RPS17 - RPS17

RPS17
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4UJE, 4D5L, 4UJD, 5FLX, 4D61, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS17, DBA4, RPS17L, RPS17L1, RPS17L2, S17, рибосомный белок S17
Внешние идентификаторы	OMIM: 180472 MGI: 1309526 ГомолоГен: 110867 Генные карты: RPS17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q25.2 Начните 82,536,750 бп[1] Конец 82,540,459 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 D3 Начните 81,342,732 бп[2] Конец 81,345,254 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы • Связывание РНК Сотовый компонент • цитозоль • рибосома • мембрана • очаговая адгезия • внутриклеточный • цитозольная малая рибосомная субъединица • внеклеточная экзосома • нуклеоплазма • внеклеточный матрикс • синапс Биологический процесс • вирусная транскрипция • SRP-зависимый котрансляционный белок, нацеленный на мембрану • гомеостаз эритроцитов • трансляционная инициация • сборка малых субъединиц рибосом • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, нонсенс-опосредованный распад • биогенез малых субъединиц рибосом • биосинтез белка • обработка рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6218	20068
Ансамбль	ENSG00000278229 ENSG00000182774	ENSMUSG00000061787
UniProt	P08708	P63276
RefSeq (мРНК)	NM_001021 NM_001199057	NM_009092
RefSeq (белок)	NP_001012	NP_033118
Расположение (UCSC)	Chr 15: 82,54 - 82,54 Мб	Chr 7: 81.34 - 81.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

40S рибосомный белок S17 это белок что у людей кодируется RPS17 ген.^[5][6][7]

Рибосомы, то органеллы это катализировать синтез белка, состоят из малая субъединица 40S и большая 60S субъединица. Вместе эти субъединицы состоят из 4 РНК видов и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок это компонент субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S17E. Он расположен в цитоплазма. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множество процессинговых псевдогены этого гена рассредоточены по геному.^[7]

Рекомендации

1. ENSG00000182774 GRCh38: Общий выпуск 89: ENSG00000278229, ENSG00000182774 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061787 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фео С., Дэвис Б., Фрид М. (июнь 1992 г.). «Картирование семи генов рибосомных белков, содержащих интроны, показывает, что они не связаны в геноме человека». Геномика. 13 (1): 201–7. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90221-Д. PMID  1577483.
6. Филипенко М.Л., Янцен Е.И., Муравлев А.И., Копанцев Е.П., Карпова Г.Г., Мертвецов Н.П. (октябрь 1995 г.). «[Картирование генов рибосомных белков S14 и S17 на хромосомах человека с использованием кДНК из панели гибридных клеток]». Биоорг Хим. 21 (5): 349–53. PMID  7661859.
7. «Ген Entrez: рибосомный белок S17 RPS17».

дальнейшее чтение

• Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Biochem. Cell Biol. 73 (11–12): 933–47. Дои:10.1139 / o95-101. PMID  8722009.
• Чен IT, Roufa DJ (1989). «Транскрипционно активный ген рибосомного белка человека S17». Ген. 70 (1): 107–16. Дои:10.1016/0378-1119(88)90109-6. PMID  3240863.
• Chen IT, Dixit A, Rhoads DD, Roufa DJ (1986). «Гомологичные рибосомные белки бактерий, дрожжей и человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (18): 6907–11. Bibcode:1986PNAS ... 83.6907C. Дои:10.1073 / пнас.83.18.6907. ЧВК  386619. PMID  3529092.
• Мундус Д.А., Булыгин К.Н., Ямковой В.И. и др. (1993). «Структурное расположение области взаимодействия кодон-антикодон в рибосомах плаценты человека. Аффинное мечение субъединиц 40S производными олигорибонуклеотидов, содержащих кодон AUG». Биохим. Биофиз. Acta. 1173 (3): 273–82. Дои:10.1016 / 0167-4781 (93) 90124-в. PMID  8318536.
• Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии». Евро. J. Biochem. 239 (1): 144–9. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x. PMID  8706699.
• Пател Х.Р., Терада Н., Гельфанд Э.В. (1996). «Чувствительное к рапамицину фосфорилирование рибосомного белка S17 киназой p70 S6». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 227 (2): 507–12. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1537. PMID  8878544.
• Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С. и др. (1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека». Genome Res. 8 (5): 509–23. Дои:10.1101 / гр. 8.5.509. PMID  9582194.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Ю Й, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ субъединицы рибосомы 40S человека: нативные и связанные с IRES комплексы HCV». Белковая наука. 14 (6): 1438–46. Дои:10.1110 / пс. 041293005. ЧВК  2253395. PMID  15883184.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись об анемии Даймонда-Блэкфана