VP40 - VP40
| VP40 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Гексамер матричного белка VP40, вирус Эбола | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | VP40 | ||||||||
| Pfam | PF07447 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR008986 | ||||||||
| SCOP2 | 1h2c / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии VP40 это имя вирусный матричный белок. Чаще всего встречается в Вирус Эбола (EBOV),[1] тип несегментированной отрицательной нити РНК вирус. Вирус Эбола вызывает тяжелые и часто смертельные геморрагическая лихорадка в люди, известный как Болезнь, вызванная вирусом Эбола. Вирусная матрица белок VP40 является основным структурный белок, который играет центральную роль в сборке вирусов и подающий надежды на плазматическая мембрана инфицированных клетки. VP40 белки работать, связываясь с сотовый мембраны, взаимодействующий с цитоплазматический хвосты гликопротеинов и привязка к рибонуклеопротеин сложный.[нужна цитата ]
Структура
VP40 мономер состоит из двух белковые домены, то N-концевой домен олигомеризации и C-терминал мембранно-связывающий домен, соединенный гибким линкером. Оба N- и C-терминала домены складывать в бета-бутерброд структуры аналогичной топологии.[2] Внутри N-концевого домена находятся два перекрывающихся L-домена с последовательности PTAP и PPEY в остатки 7-13, которые необходимы для эффективного бутонизации.[3] Считается, что L-домены опосредуют свою функцию в почковании через взаимодействие со специфическими клеточными белками хозяина, такими как TSG101 и впс-4.[4]
Функция
VP40 координирует многочисленные функции вирусного жизненного цикла Вирус Эбола. К ним относятся: регуляция вирусного транскрипция, морфогенез, упаковка и почкование зрелых вирионов.[5]
VP40 проходит через промежуточные состояния сборки (например, октамеры). Было отмечено, что белки, кодируемые EBOV (VP30, VP35 и VP40), действуют независимо как супрессоры Подавление РНК, что указывает на то, что вирус активно сопротивляется клеточной РНКи во время репликации.[5]
Значение VP40
Изучение матричного протеина VP40 важно из-за высокой смертность вируса Эбола, который внесен в список ВОЗ Возбудитель группы риска 4, HHS Выбрать агента, Национальные институты здравоохранения США /НИАИД Приоритетный патоген категории А, а CDC Агент биотерроризма категории А и биологический агент экспортного контроля со стороны Австралийская группа.[5]
Экспрессии матричного белка VP40 достаточно для генерации вирусоподобные частицы (нет вирусного генетического материала) в млекопитающее хозяев, которые с морфологической точки зрения удивительно неотличимы от живого вируса.[5]
Вспышка вируса Эбола в Западной Африке
Во время и после 2014-2016 гг. Эпидемия вируса Эбола в Западной Африке искались варианты лечения; среди них был матричный белок VP40 в качестве мишени для возможных исследований, которые могут (или не может) приводят к терапевтическому варианту.[6][7]
Рекомендации
- ^ Дессен, Андреа; Волчков Виктор; Дольник, Ольга; Кленк, Ханс-Дитер; Вайссенхорн, Винфрид (15 августа 2000 г.). «Кристаллическая структура матричного белка VP40 вируса Эбола». Журнал EMBO. 19 (16): 4228–4236. Дои:10.1093 / emboj / 19.16.4228. ISSN 0261-4189. ЧВК 302032. PMID 10944105.
- ^ Дессен А., Волчков В., Дольник О., Кленк HD, Вайссенхорн В. (август 2000 г.). «Кристаллическая структура матричного белка VP40 вируса Эбола». EMBO J. 19 (16): 4228–36. Дои:10.1093 / emboj / 19.16.4228. ЧВК 302032. PMID 10944105.
- ^ Тимминс Дж., Шон Дж., Рикар-Блюм С., Скианиманико С., Вернет Т., Руигрок Р. В., Вайссенхорн В. (февраль 2003 г.). «Взаимодействие матричного белка вируса Эбола VP40 с человеческими клеточными факторами Tsg101 и Nedd4». J. Mol. Биол. 326 (2): 493–502. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 01406-7. PMID 12559917.
- ^ Ликата Дж. М., Симпсон-Холли М., Райт Н. Т., Хан З., Парагас Дж., Харти Р. Н. (февраль 2003 г.). «Перекрывающиеся мотивы (PTAP и PPEY) в белке VP40 вируса Эбола функционируют независимо как домены позднего почкования: участие белков-хозяев TSG101 и VPS-4». Дж. Вирол. 77 (3): 1812–9. Дои:10.1128 / jvi.77.3.1812-1819.2003. ЧВК 140960. PMID 12525615.
- ^ а б c d Сильва Л.П., Ванзил М., Бавари С., Аман Дж. М., Шример, округ Колумбия (2012). «Сборка матричного протеина вируса Эбола VP40 регулируется защелкивающими свойствами N- и C-концевых хвостов». PLoS ONE. 7 (7): e39978. Bibcode:2012PLoSO ... 739978S. Дои:10.1371 / journal.pone.0039978. ЧВК 3390324. PMID 22792204.
- ^ Мадара, Джонатан Дж; Хан, Цзыин; Рутел, Гордон; Фридман, Брюс Д; Харти, Рональд Н. (2017-02-05). «Многофункциональный матричный белок VP40 вируса Эбола является многообещающей терапевтической мишенью». Будущая вирусология. 10 (5): 537–546. Дои:10.2217 / fvl.15.6. ISSN 1746-0794. ЧВК 4480923. PMID 26120351.
- ^ Балмит, Марисса; Солиман, Махмуд Э. С. (01.02.2017). «VP40 вируса Эбола в качестве мишени для терапии EboV: всесторонний ландшафт конформации и связывания ингибиторов от ускоренной молекулярной динамики». Биохимия и биофизика клетки. 75 (1): 65–78. Дои:10.1007 / s12013-017-0783-8. ISSN 1559-0283. PMID 28144904.требуется подписка