Propionibacterineae - Propionibacterineae

Propionibacterineae
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Актинобактерии
Учебный класс:	Актинобактерии
Заказ:	Актиномицеты
Подотряд:	Propionibacterineae Рейни и др. 1997 исправление. Zhi et al. 2009 г.
Семья
Nocardioidaceae Пропионибактерии
Синонимы
Пропионибактерии Патрик и Макдауэлл 2015 «Пропионибактерии» Патрик и Макдауэлл 2012

Propionibacterineae является Актиномицет подотряд с двумя семействами и многочисленными родами.

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) ^[1] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)^[2]

Криббелла Park et al. 1999 исправление. Эверест и др. 2013     Nocardioidaceae   Аэромикробий Miller, Woese & Brenner 1991 исправляют. Юн, Ли и О, 2005       Nocardioides Prauser 1976 [вкл. Мумиа и Pimelobacter simplex ]       Nocardioides 2       Nocardioides 3     Марморикола Urzi et al. 2000 исправление. Kim et al. 2015 г.           Пропионибактерии     Propioniferax innocua (Pitcher & Collins, 1992) Yokota et al. 1994 г.       Маринилутейкокк Zhang et al. 2014 г.     Granulicoccus phenolivorans Maszenan et al. 2007 г.           Науманнелла halotolerans Ризер, Шерер и Веннинг, 2012 г.         Пропиониклава поздняя Sugawara et al. 2011 г.       Micropruina glycogenica Shintani et al. 2000 г.       Propionicimonas paludicola Акасака и др. 2003 г.     Propionicella superfundia Bae et al. 2006 г.             Ауратикокк монументальный Алонсо-Вега и др. 2011 г.       Микролунатус Накамура и др. 1995 г.     Фридманниелла Schumann et al. 1997 г.             Aestuariimicrobium kwangyangense Юнг и др. 2007 г.       Лютеококк Тамура, Такеучи и Йокота 1994 исправляют. Collins et al. 2000 г.         Tessaracoccus oleiagri Cai et al. 2011 г.       Brooklawnia Рейни и др. 2006 г.     Пропионимикробиум лимфофильный (Торри 1916) Stackebrandt et al. 2002 г.           Тессаракокк Maszenan et al. 1999 г.       Tessaracoccus lapidicaptus Пуэнте-Санчес и др., 2014 г.     Пропионибактерии Орла-Йенсен 1909 исправить. Charfreitag, Collins & Stackebrandt, 1988 г.

Таксономия

В настоящее время принятая филогения основана на выпуске 123 LTP на основе 16S рРНК, разработанном Проект "Живое дерево всех видов" ^[3]

• Nocardioidaceae Нестеренко, Квасников и Ногина, 1990 исправление. Чжи, Ли и Стакебрандт, 2009 г.
  • ?Актинополиморфный Wang et al. 2001 г.
  • Аэромикробий Miller et al. 1991 исправление. Юн и др. 2005 г.
  • Флиндерсиелла Kaewkla и Franco 2011
  • ?Криббелла Park et al. 1999 исправление. Эверест и др. 2013
  • Марморикола Urzì et al. 2000 исправление. Ли и Ли 2010
  • Мумиа Ли и др. 2014 г.
  • Nocardioides Prauser 1976
  • Пимелобактер Suzuki & Komagata 1983 г.
  • ?Thermasporomyces Yabe et al. 2011 г.
• Пропионибактерии Delwiche 1957 исправить. Чжи, Ли и Стакебрандт, 2009 г.
  • ?Acidipropionibacterium Шольц и Килиан 2016
  • ?Кутибактерии Шольц и Килиан 2016
  • ?Понтикокк ♠ Ли и Ли и 2008
  • ?Псевдопропионибактерии Шольц и Килиан 2016
  • ?Raineyella Пикута и др. 2016 г.
  • Эстуариимикробиум Юнг и др. 2007 г.
  • Ауратикокк Алонсо-Вега и др. 2011 г.
  • Brooklawnia Рейни и др. 2006 г.
  • Фридманниелла Schumann et al. 1997 г.
  • Грануликокк Maszenan et al. 2007 г.
  • Лютеококк Тамура, Такеучи и Йокота 1994 исправляют. Collins et al. 2000 г.
  • Маринилутейкокк Zhang et al. 2014 г.
  • Микролунатус Накамура и др. 1995 г.
  • Micropruina Shintani et al. 2000 г.
  • Науманнелла Ризер, Шерер и Веннинг, 2012 г.
  • Пропионибактерии Орла-Йенсен 1909 исправить. Charfreitag et al. 1988 г.
  • Пропионицелла Bae et al. 2006 г.
  • Пропиониклава Sugawara et al. 2011 г.
  • Пропионицимонас Акасака и др. 2003 г.
  • Пропиониферакс Yokota et al. 1994 г.
  • Пропионимикробий Stackebrandt et al. 2002 г.
  • Тессаракокк Maszenan et al. 1999 г.

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)

Рекомендации

1. J.P. Euzéby. "Propionibacterineae". Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2016-11-11.
2. Сэйерс; и другие. «Пропионибактерии». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2016-11-11.
3. Проект "Живое дерево всех видов".«Релиз 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2016-11-11.