Thermoanaerobacterales - Thermoanaerobacterales

Thermoanaerobacterales
Научная классификация
Королевство:	Бактерии
Разделение:	Фирмикуты
Учебный класс:	Clostridia Рейни 2010
Заказ:	Thermoanaerobacterales Wiegel 2010
Семьи и роды
Thermoanaerobacteraceae Wiegel 2010 Аммонифекс Хубер и Стеттер 1996 исправляют. Мирошниченко и др. 2008 г. Brockia Перевалова и др. 2013 Caldanaerobacter Fardeau et al. 2004 г. Калданаэробиус Ли и др. 2008 г. Calderihabitans Йонеда и др. 2013 Калорибактерии Слободкина и др. 2012 г. Карбоксидотермус Светличный и др. 1991 исправление. Новиков и др. 2011 г. Десульфотермобактер Фролов и др. 2018 г. Десульфовиргула Kaksonen et al. 2007 г. Фервидикола Огг и Патель 2009 Гелрия Plugge et al. 2002 г. Мурелла Коллинз и др. 1994 г. Тепиданаэробактер Sekiguchi et al. 2006 г. Thermacetogenium Hattori et al. 2000 г. Thermanaeromonas Mori et al. 2002 г. Thermoanaerobacter Вигель и Юнгдаль 1982 исправляют. Ли и др. 2007 г. Термодесульфитимонас Слободкина и др. 2017 г. Thermodesulfobiaceae Mori et al. 2004 г. Термодесульфобий Mori et al. 2004 г. Семейство Thermoanaerobacterales III. Incertae Sedis Калданаэровирга Вагнер и др. 2009 г. Caldicellulosiruptor Рейни и др. 1995 исправление. Onyenwoke et al. 2006 г. Syntrophaceticus Westerholm et al. 2011 г. Thermoanaerobacterium Ли и др. 1993 исправление. Cann et al. 2001 г. Термоседиминибактер Ли и др. 2006 г. Термовенабулюм Заварзина и др. 2002 г. Термоворакс Mäkinen et al. 2012 г. Семейство Thermoanaerobacterales IV. Incertae Sedis Махелла Bonilla Salinas et al. 2004 г.

В Thermoanaerobacterales это полифилетический порядок из бактерии помещенный в полифилетический учебный класс Clostridia, и включает четыре семейства: Thermoanaerobacteraceae, то Thermodesulfobiaceae, то Семейство Thermoanaerobacterales III. Incertae Sedis, а Семейство Thermoanaerobacterales IV. Incertae Sedis, и различные неразмещенные роды.^[1]

Этот порядок отмечен способностями вида выживать в экстремальные условия без кислорода и относительно повышенных для живого температур (до 80-90 ° С). Пример организма в этом порядке: Thermoanaerobacter ethanolicus.^[2]

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)^[3] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)^[1]и филогения основана на высвобождении 111 LTP на основе 16S рРНК Проект "Живое дерево всех видов".^[4]

Thermoanaerobacterales, как упоминалось ранее, является полифилетический, и состоит из более чем шести морфологически и физиологически похожих клад:

• Clostridium thermoamylolyticum ♠ Каткоцин и др. 1985 г.
• Гелрия
• Caldicellulosiruptor
• Desulfovirgula thermocuniculi Kaksonen et al. 2007 г.
• Thermanaeromonas toyohensis Mori et al. 2002 г.
• Thermodesulfobiaceae
• Thermoanaerobacteraceae
• Thermoanaerobacterales Неназванная клада I [вкл. Фервидикола ]

Тепиданаэробактер   ?Т. ацетатоксиданс ♠ Westerholm et al. 2011 г.     Т. синтрофический Sekiguchi et al. 2006 г. (тип sp.)        Термовенабулюм   T. gondwanense Ogg et al. 2010 г.     Т. ferriorganovorum Заварзина и др. 2002 г. (тип sp.)        Термоседиминибактер   Т. litoriperuensis Ли и др. 2006 г.     T. oceani Ли и др. 2006 г. (тип sp.)         Fervidicola ferrireducens Огг и Патель 2009       Caldanaerovirga acetigignens Вагнер и др. 2009 г.     Термоворакс субтерранеус Mäkinen et al. 2012 г.

• Thermoanaerobacterales Безымянная клада II

Мурелла   ?М. perchloratireducens ♠ Balk et al. 2008 г.       M. thermoacetica (Fontaine et al. 1942) Collins et al. 1994 г. (тип sp.)     M. thermoautotrophica (Wiegel et al. 1982) Collins et al. 1994 г.         М. humiferrea Непомнящая и др. 2012 г.       М. глицерини Слободкин и др. 1997 г.     М. Mulderi Balk et al. 2005 г.               Syntrophaceticus schinkii Westerholm et al. 2011 г.     Thermacetogenium phaeum Hattori et al. 2000 г.     Карбоксидотермус   С. пертинакс Йонеда и др. 2012 г.       C. islandicus Новиков и др. 2011 г.       С. сидерофилус Слепова и др. 2009 г.       С. ferrireducens (Слободкин и др., 1997) Слободкин и др. 2006 г.     C. Hydrogenoformans Светличный и др. 1991 г. (тип sp.)

• Thermoanaerobacterales Безымянная клада III [вкл. Термогидрогениум ]

Махелла австралийская Bonilla Salinas et al. 2004 г.      Калданаэробиус   С. fijiensis Ли и др. 2008 г. (тип sp.)       С. polysaccharolyticus (Cann et al. 2001) Lee et al. 2008 г.     C. zeae (Cann et al. 2001) Lee et al. 2008 г.           Калорибактерии цистерны Слободкина и др. 2012 г.   Thermoanaerobacterium   ?T. bryantii ♠ Строот и др. 2002 г.     ?T. islandicum ♠ Орлигссон и Бальдурссон, 2006 г.         Т. aotearoense Лю и др. 1996 г.     T. thermostercoris Romano et al. 2011 г.         T. thermosaccharolyticum (McClung 1935) Collins et al. 1994 г.     Thermohydrogenium kirishiense Захарова и др. 1996 г.           Т. aciditolerans Кубланов и др. 2007 г.       Т. saccharolyticum Ли и др. 1993 г.       T. thermosulfurigenes (Schink and Zeikus, 1983) Ли и др. 1993 г. (тип sp.)     Т. xylanolyticum Ли и др. 1993 г.

Примечания:
♣ Международный журнал систематической бактериологии или же Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии (IJSB / IJSEM) опубликованные виды, которые находятся в печати.
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛПСН).

Рекомендации

1. Сэйерс; и другие. "Thermoanaerobacterales". Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2 марта 2019.
2. К. Майкл Хоган. 2010 г. Экстремофил. ред. Э. Моноссон и К. Кливленд, Энциклопедия Земли. Национальный совет по науке и окружающей среде, Вашингтон, округ Колумбия.
3. J.P. Euzéby. "Thermoanaerobacterales". Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2 марта 2019.
4. Проект "Живое дерево всех видов".«Выпуск 111 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 20 марта 2013.