Rhizobium binae - Rhizobium binae
| Rhizobium binae | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Королевство: | |
| Тип: | |
| Учебный класс: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | R. binae |
| Биномиальное имя | |
| Rhizobium binae Харун-или Рашид и др. 2015 г. | |
Rhizobium binae это грамотрицательная бактерия который был изолирован от корневые узелки из чечевица в Бангладеш.
Описание
R. binae находятся стержневидный бактерии, обнаруженные в почве. Они требуется кислород и не образовывать споры.[1]
R. binae хорошо расти на YEMA средний агар, где они образуют колонии которые круглые, выпуклые и кремово-белые. Штаммы выживают при pH значения от 5,5 до 10. Они очень чувствительны к ампициллин и устойчив к канамицин и налидиксовая кислота. Штаммы не переносят тетрациклин и не растут LB средний.[1]
R. binae может использовать различные питательные вещества, в том числе декстрин, D-мальтоза, D-трегалоза, D-целлобиоза, гентиобиоза, сахароза, D-раффиноза, α-D-глюкоза, D-тураноза, α-D лактоза, D-фруктоза, D-мелибиоза, β-метил-D-глюкозид, салицин, N-ацетил-D-галактозамин, D-манноза, D-галактоза, D-маннитол, D-соррбитол, D-арабитол, глицерин, D-глюкозо-6-фосфат, D-фруктозо-6-фосфат, D-аланин, L-аспарагиновая кислота, L-гистидин, l-пироглутаминовая кислота, хинная кислота, D-сахарная кислота, метилпируват, L-молочная кислота, лимонная кислота, D-яблочная кислота, L-яблочная кислота, бромянтарная кислота, β-гидрокси-d, l-масляная кислота и уксусная кислота. R. binae нельзя использовать питательные вещества N-ацетил-D-маннозамин, 3-метилглюкозу, инозин, глицил-L-пролин, L-аргинин, D-галактуроновая кислота, D-глюкуроновая кислота, глюкуронамид, п-гидроксифенилуксусная кислота, метиловый эфир D-молочной кислоты, α-кетоглутаровая кислота, подросток 40, пропионовая кислота или же муравьиная кислота.[1]
R. binae может расти в присутствии соединений антибиотиков линкомицин и теллурит калия, но не при наличии 1% лактат натрия, тролеандомицин, хлорид лития или же бутират натрия.[1]
Типовой штамм R. binae представляет собой штамм BLR195T (= LMG 28443T = DSM 29288T).[1]
Приложения
Различные штаммы этого вида могут образовывать эффективные клубеньки и увеличивать рост чечевицы, гороха и латируса, а также полезны для производства биоудобрений.
Генетика
R. binae генетически очень похож на своих близких родственников Rhizobium etli и Ризобум Phaseoli.[1] В GC-контент ДНК типового штамма R. binae составляет 61,5%.[1]
Последовательность генома доступна в NCBI и Европейский нуклеотидный архив.
История
R. binae впервые был описан в 2015 г. М. Харун-или Рашидом и другими. Он был выделен из корневых клубеньков Lens culinaris в Фени район Бенгладеш. Он был назван "binae" как сокращение от Бангладешский институт ядерного сельского хозяйства, научно-исследовательский институт, в котором изначально изучались бактерии.[1]
Рекомендации
- ^ а б c d е ж грамм час Рашид, М. Харун-или; Клеркс, Пиа; Эвераль, Изобель; Подмигнуть, Майкл; Виллемс, Энн; Янг, Дж. Питер В .; Сантош Браун, Маркус (2015). «Средняя нуклеотидная идентичность последовательностей генома подтверждает описание Ризобиум лентис sp. ноя., Rhizobium bangladeshense sp. ноя И Rhizobium binae sp. ноя Из клубеньков чечевицы (Lens culinaris) ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 65 (9): 3037–45. Дои:10.1099 / ijs.0.000373. HDL:1854 / LU-7061135. PMID 26060217.
дальнейшее чтение
- Рашид, М.Х., Гонсалес, Х., Янг, Дж.П.У., и Винк, М. (2014) Rhizobium leguminosarum является симбионтом чечевицы на Ближнем Востоке и в Европе, но не в Бангладеш. FEMS Microbiology Ecology, 87: 64-77.
- Rashid, M.H., Schafer, H., Gonzalez, H, and Wink, M. (2012) Генетическое разнообразие клубеньковых ризобий чечевицы (Lens culinaris) в Бангладеш. Систематическая и прикладная микробиология, 35: 98-109.