Гаплогруппа E-M215 (Y-ДНК) - Haplogroup E-M215 (Y-DNA)

Гаплогруппа E-M215
Возможное время происхождения47 500 - 38 600 лет назад[1][2]
Возможное место происхожденияСеверо-Восточная Африка или северный Африканский рог[1][2]
ПредокE-P2
ПотомкиE-M35, E-M281
Определение мутацийM215

E-M215, также известный как E1b1b и раньше E3b, является основным гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека. Это подразделение макро-гаплогруппа E-M96, который определяется однонуклеотидный полиморфизм (SNP) мутация M215.[3][4][5] Другими словами, это один из основных родословная из человечество, связывая от отца к сыну с общим предком по мужской линии ("Y-хромосомный Адам "). Это предмет обсуждения и изучения в генетика а также генетическая генеалогия, археология, и историческая лингвистика.

Гаплогруппа E-M215 имеет две древние ветви, которые содержат все известные современные субклады E-M215, E-M35 и E-M281. Из двух последних подгаплогрупп E-M215, единственная ветвь, которая была подтверждена у коренного населения за пределами Эфиопия это E-M35. E-M35, в свою очередь, имеет две известные ветви, E-V68 и E-Z827, которые содержат большинство всех современных носителей субклада E-M215. Субклады E-V68 и E-V257 были обнаружены на самых высоких частотах в Северная Африка и Африканский рог, а также при более низких процентах в части Средний Восток и Европа, а в изолированных популяциях Южная Африка.

Происхождение

Карта происхождения E1b1b1

Происхождение E-M215 было датировано Кручиани в 2007 году примерно 22 400 лет назад в Африканский рог.[6][Примечание 1] E-M35 был датирован Батини в 2015 году от 15 400 до 20 500 лет назад.[7] В июне 2015 года Тромбетта и др. сообщили о ранее недооцененной большой разнице в возрасте между гаплогруппой E-M215 (38,6 тыс. лет назад; 95% ДИ 31,4–45,9 тыс. лет назад) и ее подгаплогруппой E-M35 (25,0 тыс. лет назад; 95% ДИ 20,0–30,0 тыс. лет назад) и оценили ее происхождение. быть в Северо-Восточная Африка, где узел, разделяющий ветви E-V38 и E-M215, встречается около 47 500 лет назад (95% ДИ: 41,3–56,8 тыс. лет назад).[1]

Древние расселения основных линий передачи E-M35. На карте показаны предполагаемые самые ранние перемещения клонов E-M215, описанные в самых последних статьях.[8][6][9][10]

Считается, что все основные ответвления E-M35 возникли в той же области, что и родительская клада: в Северная Африка, то Африканский рог, или близлежащие районы Ближний Восток. Предполагается, что некоторые ответвления E-M35 покинули Африку тысячи лет назад, тогда как другие могли прибыть с Ближнего Востока. Например, Андерхилл (2002) связывает распространение гаплогруппы с Неолитическая революция, полагая, что структура и региональный образец субкладов E-M35 потенциально дают «реагенты, с помощью которых можно сделать вывод о конкретных эпизодах истории популяции, связанных с Неолит расширение сельского хозяйства ". Battaglia et al. (2007) также подсчитали, что E-M78 (называемый в этой статье E1b1b1a1) находится в Европе более 10 000 лет. Соответственно, человеческие останки, раскопанные в испанской погребальной пещере, датируемые примерно 7000 лет назад, оказались в этой гаплогруппе.[11] Еще два E-M78 были обнаружены в эпоху неолита. Сопот и Lengyel культуры тоже.[12]

По поводу E-M35 в Европа в рамках этой схемы, Андерхилл и Кивисилд (2007) заметили, что E-M215, кажется, представляет собой поздно-Плейстоцен миграция из Северной Африки в Европу через Синайский полуостров в Египет.[Заметка 2] Хотя это предложение не оспаривается, недавно оно было предложено Trombetta et al. (2011) что есть также свидетельства дополнительной миграции E-M215, перевозящего людей прямо из Северной Африки в юго-западную Европу по морскому маршруту (см. ниже).

По данным Lazaridis et al. (2016), Натуфийский скелетные останки древних Левант преимущественно несли гаплогруппу Y-ДНК E1b1b. Из пяти натуфийских экземпляров, проанализированных на предмет отцовских линий, три принадлежали к E1b1b1b2 (xE1b1b1b2a, E1b1b1b2b), E1b1 (xE1b1a1, E1b1b1b1) и E1b1b1b2 (xE1b1b1b1b1b) sub) (E1b1b2b) 60% sub. Гаплогруппа E1b1b также обнаруживалась в умеренных количествах среди окаменелостей последующих поколений. Докерамический неолит B в культуре, причем субклады E1b1b1 и E1b1b1b2 (xE1b1b1b2a, E1b1b1b2b) наблюдались в двух из семи образцов PPNB (~ 29%). Ученые предполагают, что ранние фермеры из Леванта, возможно, распространились на юг, в Восточную Африку, принеся с собой наследственные компоненты Западной Евразии и Базальной Евразии, отдельные от тех, которые позже прибыли в Северную Африку.

Кроме того, гаплогруппа E1b1b1 была обнаружена в древнеегипетский мумия, раскопанная на Абусир эль-Мелек археологические раскопки в Среднем Египте, которые датируются периодом между поздним Новое Королевство и Римская эпоха.[13] Окаменелости на Иберомаврусский сайт Ифри н'Амр или Мусса в Марокко, которые были датированы примерно 5000 г. до н.э., также несли гаплотипы, относящиеся к субкладу E1b1b1b1a (E-M81). Эти древние люди несли автохтонный геномный компонент Магриби, который достигает пика среди современных Североафриканцы, что указывает на то, что они были предками населения в этом районе.[14] Гаплогруппа E1b1b также наблюдалась в древних Гуанчи окаменелости, раскопанные в Гран-Канария и Тенерифе на Канарские острова, которые были датированы радиоуглеродом между VII и XI веками нашей эры. Несущие кладу особи, которые были проанализированы на отцовскую ДНК, были захвачены на сайте Тенерифе, и все эти образцы, как было установлено, принадлежат к субкладу E1b1b1b1a1 или E-M183 (3/3; 100%).[15]

Loosdrecht et al. (2018) проанализировали полногеномные данные семи древних Иберомаврусский лица из Grotte des Pigeons возле Taforalt в восточном Марокко. Окаменелости были непосредственно датированы периодом между 15 100 и 13 900 калиброванными годами до настоящего времени. Ученые обнаружили, что пять мужских особей с достаточной сохранностью ядерной ДНК принадлежали к субкладу E1b1b1a1 (M78), причем один скелет нес родительскую линию E1b1b1a1b1 от E-V13, другой мужской образец принадлежал к E1b1b (M215 *).[16]

Распределение

В Африке E-M215 распространяется с самыми высокими частотами в Африканский рог и Северная Африка, откуда он за последние тысячелетия распространился на юг до Южная Африка, и на север в Западная Азия и Европа (особенно Средиземноморье и Балканы ).[8][17][18][19]

Почти все мужчины E-M215 также находятся в E-M35. В 2004 году было обнаружено, что M215 старше, чем M35, когда были обнаружены люди, которые имеют мутацию M215, но не имеют мутации M35.[8]В 2013 году один человек в Хорасане, Северо-Восточный Иран, был обнаружен Ди Кристофаро и др. (2013) быть положительным для M215, но отрицательным для M35.

E-M215 и E-M35 довольно распространены среди Афроазиатские спикеры. Лингвистическая группа и носители линии E-M35 с большой вероятностью возникли и рассеялись вместе из Афроазиатский урхеймат.[20][21][22] Среди населения с афро-азиатской говорящей историей значительная часть Еврейский мужские линии - E-M35.[23] Гаплогруппа E-M35, на долю которой приходится примерно 18%[17] до 20%[24][25] из Ашкенази и 8,6%[26] до 30%[17] из Сефарды Y-хромосомы, по-видимому, являются одной из основных линий еврейского населения.[27][Заметка 3]

Следующая таблица включает только выборочные популяции с более чем 1% мужчин E-M215 со всеми известными субкладами по состоянию на июнь 2015 года. Она содержит кладу E-V1515, определенную Trombetta et al. 2015, и все субклады E1b1b, распределенные ниже Сахары (E-V42, E-M293, E-V92, E-V6), которые были идентифицированы как базальные клады E-M35 в прежней филогении.[1]

численность населенияNОбласть, крайЯзыкИтого E-M215E-V2009E-M78 *E-V1477E-V1083 *E-V13E-V22E-V12 *E-V32E-V259E-V65E-V257 *E-M81E-M123 *E-M34E-V1515 *E-V1486 *E-V2881 *E-V1792E-V92E-M293 *E-V3065E-V42E-V1785 *E-V6E-V16
Северная Африка
Марокканские арабы55МароккоAA / семитский70.90.00.00.00.00.07.30.00.00.032.70.030.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Асни Берберс54МароккоAA / берберский85.20.00.00.00.00.03.70.00.00.00.01.979.60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Бухрия Берберс67МароккоAA / берберский79.10.00.00.00.01.50.00.00.00.00.00.077.60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Берберы Среднего Атласа69МароккоAA / берберский81.20.00.00.00.00.00.00.00.00.010.10.071.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Марракешские берберы27МароккоAA / берберский92.60.00.00.00.00.03.73.70.00.00.03.777.80.03.70.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Souss Berbers34МароккоAA / берберский79.42.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.076.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Уарзазатские берберы31МароккоAA / берберский54.80.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.054.80.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Мозабитские берберы67АлжирAA / берберский89.60.00.00.00.00.00.00.00.00.01.50.086.60.01.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Тунисские евреи10ТунисAA / семитский20.00.00.010.00.00.00.00.00.00.00.00.010.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Ливийские арабы10ЛивияAA / семитский50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.020.00.030.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Ливийские евреи23ЛивияAA / семитский26.10.00.00.00.04.30.00.00.00.04.30.00.00.017.40.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Северные египтяне49ЕгипетAA / семитский42.90.00.00.00.02.016.34.12.00.00.00.04.14.110.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Египетские берберы из Сивы93ЕгипетAA / семитский18.30.00.00.00.00.00.02.20.00.04.32.21.10.02.20.00.00.00.00.00.00.00.00.06.50.0
Египтяне из Бахарии41ЕгипетAA / семитский56.10.00.00.00.02.422.014.60.00.02.47.34.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.02.40.0
Египтяне из оазиса Гурна34ЕгипетAA / семитский17.60.05.90.00.00.00.08.82.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Южные египтяне47ЕгипетAA / семитский78.70.00.00.00.00.00.074.50.00.00.00.00.02.12.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Западная / Центральная Африка
Манденка16СенегалNC / Mande6.30.00.00.00.00.00.06.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Туареги22НигерAA / берберский13.60.00.00.00.00.00.04.50.00.00.00.09.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Даба29Камерун (Север)AA / Чад3.40.00.00.00.00.00.00.00.03.40.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Guidar9Камерун (Север)AA / Чад11.10.00.00.00.00.00.00.00.011.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Мандара82Камерун (Север)AA / Чад2.40.00.00.00.00.00.01.20.00.00.01.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Шува арабы5Камерун (Север)AA / семитский20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.020.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Фульбе из Камеруна76Камерун (Север)Северная Каролина / Атлантика1.31.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Moundang21Камерун (Север)NC / Adamawa4.80.00.00.00.00.00.00.04.80.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Восточная африка
Тигре5ЭритреяAA / семитский100.00.00.00.00.00.00.00.060.00.00.00.00.00.00.020.00.00.00.00.00.00.00.00.020.00.0
Нара15ЭритреяNS / суданский60.00.00.00.00.00.06.70.013.30.00.00.00.00.00.013.36.70.00.00.00.00.013.30.06.70.0
Кунама20ЭритреяNS / Cunama65.00.00.00.00.00.05.00.020.00.00.00.00.00.05.00.00.05.00.00.00.00.015.010.05.00.0
Сахо94ЭритреяAA / Cushitic98.90.00.00.01.10.088.30.00.00.00.00.00.00.01.10.00.00.00.00.00.00.00.00.08.50.0
Tigrai32Эритрея / ЭфиопияAA / семитский71.90.00.00.00.00.03.13.121.90.00.00.00.00.00.00.03.13.10.00.00.00.00.031.36.30.0
Афар25ДжибутиAA / Cushitic60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.04.00.00.00.00.00.00.00.00.00.056.00.0
Сомалийский40ДжибутиAA / Cushitic25.00.00.00.00.00.00.00.025.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Эфиопские евреи22ЭфиопияAA / Cushitic31.80.00.00.00.00.00.00.09.10.00.00.00.00.013.60.00.00.00.00.00.00.09.10.00.00.0
Амхара82ЭфиопияAA / семитский45.10.00.00.00.00.02.40.011.00.00.00.00.00.013.40.00.02.40.01.20.00.01.20.08.54.9
Оромо62ЭфиопияAA / Cushitic53.20.00.00.00.00.00.00.022.60.00.00.00.00.04.80.00.017.70.00.01.60.03.20.01.61.6
Волайта12ЭфиопияAA / Omotic58.30.00.00.00.00.08.30.08.30.00.00.00.00.08.30.00.08.30.00.08.30.00.00.016.70.0
Сомалийский12ЭфиопияAA / Cushitic50.00.00.00.00.00.08.30.025.00.00.00.00.00.00.00.00.016.70.00.00.00.00.00.00.00.0
Gurage7ЭфиопияAA / семитский42.90.00.00.00.00.028.60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.014.30.0
Сомалийский5СомалиAA / Cushitic100.00.00.00.00.00.00.00.080.00.00.00.00.00.00.00.00.00.020.00.00.00.00.00.00.00.0
Туркана6КенияNS / суданский50.00.00.00.00.00.033.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.016.70.00.00.00.00.0
Борана9КенияAA / Cushitic77.80.00.00.00.00.00.00.066.70.00.011.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Сомалийский6КенияAA / Cushitic100.00.00.00.00.00.00.00.066.70.00.00.00.00.00.00.00.016.70.00.00.00.00.00.016.70.0
Нилотическая Западная Кения11КенияNS / суданский45.50.00.00.00.00.09.19.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.018.20.00.00.09.10.0
Лухья51КенияСеверная Каролина / Банту9.80.00.00.00.00.00.00.05.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.03.90.00.00.00.00.0
Другое банту17КенияСеверная Каролина / Банту11.80.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.011.80.00.00.00.00.0
Кикую9КенияСеверная Каролина / Банту11.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.011.10.00.00.00.00.0
Масаи45КенияNS / суданский37.80.00.00.00.00.06.70.06.70.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.024.40.00.00.00.00.0
Тутси9БурундиСеверная Каролина / Банту22.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.022.20.00.00.00.00.0
Южная Африка
! Кунг64АнголаKS10.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.09.41.60.00.00.00.0
Кхве26НамибияKS30.80.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.030.80.00.00.00.00.0
банту8Южная АфрикаСеверная Каролина / Банту12.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.012.50.00.00.00.00.0
Европа
Северный португальский50ПортугалияIE10.00.00.00.00.04.00.00.00.00.00.00.04.00.00.02.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Южный португальский49ПортугалияIE16.30.00.00.00.04.10.00.00.00.00.00.012.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Пасиегос из Кантабрии56ИспанияIE42.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.01.841.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Астурийцы90ИспанияIE12.20.00.00.00.05.64.40.00.00.00.00.02.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Южные испанцы62ИспанияIE6.50.00.00.00.00.03.20.00.00.00.01.61.60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Испанские баски55ИспанияБаскский3.60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.03.60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Французский85ФранцияIE8.20.00.00.00.03.50.01.20.00.00.00.03.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Французские баски16ФранцияБаскский6.30.00.00.00.00.00.06.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Корсиканцы140ФранцияIE6.40.00.00.00.04.30.00.00.00.00.00.70.00.01.40.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Датский35ДанияIE2.90.00.00.00.02.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Немцы77ГерманияIE3.90.00.00.00.03.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Северные итальянцы80ИталияIE11.30.00.00.00.06.32.50.00.00.00.00.01.30.01.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Центральные итальянцы356ИталияIE12.90.00.00.00.05.32.00.30.00.00.30.30.80.03.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Южные итальянцы141ИталияIE15.60.70.00.00.08.51.40.70.00.00.00.01.40.02.80.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Сицилийцы153ИталияIE20.30.00.00.00.07.24.60.70.00.00.70.00.70.06.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Сардинцы374ИталияIE8.30.80.00.00.31.10.80.30.00.01.10.30.30.03.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Польский40ПольшаIE2.50.00.00.00.02.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Словенцы104СловенияIE2.90.00.00.00.02.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Эстонцы74ЭстонияU5.40.00.00.00.04.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Венгры106ВенгрияU10.40.00.00.00.09.40.00.00.00.00.00.00.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Румыны30РумынияIE26.70.00.00.00.026.70.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Македонцы99МакедонияIE18.20.00.00.00.018.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Континентальные греки32ГрецияIE28.10.00.00.00.025.00.00.00.00.00.00.00.00.03.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Болгары112БолгарияIE22.30.00.00.00.021.40.00.00.00.00.00.00.00.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Сефардские болгары20БолгарияIE5.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.05.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Албанцы21АлбанияIE33.30.00.00.00.033.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Ближний Восток
Сефардский турецкий19индюкА10.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.05.30.05.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Стамбул Турецкий35индюкА17.10.00.00.00.02.95.70.00.00.00.00.05.70.02.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Юго-западный турецкий40индюкА7.50.00.00.00.02.50.00.00.00.00.00.02.50.02.50.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Северо-Восточный Турецкий41индюкА2.40.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.02.40.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Центральная Анатолия61индюкА9.80.00.00.00.04.90.01.60.00.00.00.00.00.03.30.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Юго-Восточный Турецкий24индюкА8.30.00.00.00.04.20.00.00.00.00.00.00.00.04.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Эрзурум Турецкий25индюкА12.00.00.00.00.00.00.04.00.00.00.00.00.00.08.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Турки-киприоты46индюкА23.90.00.00.00.010.92.20.00.00.00.00.08.70.02.20.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Бедуины28ИзраильAA / семитский14.30.00.00.00.00.03.60.00.00.00.00.03.60.07.10.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Друзы арабы28ИзраильAA / семитский14.30.00.00.00.010.70.00.00.00.00.00.00.00.03.60.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Палестинцы29ИзраильAA / семитский13.80.00.00.00.03.46.90.00.00.00.00.00.00.03.40.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Арабов41Объединенные Арабские ЭмиратAA / семитский7.30.00.00.00.00.02.40.00.00.00.00.00.00.04.90.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Оманит13ОманAA / семитский15.40.00.00.00.00.07.70.00.00.00.00.00.00.07.70.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
Йеменцы94ЙеменAA / семитский14.90.00.00.00.00.00.02.13.20.00.00.01.10.07.40.00.00.00.00.00.00.00.00.00.01.1

E-M215 ассоциация с выносливостью

Moran et al. (2004) наблюдали, что среди групп Y-ДНК (отцовской), принадлежащих элитным спортсменам на выносливость в Эфиопии, гаплогруппа E3b1 отрицательно коррелировала с показателями элитных спортсменов на выносливость,[28] тогда как гаплогруппы E *, E3 *, К * (xP),[28] и J * (xJ2) были значительно чаще среди элитных спортсменов на выносливость.[28]

Субклады E-M215

Семейное древо

Следующее филогенетическое дерево основан на дереве YCC 2008 и последующих опубликованных исследованиях, резюмированных ISOGG. Он включает все известные субклады по состоянию на июнь 2015 г. (Trombetta et al.2015)[29][4][5]

  • E-M215 (E1b1b)
    • E-M215 *. Редко или не существует.
    • E-M35 (E1b1b1)
      • E-V68 (E1b1b1a)
        • E-V2009. Встречается у людей на Сардинии и Марокко.
        • E-M78 (E1b1b1a1). Северная Африка, Африканский Рог, Западная Азия, Сицилия. (Ранее «E1b1b1a».)
          • E-M78 *
          • E-V1477. Встречается у тунисских евреев.
          • E-V1083.
            • E-V1083 *. Встречается только в Эритрее (1,1%) и Сардинии (0,3%).
            • E-V13
            • E-V22
          • E-V1129
            • E-V12
              • E-V12 *
              • E-V32
            • E-V264
              • E-V259. Найден в Северном Камеруне.
              • E-V65
                • E-CTS194
      • E-Z827 (E1b1b1b)[30]
        • E-V257 / L19 (L19, V257) - E1b1b1b1[30]
          • E-PF2431
          • E-M81 (M81)
            • E-PF2546
              • E-PF2546 *
              • E-CTS12227
                • E-MZ11
                  • E-MZ12
              • E-A929
                • E-Z5009
                  • E-Z5009 *
                  • E-Z5010
                  • E-Z5013
                    • E-Z5013 *
                    • E-A1152
                • E-A2227
                  • E-A428
                  • E-MZ16
                • E-PF6794
                  • E-PF6794 *
                  • E-PF6789
                    • E-MZ21
                    • E-MZ23
                    • E-MZ80
                • E-A930
                • E-Z2198 / E-MZ46
                  • E-A601
                  • E-L351
        • E-Z830 (Z830) - E1b1b1b2[30]
          • E-M123 (M123)
            • E-M34 (M34)
              • E-M84 (M84)
                • E-M136 (M136)
              • E-M290 (M290)
              • E-V23 (V23)
              • E-L791 (L791, L792)
          • E-V1515. E-V1515 и его субклады в основном ограничены Восточной Африкой.
            • E-V1515 *
            • E-V1486
              • E-V1486 *
              • E-V2881
                • E-V2881 *
                • E-V1792
                • E-V92
              • E-M293 (M293)
                • E-M293 *
                • E-P72 (P72)
                • E-V3065 *
            • E-V1700
              • E-V42 (V42)
              • E-V1785
                • E-V1785 *
                • E-V6 (V6)
      • E-V16 / E-M281 (E1b1b2). Редкий. Встречается у людей в Эфиопии, Йемене и Саудовской Аравии.

Исключительные случаи мужчин с положительным M215 и отрицательным M35 («E-M215 *») были обнаружены в двух Амхарас Эфиопии и один Йеменцы.[8][31] По крайней мере, некоторые из этих людей, а может быть, и все, известны с начала 2011 года как принадлежащие к редкой родственной группе E-M35, известной как E-V16 или E-M281.[32] Об открытии M281 объявили Semino et al. 2002 г., который нашел его в двух эфиопских Оромо. Trombetta et al. 2011 г. нашли еще 5 эфиопов и аналогичный SNP для M281, V16. Именно в статье 2011 года положение генеалогического дерева (M215 + / M35-) было обнаружено, как описано выше. Производная E-M215, E-M35, определяется SNP M35. 1 туркменский человек из Jawzjan с мутацией, определяющей подклад, обозначается как E-M35 *.[33] По состоянию на июнь 2015 года существует все более сложная древовидная структура, которая делит большинство мужчин в E-M35 на две ветви: E-V68 и E-Z827.

Наиболее часто описываемые субклады - E-M78, часть E-V68, и E-M81, который является веткой E-Z827. Эти два субклада представляют собой самую большую долю современного населения E-M215. E-M78 встречается в большей части ареала, где E-M215 встречается, за исключением Южной Африки. E-M81 встречается в основном в Северной Африке. E-M123 менее распространен, но широко рассредоточен со значительными популяциями в определенных частях Африканского Рога, Леванта, Аравии, Иберии и Анатолии. Новая клада (E-V1515) была определена Trombetta et al. 2015 г., который возник около 12 тыс. Лет назад (95% ДИ 8,6–16,4) в Восточной Африке, где он в настоящее время в основном распространен. Эта клада включает субклады E-V42, E-M293, E-V92 и E-V6, которые были идентифицированы как базальные клады E-M35 в предыдущей филогении.[1]

В E-M35 есть поразительные параллели между двумя гаплогруппами, E-V68 и E-V257. Оба содержат линию, которая часто наблюдалась в Африке (E-M78 и E-M81, соответственно), и группу недифференцированных хромосом, которые в основном встречаются в южной Европе. Расширение авианосцев E-M35, возможно, с Ближнего Востока, как предлагалось другими авторами, и разделение на две ветви, разделенные географическим барьером Средиземного моря, могло бы объяснить эту географическую закономерность. Однако отсутствие E-V68 * и E-V257 * на Ближнем Востоке делает морское распространение между Северной Африкой и Южной Европой более правдоподобной гипотезой.

TMRCA основных узлов в E-M215

TMRCA (тыс. Шт.)Тромбетта 2015YПолный
E-M2153935,4
* E-M352523,9
** E-V682020
*** E-M781513
** E-Z827?23,6
*** E-V257 / L19?13,9
**** E-M81?2,7
*** E-Z8302019
**** E-M34?15
**** E-V151519?

E-V68 (E1b1b1a)

E-V68, преобладает его более известный субклад E-M78. Три человека "E-V68 *", которые находятся в E-V68, но не E-M78, были зарегистрированы в Сардиния, к Trombetta et al. 2011 г., анонсируя открытие V68. Авторы отметили, что, поскольку E-V68 * не был обнаружен в образцах с Ближнего Востока, это, по-видимому, свидетельствует о морской миграции из Африки в юго-западную Европу.E-M78 - часто встречающийся субклад, широко распространенный в Северная Африка, то Африканский рог, Западная Азия, (Ближний Восток и Ближний Восток) «до Южной Азии»,[6] и все Европа.[34] В европейском распределении пик частоты сосредоточен в частях Балканы (в некоторых регионах почти до 50%)[17][35] и Сицилия, и снижение частот очевидно в сторону Западной, Центральной и Северо-Восточной Европы.

На основе генетических STR данные о дисперсии, Cruciani et al. 2007 г. предполагает, что E-M78 возник в районе Египет и Ливия.[Примечание 4] около 18 600 лет назад (17 300 - 20 000 лет назад).[Примечание 5] Battaglia et al. 2008 г. описывают Египет как «центр распределения различных географически локализованных субкладов, связанных с M78», и, основываясь на археологических данных, они предполагают, что точка происхождения E-M78 (в отличие от более позднего распространения из Египта), возможно, находилась в а рефугиум которые «существовали на рубеже современных Судан и Египет, рядом Озеро Нубия, до начала влажной фазы около 8500 г. до н.э. Сдвигающиеся на север дождевые пояса в этот период могли также стимулировать быструю миграцию Мезолит собирателей на север в Африке, Левант и, в конечном итоге, к Малая Азия и Европа, где каждая из них в конечном итоге разделилась на свои региональные отличительные ветви ". На юг, Hassan et al. 2008 г. также объясните доказательства того, что некоторые субклады E-M78, в частности E-V12 и E-V22, «могли быть занесены в Судан из Северной Африки после прогрессирующего опустынивания Сахары около 6000–8000 лет назад». И аналогично, Cruciani et al. 2007 г. предполагают, что E-M78 в Эфиопии, Сомали и прилегающих районах мигрировал обратно в этот регион со стороны Египта после приобретения мутации E-M78.

Недавно E-M78 был датирован Trombetta et al. 2015. между 20 300 и 14 800 лет назад.[1]

Субклады E-M78

Здесь перечислены основные субклады M78 по состоянию на июнь 2015 года. В субкладе E-M78, Trombetta et al. В 2015 году большая часть бывших хромосом E-M78 * была распределена по трем новым разным ветвям: E-V1083 *, E-V1477 и E-V259. Первый - сестра парагруппы кладов E-V22 и E-V13. Мутация V1477 определяет новую базальную ветвь, которая наблюдалась только в одном образце из Северной Африки. Наконец, родственная клада E-V12, определенная V264, включает E-V65 и V259, новую ветвь, распространенную в Центральной Африке.[1][34]

  • E-M78 (E1b1b1a1) Северная Африка, Африканский Рог, Западная Азия, Европа (ранее «E1b1b1a»).
    • E-M78 * Встречается в Марокко, южной Португалии, южной Испании и Иране (провинции Тегеран и Семнан).
    • E-V1477 Встречается у тунисских евреев.
    • E-V1083
      • E-V1083 * Встречается только в Эритрее (1,1%) и Сардинии (0,3%).
      • E-V13 Это наиболее распространенный субклад E-M215, встречающийся в Европе. Это особенно распространено на Балканах.
      • E-V22. Сосредоточен в Северо-Восточной Африке и на Ближнем Востоке. Пики среди сахо.
    • E-V1129
      • E-V12. Встречается в Египте, Судане и других местах. Имеет важный подклад
        • E-V12 * Наиболее распространенная линия среди южных египтян (74,5%).
        • E-V32. Очень распространен среди сомалийцев, тигре и оромос.
      • E-V264
        • E-V259 Найден в Северном Камеруне.
        • E-V65 Связан с Северной Африкой, но также встречается на Сицилии, а также в континентальной Италии.
    • E-M521 Не упоминается Тромбеттой и др., 2015. Найден у двух человек в Греции Battaglia et al. 2008 г. и у одного человека из Восточно-Альпийского региона Италии Coia et al. (2013)

E-Z827 (E1b1b1b)

В генетике человека E-Z827, это имя крупного гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека в изобилии встречается в Северной Африке, особенно Магриб, и в меньшей степени в Африканский рог, то Ближний Восток и Европа.

E-V257 / E-L19 (E1b1b1b1)

E-V257 * люди в их выборках, которые были E-V257, но не E-M81. Борана из Кении, марракешский бербер, корсиканец, сардинец, южный испанец и кантабриец. Как уже упоминалось выше, Trombetta et al. 2011 г. предполагают, что отсутствие E-V257 * на Ближнем Востоке (Ифулл нашел молодого в Иранский Азербайджан[36] и другой молодой в Армении[37]) делает морское перемещение из северной Африки в южную Европу наиболее правдоподобной гипотезой для объяснения его распространения. Yfull перечисляет 24 человека, все из которых принадлежат к одной ветви, которая на 30% моложе их общего предка с M81.[38]

E-M81

E-M81 является наиболее распространенным субкладом гаплогруппы E-L19 / V257. Он сосредоточен в Магриб, и преобладает его субклад E-M183. Считается, что E-M183 возник в Северо-Западной Африке и имеет предполагаемый возраст 4700 лн.[39]

Эта гаплогруппа достигает средней частоты 61% в Магриб и 51% в Северная Африка, частота снижается примерно с 80% до 100% в популяциях берберов,[40][41] включая сахарцев, примерно до 29% к востоку от этого диапазона в Египте.[42][43][44][45] Из-за своего молодого возраста и распространенности среди этих групп, а также других, таких как Mozabite, Средний Атлас, Kabyle и другие берберский групп, это иногда называют генетическим «берберским маркером». Pereira et al. 2010 г. сообщать о высоких уровнях среди Туареги в двоем Сахара населения - 77,8% около Гором-Гором, в Буркина-Фасо, и 81,8% от Гози в Мали. Была гораздо более низкая частота 11,1% в непосредственной близости от Танут в Нигер. E-M81 также довольно распространен среди Магрибский арабский говорящие группы. Обычно он встречается с частотой около 45% в прибрежных городах Алжир и Тунис (Джиджель, Оран, Тизи Узу, Алжир, Тунис, Сусс ).[42][46]

В этом ключевом районе от Египта до Атлантический океан, Sole-Morata et al. 2017 г. сообщить о паттерне M183-SM001 уменьшения микроспутник вариация гаплотипа (подразумевающая больший возраст родословной в прежних областях) от Племя регибат в Оран и они нашли M183 * (не SM001) в Иберии, Ливии и Марокко. Arredi et al. 2004 г. однако, микросателлитные вариации уменьшаются с востока на запад, что сопровождается значительным увеличением частоты. На восточной окраине этого основного диапазона Куянова и др. 2009 г. обнаружил M81 у 28,6% (10 из 35 мужчин) в Эль-Хайес в Ливийская пустыня в Египте.

Arredi et al. 2004 г. считают, что модель распределения и дисперсии согласуется с гипотезой "демическая диффузия "с Востока. Автохтонного присутствия E-M81 на Ближнем Востоке нет (есть в Ливане.[47]), что указывает на то, что M81, скорее всего, произошел от своей родительской клады M35 либо в Северной Африке, либо, возможно, на юге, до Африканского Рога.[22]

В Европе E-M81 широко распространен, но редко, в Пиренейский полуостров показывает среднюю частоту 4% (45/1140) на Пиренейском полуострове с частотами, достигающими 3,5% в Галиция, 4% в Западной Андалусия и Северо-Запад Кастилия. Однако в это исследование включены 153 человека с островов Майорка, Менорка и Ибица, а также 24 человека из Гаскони, которые не находятся на Пиренейском полуострове. Без этих 177 особей средний показатель для Пиренейского полуострова составляет 4,1% (40/963),[48] он находится на уровне, сопоставимом с E-M78, со средней частотой около 5%. Его частоты выше в западной половине полуострова и достигают 8% в Эстремадура и южной Португалии, от 4% до 5% в Галиция, 5% в западных Андалусия и 4% на северо-западе Кастилия и от 9% до 17% в Кантабрия.[26][49][50][51][52] Самые высокие частоты этой клады, обнаруженные до сих пор в Европе, наблюдались в Valles Pasiegos из Кантабрия от 5,5% (8/45)[52] до 41% (23/56).[8] Средняя частота 8,28% (54/652) также отмечена на испанском языке. Канарские острова с частотами более 10% на трех крупнейших островах Тенерифе (10.68%), Гран-Канария (11,54%) и Фуэртевентура (13.33%).[53]

E-M81 также встречается в Франция,[8] 2,70% (15/555) в целом с частотами выше 5% в Овернь (5/89) и Иль-де-Франс (5/91),[54][55] в Сицилия (примерно 9% в целом, но до 14% в Пьяцца Армерина ),[56] и с гораздо меньшей частотой около Lucera (2,7%), в континентальной Италия,[51] возможно, из-за древних миграций во время Исламский, Римский, и Карфагенский империи. В исследовании 2014 года Стефании Сарно и соавт. с 326 образцами из Козенца, Реджо-ди-Калабрия, Лечче и 5 провинциях Сиклии, E-M81 показывает среднюю частоту 6,5%, но типичный гаплотип ядра Магрибина 13-14-30-24-9-11-13 был обнаружен только у двух из пяти индивидуумов E-M81. Эти результаты, наряду с незначительным вкладом североафриканских популяций, выявленным анализом графиков, подобных примеси, предполагают лишь незначительное влияние транс-средиземноморских потоков генов на текущий генетический пул SSI.[56][57]

E-M81 также был обнаружен в 2013 году на уровне 5,8% в большой выборке из 1204 человек. Сардинцы.[58]

В результате своего распространения в старом мире этот субклад встречается повсюду. Бразилия[59] 5,4% в Бразилия (Рио де Жанейро),[Примечание 6] и среди Латиноамериканец мужчины из Калифорния и Гавайи 2.4%.[60]

В меньшем количестве мужчин E-M81 можно встретить в районах, соприкасающихся с [Северной Африкой, как вокруг Сахары, так и в таких местах, как Судан, и вокруг Средиземного моря в таких местах, как Ливан, индюк, и среди Сефардские евреи.

Есть два признанных субклада E-M81, хотя один гораздо важнее другого.[который? ]

Субклад E-M81 был обнаружен в древних Гуанчи (Bimbapes) окаменелости, раскопанные в Пунта-Асуль, Эль Йерро, Канарские острова, которые датируются X веком (~ 44%).[61]

E-M107

Андерхилл 2000 нашел один образец E-M107 в Мали.

E-M183

E-M183 чрезвычайно доминирует (более 99%[62]) внутри E-M81. Карафет и др. 2008 г. впервые описал его как субклад E-M81. Известные субклады E-M183 включают:

E-Z830 (E1b1b1b2)

Это недавно обнаруженный субклад, который еще не включен в большинство деревьев гаплогрупп, E-Z830 включает подтвержденные субклады E-M123, E-V1515 (E-M293, E-V42, E-V6, E-V92), и E-Z830 * и является родственным классом E-L19. В настоящее время, [постоянная мертвая ссылка ] филогенетический проект E-M35 распознает четыре отдельных кластера носителей Z830 *, два из которых имеют исключительно еврейское происхождение. Остальные два значительно меньше по размеру и включают отдельных особей в Германии, Испании, Латинской Америке, Египте и Эфиопии.[63][64][65][66]

E-M123

E-M123 в основном известен своей основной субкладой E-M34, которая доминирует над этой кладой.[Примечание 7]

E-V1515

Новая клада (E-V1515) была определена Trombetta et al. 2015 г., который возник около 12 тыс. Лет назад (95% ДИ 8,6–16,4) в Восточной Африке, где он в настоящее время в основном распространен. В эту кладу входят все гаплогруппы к югу от Сахары (E-V42, E-M293, E-V92, E-V6), о которых в предыдущей филогении сообщалось как базальные клады E-M35.[1]

E-M293

E-M293 является субкладом E-V1515. Впервые он был идентифицирован ISOGG как второй класс в E-Z830. Он был обнаружен до E-Z830, анонсирован в Хенн 2008, что связывало его с распространением скотоводство из Восточная Африка в Южная Африка. До сих пор высокие уровни были обнаружены у определенных этнических групп в Танзании и Южной Африке. Высшие были Datooga (43%), Кхве (Kxoe) (31%), Burunge (28%), и Народы сандаве (24%). Хенн (2008) в своем исследовании также обнаружил двух кенийских мужчин, говорящих на банту, с мутацией M293.[9]

Другие субклады E-M215 редки в Южной Африке. Авторы заявляют: «Без информации о M293 у масаи, хема и других популяций в Кении, Судане и Эфиопии мы не можем с большей уверенностью определить точный географический источник M293. Однако имеющиеся данные указывают на современную Танзанию как ранний и важный географический локус эволюции M293. ". Они также говорят, что «M293 находится только в Африке к югу от Сахары, что указывает на отдельную филогенетическую историю для образцов M35.1 * (бывших) дальше на север».

E-P72 появляется в Карафете (2008). Trombetta et al. 2011 г. объявил, что это субклад E-M293.

E-V42

Trombetta et al. 2011 г. объявил об открытии E-V42 в двух Бета Израиль человек. Было высказано предположение, что это может быть ограничено регионом вокруг Эфиопии. Однако дальнейшие испытания, проведенные коммерческими компаниями по тестированию ДНК, подтвердили множество положительных результатов для этого субклада в Саудовской Аравии, Кувейте и одного человека в Португалии, имеющего корень из Аравии.[67]

E-V6

Подклад E-V6 для E-V1515 определяется V6. Cruciani et al. (2004) идентифицировали значительное присутствие этих линий в Эфиопии, а также некоторых в соседних Сомалийцы. Среди образцов Эфиопии и Сомали самые высокие показатели были 14,7% среди амхарцев и 16,7% среди Волайта.

На юг, Тишкофф и др. (2007) идентифицировал одного человека V6 + в выборке из 35 датуг из Танзании. И дальше на север, Dugoujon et al. (2009) идентифицировал еще 6 мужчин в выборке из 93 человек из Сива оазис, который является берберским населением

E-V92

Trombetta et al. 2011 г. объявил об обнаружении E-V92 в двух амхарах. Подобно E-V6 и E-V42, возможно, он существует только в районе Эфиопии.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 г. в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
E-P2921III13Eu3H2BE *EEEEEEEEEE
E-M3321III13Eu3H2BE1 *E1E1aE1aE1E1E1aE1aE1aE1aE1a
E-M4421III13Eu3H2BE1aE1aE1a1E1a1E1aE1aE1a1E1a1E1a1E1a1E1a1
E-M7521III13Eu3H2BE2aE2E2E2E2E2E2E2E2E2E2
E-M5421III13Eu3H2BE2bE2bE2bE2b1-------
E-P225III414Eu3H2BE3 *E3E1bE1b1E3E3E1b1E1b1E1b1E1b1E1b1
E-M28III515Eu2H2BE3a *E3aE1b1E1b1aE3aE3aE1b1aE1b1aE1b1aE1b1a1E1b1a1
E-M588III515Eu2H2BE3a1E3a1E1b1a1E1b1a1E3a1E3a1E1b1a1E1b1a1E1b1a1E1b1a1a1aE1b1a1a1a
E-M116.28III515Eu2H2BE3a2E3a2E1b1a2E1b1a2E3a2E3a2E1b1a2E1b1a2E1ba12удаленныйудаленный
E-M1498III515Eu2H2BE3a3E3a3E1b1a3E1b1a3E3a3E3a3E1b1a3E1b1a3E1b1a3E1b1a1a1cE1b1a1a1c
E-M1548III515Eu2H2BE3a4E3a4E1b1a4E1b1a4E3a4E3a4E1b1a4E1b1a4E1b1a4E1b1a1a1g1cE1b1a1a1g1c
E-M1558III515Eu2H2BE3a5E3a5E1b1a5E1b1a5E3a5E3a5E1b1a5E1b1a5E1b1a5E1b1a1a1dE1b1a1a1d
E-M108III515Eu2H2BE3a6E3a6E1b1a6E1b1a6E3a6E3a6E1b1a6E1b1a6E1b1a6E1b1a1a1eE1b1a1a1e
E-M3525III414Eu4H2BE3b *E3bE1b1b1E1b1b1E3b1E3b1E1b1b1E1b1b1E1b1b1удаленныйудаленный
E-M7825III414Eu4H2BE3b1 *E3b1E1b1b1aE1b1b1a1E3b1aE3b1aE1b1b1aE1b1b1aE1b1b1aE1b1b1a1E1b1b1a1
E-M14825III414Eu4H2BE3b1aE3b1aE1b1b1a3aE1b1b1a1c1E3b1a3aE3b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a1c1E1b1b1a1c1
E-M8125III414Eu4H2BE3b2 *E3b2E1b1b1bE1b1b1b1E3b1bE3b1bE1b1b1bE1b1b1bE1b1b1bE1b1b1b1E1b1b1b1a
E-M10725III414Eu4H2BE3b2aE3b2aE1b1b1b1E1b1b1b1aE3b1b1E3b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1aE1b1b1b1a1
E-M16525III414Eu4H2BE3b2bE3b2bE1b1b1b2E1b1b1b1b1E3b1b2E3b1b2E1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b1a2a
E-M12325III414Eu4H2BE3b3 *E3b3E1b1b1cE1b1b1cE3b1cE3b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1b2a
E-M3425III414Eu4H2BE3b3a *E3b3aE1b1b1c1E1b1b1c1E3b1c1E3b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1b2a1
E-M13625III414Eu4H2BE3ba1E3b3a1E1b1b1c1aE1b1b1c1a1E3b1c1aE3b1c1aE1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1b2a1a1

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

  • α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
  • β Андерхилл 2000
  • γ Молот 2001
  • δ Карафет 2001
  • ε Семино 2000
  • ζ Вс 1999
  • η Капелли 2001

Обсуждение

E-M215 и E1b1b1 являются принятыми в настоящее время именами, найденными в предложениях Консорциум Y-хромосомы (YCC) для клад, определяемых мутациями M215 и M35 соответственно, которые также могут обозначаться как E-M215 и E-M35.[4] Номенклатура E3b (E-M215) и E3b1 (E-M35) соответственно были определенные YCC имена, используемые для обозначения тех же гаплогруппы в более ранней литературе с разветвлением E-M35 как отдельным субклад E-M215 в 2004 году.[8] До 2002 г. эти гаплогруппы не были обозначены единообразно, и их связь с другими родственными клады в гаплогруппа E и гаплогруппа DE. Но в нестандартной или старой терминологии E-M215, например, примерно то же самое, что и «гаплотип V», все еще используемый в таких публикациях, как Жерар и др. (2006).[5]

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК E Субклады

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр

Примечания

  1. ^ Cruciani et al. (2004): «Несколько наблюдений указывают на Восточную Африку как на родину гаплогруппы E3b, то есть в ней было (1) наибольшее количество различных кладов E3b (таблица 1), (2) высокая частота этой гаплогруппы и высокое микросателлитное разнообразие, и, наконец, (3) исключительное присутствие недифференцированного E3b * парагруппа. »Как упоминалось выше,« E3b »- старое название E-M215. Semino et al. (2004): "Этот вывод дополнительно подтверждается наличием дополнительной линейной диверсификации Hg E и самой высокой частотой встречаемости E-P2 * и E-M35 * в том же регионе. Распространение E-P2 *, по-видимому, ограничивается восточноафриканскими народами. Линия E-M35 * показывает самую высокую частоту (19,2%) в эфиопском оромо, но с более широким диапазоном распространения, чем E-P2 * ». Для E-M215 Cruciani et al. (2007) снизили свою оценку до 22 400 с 25 600 в Cruciani et al. (2004), повторная калибровка тех же данных.
  2. ^ «Данные по Y-хромосоме показывают сигнал для отдельной миграции позднего плейстоцена из Африки в Европу через Синай, о чем свидетельствует распределение клонов гаплогруппы E3b, которое не проявляется в распределении гаплогрупп мтДНК».Андерхилл и Кивисилд (2007:547)
  3. ^ «Парагруппа E-M35 * и гаплогруппа J-12f2a * соответствуют критериям основных линий происхождения AJ, потому что они широко распространены как в популяциях AJ, так и в ближневосточных популяциях, и встречаются гораздо реже в европейских нееврейских популяциях». Behar et al. (2004)
  4. ^ Cruciani et al. 2007 г. используйте термин «Северо-Восточная Африка» для обозначения Египта и Ливии, как показано в таблице 1 исследования. До Cruciani et al. 2007 г., Semino et al. 2004 г. Восточная Африка как возможное место происхождения E-M78, на основании испытаний в Эфиопии. Это произошло из-за высокой частоты и разнообразия линий E-M78 в регионе Эфиопия. Тем не мение, Cruciani et al. 2007 г. смогли изучить больше данных, включая население из Северной Африки, которое не было представлено в Semino et al. 2004 г. исследования и нашли доказательства того, что линии E-M78, которые составляют значительную часть некоторых популяций в этом регионе, были относительно молодыми ветвями (см. E-V32 ниже). Таким образом, они пришли к выводу, что «Северо-Восточная Африка» была вероятным местом происхождения E-M78, основываясь на «периферийном географическом распределении наиболее производных подгаплогрупп по отношению к северо-востоку Африки, а также на результатах количественного анализа UEP и микросателлитного разнообразия». . Итак, согласно Cruciani et al. 2007 г. E-M35, родительский класс E-M78, возник в Восточной Африке, впоследствии распространился на Северо-Восточную Африку, а затем произошла «обратная миграция» хромосом E-M215, которые приобрели мутацию E-M78. Cruciani et al. 2007 г. поэтому отметьте это как свидетельство «коридора для двунаправленных миграций» между Северо-Восточной Африкой (Египет и Ливия по их данным) с одной стороны и Восточной Африкой с другой. Авторы считают, что было «как минимум 2 эпизода между 23,9–17,3 тыс. Лет назад и 18,0–5,9 тыс. Лет назад».
  5. ^ Cruciani et al. 2007 г. используйте два метода расчета для оценки возраста E-M78, которые дают очень разные результаты. В течение 18 600 лет назад Метод ASD используется, а на секунду "ρ метод ", используемый в качестве проверки, дает 13,7кья с стандартное отклонение 2,3 тыс. лет назад, но разница между двумя методами велика только для оценки возраста E-M78, а не его субкладов. Авторы заявляют, что большая разница «объясняется соответствующим отклонением от звездообразной структуры из-за повторяющихся эффекты основателя "
  6. ^ (6 из 112): «Присутствие хромосом североафриканского происхождения (E3b1b-M81; Cruciani et al., 2004) также можно объяснить притоком португальцев, но в первую очередь итальянским, поскольку эта гаплогруппа достигает частоты 4,6. % в Португалия и 4,8% Италия, очень похожая на частоту, найденную в Рио де Жанейро (4,4%) среди европейских вкладчиков ». Silva et al. 2006 г.
  7. ^ Например, с 11 ноября 2008 г. филогенетический проект E-M35[постоянная мертвая ссылка ] имел записи о четырех тестах E-M123 * по сравнению с 93 результатами тестов с E-M34.

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час Trombetta et al. 2015, Филогеографические уточнения и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы Е Y-хромосомы человека позволяют по-новому взглянуть на расселение ранних скотоводов на африканском континенте.
  2. ^ а б Хабер М., Джонс А.Л., Коннел Б.А., Асан, Арчиеро Э., Хуанмин И., Томас М.Г., Сюэ Ю., Тайлер-Смит К. (июнь 2019 г.). «Редкая африканская гаплогруппа Y-хромосомы с глубокими корнями D0 и ее значение для распространения современного человека за пределы Африки». Генетика. 212 (4): 1421–1428. Дои:10.1534 / генетика.119.302368. ЧВК  6707464. PMID  31196864.
  3. ^ ISOGG (2011)
  4. ^ а б c Карафет и др. (2008)
  5. ^ а б c Консорциум Y-хромосомы "YCC" (2002)
  6. ^ а б c Cruciani et al. (2007)
  7. ^ Недавнее крупномасштабное расширение отцовства в Европе, показанное повторным упорядочением населения, Кьяра Батини и др., nature.com, 2015
  8. ^ а б c d е ж грамм Cruciani et al. (2004)
  9. ^ а б Henn et al. (2008)
  10. ^ Hassan et al. (2008)
  11. ^ Lacan et al. (2011)
  12. ^ «Молекулярно-генетическое исследование истории неолитического населения Западного Карпатского бассейна» (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) на 21.07.2015.
  13. ^ Schuenemann, Verena J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды». Nature Communications. 8: 15694. Bibcode:2017НатКо ... 815694S. Дои:10.1038 / ncomms15694. ЧВК  5459999. PMID  28556824.
  14. ^ Фрегель; и другие. (2018). «Древние геномы из Северной Африки свидетельствуют о доисторических миграциях в Магриб как из Леванта, так и из Европы». bioRxiv  10.1101/191569.
  15. ^ Родригес-Варела; и другие. (2017). «Геномный анализ человеческих останков с Канарских островов до европейского завоевания выявил близкое родство с современными североафриканцами». Текущая биология. 27 (1–7): 3396–3402.e5. Дои:10.1016 / j.cub.2017.09.059. PMID  29107554. Получено 27 октября 2017.
  16. ^ Loosdrecht et al. (2018), Плейстоценовые геномы Северной Африки связывают человеческие популяции Ближнего Востока и Африки к югу от Сахары, Наука, 15 марта 2018 г .: eaar8380 DOI: 10.1126 / science.aar8380
  17. ^ а б c d Semino et al. (2004)
  18. ^ Россер и др. (2000)
  19. ^ Firasat et al. (2006)
  20. ^ Ehret et al. (2004)
  21. ^ Кейта и Бойс (2005)
  22. ^ а б Кейта 2008
  23. ^ Behar et al. (2003)
  24. ^ Behar et al. (2004)
  25. ^ Шен и др. (2004)
  26. ^ а б Адамс и др. (2008)
  27. ^ Nebel et al. (2001)
  28. ^ а б c Moran, Colin N .; и другие. (2004). «Гаплогруппы Y-хромосомы элитных бегунов на выносливость из Эфиопии». Генетика человека. 115 (6): 492–7. Дои:10.1007 / s00439-004-1202-у. PMID  15503146. S2CID  13960753. Получено 6 февраля 2017.
  29. ^ ISOGG (2008)
  30. ^ а б c ISOGG 2015
  31. ^ Cadenas et al. 2007 г.
  32. ^ Trombetta et al. 2011 г.
  33. ^ (Рисунок S.7) Дж. Д. Кристофаро и др., 2013, «Афганский Гиндукуш: где сходятся потоки генов на евразийском субконтиненте», http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0076748
  34. ^ а б Cruciani et al. 2006 г.
  35. ^ Peričic et al. 2005 г.
  36. ^ https://yfull.com/tree/E-Y133414/
  37. ^ https://yfull.com/tree/E-FGC18960*/
  38. ^ https://yfull.com/tree/E-L19/
  39. ^ https://www.yfull.com/tree/E-M81/
  40. ^ Кручиани, Фульвио; Ла Фратта, Роберта; Сантоламацца, Пьеро; Селлитто, Даниэле; Пасконе, Роберто; Мораль, Педро; Уотсон, Элизабет; Гуида, Валентина; Коломб, Элиан Беро (май 2004 г.). «Филогеографический анализ хромосом гаплогруппы E3b (E-M215) Y выявил множественные миграционные события в Африке и за ее пределами». Американский журнал генетики человека. 74 (5): 1014–1022. Дои:10.1086/386294. ISSN  0002-9297. ЧВК  1181964. PMID  15042509.
  41. ^ Фадхлауи-Зид, Карима; Мартинес-Крус, Бегонья; Ходжет-эль-Хил, Хуссейн; Мендизабал, Изабель; Бенаммар-Эльгаайед, Амель; Комас, Дэвид (октябрь 2011 г.). «Генетическая структура тунисских этносов по отцовской линии». Американский журнал физической антропологии. 146 (2): 271–280. Дои:10.1002 / ajpa.21581. ISSN  1096-8644. PMID  21915847.
  42. ^ а б Arredi et al. 2004 г.
  43. ^ Альварес и др. 2009 г.
  44. ^ Bosch et al. 2001 г.
  45. ^ Куянова, Мартина; Перейра, Луиза; Фернандес, Вероника; Перейра, Жоана Б.; Черны, Виктор (октябрь 2009 г.). «Ближневосточные неолитические генетические данные в небольшом оазисе египетской Западной пустыни». Американский журнал физической антропологии. 140 (2): 336–346. Дои:10.1002 / ajpa.21078. ISSN  1096-8644. PMID  19425100.
  46. ^ Робино и др. 2008 г.
  47. ^ https://yfull.com/tree/E-A5604/
  48. ^ см. таблицу В архиве 2013-07-30 в Wayback Machine.
  49. ^ Флорес и др. 2005 г.
  50. ^ Beleza et al. 2006 г.
  51. ^ а б Capelli et al. 2009 г.
  52. ^ а б MacaMaca-Meyer et al. 2003 г.
  53. ^ Fregel et al. 2009 г., см. таблицу
  54. ^ Рамос-Луиза и др. 2009 г.
  55. ^ Были проанализированы только мужчины с французской фамилией, чтобы попытаться исключить более недавних иммигрантов.
  56. ^ а б Ди Гаэтано и др. 2009 г.
  57. ^ Сарно, S; Боаттини, А; Carta, M; Ферри, G; Alù, M; Yao, DY; Ciani, G; Петтенер, Д; Луизелли, Д. (2014). «Древний средиземноморский плавильный котел: исследование однородной генетической структуры и истории населения Сицилии и Южной Италии». PLOS ONE. 9 (4): e96074. Bibcode:2014PLoSO ... 996074S. Дои:10.1371 / journal.pone.0096074. ЧВК  4005757. PMID  24788788. CC-BY icon.svg Эта статья содержит цитаты из этого источника, который доступен под Лицензия Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).
  58. ^ Francalacci et al. (2013), Низкочастотное секвенирование ДНК 1200 сардинцев реконструирует европейскую филогению Y-хромосомы
  59. ^ (8 из 132), Mendizabal et al. 2008 г.
  60. ^ (7 из 295), Paracchini et al. 2003 г.
  61. ^ Ordóñez, A.C .; Fregel, R .; Трухильо-Медерос, А .; Hervella, M .; де-ла-Руа, С .; Арне-де-ла-Роса, М. (2017). «Генетические исследования доиспанского населения, захороненного в пещере Пунта Асуль (Эль Йерро, Канарские острова)». Журнал археологической науки. 78: 20–28. Дои:10.1016 / j.jas.2016.11.004.
  62. ^ https://yfull.com/tree/E-M81/
  63. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2015-09-24. Получено 2012-04-01.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  64. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2015-09-24. Получено 2012-04-01.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  65. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2015-09-24. Получено 2012-04-01.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  66. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2015-09-24. Получено 2012-04-01.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  67. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2015-09-24. Получено 2013-01-14.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)

Дополнительные источники

внешняя ссылка