NP_062534
Расположение (UCSC)	Chr 10: 94.03 - 94.33 Мб	Chr 19: 38.48 - 38.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

1-Фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат фосфодиэстераза эпсилон-1 (PLCE1) является фермент что у людей кодируется PLCE1 ген.^[5][6] Этот ген кодирует фермент фосфолипазу (PLCE1), который катализирует гидролиз из фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат для создания двух вторых мессенджеров: инозитол 1,4,5-трифосфат (IP3) и диацилглицерин (DAG). Мутации в этом гене вызывают раннее начало нефротический синдром и были связаны с дефицитом дыхательной цепи с диффузным мезангиальным склерозом.^[7][8]

Структура

PLCE1 расположен на q рука из хромосома 10 в позиции 23,33 и имеет 39 экзоны.^[7] PLCE1, белок, кодируемый этим геном, расположен на аппарат Гольджи, то клеточная мембрана, а в цитозоль. Он содержит 3 хода, 15 бета-нити, и 6 альфа-спирали. PLCE1 содержит 260 аминокислот Рас-ГЭФ домен на стр. 531-790, 149-аминокислотный X-бокс-домен PI-PLC на стр. 1392-1540, 117-аминокислотный Y-бокс-домен PI-PLC на стр. 1730 - 1846, 101 аминокислота C2 домен на стр. 1856 - 1956, Ras-ассоциированный 1 домен из 103 аминокислот на стр. 2012 - 2114, и Ras-ассоциированный 2-домен из 104 аминокислот на стр. 2135 - 2238. Имеется область из 79 аминокислот из стр. 1686 - 1764, который требуется для активации PLCE1 с помощью RHOA, RHOB, GNA12, GNA13 и G-бета гамма. PLCE1 также имеет Ca2 + кофактор.^[6][9][10] Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипции, кодирующих разные изоформы.^[7]

Функция

PLCE1 принадлежит фосфолипаза семейство, которое катализирует гидролиз полифосфоинозитидов, таких как фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат (PtdIns (4,5) P2) для генерации вторых мессенджеров Ins (1,4,5) P3 и диацилглицерин. Эти продукты инициируют каскад внутриклеточных ответов, которые приводят к росту и дифференцировке клеток и экспрессия гена. [предоставлено OMIM]^[7]

Каталитическая активность

1-фосфатидил-1D-мио-инозитол 4,5-бисфосфат + H2O = 1D-мио-инозитол 1,4,5-трифосфат + диацилглицерин.^[5][6]

Клиническое значение

Мутации в этом гене вызывают раннее начало нефротический синдром. Для этого заболевания характерно: протеинурия, отек, и диффузный мезангиальный склероз или очаговый и сегментарный гломерулосклероз.^[7] Признаки и симптомы включают: почка биопсия демонстрируя неспецифический гистологический изменения, такие как очаговый сегментарный гломерулосклероз и диффузная мезангиальная пролиферация, а также генетические тесты, выявляющие патогенную мутацию S1484L. Диффузная мезангиальная пролиферация характеризуется расширением мезангиального матрикса без мезангиальной гиперцеллюлярности, гипертрофия из подоциты, вакуолизированные подоциты, утолщение базальных мембран и снижение проходимости просвета капилляров.^[11][9][10] Это заболевание также было связано с митохондриальная цитопатия в результате недостаточности дыхательной цепи, в первую очередь затрагивающей комплекс IV.^[8]

Кроме того, фосфолипаза C-эпсилон модулирует бета-адренорецептор -зависимое сердечное сокращение, и было обнаружено, что этот белок сверхэкспрессируется во время сердечная недостаточность. Исследования показали, что PLCE1 может таким образом ингибировать сердечная гипертрофия.^[12][9][10]

Взаимодействия

PLCE1 имеет 12 двоичных белок-белковые взаимодействия включая 8 ко-комплексных взаимодействий. PLCE1 взаимодействует с RyR2, HRAS, NRAS, и LIMS1.^[13]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138193 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024998 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лопес И., Мак Э. К., Динг Дж., Хэмм Хэ, Ломасни Дж. В. (январь 2001 г.). «Новая бифункциональная фосфолипаза c, которая регулируется Galpha 12 и стимулирует путь Ras / митоген-активируемой протеинкиназы». Журнал биологической химии. 276 (4): 2758–65. Дои:10.1074 / jbc.M008119200. PMID  11022047.
6. Song C, Hu CD, Masago M, Kariyai K, Yamawaki-Kataoka Y, Shibatohge M, Wu D, Satoh T, Kataoka T. (январь 2001 г.). «Регулирование новой человеческой фосфолипазы C, PLCepsilon, посредством мембранного нацеливания с помощью Ras». Журнал биологической химии. 276 (4): 2752–7. Дои:10.1074 / jbc.M008324200. PMID  11022048.
7. «Ген Entrez: фосфолипаза C PLCE1, эпсилон 1». Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
8. Баскин Э., Селда Байракчи Ю., Алехан Ф., Оздемир Х., Онер А., Хорват Р., Вега-Уорнер В., Хильдебрандт Ф., Озалтин Ф. (июль 2011 г.). «Дефицит дыхательной цепи, проявляющийся в виде диффузного мезангиального склероза с мутацией NPHS3». Детская нефрология. 26 (7): 1157–61. Дои:10.1007 / s00467-011-1814-0. ЧВК  3329966. PMID  21365190.
9. «PLCE1 - 1-фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфатфосфодиэстераза эпсилон-1 - Homo sapiens (человек) - ген и белок PLCE1». www.uniprot.org. Получено 2018-08-30. Эта статья включает текст, доступный под CC BY 4.0 лицензия.
10. «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК  5210571. PMID  27899622.
11. Hinkes B, Wiggins RC, Gbadegesin R, Vlangos CN, Seelow D, Nürnberg G и др. (Декабрь 2006 г.). «Позиционное клонирование обнаруживает мутации в PLCE1, ответственные за вариант нефротического синдрома, который может быть обратимым». Природа Генетика. 38 (12): 1397–405. Дои:10,1038 / ng1918. PMID  17086182. S2CID  4037950.
12. Ван Х., Острейх Э.А., Маэкава Н., Буллард Т.А., Викстром К.Л., Дирксен Р.Т., Келли Г.Г., Блаксалл Б.К., Смрка А.В. (декабрь 2005 г.). «Фосфолипаза C epsilon модулирует зависящее от бета-адренорецепторов сердечное сокращение и подавляет сердечную гипертрофию». Циркуляционные исследования. 97 (12): 1305–13. Дои:10.1161 / 01.RES.0000196578.15385.bb. PMID  16293787.
13. IntAct. www.ebi.ac.uk https://www.ebi.ac.uk/intact/interactions?conversationContext=1. Получено 2018-08-30. Отсутствует или пусто | название = (Помогите)

дальнейшее чтение

• Джефферсон Дж. А., Шенкленд С. Дж. (Июль 2007 г.). «Семейный нефротический синдром: в бой вступает PLCE1». Нефрология, Диализ, Трансплантация. 22 (7): 1849–52. Дои:10.1093 / ndt / gfm098. PMID  17449496.
• Чефай Д., Дебре П., Качорек М., Идзиорек Т., Отран Б., Висмут Г. (декабрь 1990 г.). «Гликопротеины вируса иммунодефицита человека-1 gp120 и gp160 специфически ингибируют путь трансдукции фосфоинозитида рецептора CD3 / Т-клетки к антигену». Журнал клинических исследований. 86 (6): 2117–24. Дои:10.1172 / JCI114950. ЧВК  329852. PMID  1979339.
• Заули Г., Превиати М., Карамелли Е., Бассини А., Фальсьери Е., Гибеллини Д., Бертоласо Л., Боско Д., Робуффо И., Капитани С. (сентябрь 1995 г.). «Экзогенный белок Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 избирательно стимулирует фосфатидилинозитол-специфический ядерный путь фосфолипазы C в линии Т-клеток Jurkat». Европейский журнал иммунологии. 25 (9): 2695–700. Дои:10.1002 / eji.1830250944. PMID  7589147.
• Чен П., Мейн М., Пауэр С., Нат А. (сентябрь 1997 г.). «Белок Tat ВИЧ-1 индуцирует продукцию фактора некроза опухоли альфа. Последствия для неврологических заболеваний, связанных с ВИЧ-1». Журнал биологической химии. 272 (36): 22385–8. Дои:10.1074 / jbc.272.36.22385. PMID  9278385.
• Майн М., Братанич А.С., Чен П., Рана Ф., Нат А., Власть С. (1998). «Молекулярное разнообразие ВИЧ-1 и индукция TNF-альфа: последствия для неврологических заболеваний, вызванных ВИЧ». Нейроиммуномодуляция. 5 (3–4): 184–92. Дои:10.1159/000026336. PMID  9730685. S2CID  19529677.
• Хоги, Нью-Джерси, Холден С.П., Нат А., Гейгер Д.Д. (октябрь 1999 г.). «Участие регулируемых инозитол-1,4,5-трифосфатом запасов внутриклеточного кальция в дисрегуляции кальция и гибели нейронных клеток, вызванной белком tat ВИЧ-1». Журнал нейрохимии. 73 (4): 1363–74. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0731363.x. PMID  10501179. S2CID  25410140.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К., Хиросава М., Охара О. (апрель 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 7 (2): 143–50. Дои:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID  10819331.
• Mayne M, Holden CP, Nath A, Geiger JD (июнь 2000 г.). «Высвобождение кальция из хранилищ, регулируемых инозитол-1,4,5-трифосфатным рецептором, с помощью ВИЧ-1 Tat регулирует продукцию TNF-альфа в макрофагах человека». Журнал иммунологии. 164 (12): 6538–42. Дои:10.4049 / jimmunol.164.12.6538. PMID  10843712.
• Jin TG, Satoh T, Liao Y, Song C, Gao X, Kariya K, Hu CD, Kataoka T (август 2001 г.). «Роль домена гомологии CDC25 фосфолипазы Cepsilon в усилении Rap1-зависимой передачи сигналов». Журнал биологической химии. 276 (32): 30301–7. Дои:10.1074 / jbc.M103530200. PMID  11395506.
• Schmidt M, Evellin S, Weernink PA, von Dorp F, Rehmann H, Lomasney JW, Jakobs KH (ноябрь 2001 г.). «Новый путь передачи сигналов фосфолипаза-С-кальций, опосредованный циклическим АМФ и Rap GTPase». Природа клеточной биологии. 3 (11): 1020–4. Дои:10.1038 / ncb1101-1020. PMID  11715024. S2CID  6423723.
• Evellin S, Nolte J, Tysack K, vom Dorp F, Thiel M, Weernink PA, Jakobs KH, Webb EJ, Lomasney JW, Schmidt M (май 2002 г.). «Стимуляция фосфолипазы C-эпсилон мускариновым ацетилхолиновым рецептором M3, опосредованная циклическим АМФ и GTPase Rap2B». Журнал биологической химии. 277 (19): 16805–13. Дои:10.1074 / jbc.M112024200. PMID  11877431.
• Song C, Satoh T, Edamatsu H, Wu D, Tadano M, Gao X, Kataoka T (ноябрь 2002 г.). «Различная роль Ras и Rap1 в зависимой от фактора роста активации фосфолипазы C-эпсилон». Онкоген. 21 (53): 8105–13. Дои:10.1038 / sj.onc.1206003. PMID  12444546.
• Беннасер Ю., Баду А., Ткачук Дж., Бахрауи Э. (ноябрь 2002 г.). «Сигнальные пути, запускаемые Tat ВИЧ-1 в человеческих моноцитах для индукции TNF-альфа». Вирусология. 303 (1): 174–80. Дои:10.1006 / viro.2002.1676. PMID  12482669.
• Чизик Дж., Брогдон Дж. Л., Баду А., Хенегариу О., Престон Херлберт П., Флавелл Р., Нижний К. (май 2003 г.). «Активация CD4 Т-клеток Raf-независимыми эффекторами Ras». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (10): 6003–8. Bibcode:2003ПНАС..100.6003С. Дои:10.1073 / pnas.1031494100. ЧВК  156316. PMID  12721365.
• Леннартссон Дж., Вернштедт К., Энгстрём У., Хеллман У., Рённстранд Л. (август 2003 г.). «Идентификация Tyr900 в киназном домене c-Kit в качестве Src-зависимого сайта фосфорилирования, опосредующего взаимодействие с c-Crk». Экспериментальные исследования клеток. 288 (1): 110–8. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00206-4. PMID  12878163.
• vom Dorp F, Sari AY, Sanders H, Keiper M, Oude Weernink PA, Jakobs KH, Schmidt M (август 2004 г.). «Ингибирование фосфолипазы C-epsilon Gi-связанными рецепторами». Сотовая связь. 16 (8): 921–8. Дои:10.1016 / j.cellsig.2004.01.009. PMID  15157671.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.