MRPS17 - MRPS17

MRPS17
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPS17, HSPC011, MRP-S17, RPMS17, S17mt, митохондриальный рибосомный белок S17
Внешние идентификаторы	OMIM: 611980 MGI: 1913508 ГомолоГен: 9320 Генные карты: MRPS17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p11.2 Начинать 55,951,877 бп[1] Конец 55,956,500 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G1.3 Начинать 129,715,497 бп[2] Конец 129,722,556 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы • связывание рРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • внутриклеточный • митохондрия • митохондриальная малая рибосомная субъединица Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • биосинтез белка • митохондриальный перевод Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51373	66258
Ансамбль	ENSG00000239789	ENSMUSG00000034211
UniProt	Q9Y2R5	Q9CQE3
RefSeq (мРНК)	NM_015969	NM_025450
RefSeq (белок)	NP_057053	NP_079726 NP_001343883 NP_001343884 NP_001343885 NP_001343886 NP_001343887 NP_001343888
Расположение (UCSC)	Chr 7: 55.95 - 55.96 Мб	Chr 5: 129,72 - 129,72 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

28S рибосомный белок S17, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPS17 ген.^[5][6]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшого 28S субъединица и большая субъединица 39S. По оценкам, у них 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 28S, принадлежащий к рибосомальный белок Семейство S17P. Кодируемый белок является умеренно консервативным между митохондриальными и прокариотическими рибосомными белками человека. Псевдогены соответствующие этому гену обнаруживаются на хромосомах 1p, 3p, 6q, 14p, 18q и Xq.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000239789 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034211 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кавдар Коц Э, Буркхарт В., Блэкберн К., Мозли А., Спремулли Л.Л. (май 2001 г.). «Маленькая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация полного набора присутствующих рибосомных белков». J Biol Chem. 276 (22): 19363–74. Дои:10.1074 / jbc.M100727200. PMID  11279123.
6. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок MRPS17 S17».

дальнейшее чтение

• Мао М., Фу Дж., Ву Дж. С. и др. (1998). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих CD34 + гематопоэтических стволовых / клетках-предшественниках, с помощью тегов экспрессируемой последовательности и эффективного клонирования кДНК полной длины». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (14): 8175–80. Bibcode:1998ПНАС ... 95.8175М. Дои:10.1073 / пнас.95.14.8175. ЧВК  20949. PMID  9653160.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Сузуки Т., Терасаки М., Такемото-Хори С. и др. (2001). «Протеомный анализ митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация белковых компонентов в малой субъединице 28 S». J. Biol. Chem. 276 (35): 33181–95. Дои:10.1074 / jbc.M103236200. PMID  11402041.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.