Стрептококки Viridans - Viridans streptococci - Wikipedia

Стрептококки Viridans
Научная классификация
Королевство:	Бактерии
Тип:	Фирмикуты
Учебный класс:	Кокки
Заказ:	Лактобациллы
Семья:	Streptococcaceae
Род:	Стрептококк

В стрептококки viridans большая группа комменсальный стрептококковый Грамположительные бактерии виды, которые α-гемолитический, вызывая зеленую окраску крови чашки с агаром (отсюда и название «viridans», от латинского «vĭr ,dis», зеленый). Псевдо-таксономический термин «Streptococcus viridans» часто используется для обозначения этой группы видов, но авторы, которые не любят использовать псевдотаксономический термин (который трактует группу видов, как если бы они были одним видом), предпочитают термины стрептококки viridans,^[1] стрептококки группы viridans (VGS), или же стрептококковые виды viridans.

Эти виды не обладают Lancefield антигены.^[2] В целом, патогенность низкий.^[3]

Идентификация

Стрептококки Viridans можно отличить от Пневмококк используя оптохин проверить, насколько устойчивы к оптохину стрептококки viridans; им также не хватает полисахарид -основан капсула типично S. pneumoniae или Антигены Лансфилда из пиогенный представители рода.^[4]

	Стрептококки Viridans	Пневмококк
С желчью	Нерастворимый	Растворимый
Ферментация инулина	Не ферментер	Ферментер с производством кислоты
Чувствительность к оптохин	Не чувствительный	Чувствительный
Патогенность для мышей	Непатогенный	Патогенный
Тест Quellung (активно не используется)	Отрицательный	Положительный

Патология

Эти организмы наиболее многочисленны во рту, и один из членов группы, S. mutans, является причиной кариес в большинстве случаев и популяций. S. sanguinis также еще одна потенциальная причина. Другие могут быть вовлечены в другие инфекции полости рта или десен, как перикоронит. Если они попадают в кровоток, они могут вызвать эндокардит, особенно у лиц с поврежденными сердечные клапаны. Они являются наиболее частыми причинами подострый бактериальный эндокардит. Стрептококки Viridans выявляются при: неонатальные инфекции.^[5]

Стрептококки Viridans обладают уникальной способностью синтезировать декстраны из глюкоза, что позволяет им придерживаться фибрин -тромбоцит агрегаты при повреждении сердечных клапанов. Этот механизм лежит в основе их способности вызывать подострый порок клапанов сердца после их попадания в кровоток (например, после удаление зубов ).

Идентификация

Фенотипическая и биохимическая идентификация

Идентификация VGS на уровне вида может быть трудной, а фенотипическая идентификация не всегда точна. Название «вириданс» в некоторой степени неправильное, так как многие виды не вызывают гемолиза на кровяном агаре. С точки зрения классификации, бесполезно пытаться дифференцировать альфа-гемолиз от отсутствия гемолиза на пластинах с кровяным агаром (иногда называемый «гамма-гемолизом»); эта функция может широко варьироваться в зависимости от питательной среды, используемой для культивирования организма, а также от температуры инкубации. Отсутствие альфа-гемолиза, похоже, не коррелирует с клиническим исходом или тяжестью заболевания; не было зарегистрировано ни одного ферментативного или токсигенного эффекта как побочного продукта альфа-гемолиза.

Под микроскопом бактерии группы viridans представляют собой цепочечные грамположительные кокки. Они не экспрессируют каталазу и поэтому являются каталазо-отрицательными.^[6] Они являются лейцинаминопептидазоположительными, отрицательными по пирролидонилариламидазе и не растут в 6,5% NaCl, и почти все виды отрицательны для роста на агаре с желчным эскулином. Они отличаются от пневмококков тем, что устойчивы к оптохинам и не растворяются в желчи. Однако Richter et al. изучили ошибочную идентификацию VGS, представленных в программы антимикробного надзора, как пневмококки, и обнаружили, что различие между S. pneumoniae от VGS может быть затруднено, что неудивительно в свете того, что С. митис и С. оралис обладают> 99% гомологией последовательности с S. pneumoniae (47). Авторы также обнаружили, что тестирование оптохинового диска не работает так же хорошо, как тестирование растворимости желчи для идентификации; при обследовании 1733 протестированных изолятов тестирование растворимости в желчи имело более высокую чувствительность и специфичность для дифференциации VGS от пневмококков (47).

S. anginosus группаВ S. anginosus группа организмов может быть бета-, альфа- или негемолитической. Изоляты, у которых отсутствует бета-гемолиз, обычно относятся к группе VGS. С. constellatus наиболее вероятно из этой группы быть бета-гемолитиками. Есть некоторые доказательства причастности бета-гемолитического С. constellatus subsp. pharyngis как причина фарингита (55). С. промежуточный виды из этой группы, наиболее часто выделяемые из абсцессов мозга и печени. В S. anginosus группа может обладать антигенами группы Лэнсфилда A, C, G и F, хотя С. промежуточный почти никогда не обладает антигенами группы Лансфилда. Изоляты S. anginosus группы имеют характерный запах «ириски». Члены группы универсально положительны по трем биохимическим реакциям: производство ацетоина из глюкозы (положительное Vogues – Proskauer реакция), аргинин и сорбит. Они очень полезны для дифференциации этой группы от других VGS.

S. mitis группа.В S. mitis Группа организмов состоит из нескольких видов и биохимически очень инертна, что может сделать идентификацию на уровне видов очень сложной задачей. Использование недействительных названий видов также было особой проблемой с S. mitis группа. Изоляты этой группы отрицательны по продукции ацетоина, аргинина, эскулина и маннита и отрицательны при ферментации сорбита (14). S. pneumoniae недавно охарактеризованный член S. mitis группа 1). Поскольку этот организм тесно связан с S. pneumoniae и другими организмами группы S. mitis, точная идентификация может быть затруднена. S. pseudopneumoniae не имеет пневмококковой капсулы и устойчив к оптохину при инкубации в атмосфере с повышенным содержанием CO.₂ но чувствителен при инкубации на воздухе. Растворимость в желчи - более специфический тест для S. pseudopneumoniae чем восприимчивость к оптохинам, так как организм не растворяется в желчи (1).

S. sanguinis группаГенетически неоднородный S. sanguinis группа ранее была известна как S. sanguinis. Некоторые систематики сгруппировали S. sanguinis группа с S. mitis группа на основе анализа последовательности гена 16S рРНК, но S. sanguinis Групповые организмы обладают различными фенотипическими характеристиками. Изолирует в S. sanguinis группа - положительные по аргинину и эскулину. Как и члены S. mitis группа, они отрицательны на продукцию ацетоина и ферментацию маннита и сорбита. В S. sanguinis группа включает S. sanguinis, S. parasanguinis, и S. gordonii (14).

S. salivarius группаВ S. salivarius группа тесно связана с S. bovis группа. Виды из этой группы, которые были изолированы от инфекции человека, включают: S. salivarius и С. вестибулярный, а также С. термофильный, который был обнаружен из молочных продуктов. S. salivarius Организмы группы положительны по продукции ацетоина и положительны по эскулину, но отрицательны по гидролизу аргинина и ферментации маннита и сорбита.

S. mutans группаЧлены S. mutans группа в основном изолирована от ротовой полости человека и включает несколько видов, фенотипически сходных. S. mutans и S. sobrinus виды в этой группе, наиболее часто изолируемые от инфекции человека. Они не гидролизуют аргинин, но положительны в отношении продукции ацетоина, гидролиза эскулина и ферментации маннита и сорбита.

Автоматизированные биохимические методы идентификацииЧто касается VGS, использование автоматизированных систем для идентификации исторически считалось проблематичным, и эта тема применима к множеству автоматизированных методологий. Одним из основных факторов, влияющих на качество генерируемых идентификаций, является то, что системы могут не иметь всех видов, представленных в их базах данных (32). В одном исследовании, сравнивающем точность карты Vitek2 ID-GPC с точностью традиционных биохимических методов на основе агара для идентификации различных грамположительных и грамотрицательных организмов, 72% грамположительных изолятов были точно идентифицированы с помощью Vitek2. система (21). Среди наиболее проблемных идентификаций (неправильно идентифицированных или неразрешенных) были VGS; S. anginosus, S. mutans, и S. sanguinis были ошибочно идентифицированы как другие виды VGS и, в некоторых случаях, как S. pneumoniae (21).

Исследование способности панели SMIC / ID BD Phoenix system идентифицировать Streptococcus spp. классифицировали 97 последовательных клинических изолятов стрептококков, включая 34 изолята VGS, используя биохимические методы в качестве эталонного метода (26). Девяносто один процент изолятов стрептококков показал соответствие между Phoenix и эталонным методом. Из 12 протестированных изолятов группы S. mitis система Phoenix правильно идентифицировала семь изолятов с двумя несогласованными идентификациями, и было три изолята, для которых система Phoenix не произвела никакой идентификации. Из 22 S. anginosus группы изолятов, 18 были правильно идентифицированы, а четыре не соответствовали друг другу. Во втором исследовании оценивалась панель Phoenix SMIC / ID-2 с использованием системы API 20 Strep в качестве метода сравнения (разрешение противоречивых результатов с помощью секвенирования гена 16S рРНК, а также амплификации и секвенирования генов домашнего хозяйства) (5). Для VGS был проанализирован 31 изолят, при этом соответствие между методами Phoenix и референсными методами только 53%. С. митис групповые организмы, 100% соответствие для S. anginosus группы и 75% согласованности для S. sanguinis групповые организмы (5).

Идентификация на основе последовательностиИсторически исследования гибридизации ДНК-ДНК использовались для подтверждения идентификации на уровне видов для VGS. Однако клинические лаборатории не могут использовать эти процедуры для идентификации этих организмов. Впоследствии для идентификации на уровне видов VGS были введены другие системы идентификации на основе последовательностей. В общем, секвенирование гена 16S рРНК приводит к плохому разрешению до видового уровня в VGS. Это связано с высокой степенью гомологии гена 16S рРНК в этой группе организмов; S. mitis, С. оралис, S. pseudopneumoniae, и S. pneumoniae почти всегда гомология последовательности в этом гене составляет> 99%. В свете высокой степени сходства последовательностей гена 16S рРНК было исследовано секвенирование альтернативных генов-мишеней для надежной идентификации на уровне видов. Одна многообещающая мишень, rnpB, была исследована Innings et al., Которые проанализировали две вариабельные области rnpB с помощью пиросеквенирования (28). Из 43 проанализированных видов все были идентифицированы до уровня вида, за исключением двух изолятов: S. anginosus/С. constellatus и С. Infantis/S. peroris. rnpB может использоваться для идентификации VGS с высоким разрешением. Еще один успешный подход - анализ последовательности гена марганец-зависимой супероксиддисмутазы, описанный Poyart et al. Этот метод был использован для точной дифференциации более 29 видов стрептококков, включая 16 видов VGS, с четкой дифференциацией S. mitis, С. оралис, и S. pneumoniae (44, 45). Другие методы, которые использовались с разной степенью успеха, включают анализ последовательности межгенной спейсерной области 16S-23S, секвенирование гена d-аланин-d-аланин-лигазы и секвенирование гена гиалуронатлиазы.

Рекомендации

1. Иллюстрированный медицинский словарь Дорланда, заглавное слово "streptococcus", подраздел "viridans streptococci".
2. Райан К.Дж., Рэй К.Г., ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4-е изд.). Макгроу Хилл. С. 293–4. ISBN  978-0-8385-8529-0.
3. Вириданс + стрептококки в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
4. Паттерсон MJ (1996). «Стрептококк». В Baron S; и другие. (ред.). Медицинская микробиология Барона (4-е изд.). Univ Техасского медицинского отделения. ISBN  978-0-9631172-1-2.
5. Baucells, B.J .; Mercadal Hally, M .; Álvarez Sánchez, A.T .; Фигерас Алой, Дж. (2015). "Проблемные препараты для профилактики некрозного энтероколита и позднего восстановления сепсиса и смертной казни неонатального ребенка в течение 1 500 г: una revisión sistemática". Anales de Pediatría. 85 (5): 247–255. Дои:10.1016 / j.anpedi.2015.07.038. ISSN  1695-4033. PMID  26611880.
6. Doern, Christopher D .; Бернем, Кэри-Энн Д. (ноябрь 2010 г.). «Непросто быть зеленым: стрептококки группы Вириданс с акцентом на педиатрические клинические проявления». Журнал клинической микробиологии. 48 (11): 3829–3835. Дои:10.1128 / JCM.01563-10. ISSN  0095-1137. ЧВК  3020876. PMID  20810781.

дальнейшее чтение

Навин Кумар, Венкатесан; ван дер Линден, Марк; Менон, Тангам; Патрик Ницше-Шмитц, Д. (май 2014 г.). «Стрептококки группы Viridans и bovis, вызывающие инфекционный эндокардит в двух регионах с противоположной эпидемиологией». Международный журнал медицинской микробиологии. 304 (3–4): 262–268. Дои:10.1016 / j.ijmm.2013.10.004. PMID  24220665.