MRPS12 - MRPS12

MRPS12
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPS12, MPR-S12, MT-RPS12, RPMS12, RPS12, RPSM12, митохондриальный рибосомный белок S12
Внешние идентификаторы	OMIM: 603021 MGI: 1346333 ГомолоГен: 6848 Генные карты: MRPS12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начните 38,930,548 бп[1] Конец 38,933,162 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B1 Начните 28,739,641 бп[2] Конец 28,741,820 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • структурная составляющая рибосомы Сотовый компонент • малая рибосомная субъединица • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • внутриклеточный • митохондриальная рибосома • митохондрия • митохондриальная малая рибосомная субъединица Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • биосинтез белка • митохондриальный перевод Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6183	24030
Ансамбль	ENSG00000283018 ENSG00000128626	ENSMUSG00000045948
UniProt	O15235	O35680
RefSeq (мРНК)	NM_033363 NM_021107 NM_033362	NM_011885 NM_001360250 NM_001360252 NM_001360254
RefSeq (белок)	NP_066930 NP_203526 NP_203527	NP_036015 NP_001347179 NP_001347181 NP_001347183
Расположение (UCSC)	Chr 19: 38.93 - 38.93 Мб	Chr 7: 28.74 - 28.74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

28S рибосомный белок S12, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPS12 ген.^[5][6][7]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшого 28S субъединица и большая субъединица 39S. По оценкам, у них 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 28S, принадлежащий к рибосомальный белок Семейство S12P. Кодируемый белок является ключевым компонентом малой субъединицы рибосомы и контролирует точность декодирования и восприимчивость к аминогликозидные антибиотики. Ген митохондрий серил -тРНК синтетаза расположен выше этого гена и рядом с ним, и оба гена являются возможными кандидатами на роль гена аутосомно-доминантной глухоты (DFNA4). Варианты сращивания которые отличаются 5'-UTR, были обнаружены для этого гена; все три варианта кодируют один и тот же белок.^[7]

использованная литература

1. ENSG00000128626 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000283018, ENSG00000128626 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045948 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шах Ж., Миглиози В., Миллер С.К., Ван А., Фридман Т.Б., Джейкобс Х.Т. (июнь 1998 г.). «Хромосомные местоположения трех ядерных генов человека (RPSM12, TUFM и AFG3L1), определяющих предполагаемые компоненты аппарата экспрессии митохондриальных генов». Геномика. 48 (3): 384–8. Дои:10.1006 / geno.1997.5166. PMID  9545647.
6. Джонсон Д.Ф., Хамон М., Фишель-Годсиан Н. (декабрь 1998 г.). «Характеристика человеческого митохондриального рибосомного гена S12». Геномика. 52 (3): 363–8. Дои:10.1006 / geno.1998.5448. PMID  9790755.
7. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок MRPS12 S12».

дальнейшее чтение

• Шах З.Х., О'Делл К.М., Миллер С.К. и др. (1998). «Ядерные гены Metazoan миторибосомного белка S12». Ген. 204 (1–2): 55–62. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00521-0. PMID  9434165.
• Мариоттини П., Шах Ж., Тойвонен Дж. М. и др. (1999). «Экспрессия гена миторибосомного белка S12 контролируется в клетках человека на уровнях транскрипции, сплайсинга РНК и трансляции». J. Biol. Chem. 274 (45): 31853–62. Дои:10.1074 / jbc.274.45.31853. PMID  10542210.
• Кавдар Коч Э., Беркхарт В., Блэкберн К. и др. (2001). «Маленькая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация полного набора присутствующих рибосомных белков» (PDF). J. Biol. Chem. 276 (22): 19363–74. Дои:10.1074 / jbc.M100727200. PMID  11279123. S2CID  26254238.
• Сузуки Т., Терасаки М., Такемото-Хори С. и др. (2001). «Протеомный анализ митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация белковых компонентов в малой субъединице 28 S». J. Biol. Chem. 276 (35): 33181–95. Дои:10.1074 / jbc.M103236200. PMID  11402041.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Цуй Ю.П., Ван Дж. Б., Чжан XY и др. (2003). «Использование дрожжевой двухгибридной системы для идентификации белков, связанных с ECRG2, и их возможных взаимодействий с геном ECRG2». Мир J. Гастроэнтерол. 9 (9): 1892–6. Дои:10.3748 / wjg.v9.i9.1892. ЧВК  4656638. PMID  12970870.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.