MRPL22 - MRPL22

MRPL22
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J7Y
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPL22, L22mt, MRP-L22, MRP-L25, RPML25, HSPC158, митохондриальный рибосомный белок L22
Внешние идентификаторы	OMIM: 611835 MGI: 1333794 ГомолоГен: 56664 Генные карты: MRPL22
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q33.2 Начинать 154,941,073 бп[1] Конец 154,969,411 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начинать 58,171,661 бп[2] Конец 58,179,565 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • большая рибосомная субъединица • рибосома • митохондрия • митохондриальная большая рибосомная субъединица Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • биосинтез белка • сборка рибосом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	29093	216767
Ансамбль	ENSG00000082515	ENSMUSG00000020514
UniProt	Q9NWU5	Q8BU88
RefSeq (мРНК)	NM_014180 NM_001014990	NM_175001
RefSeq (белок)	NP_001014990 NP_054899	NP_778166
Расположение (UCSC)	Chr 5: 154.94 - 154.97 Мб	Chr 11: 58.17 - 58.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

39S рибосомный белок L22, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPL22 ген.^[5]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой 28S-субъединицы и большой 39S-субъединицы. У них примерно 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 39S, который принадлежит к семейству рибосомных белков L22. А псевдоген соответствующий этому гену находится на хромосоме 4q. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000082515 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020514 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок L22 MRPL22».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Goldschmidt-Reisin S, Kitakawa M, Herfurth E, et al. (1999). «Митохондриальные рибосомные белки млекопитающих. Секвенирование N-концевой аминокислоты, характеристика и идентификация соответствующих генных последовательностей». J. Biol. Chem. 273 (52): 34828–36. Дои:10.1074 / jbc.273.52.34828. PMID  9857009.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Koc EC, Burkhart W., Blackburn K, et al. (2001). «Большая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Анализ набора присутствующих рибосомных белков». J. Biol. Chem. 276 (47): 43958–69. Дои:10.1074 / jbc.M106510200. PMID  11551941.
• О'Брайен Т.В. (2002). «Эволюция богатой белком митохондриальной рибосомы: последствия для генетических заболеваний человека». Ген. 286 (1): 73–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00808-3. PMID  11943462.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.