MRPS22 - MRPS22

MRPS22
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPS22, C3orf5, COXPD5, GIBT, MRP-S22, RPMS22, GK002, митохондриальный рибосомный белок S22, ODG7
Внешние идентификаторы	OMIM: 605810 MGI: 1928137 ГомолоГен: 57030 Генные карты: MRPS22
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q23 Начинать 139,005,806 бп[1] Конец 139,357,223 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 E3.3 Начинать 98,588,730 бп[2] Конец 98,601,660 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • митохондриальная рибосома • митохондрия • митохондриальная малая рибосомная субъединица Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	56945	64655
Ансамбль	ENSG00000175110	ENSMUSG00000032459
UniProt	P82650	Q9CXW2
RefSeq (мРНК)	NM_020191 NM_001363857 NM_001363893	NM_025485
RefSeq (белок)	NP_064576 NP_001350786 NP_001350822	NP_079761
Расположение (UCSC)	Chr 3: 139.01 - 139.36 Мб	Chr 9: 98,59 - 98,6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

28S рибосомный белок S22, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPS22 ген.^[5][6]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшого 28S субъединица и большая субъединица 39S. У них примерно 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 28S, который, по-видимому, не имеет аналогов в прокариотических и митохондриальных рибосомах грибов. Этот ген лежит теломерный из и транскрибируется в противоположном направлении от вилочный ящик L2 ген. А псевдоген соответствующий этому гену находится на хромосоме Xq.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175110 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032459 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Crisponi L, Deiana M, Loi A, Chiappe F, Uda M, Amati P, Bisceglia L, Zelante L, Nagaraja R, Porcu S, Ristaldi MS, Marzella R, Rocchi M, Nicolino M, Lienhardt-Roussie A, Nivelon A, Verloes A, Schlessinger D, Gasparini P, Bonneau D, Cao A, Pilia G (февраль 2001 г.). «Предполагаемый фактор транскрипции вилки FOXL2 мутировал при синдроме блефарофимоза / птоза / обратного эпиканта». Нат Жене. 27 (2): 159–66. Дои:10.1038/84781. PMID  11175783. S2CID  26750194.
6. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок MRPS22 S22».

дальнейшее чтение

• Koc EC, Burkhart W., Blackburn K, et al. (2000). «Протеомический подход к идентификации рибосомных белков малых субъединиц митохондрий млекопитающих». J. Biol. Chem. 275 (42): 32585–91. Дои:10.1074 / jbc.M003596200. PMID  10938081.
• Кавдар Коч Э., Беркхарт В., Блэкберн К. и др. (2001). «Маленькая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация полного набора присутствующих рибосомных белков». J. Biol. Chem. 276 (22): 19363–74. Дои:10.1074 / jbc.M100727200. PMID  11279123.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Криспони Л., Уда М., Дейана М. и др. (2004). «Инактивация FOXL2 посредством транслокации на расстоянии 171 т.п.н.: анализ 500 т.п.н. хромосомы 3 на предмет возможных регуляторных последовательностей дальнего действия». Геномика. 83 (5): 757–64. Дои:10.1016 / j.ygeno.2003.11.010. PMID  15081106.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Гуо Д., Хан Дж., Адам Б.Л. и др. (2005). «Протеомный анализ субстратов SUMO4 в клетках HEK293 в условиях стресса, вызванного сывороточным голоданием». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 337 (4): 1308–18. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID  16236267.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.