MRPS11 - MRPS11

MRPS11
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPS11, HCC-2, MRP-S11, S11mt, митохондриальный рибосомный белок S11
Внешние идентификаторы	OMIM: 611977 MGI: 1915244 ГомолоГен: 32554 Генные карты: MRPS11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q25.3 Начинать 88,467,453 бп[1] Конец 88,480,776 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 D2 Начинать 78,783,119 бп[2] Конец 78,792,989 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы • Связывание мРНК 5'-UTR • связывание малых рибосомных субъединиц рРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • митохондрия • митохондриальная малая рибосомная субъединица Биологический процесс • Ответ на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК • сборка малых субъединиц рибосом • созревание SSU-рРНК из транскрипта трицистронной рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • биосинтез белка • митохондриальный перевод Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64963	67994
Ансамбль	ENSG00000181991	ENSMUSG00000030611
UniProt	P82912	Q9DCA2
RefSeq (мРНК)	NM_022839 NM_176805 NM_001321970 NM_001321972 NM_001321973 NM_001321974 NM_001321976	NM_026498 NM_001360702
RefSeq (белок)	NP_001308899 NP_001308901 NP_001308902 NP_001308903 NP_001308905 NP_073750 NP_789775	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 15: 88.47 - 88.48 Мб	Chr 7: 78.78 - 78.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

28S рибосомный белок S11, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPS11 ген.^[5][6]

Функция

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшого 28S субъединица и большая субъединица 39S. По оценкам, у них 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 28S, который имеет высокий уровень сходства последовательностей с рибосомальный белок Члены семьи S11P.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000181991 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030611 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сузуки Т., Терасаки М., Такемото-Хори К., Ханада Т., Уэда Т., Вада А., Ватанабе К. (август 2001 г.). «Протеомный анализ митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация белковых компонентов в малой субъединице 28 S». J Biol Chem. 276 (35): 33181–95. Дои:10.1074 / jbc.M103236200. PMID  11402041.
6. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок MRPS11 S11».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Кавдар Коч Э., Беркхарт В., Блэкберн К. и др. (2001). «Маленькая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация полного набора присутствующих рибосомных белков». J. Biol. Chem. 276 (22): 19363–74. Дои:10.1074 / jbc.M100727200. PMID  11279123.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Исигучи Х., Изуми Х., Торигоэ Т. и др. (2004). «ZNF143 активирует экспрессию гена в ответ на повреждение ДНК и связывается с ДНК, модифицированной цисплатином». Int. J. Рак. 111 (6): 900–9. Дои:10.1002 / ijc.20358. PMID  15300802. S2CID  37308382.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P82912 (28S рибосомный белок S11, митохондриальный) на PDBe-KB.