MRPL39 - MRPL39

MRPL39
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J7Y, 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPL39, C21orf92, L39mt, MRP-L5, MRPL5, PRED22, PRED66, RPML5, MSTP003, митохондриальный рибосомный белок L39, L5mt
Внешние идентификаторы	OMIM: 611845 MGI: 1351620 ГомолоГен: 9679 Генные карты: MRPL39
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q21.3 Начинать 25,585,656 бп[1] Конец 25,607,517 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 C3.3 Начинать 84,717,576 бп[2] Конец 84,735,742 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • митохондриальная рибосома • митохондриальная большая рибосомная субъединица • митохондрия Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54148	27393
Ансамбль	ENSG00000154719	ENSMUSG00000022889
UniProt	Q9NYK5	Q9JKF7
RefSeq (мРНК)	NM_017446 NM_080794	NM_017404 NM_001384093 NM_001384095 NM_001384096
RefSeq (белок)	NP_059142 NP_542984	NP_059100 NP_001371022 NP_001371024 NP_001371025
Расположение (UCSC)	Chr 21: 25.59 - 25.61 Мб	Chr 16: 84,72 - 84,74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

39S рибосомный белок L39, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPL39 ген.^[5][6]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой 28S-субъединицы и большой 39S-субъединицы. У них примерно 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 39S. Два варианты расшифровки кодирование различных изоформы были описаны. А псевдоген соответствующий этому гену находится на хромосоме 5q.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154719 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022889 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кенмоти Н., Судзуки Т., Уэчи Т., Магури М., Куниба М., Хига С., Ватанабе К., Танака Т. (сентябрь 2001 г.). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
6. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок L39 MRPL39».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• О'Брайен Т.В., Фислер С.Е., Денслоу Н.Д. и др. (2000). «Митохондриальные рибосомные белки млекопитающих (2). Аминокислотное секвенирование, характеристика и идентификация соответствующих последовательностей генов». J. Biol. Chem. 274 (51): 36043–51. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36043. PMID  10593885.
• Спирина О., Быховская Ю., Каява А.В. и др. (2001). «Сердечно-специфический сплайсинг-вариант митохондриального рибосомного белка человека (обработка мРНК; тканеспецифический сплайсинг)». Ген. 261 (2): 229–34. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00504-7. PMID  11167009.
• О'Брайен Т.В. (2002). «Эволюция богатой белком митохондриальной рибосомы: последствия для генетических заболеваний человека». Ген. 286 (1): 73–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00808-3. PMID  11943462.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.