EIF4B - EIF4B - Wikipedia

EIF4B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WI8, 2J76
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF4B, EIF-4B, ​​PRO1843, фактор инициации трансляции эукариот 4B
Внешние идентификаторы	OMIM: 603928 MGI: 95304 ГомолоГен: 83162 Генные карты: EIF4B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.13 Начинать 53,006,158 бп[1] Конец 53,042,209 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 F2 Начинать 102,073,773 бп[2] Конец 102,097,173 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • связывание малых субъединиц рибосом • GO: 0008026 геликазная активность • Активность обмена цепи РНК • Активность отжига цепи РНК • Связывание РНК • активность фактора инициации трансляции Сотовый компонент • цитозоль • комплекс фактора инициации трансляции эукариот 4F • полисом Биологический процесс • укорочение поли (A) хвоста мРНК с ядерной транскрипцией • регулирование инициации трансляции • формирование комплекса преиницииции трансляции • сборка комплекса фактора инициации трансляции эукариот 4F • биосинтез белка • трансляционная инициация • цитоплазматический перевод Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1975	75705
Ансамбль	ENSG00000063046	ENSMUSG00000058655
UniProt	P23588	Q8BGD9
RefSeq (мРНК)	NM_001300821 NM_001417 NM_018507 NM_001330654	NM_145625
RefSeq (белок)	NP_001287750 NP_001317583 NP_001408	NP_663600
Расположение (UCSC)	Chr 12: 53.01 - 53.04 Мб	Chr 15: 102.07 - 102,1 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор инициации трансляции эукариот 4B это белок что у людей кодируется EIF4B ген.^[5]

Взаимодействия

eIF4B был показан взаимодействовать с и стимулировать активность eIF4A и привязать к eIF3 комплекс через eIF3A субъединица.^[6] Это взаимодействие приводит к привлечению малая рибосомная субъединица эукариот (40S) к мРНК, которая, в свою очередь, подготовит почву для последующих шагов, ведущих к удлинение.

Смотрите также

• Эукариотический перевод
• eIF4F

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000063046 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058655 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции EIF4B 4B".
6. Меррик WC (октябрь 2015 г.). «eIF4F: ретроспектива». Журнал биологической химии. 290 (40): 24091–9. Дои:10.1074 / jbc.R115.675280. ЧВК  4591800. PMID  26324716.

дальнейшее чтение

• van Heugten HA, Kasperaitis MA, Thomas AA, Voorma HO (1991). «Доказательства того, что фактор инициации эукариот (eIF) 2 представляет собой белок, связывающий кэп, который стимулирует распознавание кэпа с помощью eIF-4B и eIF-4F». J. Biol. Chem. 266 (11): 7279–84. PMID  2016328.
• Милберн СК, Херши Дж. У., Дэвис М. В., Келлехер К., Кауфман Р. Дж. (1990). «Клонирование и экспрессия кДНК эукариотического фактора инициации 4B: определение последовательности позволяет идентифицировать общий мотив распознавания РНК». EMBO J. 9 (9): 2783–90. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07466.x. ЧВК  551988. PMID  2390971.
• Хау Дж. Г., Херши Дж. В. (1984). «Фактор инициации трансляции и ассоциация рибосом с фракцией каркаса цитоскелета из клеток HeLa». Клетка. 37 (1): 85–93. Дои:10.1016/0092-8674(84)90303-9. PMID  6722878.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Méthot N, Pause A, Hershey JW, Sonenberg N (1994). «Фактор инициации трансляции eIF-4B содержит РНК-связывающую область, которая отличается и независима от его консенсусной последовательности рибонуклеопротеина». Мол. Клетка. Биол. 14 (4): 2307–16. Дои:10.1128 / mcb.14.4.2307. ЧВК  358597. PMID  8139536.
• Наранда Т., Стронг В.Б., Меная Дж., Фаббри Б.Дж., Херши Дж. В. (1994). «Два структурных домена фактора инициации eIF-4B участвуют в связывании с РНК». J. Biol. Chem. 269 (20): 14465–72. PMID  8182051.
• Méthot N, Song MS, Sonenberg N (1996). «Область, богатая аспарагиновой кислотой, аргинином, тирозином и глицином (DRYG), опосредует самоассоциацию эукариотического фактора инициации 4B (eIF4B) и взаимодействие с eIF3». Мол. Клетка. Биол. 16 (10): 5328–34. Дои:10.1128 / MCB.16.10.5328. ЧВК  231531. PMID  8816444.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Рихтер, штат Нью-Джерси, Роджерс Г.В., Хенсолд Д.О., Меррик В.К. (1999). «Дальнейшая биохимическая и кинетическая характеристика фактора инициации эукариот человека 4H». J. Biol. Chem. 274 (50): 35415–24. Дои:10.1074 / jbc.274.50.35415. PMID  10585411.
• Бушелл М., Вуд В., Клеменс М.Дж., Морли С.Дж. (2000). «Изменения в целостности и ассоциации факторов инициации синтеза белка эукариот во время апоптоза». Евро. J. Biochem. 267 (4): 1083–91. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01101.x. PMID  10672017.
• Бушелл М., Вуд В., Карпентер Г., Пейн В.М., Морли С.Дж., Клеменс М.Дж. (2001). «Нарушение взаимодействия эукариотического фактора инициации синтеза белка 4B с поли (A) -связывающим белком путем расщепления, опосредованного каспазой и вирусной протеазой». J. Biol. Chem. 276 (26): 23922–8. Дои:10.1074 / jbc.M100384200. PMID  11274152.
• Флеминг К., Гуман Дж., Юан Х, Симпсон П., Сендрой А., Мэтьюз С., Карри С. (2003). «Структура раствора и взаимодействия РНК мотива распознавания РНК от фактора инициации трансляции эукариот 4B». Биохимия. 42 (30): 8966–75. Дои:10.1021 / bi034506g. PMID  12885229.
• Рот Б., Пейретти Ф., Гинграс А.С., Ливингстон М., Шахбазиан Д., Майер Г.Л., Полакевич Р.Д., Соненберг Н., Херши Дж. В. (2004). «Фосфорилирование эукариотического фактора инициации трансляции 4B Ser422 модулируется киназами S6». EMBO J. 23 (8): 1761–9. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600193. ЧВК  394247. PMID  15071500.
• Doepker RC, Hsu WL, Saffran HA, Smiley JR (2004). «Белок отключения хозяина вириона вируса простого герпеса стимулируется факторами инициации трансляции eIF4B и eIF4H». Дж. Вирол. 78 (9): 4684–99. Дои:10.1128 / JVI.78.9.4684-4699.2004. ЧВК  387725. PMID  15078951.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Шахбазян Д., Ру П.П., Мьё В., Коэн М.С., Рот Б., Тонтон Дж., Херши Дж. В., Бленис Дж., Пенде М., Соненберг Н. (2006). «Пути mTOR / PI3K и MAPK сходятся на eIF4B, чтобы контролировать его фосфорилирование и активность». EMBO J. 25 (12): 2781–91. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601166. ЧВК  1500846. PMID  16763566.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.