EHMT2 - EHMT2

EHMT2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2O8J, 3DM1, 3K5K, 3RJW, 4NVQ, 5JJ0, 5JHN, 5JIN
Идентификаторы
Псевдонимы	EHMT2, BAT8, C6orf30, G9A, GAT8, KMT1C, NG36, эухроматический гистон-лизинметилтрансфераза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 604599 MGI: 2148922 ГомолоГен: 48460 Генные карты: EHMT2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.33 Начните 31,879,759 бп[1] Конец 31,897,687 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 B1 | 17 18,45 см Начните 34,898,469 бп[2] Конец 34,914,052 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность метилтрансферазы • трансферазная активность • гистон-метилтрансферазная активность (специфическая для H3-K9) • промотор-специфическое связывание хроматина • связывание ионов цинка • Связывание с доменом цинкового пальца C2H2 • активность гистон-лизин N-метилтрансферазы • связывание ионов металлов • активность гистонметилтрансферазы (специфическая для H3-K27) • протеин-лизин-N-метилтрансферазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание p53 Сотовый компонент • нуклеоплазма • хромосома • ядерный хроматин • ядро клетки • ядерное пятнышко Биологический процесс • регулирование репликации ДНК • клеточный ответ на голодание • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Метилирование ДНК • метилирование • диметилирование пептидил-лизина • метилирование гистонового лизина • метилирование гистонов • метилирование гистона H3-K27 • метилирование гистона H3-K9 • отрицательное регулирование перехода G0 на G1 • организация хроматина • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10919	110147
Ансамбль	ENSG00000238134 ENSG00000224143 ENSG00000206376 ENSG00000204371 ENSG00000227333 ENSG00000232045 ENSG00000236759	ENSMUSG00000013787
UniProt	Q96KQ7	Q9Z148
RefSeq (мРНК)	NM_001289413 NM_006709 NM_025256 NM_001318833 NM_001363689	NM_001286573 NM_001286575 NM_145830 NM_147151
RefSeq (белок)	NP_001276342 NP_001305762 NP_006700 NP_079532 NP_001350618	NP_001273502 NP_001273504 NP_665829 NP_671493
Расположение (UCSC)	Chr 6: 31,88 - 31,9 Мб	Chr 17: 34.9 - 34.91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эухроматическая гистон-лизин-N-метилтрансфераза 2 (EHMT2), также известен как G9a, это гистон-метилтрансфераза фермент что у людей кодируется EHMT2 ген.^[5][6][7] G9a катализирует моно- и диметилированное состояние гистон H3 в лизин остаток 9 (т.е. H3K9me1 и H3K9me2 ) и остаток лизина 27 (H3K27me1 и HeK27me2 ).^[8][9]

Функция

Кластер генов BAT1-BAT5 локализован рядом с генами TNF-альфа и TNF-бета. Этот ген находится рядом с этим кластером; он был нанесен на карту рядом с геном C2 в области размером 120 т.п.н., включающей пару генов HSP70. Все эти гены находятся в области класса III главного комплекса гистосовместимости человека. Считалось, что этот ген представляет собой два разных гена, NG36 и G9a, соседних друг с другом, но недавняя публикация показывает, что существует только один ген. Считается, что белок, кодируемый этим геном, участвует во внутриклеточном белок-белковом взаимодействии. Есть три альтернативно сплайсированных варианта транскрипта этого гена, но только два полностью описаны.^[7]

G9a и G9a-подобный белок, другая гистон-лизин-N-метилтрансфераза, катализируют синтез H3K9me2, который является репрессивный отметка.^[8][9][10] G9a - важный механизм контроля эпигенетическая регуляция в пределах прилежащее ядро (NAcc);^[11] снижение экспрессии G9a в NAcc играет центральную роль в опосредовании развития зависимость.^[11] G9a выступает против увеличения ΔFosB выражение через H3K9me2 и подавляется ΔFosB.^[11][12] G9a оказывает эффект, противоположный эффекту ΔFosB, на поведение, связанное с наркотиками (например, самоуправление ) и синаптическое ремоделирование (например, дендритное ветвление - разработка дополнительных древовидных дендритные ветви и шипы ) в прилежащем ядре и, следовательно, противодействует функции ΔFosB, а также увеличивает ее экспрессию.^[11] G9a и ΔFosB имеют много общих генов-мишеней.^[13] Помимо своей роли в прилежащем ядре, G9a играет критическую роль в развитии и поддержании нейропатической боли.^[14][15] После повреждения периферического нерва G9a регулирует экспрессию +600 генов в ганглиях задних корешков. Это транскриптомное изменение перепрограммирует сенсорные нейроны в состояние повышенной возбудимости, приводящее к повышенной чувствительности к механической боли. ^[14]

Взаимодействия

EHMT2 был показан взаимодействовать с участием KIAA0515 и гомеодоменный белок NKX3.1, связанный с тканью простаты.^[16][17]

использованная литература

1. ENSG00000224143, ENSG00000206376, ENSG00000204371, ENSG00000227333, ENSG00000232045, ENSG00000236759 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000238134, ENSG0037000224143, ENSG3000, ENSG2000, ENSG4000224206 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013787 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Милнер CM, Кэмпбелл RD (март 1993 г.). «Ген G9a в главном комплексе гистосовместимости человека кодирует новый белок, содержащий анкириноподобные повторы». Биохимический журнал. 290 (Пт 3): 811–8. Дои:10.1042 / bj2900811. ЧВК  1132354. PMID  8457211.
6. Татибана М., Сугимото К., Фукусима Т., Синкай Ю. (июль 2001 г.). «Белок, содержащий заданный домен, G9a, представляет собой новую предпочитающую лизин гистон-метилтрансферазу млекопитающих с гиперактивностью и специфической селективностью к лизинам 9 и 27 гистона H3». Журнал биологической химии. 276 (27): 25309–17. Дои:10.1074 / jbc.M101914200. PMID  11316813.
7. «Ген Entrez: EHMT2 эухроматическая гистон-лизин-N-метилтрансфераза 2».
8. Нестлер EJ (август 2015 г.). Роль схемы вознаграждения мозга в депрессии: механизмы транскрипции. Международный обзор нейробиологии. 124. С. 151–70. Дои:10.1016 / bs.irn.2015.07.003. ISBN  9780128015834. ЧВК  4690450. PMID  26472529.
9. «Гистон-лизин-N-метилтрансфераза, H3-лизин-9-специфическая 3». HIstome: информационная база по гистонам. Получено 8 июн 2018.
10. «Гистон-лизин-N-метилтрансфераза, H3-лизин-9 специфическая 5». HIstome: информационная база по гистонам. Получено 8 июн 2018.
11. Нестлер EJ (январь 2014 г.). «Эпигенетические механизмы наркомании». Нейрофармакология. 76 (Pt B): 259–68. Дои:10.1016 / j.neuropharm.2013.04.004. ЧВК  3766384. PMID  23643695.
12. Уолли К. (декабрь 2014 г.). «Психиатрические расстройства: подвиг эпигенетической инженерии». Обзоры природы. Неврология. 15 (12): 768–9. Дои:10.1038 / номер 3869. PMID  25409693. S2CID  11513288.
13. Робисон А.Дж., Нестлер Э.Дж. (октябрь 2011 г.). «Транскрипционные и эпигенетические механизмы зависимости». Обзоры природы. Неврология. 12 (11): 623–37. Дои:10.1038 / nrn3111. ЧВК  3272277. PMID  21989194.
    Рисунок 4: Эпигенетическая основа лекарственной регуляции экспрессии генов
14. Лаумет, Жоффруа (2015). «G9a необходим для эпигенетического подавления генов К + каналов при переходе от острой боли к хронической». Природа Неврология. 18 (12): 1746–1755. Дои:10.1038 / № 4165. ЧВК  4661086. PMID  26551542.
15. Лян, Лингли (2016). «G9a участвует в индуцированном повреждением нерва подавлении Kcna2 в первичных сенсорных нейронах». Научные отчеты. 6: 37704. Bibcode:2016НатСР ... 637704Л. Дои:10.1038 / srep37704. ЧВК  5118693. PMID  27874088.
16. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
17. Датта А. и др. (Июнь 2016). «Идентификация транскрипционной регуляторной сети NKX3.1-G9a-UTY, которая контролирует дифференцировку простаты». Наука. 352 (6293): 1576–80. Bibcode:2016Научный ... 352.1576D. Дои:10.1126 / science.aad9512. ЧВК  5507586. PMID  27339988.

дальнейшее чтение

• Шпионы Т., Бреснахан М., Строминджер Дж. Л. (ноябрь 1989 г.). «Главный комплекс гистосовместимости человека содержит минимум 19 генов между кластером комплемента и HLA-B». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (22): 8955–8. Bibcode:1989PNAS ... 86.8955S. Дои:10.1073 / pnas.86.22.8955. ЧВК  298409. PMID  2813433.
• Браун С.Е., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон С.М. (декабрь 2001 г.). «Новые генные продукты NG36 / G9a, кодируемые в областях MHC класса III человека и мыши». Геном млекопитающих. 12 (12): 916–24. Дои:10.1007 / s00335-001-3029-3. PMID  11707778. S2CID  9510386.
• Огава Х., Исигуро К., Гаубац С., Ливингстон Д.М., Накатани И. (май 2002 г.). «Комплекс с модификаторами хроматина, который занимает E2F- и Myc-чувствительные гены в клетках G0». Наука. 296 (5570): 1132–6. Bibcode:2002Наука ... 296.1132O. Дои:10.1126 / science.1069861. PMID  12004135. S2CID  34863978.
• Татибана М., Сугимото К., Нодзаки М., Уэда Дж., Охта Т., Оки М., Фукуда М., Такеда Н., Ниида Х, Като Х., Синкай Ю. (июль 2002 г.). «Гистон-метилтрансфераза G9a играет доминирующую роль в метилировании эухроматического гистона H3 по лизину 9 и необходима для раннего эмбриогенеза». Гены и развитие. 16 (14): 1779–91. Дои:10.1101 / gad.989402. ЧВК  186403. PMID  12130538.
• Ши И, Савада Дж, Суи Дж, эль Аффар Б., Ветстайн Дж. Р., Лан Ф, Огава Х, Люк М. П., Накатани Й, Ши Й (апрель 2003 г.). «Скоординированные модификации гистонов, опосредованные корепрессорным комплексом CtBP». Природа. 422 (6933): 735–8. Bibcode:2003Натура.422..735С. Дои:10.1038 / природа01550. PMID  12700765. S2CID  2670859.
• Се Т., Роуэн Л., Агуадо Б., Ахерн М.Э., Мадан А., Цинь С., Кэмпбелл Р.Д., Худ Л. (декабрь 2003 г.). «Анализ области класса III главного комплекса гистосовместимости с плотным геном и его сравнение с мышью». Геномные исследования. 13 (12): 2621–36. Дои:10.1101 / гр.1736803. ЧВК  403804. PMID  14656967.
• Рупра А., Кази Р., Шёнике Б., Дейли Т.Дж., Моррисон Дж.Ф. (июнь 2004 г.). «Локализованные домены G9a-опосредованного метилирования гистонов необходимы для подавления нейрональных генов». Молекулярная клетка. 14 (6): 727–38. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.026. PMID  15200951.
• Нишио Х., Уолш М.Дж. (август 2004 г.). «Замещающий белок / разрезанный гомолог CCAAT привлекает гистон-лизинметилтрансферазу G9a для подавления транскрипции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (31): 11257–62. Bibcode:2004ПНАС..10111257Н. Дои:10.1073 / pnas.0401343101. ЧВК  509191. PMID  15269344.
• Коллинз Р.Э., Татибана М., Тамару Х., Смит К.М., Цзя Д., Чжан Х, Селкер Э.У., Синкай Й., Ченг Х (февраль 2005 г.). «Анализ in vitro и in vivo переключателя Phe / Tyr, контролирующего специфичность продукта гистоновых лизинметилтрансфераз». Журнал биологической химии. 280 (7): 5563–70. Дои:10.1074 / jbc.M410483200. ЧВК  2696276. PMID  15590646.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Дуан З., Заребски А., Монтойя-Дуранго Д., Граймс Х.Л., Хорвиц М. (декабрь 2005 г.). «Gfi1 координирует эпигенетическую репрессию p21Cip / WAF1 за счет привлечения гистонолизинметилтрансферазы G9a и гистондеацетилазы 1». Молекулярная и клеточная биология. 25 (23): 10338–51. Дои:10.1128 / MCB.25.23.10338-10351.2005. ЧВК  1291230. PMID  16287849.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Ривз М., Мерфи Дж., Гривз Р., Фэрли Дж., Брем А., Синклер Дж. (Октябрь 2006 г.). «Авторепрессия главного немедленного-раннего промотора / энхансера цитомегаловируса человека на поздних этапах инфицирования опосредуется привлечением ферментов ремоделирования хроматина с помощью IE86». Журнал вирусологии. 80 (20): 9998–10009. Дои:10.1128 / JVI.01297-06. ЧВК  1617317. PMID  17005678.
• Estève PO, Chin HG, Smallwood A, Feehery GR, Gangisetty O, Karpf AR, Carey MF, Pradhan S (ноябрь 2006 г.). «Прямое взаимодействие между DNMT1 и G9a координирует метилирование ДНК и гистонов во время репликации». Гены и развитие. 20 (22): 3089–103. Дои:10.1101 / gad.1463706. ЧВК  1635145. PMID  17085482.