RPS15 - RPS15

RPS15
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX, 3J7R, 4D61, 4UJC, 4D5L, 4UJE, 3J7P, 4V5Z, 4UJD
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS15, RIG, S15, рибосомный белок S15
Внешние идентификаторы	OMIM: 180535 MGI: 98117 ГомолоГен: 110643 Генные карты: RPS15
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начинать 1,438,358 бп[1] Конец 1,440,494 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 C1 Начинать 80,292,453 бп[2] Конец 80,294,114 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • структурная составляющая рибосомы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитозоль • рибосома • мембрана • очаговая адгезия • цитозольная малая рибосомная субъединица • малая рибосомная субъединица • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • экспорт малой субъединицы рибосомы из ядра • вирусная транскрипция • SRP-зависимый котрансляционный белок, нацеленный на мембрану • дифференцировка остеобластов • трансляционная инициация • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, нонсенс-опосредованный распад • биогенез малых субъединиц рибосом • сборка малых субъединиц рибосом • биосинтез белка • обработка рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6209	20054
Ансамбль	ENSG00000115268	ENSMUSG00000063457
UniProt	P62841	P62843
RefSeq (мРНК)	NM_001018 NM_001308226	NM_009091 NM_001310726
RefSeq (белок)	NP_001009 NP_001295155	NP_001297655 NP_033117
Расположение (UCSC)	Chr 19: 1.44 - 1.44 Мб	Chr 10: 80.29 - 80.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

40S рибосомный белок S15 это белок что у людей кодируется RPS15 ген.^[5][6]

Рибосомы, то органеллы который катализировать синтез белка, состоят из малая субъединица 40S и большая субъединица 60S. Вместе эти субъединицы состоят из 4 РНК видов и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок это компонент субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S19P. Он расположен в цитоплазма. Было обнаружено, что этот ген активируется в различных опухолях, таких как инсулиномы, рак пищевода, и рак толстой кишки. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множество процессинговых псевдогены этого гена рассредоточены по геному.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115268 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063457 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сига К., Ямамото Х., Окамото Х. (июнь 1990 г.). «Выделение и характеристика человеческого гомолога rig и его псевдогенов: функциональный ген имеет особенности, характерные для генов домашнего хозяйства». Proc Natl Acad Sci U S A. 87 (9): 3594–8. Дои:10.1073 / pnas.87.9.3594. ЧВК  53948. PMID  2159154.
6. «Ген Entrez: рибосомный белок S15 RPS15».

дальнейшее чтение

• Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Biochem. Cell Biol. 73 (11–12): 933–47. Дои:10.1139 / o95-101. PMID  8722009.
• Китагава М., Такасава С., Кикучи Н. и др. (1991). «rig кодирует рибосомный белок S15. Первичная структура рибосомного белка S15 млекопитающих». FEBS Lett. 283 (2): 210–4. Дои:10.1016 / 0014-5793 (91) 80590-У. PMID  2044758. S2CID  2687455.
• Иноуэ С., Сига К., Такасава С. и др. (1987). «Эволюционная консервация гена инсулиномы и его возможная функция». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (19): 6659–62. Дои:10.1073 / пнас.84.19.6659. ЧВК  299142. PMID  2821540.
• Марион MJ, Мэрион C (1988). «Рибосомные белки S2, S6, S10, S14, S15 и S25 локализуются на поверхности 40 S субъединиц млекопитающих и стабилизируют их конформацию. Исследование с иммобилизованным трипсином». FEBS Lett. 232 (2): 281–5. Дои:10.1016/0014-5793(88)80753-1. PMID  3378620. S2CID  44333810.
• Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии». Евро. J. Biochem. 239 (1): 144–9. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x. PMID  8706699.
• Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С. и др. (1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека». Genome Res. 8 (5): 509–23. Дои:10.1101 / гр. 8.5.509. PMID  9582194.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ю Й, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ субъединицы рибосомы 40S человека: нативные и связанные с IRES комплексы HCV». Белковая наука. 14 (6): 1438–46. Дои:10.1110 / пс. 041293005. ЧВК  2253395. PMID  15883184.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого рибосомного белка 40S S15