EIF4G3 - EIF4G3

EIF4G3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1HU3
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF4G3, eIF-4G 3, eIF4G 3, eIF4GII, фактор инициации трансляции эукариот 4 гамма 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 603929 MGI: 1923935 ГомолоГен: 2789 Генные карты: EIF4G3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.12 Начните 20,806,292 бп[1] Конец 21,176,888 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D3 Начните 137,993,022 бп[2] Конец 138,208,508 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание кэп-РНК • активность фактора трансляции, связывание РНК • активность фактора инициации трансляции • Связывание РНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание мРНК Сотовый компонент • цитозоль • комплекс фактора инициации трансляции эукариот 4F Биологический процесс • трансляционная инициация • GO: 0022415 вирусный процесс • биосинтез белка • регулирование перевода • регулирование инициации трансляции • отрицательная регуляция аутофагии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8672	230861
Ансамбль	ENSG00000075151	ENSMUSG00000028760
UniProt	O43432	Q80XI3
RefSeq (мРНК)	NM_001198801 NM_001198802 NM_001198803 NM_003760	NM_001256195 NM_001256198 NM_172703 NM_001355699 NM_001355700
RefSeq (белок)	NP_001185730 NP_001185731 NP_001185732 NP_003751	NP_001243124 NP_001243127 NP_766291 NP_001342628 NP_001342629 NP_001356059 NP_001356060
Расположение (UCSC)	Chr 1: 20.81 - 21.18 Мб	Chr 4: 137,99 - 138,21 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор инициации трансляции эукариот 4 гамма 3 это белок что у людей кодируется EIF4G3 ген.^[5][6] Ген кодирует белок, который функционирует в перевод помогая сборке рибосома на информационная РНК шаблон.^[7] Как ни странно, этот белок обычно называют eIF4GII, поскольку, хотя EIF4G3 является третьим геном, похожим на фактор инициации трансляции эукариот 4 гамма, секунда изоформа EIF4G2 не является активным фактором инициации трансляции.^[8]

Взаимодействия

EIF4G3 был показан взаимодействовать с участием PABPC1.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000075151 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028760 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гради А., Иматака Х., Свиткин Ю. В., Ром Э, Рот Б., Морино С., Соненберг Н. (январь 1998 г.). «Новый функциональный фактор инициации трансляции человеческих эукариот 4G». Мол. Cell. Биол. 18 (1): 334–42. Дои:10.1128 / mcb.18.1.334. ЧВК  121501. PMID  9418880.
6. «Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции EIF4G3, гамма, 3».
7. Gingras AC, Raught B, Sonenberg N (1999). «Факторы инициации eIF4: эффекторы рекрутирования мРНК в рибосомы и регуляторы трансляции». Анну. Преподобный Biochem. 68: 913–63. Дои:10.1146 / annurev.biochem.68.1.913. PMID  10872469.
8. Гради А, Иматака Х, Свиткин Ю. В., Ром Э, Рот Б., Морино С., Соненберг Н. (1998). «Новый функциональный фактор инициации трансляции человеческих эукариот 4G». Мол. Cell. Биол. 18 (1): 334–42. Дои:10.1128 / mcb.18.1.334. ЧВК  121501. PMID  9418880.
9. Иматака Х, Гради А, Зоненберг Н (декабрь 1998 г.). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции». EMBO J. 17 (24): 7480–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.24.7480. ЧВК  1171091. PMID  9857202.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Иматака Х, Гради А, Соненберг Н (1998). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции». EMBO J. 17 (24): 7480–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.24.7480. ЧВК  1171091. PMID  9857202.
• Pyronnet S, Imataka H, ​​Gingras AC, Fukunaga R, Hunter T, Sonenberg N (1999). «Человеческий фактор инициации трансляции эукариот 4G (eIF4G) рекрутирует mnk1 для фосфорилирования eIF4E». EMBO J. 18 (1): 270–9. Дои:10.1093 / emboj / 18.1.270. ЧВК  1171121. PMID  9878069.
• Waskiewicz AJ, Johnson JC, Penn B., Mahalingam M, Kimball SR, Cooper JA (1999). «Фосфорилирование кэп-связывающего белка фактора инициации трансляции эукариот 4E протеинкиназой Mnk1 in vivo». Мол. Cell. Биол. 19 (3): 1871–80. Дои:10.1128 / MCB.19.3.1871. ЧВК  83980. PMID  10022874.
• Диас Нето Э, Корреа Р., Верджовски-Алмейда С., Брионес М. Р., Нагаи М. А., Да Силва В., Заго М. А., Бордин С., Коста Ф. Ф., Голдман Г. Х., Карвалью А. Ф., Мацукума А., Байя Г. С., Симпсон Д. Г., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонженил К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Маркотриджиано Дж., Ломакин И.Б., Соненберг Н., Пестова Т.В., Hellen CU, Берли С.К. (2001). «Консервированный домен HEAT в eIF4G управляет сборкой механизма инициации трансляции». Мол. Ячейка. 7 (1): 193–203. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00167-8. PMID  11172724.
• Гради А., Свиткин Ю. В., Соммергрубер В., Иматака Н., Морино С., Скерн Т., Зоненберг Н. (2003). «Сайты расщепления протеиназой риновируса 2A человека в факторах инициации эукариот (eIF) 4GI и eIF4GII различаются». Дж. Вирол. 77 (8): 5026–9. Дои:10.1128 / JVI.77.8.5026-5029.2003. ЧВК  152112. PMID  12663812.
• Миура Т., Ширатори Ю., Шимма Н. (2003). «Резонансное определение каркаса человеческого фактора инициации трансляции эукариот 4E (eIF4E) в комплексе с 7-метилгуанозиндифосфатом (m7GDP) и 17-аминокислотным пептидом, полученным из eIF4GII человека». J. Biomol. ЯМР. 27 (3): 279–80. Дои:10.1023 / А: 1025442322316. PMID  12975586.
• Цинь Х, Рот Б., Соненберг Н., Гольдштейн Э. Г., Эдельман А. М. (2003). «Скрининг фосфорилирования определяет фактор инициации трансляции 4GII как внутриклеточную мишень для Ca (2 +) / кальмодулин-зависимой протеинкиназы I». J. Biol. Chem. 278 (49): 48570–9. Дои:10.1074 / jbc.M308781200. PMID  14507913.
• Гради А., Фогер Н., Стронг Р., Свиткин Ю. В., Зоненберг Н., Скерн Т., Белшем Г. Дж. (2004). «Расщепление эукариотического фактора инициации трансляции 4GII в клетках, инфицированных вирусом ящура: идентификация сайта расщепления L-протеазой in vitro». Дж. Вирол. 78 (7): 3271–8. Дои:10.1128 / JVI.78.7.3271-3278.2004. ЧВК  371048. PMID  15016848.
• Lejeune F, Ranganathan AC, Maquat LE (2004). «eIF4G необходим для первого раунда трансляции в клетках млекопитающих». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (10): 992–1000. Дои:10.1038 / nsmb824. PMID  15361857.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.