ABCC11 - ABCC11

ABCC11
Идентификаторы
Псевдонимы	ABCC11, АТФ-связывающая кассета, подсемейство C (CFTR / MRP), член 11, EWWD, MRP8, WW, АТФ-связывающая кассета, подсемейство C, член 11, АТФ-связывающая кассета, транспортер подсемейства C, член 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607040 ГомолоГен: 69511 Генные карты: ABCC11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q12.1 Начните 48,166,910 бп[1] Конец 48,247,568 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • активность трансмембранного переносчика органических анионов • АТФазная активность • Связывание АТФ • активность трансмембранного переносчика пуриновых нуклеотидов • Активность трансмембранного переносчика анионов, связанных с АТФазой • Активность АТФазы, связанная с трансмембранным перемещением веществ Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная экзосома • мембрана • вакуоль • вакуолярная мембрана • клеточная мембрана • мембрана цитоплазматических везикул • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • транспорт пуриновых нуклеотидов • трансмембранный транспорт • перенос органических анионов • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	85320	н / д
Ансамбль	ENSG00000121270	н / д
UniProt	Q96J66	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_032583 NM_033151 NM_145186 NM_001370496 NM_001370497	н / д
RefSeq (белок)	NP_115972 NP_149163 NP_660187 NP_001357425 NP_001357426 NP_115972.2 NP_149163.2	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 16: 48.17 - 48.25 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Член С 11 подсемейства транспортеров АТФ-связывающих кассет, также MRP8 (Белок, связанный с множественной лекарственной устойчивостью 8) это мембранный транспортер который экспортирует определенные молекулы изнутри клетки. Это белок что у людей кодируется ген ABCC11.^[3][4][5]

Ген отвечает за определение человеческого сера тип (влажная или сухая ушная сера) и наличие подмышек осмидроз (запах, связанный с потеть вызвано чрезмерным апокринный секреция).

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства переносчиков АТФ-связывающих кассет (ABC). Белки ABC транспортируют различные молекулы через внеклеточные и внутриклеточные мембраны. Гены ABC делятся на семь отдельных подсемейств (ABC1, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Переносчик ABCC11 является членом подсемейства MRP, которое участвует в формировании множественной лекарственной устойчивости. Продукт этого гена участвует в физиологических процессах с участием желчных кислот, конъюгированных стероидов и циклических нуклеотидов. Кроме того, однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в этом гене отвечает за определение человеческого ушная сера тип и наличие запаха подмышек. Этот ген и член семейства ABCC12, как установлено, происходят в результате дупликации, и оба локализованы на хромосоме 16q12.1. Для этого гена описано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов.^[5]

Молекулярная генетика

Расположение ABCC11 с его 30 экзонами на хромосоме 16. Важный однонуклеотидный полиморфизм (SNP) 538G → A расположен на экзоне 4.

В ABCC11 ген присутствует в человеческий геном как два аллели, отличающиеся одним нуклеотид также известный как однонуклеотидный полиморфизм (SNP).^[6] SNP в ABCC11 ген на хромосома 16 в база позиция 538 либо гуанин или аденин определяет две различные группы фенотипы.^[6][7] Это соответственно код для глицин и аргинин в генах белок товар. Доминантное наследование GG или GA генотип наблюдается при рецессивном генотипе AA. Фенотипы, выраженные генотипами, включают: сера тип (влажная или сухая ушная сера), осмидроз (запах, связанный с потеть вызвано чрезмерным апокринный секреция), и, возможно, рак молочной железы риск, хотя продолжаются дискуссии о том, существует ли реальная корреляция фенотипа влажной ушной серы с восприимчивостью к раку груди.^[8][9] Генотип GG или GA вызывает фенотип влажной ушной серы (липкий и коричневый цвет) и едкий запах пота и является доминантным аллелем.^[8] Обратите внимание, что для этого фенотипа необходимо присутствие только одного гуанина. В гомозиготный рецессивный генотип AA вызывает фенотип сухой ушной серы (сухой и шелушащийся) и слегка пахнущий пот.^[8]

Аллели, содержащие гуанин, производят белок, который гликозилированный но аллели, содержащие аденин, не гликозилированы. Полученный белок лишь частично разрушается протеасомы.^[6] Этот эффект локализован на серная железа мембраны.^[6] Поскольку аденинсодержащий аллельный белковый продукт разрушается только частично, оставшийся функциональный белок располагается на мембране клеточной поверхности, которая ABCC11 роль гена в запахе пота, вероятно, частично связана с количественной дозировкой белка ABCC11.^[6]

Из эволюционный перспектива, последствия серного типа на фитнес неизвестны. хотя пот без запаха в древнем северном Евразийский постулируется, что население адаптивный преимущество для холодной погоды.^[7] В некоторых нечеловеческих млекопитающие, вязка сигналы через выпуск запаха, усиленного повышенной секрецией апокрина, могут быть фактором половой отбор.^[7]

Физический человек черты, которые контролируются одним геном, необычный. Большинство характеристик человека контролируется несколькими генами (полигены ); ABCC11 является своеобразным примером гена с однозначным фенотипом, который контролируется SNP. Кроме того, это считается плейотропный ген.

Демография

Мировая карта распределения аллеля А однонуклеотидного полиморфизма rs17822931 в гене ABCC11. Доля аллелей А в каждой популяции представлена ​​белой областью в каждом круге.

Историю миграции людей можно проследить с помощью ABCC11 генные аллели. Разница между ушной серой и запахом тела в национальности во всем мире именно из-за ABCC11 генные аллели.^[7] Предполагается, что 40 000 лет назад древний Монголоид Племя развило фенотип сухой ушной серы, который последовал за распространением аллеля сухой ушной серы в другие регионы Азии через миграцию древнего племени.^[10] Ген распространился в результате того, что он был полезным приспособление или через эволюционно нейтральный мутация механизм, который прошел генетический дрейф События.^[10]

Частота аллелей сухой ушной серы и пота без запаха наиболее высока на Востоке и Северо-Востоке. Азия, в первую очередь Корея, Китай, Монголия, и западный Япония.^[7] Нисходящий градиент фенотипов аллелей сухой ушной серы может быть проведен из северного Китая в южную Азию, а градиент восток-запад также может быть проведен из восточной Сибири в западную Европу.^[7] В частоты аллелей внутри этнических групп продолжали сохраняться, потому что ABCC11 ген унаследован как гаплотип, группа генов или аллелей, которые, как правило, наследуются как единое целое^[7][11]

Количество летучие органические соединения (ЛОС) в ушной сере связаны с вариациями ABCC11. генотип, что, в свою очередь, зависит от этнического происхождения. В частности, генотип rs17822931, который особенно распространен у жителей Восточной Азии, коррелирует с более низкими уровнями ЛОС. Однако после поправок Бонферрони не было обнаружено, что уровни ЛОС существенно меняются ни качественно, ни количественно для большинства органических соединений по расовым группам, что позволяет предположить, что это не приводит к этническим различиям.^[12]

Смотрите также

• АТФ-связывающий кассетный транспортер

использованная литература

Цитаты

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000121270 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Таммур Дж., Прадес С., Арноулд И., Ржецкий А., Хатчинсон А., Адачи М., Шуэц Дж. Д., Свобода К. Дж., Птачек Л. Дж., Розье М., Дин М., Алликметс Р. (июль 2001 г.). «Два новых гена из суперсемейства переносчиков АТФ-связывающих кассет человека, ABCC11 и ABCC12, тандемно дублированы на хромосоме 16q12». Ген. 273 (1): 89–96. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00572-8. PMID  11483364.
4. Дин М., Ржецкий А., Алликметс Р. (июль 2001 г.). «Суперсемейство переносчиков человеческих АТФ-связывающих кассет (АВС)». Геномные исследования. 11 (7): 1156–66. Дои:10.1101 / гр.184901 (неактивно 2020-10-04). PMID  11435397.
5. «Ген Entrez: АТФ-связывающая кассета ABCC11, подсемейство C (CFTR / MRP), член 11».
6. Тойода Ю., Сакурай А., Митани Ю., Накашима М., Йошиура К., Накагава Н., Сакаи Ю., Ота И., Лежава А., Хаясизаки Ю., Ниикава Н., Исикава Т. (июнь 2009 г.). «Ушная сера, осмидроз и рак груди: почему один SNP (538G> A) в гене ABC-переносчика ABCC11 человека определяет тип ушной серы?». Журнал FASEB. 23 (6): 2001–13. Дои:10.1096 / fj.09-129098. PMID  19383836. S2CID  26853548.
7. Йошиура К., Киношита А., Исида Т., Ниноката А., Исикава Т., Канаме Т. и др. (Март 2006 г.). «SNP в гене ABCC11 является детерминантом типа ушной серы человека». Природа Генетика. 38 (3): 324–30. Дои:10,1038 / ng1733. PMID  16444273. S2CID  3201966.
8. Родригес С., Стир К.Д., Фэрроу А., Голдинг Дж., День IN (июль 2013 г.). «Зависимость использования дезодоранта от генотипа ABCC11: возможности персонализированной генетики в личной гигиене». Журнал следственной дерматологии. 133 (7): 1760–7. Дои:10.1038 / jid.2012.480. ЧВК  3674910. PMID  23325016.
9. Пак Й.Дж., Шин М.С. (сентябрь 2001 г.). «Как лучше всего лечить осмидроз?». Анналы пластической хирургии. 47 (3): 303–9. Дои:10.1097/00000637-200109000-00014. PMID  11562036. S2CID  25590802.
10. Исикава Т., Тойода Ю., Ёсиура К., Ниикава Н. (01.01.2012). «Фармакогенетика ABC-переносчика ABCC11 человека: новые взгляды на рост апокринных желез и секрецию метаболитов». Границы генетики. 3: 306. Дои:10.3389 / fgene.2012.00306. ЧВК  3539816. PMID  23316210.
11. Прокоп-Пригге К.А., Мэнсфилд К.Дж., Паркер М.Р., Талер Э., Грайс Е.А., Высоцкий К.Дж., Прети Г. (январь 2015 г.). «Этническое / расовое и генетическое влияние на профили одоранта серы». Журнал химической экологии. 41 (1): 67–74. Дои:10.1007 / s10886-014-0533-у. ЧВК  4304888. PMID  25501636.
12. Прокоп-Пригге К.А., Грин К., Варалло Л., Высоцкий С.Дж., Прети Г. (2016). «Влияние этнической принадлежности на производство одоранта в подмышечных впадинах человека». Журнал химической экологии. 42 (1): 33–9. Дои:10.1007 / s10886-015-0657-8. ЧВК  4724538. PMID  26634572.

Источники

• Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

дальнейшее чтение

• Бера Т.К., Ли С., Сальваторе Дж., Ли Б., Пастан I (август 2001 г.). «MRP8, новый член суперсемейства ABC-транспортеров, идентифицированный программой анализа базы данных EST и прогнозирования генов, высоко экспрессируется при раке груди». Молекулярная медицина. 7 (8): 509–16. Дои:10.1007 / BF03401856. ЧВК  1950066. PMID  11591886.
• Ябуучи Х., Симидзу Х., Такаянаги С., Исикава Т. (ноябрь 2001 г.). «Множественные варианты сплайсинга двух новых переносчиков человеческих АТФ-связывающих кассет, ABCC11 и ABCC12». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 288 (4): 933–9. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5865. PMID  11688999.
• Лай Л., Тан TM (февраль 2002 г.). «Роль глутатиона в опосредованном белком 4 множественной лекарственной устойчивости (MRP4 / ABCC4) оттока цАМФ и устойчивости к аналогам пурина». Биохимический журнал. 361 (Pt 3): 497–503. Дои:10.1042/0264-6021:3610497. ЧВК  1222332. PMID  11802779.
• Stríz I, Jaresová M, Lácha J, Sedlácek J, Vítko S (2002). «MRP 8/14 и уровни прокальцитонина в сыворотке крови при трансплантации органов». Анналы трансплантологии. 6 (2): 6–9. PMID  11803621.
• Томита Х., Ямада К., Гадами М., Огура Т., Янаи Й., Накатоми К., Садамацу М., Масуи А., Като Н., Ниикава Н. (июнь 2002 г.). «Сопоставление влажного / сухого локуса ушной серы с перицентромерной областью хромосомы 16». Ланцет. 359 (9322): 2000–2. Дои:10.1016 / S0140-6736 (02) 08835-9. PMID  12076558. S2CID  20226277.
• Turriziani O, Schuetz JD, Focher F, Scagnolari C, Sampath J, Adachi M, Bambacioni F, Riva E, Antonelli G (ноябрь 2002 г.). «Нарушение накопления 2 ', 3'-дидезокси-3'-тиацитидина в Т-лимфобластоидных клетках как механизм приобретенной устойчивости, независимой от белка 4 множественной лекарственной устойчивости с возможной ролью АТФ-связывающей кассеты C11». Биохимический журнал. 368 (Pt 1): 325–32. Дои:10.1042 / BJ20020494. ЧВК  1222956. PMID  12133003.
• Гуо Ю., Котова Е., Чен З.С., Ли К., Хоппер-Борге Е., Белинский М.Г., Крух Г.Д. (август 2003 г.). «MRP8, АТФ-связывающая кассета C11 (ABCC11), представляет собой насос для оттока циклических нуклеотидов и фактор устойчивости для фторпиримидинов 2 ', 3'-дидезоксицитидина и 9' - (2'-фосфонилметоксиэтил) аденина». Журнал биологической химии. 278 (32): 29509–14. Дои:10.1074 / jbc.M304059200. PMID  12764137. S2CID  6081066.
• Bouma G, Lam-Tse WK, Wierenga-Wolf AF, Drexhage HA, Versnel MA (август 2004 г.). «Повышенные уровни MRP-8/14 в сыворотке при диабете 1 типа вызывают повышенную экспрессию CD11b и усиленную адгезию циркулирующих моноцитов к фибронектину». Сахарный диабет. 53 (8): 1979–86. Дои:10.2337 / диабет.53.8.1979. PMID  15277376.
• Фогл Т., Людвиг С., Гебелер М., Стрей А., Тори И.С., Райхельт Р., Фоелл Д., Герке В., Маниц М.П., ​​Накен В., Вернер С., Сорг С., Рот Дж. (Декабрь 2004 г.). «MRP8 и MRP14 контролируют реорганизацию микротрубочек во время трансэндотелиальной миграции фагоцитов». Кровь. 104 (13): 4260–8. Дои:10.1182 / кровь-2004-02-0446. PMID  15331440.
• Чен З.С., Го Ю., Белинский М.Г., Котова Э., Крух Г.Д. (февраль 2005 г.). «Транспорт желчных кислот, сульфатированных стероидов, эстрадиола 17-бета-D-глюкуронида и лейкотриена C4 человеческим белком множественной лекарственной устойчивости 8 (ABCC11)». Молекулярная фармакология. 67 (2): 545–57. Дои:10,1124 / моль. 104,007138. PMID  15537867. S2CID  18527978.
• Бортфельд М., Риус М., Кениг Дж., Херольд-Менде С., Ниес А.Т., Кепплер Д. (2006). «Человеческий белок множественной лекарственной устойчивости 8 (MRP8 / ABCC11), апикальный насос для оттока стероидных сульфатов, представляет собой аксональный белок ЦНС и периферической нервной системы». Неврология. 137 (4): 1247–57. Дои:10.1016 / j.neuroscience.2005.10.025. PMID  16359813. S2CID  22719472.
• Viemann D, Barczyk K, Vogl T., Fischer U, Sunderkötter C, Schulze-Osthoff K, Roth J (март 2007 г.). «MRP8 / MRP14 нарушает целостность эндотелия и вызывает программу каспазозависимой и независимой гибели клеток». Кровь. 109 (6): 2453–60. Дои:10.1182 / кровь-2006-08-040444. PMID  17095618.

внешняя ссылка

• ABCC11 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек ABCC11 расположение генома и ABCC11 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.