EIF1 - EIF1

EIF1
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2IF1, 4KZX, 4KZY
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF1, A121, EIF-1, EIF1A, ISO1, SUI1, эукариотический фактор инициации трансляции 1, эукариотический фактор инициации 1
Внешние идентификаторы	ГомолоГен: 130538 Генные карты: EIF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.2 Начинать 41,688,885 бп[1] Конец 41,692,668 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора трансляции, связывание РНК • активность фактора инициации трансляции • Связывание РНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание малых субъединиц рибосом Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • эукариотический преинициативный комплекс 43S Биологический процесс • трансляционная инициация • реакция на стресс • дозовая компенсация за счет инактивации Х-хромосомы • биосинтез белка • регулирование инициации трансляции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10209	н / д
Ансамбль	ENSG00000173812	н / д
UniProt	P41567	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_005801	н / д
RefSeq (белок)	NP_005792	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 17: 41.69 - 41.69 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Фактор инициации трансляции эукариот 1 (eIF1) это белок что у людей кодируется EIF1 ген. Это связано с дрожжами SUI1.^[3][4][5]

eIF1 взаимодействует с эукариотическим малым (40S ) субъединица рибосомы и eIF3, и является компонентом преинициативного комплекса 43S (PIC).^[6] eIF1 и eIF1A кооперативно связываются с 40S, чтобы стабилизировать «открытую» конформацию преинициативного комплекса (PIC) во время эукариотический перевод инициация.^[6] eIF1 связывается с областью около рибосомного Сайт в субъединице 40S и функционирует аналогично структурно родственному бактериальному аналогу IF1.^[7]

Структура

eIF1 - это консервативный белок трансляции во всех эукариотических клетках, который отвечает за исследование несовпадений кодонов и антикодонов во время инициации трансляции. Для определения структуры человеческого eIF1 с помощью ЯМР-спектроскопии проводят эксперимент с N-концевой меткой His и eIF1. Ученые обнаружили сайт связывания, генерируя мутацию дрожжей, и изучили соседние консервативные остатки, расположенные в том же регионе. Эксперименты GST pull-down показали, что eIF1 связывается именно с субъединицей p110 eIF3, что объясняет рекрутирование eIF1. ^[8]

Функция

Функция eIf1 имеет несколько скрытых аспектов. Однако во всех эукариотических клетках инициация трансляции мРНК начинается со сканирования рибосомных преинициативных комплексов 43S, начиная с 5 ’конца мРНК. Далее, индукция через eIF1 и eIF1A необходима для выявления конформации субъединицы 40S, чтобы индуцировать DEAD-бокс-РНК-геликазу eIF4A, ее кофактор eIF4B и активность eIF4G.^[9]   

Смотрите также

• Факторы инициации эукариот^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173812 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Филдс С., Адамс, доктор медицины (январь 1994 г.). «Экспрессированные теги последовательностей идентифицируют человеческий изолог индивидуального фактора инициации трансляции». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 198 (1): 288–91. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1040. PMID  7904817.
4. Шейх М.С., Фернандес-Салас Э., Ю М., Хуссейн А., Динман Дж. Д., Пельц С.В., Хуанг Ю., Форнас А.Дж. (июнь 1999 г.). «Клонирование и характеристика человеческой генотоксической и индуцируемой стрессом эндоплазматического ретикулума кДНК, которая кодирует фактор инициации трансляции 1 (eIF1 (A121 / SUI1))». Журнал биологической химии. 274 (23): 16487–93. Дои:10.1074 / jbc.274.23.16487. PMID  10347211.
5. «Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции 1 EIF1».
6. Эйткен К.Э., Лорш-младший (июнь 2012 г.). «Механистический обзор инициации трансляции у эукариот». Структурная и молекулярная биология природы. 19 (6): 568–76. Дои:10.1038 / nsmb.2303. PMID  22664984. S2CID  9201095.
7. Fraser CS (июль 2015 г.). «Количественные исследования рекрутирования мРНК на рибосому эукариот». Биохимия. 114: 58–71. Дои:10.1016 / j.biochi.2015.02.017. ЧВК  4458453. PMID  25742741.
8. Флетчер CM, Пестова Т.В., Hellen CU, Wagner G (май 1999 г.). «Структура и взаимодействие фактора инициации трансляции eIF1». Журнал EMBO. 18 (9): 2631–7. Дои:10.1093 / emboj / 18.9.2631. ЧВК  1171342. PMID  10228174.
9. Джексон Р.Дж., Хеллен К.Ю., Пестова Т.В. (февраль 2010 г.). «Механизм инициации эукариотической трансляции и принципы его регуляции». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 11 (2): 113–27. Дои:10.1038 / nrm2838. ЧВК  4461372. PMID  20094052.
10. «EIF1 - фактор инициации трансляции 1 эукариот - Homo sapiens (человек) - ген и белок EIF1». www.uniprot.org. Получено 2018-09-23.

дальнейшее чтение

• Lian Z, Pan J, Liu J, Zhang S, Zhu M, Arbuthnot P, Kew M, Feitelson MA (март 1999 г.). «Фактор инициации трансляции, hu-Sui1, может быть мишенью антигена гепатита B X в гепатоканцерогенезе». Онкоген. 18 (9): 1677–87. Дои:10.1038 / sj.onc.1202470. PMID  10208429. S2CID  22809502.
• Флетчер CM, Пестова Т.В., Hellen CU, Wagner G (май 1999 г.). «Структура и взаимодействие фактора инициации трансляции eIF1». Журнал EMBO. 18 (9): 2631–7. Дои:10.1093 / emboj / 18.9.2631. ЧВК  1171342. PMID  10228174.
• Чин Л.С., Сингх С.К., Ван К., Мюррей С.Ф. (2000). «Идентификация генов, индуцированных окадаиновой кислотой, путем дифференциального отображения мРНК в клетках глиомы». Журнал биомедицинских наук. 7 (2): 152–9. Дои:10.1007 / BF02256622. PMID  10754390.
• Mendell JT, Medghalchi SM, Lake RG, Noensie EN, Dietz HC (декабрь 2000 г.). «Новые ортологи Upf2p предполагают функциональную связь между инициацией трансляции и бессмысленными комплексами наблюдения». Молекулярная и клеточная биология. 20 (23): 8944–57. Дои:10.1128 / MCB.20.23.8944-8957.2000. ЧВК  86549. PMID  11073994.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.

внешняя ссылка

• EIF1 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• EIF1 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• Начало трансляции, зависящее от кэпа от Nature Reviews Microbiology. Хорошее изображение и обзор функции факторов инициирования
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P41567 (Фактор инициации трансляции эукариот 1) на PDBe-KB.