Подавление гена - Gene silencing

Подавление гена это регуляция экспрессии генов в ячейке, чтобы предотвратить проявление определенного ген.[1][2] Подавление гена может происходить во время любого транскрипция или же перевод и часто используется в исследованиях.[1][2] В частности, методы, используемые для подавления генов, все чаще используются для получения терапия для борьбы с раком и другими заболеваниями, такими как инфекционные заболевания и нейродегенеративные расстройства.

Подавление гена часто рассматривается как нокдаун генов.[3][4] Когда гены замалчиваются, их экспрессия снижается.[3][4] Напротив, когда гены нокаутированы, они полностью стираются из организма. геном и, таким образом, не имеют выражения.[3][4] Подавление звука считается механизмом нокдауна гена, поскольку методы, используемые для подавления звука генов, такие как РНКи, CRISPR, или же миРНК, как правило, снижают экспрессию гена как минимум на 70%, но не устраняют его полностью. Методы, использующие сайленсинг генов, часто считаются лучше, чем нокауты генов, поскольку они позволяют исследователям изучать основные гены, необходимые для животные модели выжить и не может быть удален. Кроме того, они дают более полное представление о развитии заболеваний, поскольку болезни обычно связаны с генами, экспрессия которых снижена.[3]

Типы

Транскрипционный

Посттранскрипционный

Мейотик

Методы исследования

Антисмысловые олигонуклеотиды

Антисмысловой олигонуклеотиды были открыты в 1978 году Пол Замечник и Мэри Стивенсон.[5] Олигонуклеотиды, которые короткие нуклеиновая кислота Фрагменты связываются с комплементарными молекулами мРНК-мишени при добавлении в клетку.[5][6] Эти молекулы могут состоять из одноцепочечной ДНК или РНК и обычно имеют длину 13-25 нуклеотидов.[6][7] Антисмысловые олигонуклеотиды могут влиять на экспрессию генов двумя способами: с помощью РНКаза H -зависимый механизм или с помощью стерического блокирующего механизма.[6][7] РНКаза H-зависимые олигонуклеотиды вызывают мишень мРНК молекулы разлагаются, а стерический блокатор олигонуклеотиды предотвратить трансляцию молекулы мРНК.[6][7] Большинство антисмысловых препаратов действуют через РНКазу H-зависимый механизм, при котором РНКаза H гидролизует цепь РНК ДНК / РНК. гетеродуплекс.[6][7] Этот механизм считается более эффективным, приводя к снижению экспрессии белка и мРНК примерно на 80-95%.[6]

Рибозимы

Общий механизм, используемый рибозимами для расщепления молекул РНК

Рибозимы молекулы каталитической РНК, используемые для ингибирования экспрессия гена. Эти молекулы работают, расщепляя мРНК молекулы, по сути подавляя гены, которые их продуцируют. Сидни Альтман и Томас Чех впервые открыл каталитические молекулы РНК, РНКазу P и интронные рибозимы группы II в 1989 году и получил Нобелевскую премию за свое открытие.[8][9] Существует несколько типов рибозимных мотивов, в том числе молот, заколка для волос, вирус гепатита дельта, группа I, группа II, и РНКаза P рибозимы. Мотивы рибозимов вируса гепатита дельта (HDV), головки молотка, шпильки обычно встречаются в вирусы или вироидные РНК.[8] Эти мотивы способны самостоятельно расщеплять специфическую фосфодиэфирную связь на молекуле мРНК.[8] Ниже эукариоты и несколько бактерии содержат рибозимы группы I и группы II.[8] Эти мотивы могут самосращиваться за счет расщепления и соединения фосфодиэфирных связей.[8] Последний мотив рибозима, рибозим РНКазы P, находится в кишечная палочка и известен своей способностью расщеплять фосфодиэфирные связи нескольких тРНК предшественники при соединении с кофактором белка.[8]

Генерал каталитический механизм используется рибозимами аналогично механизму, используемому белком рибонуклеазы.[10] Эти каталитические молекулы РНК связываются с определенным сайтом и атакуют соседний фосфат в основной цепи РНК своим 2 'кислородом, который действует как нуклеофил, что приводит к образованию продуктов расщепления с 2'3'-циклическим фосфатом и 5'-концевым гидроксилом.[10] Этот каталитический механизм все чаще используется учеными для выполнения последовательного расщепления целевых молекул мРНК. Кроме того, делаются попытки использовать рибозимы для создания терапевтических средств, подавляющих гены, которые заставляли бы заглушать гены, которые вызывают заболевания.[11]

РНК-интерференция

Оставили:Обзор РНК-интерференции.

РНК-интерференция (РНКи ) - это естественный процесс, используемый клетками для регулирования экспрессии генов. Он был открыт в 1998 г. Эндрю Файер и Крейг Мелло, получившие Нобелевскую премию за свое открытие в 2006 году.[12] Процесс подавления генов сначала начинается с появления двухцепочечная РНК (дцРНК) молекула в клетку, которая запускает путь РНКи.[12] Затем двухцепочечная молекула разрезается на небольшие двухцепочечные фрагменты ферментом, называемым Дайсер.[12] Эти небольшие фрагменты, включающие малые интерферирующие РНК (миРНК) и микроРНК (миРНК), имеют длину примерно 21–23 нуклеотида.[12][13] Фрагменты интегрируются в мульти-субъединичный белок, называемый РНК-индуцированный комплекс сайленсинга, который содержит Аргонавт белки, которые являются важными компонентами пути РНКи.[12][13] Одна цепь молекулы, называемая «направляющей» цепью, связывается с RISC, в то время как другая цепь, известная как «цепь-пассажира», разрушается.[12][13] Направляющая или антисмысловая цепь фрагмента, который остается связанным с RISC, направляет специфичное для последовательности молчание целевой молекулы мРНК.[13] Гены могут подавляться молекулами миРНК, которые вызывают эндонуклеатическое расщепление целевых молекул мРНК, или молекулами миРНК, которые подавляют трансляцию молекулы мРНК.[13] При расщеплении или репрессии трансляции молекул мРНК гены, которые их образуют, становятся практически неактивными.[12] Считается, что РНКи превратилась в механизм защиты клетки от захватчиков, таких как РНК-вирусы, или для борьбы с распространением транспозоны в ДНК клетки.[12] И РНК-вирусы, и транспозоны могут существовать в виде двухцепочечной РНК и приводить к активации РНКи.[12] В настоящее время, миРНК широко используются для подавления конкретных экспрессия гена и оценить функцию гены. Компании, использующие этот подход, включают Альнилам, Санофи,[14] Стрелка, Discerna,[15] и Persomics,[16] среди прочего.

Три первичных нетранслируемых области и микроРНК

Основная статья: Три основных непереведенных региона
Основная статья: МикроРНК

Три основных непереведенных региона (3'UTRs) из информационные РНК (мРНК) часто содержат регуляторные последовательности, которые после транскрипции вызывают молчание генов. Такие 3'-UTR часто содержат оба участок связывания для микроРНК (miRNA), а также для регуляторные белки. Связываясь со специфическими сайтами в 3'-UTR, большое количество специфических miRNAs уменьшается. экспрессия гена их конкретных мРНК-мишеней путем ингибирования перевод или непосредственно вызывая деградацию транскрипта, используя механизм, аналогичный РНК-интерференции (см. МикроРНК ). 3'-UTR также может иметь сайленсерные области, которые связывают репрессорные белки, которые ингибируют экспрессию мРНК.

3'-UTR часто содержит элементы ответа микроРНК (MRE). MRE - это последовательности, с которыми миРНК связываются и вызывают молчание генов. Это преобладающие мотивы в 3'-UTR. Среди всех регуляторных мотивов в 3'-UTR (например, включая области сайленсеров) MRE составляют около половины мотивов.

По состоянию на 2014 г. miRBase интернет сайт,[17] архив miRNA последовательности и аннотации, перечисляющие 28 645 записей о 233 биологических видах. Из них 1881 miRNA находились в аннотированных локусах miRNA человека. Было предсказано, что каждая из miRNA будет иметь в среднем около четырехсот целевых мРНК (вызывающих молчание нескольких сотен генов).[18] Freidman et al.[18] подсчитать, что> 45000 миРНК целевые сайты в мРНК человека 3'UTR консервативны выше фоновых уровней, и> 60% кодирующих белки человека гены подвергались селективному давлению, чтобы поддерживать спаривание с miRNA.

Прямые эксперименты показывают, что одна миРНК может снизить стабильность сотен уникальных мРНК.[19] Другие эксперименты показывают, что один miRNA может подавлять производство сотен белков, но это подавление часто относительно мягкое (менее чем в 2 раза).[20][21]

Эффекты нарушения регуляции экспрессии генов miRNA, по-видимому, важны при раке.[22] Например, при раке желудочно-кишечного тракта девять миРНК были идентифицированы как эпигенетически изменен и эффективен в подавлении ферментов репарации ДНК.[23]

Эффекты дисрегуляции экспрессии генов miRNA также кажутся важными в психоневрологический расстройства, такие как шизофрения, биполярное расстройство, большая депрессия, болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера и расстройства аутистического спектра.[24][25][26]

Приложения

Медицинские исследования

Методы подавления генов широко используются исследователями для изучения генов, связанных с расстройствами. Эти расстройства включают рак, инфекционные заболевания, респираторные заболевания, и нейродегенеративные расстройства. Подавление гена также в настоящее время используется в усилиях по открытию новых лекарств, таких как синтетическая летальность, высокопроизводительный скрининг, и миниатюрные экраны РНКи.

Рак

РНК-интерференция был использован, чтобы заставить замолчать гены, связанные с несколькими видами рака. В in vitro исследования хронический миелолейкоз (ХМЛ), миРНК был использован для расщепления слитого белка, BCR-ABL, что предотвращает прием препарата Гливек (иматиниб ) от связывания с раковыми клетками.[27] Расщепление слитого белка снижает количество трансформированных кроветворный клетки, которые распространяются по организму за счет увеличения чувствительности клеток к препарату.[27] РНК-интерференция также может использоваться для нацеливания на определенные мутанты. Например, миРНК были способны специфически связываться с супрессором опухоли. p53 молекулы, содержащие один точечная мутация и уничтожить его, оставив неповрежденным супрессор дикого типа.[28]

Рецепторы, участвующие в митогенный пути, которые приводят к увеличению производства раковых клеток там, также являются мишенью для молекул миРНК. В хемокиновый рецептор хемокиновый рецептор 4 (CXCR4), связанный с распространением рака молочной железы, расщеплялся молекулами миРНК, что уменьшало количество делений, обычно наблюдаемых раковыми клетками.[29] Исследователи также использовали миРНК для избирательной регуляции экспрессии генов, связанных с раком. Антиапоптотические белки, такие как кластерин и сурвивин, часто экспрессируются в раковых клетках.[30][31] Кластерин и миРНК, нацеленные на сурвивин, были использованы для уменьшения количества антиапоптотических белков и, таким образом, повышения чувствительности раковых клеток к химиотерапевтическому лечению.[30][31] В естественных условиях Исследования также все чаще используются для изучения потенциального использования молекул миРНК в терапевтических средствах против рака. Например, мышам имплантировали аденокарцинома толстой кишки было обнаружено, что клетки выживают дольше, если клетки предварительно обрабатывали миРНК, которые нацелены на В-катенин в раковых клетках.[32]

Инфекционное заболевание

Вирусы

Вирусные гены и гены-хозяева, которые необходимы вирусам для репликации или проникновения в клетку, или которые играют важную роль в жизненном цикле вируса, часто становятся мишенью противовирусной терапии. РНКи использовались для нацеливания на гены при нескольких вирусных заболеваниях, таких как вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) и гепатит.[33][34] В частности, siRNA использовали для подавления первичного рецептора хемокина 5 (CCR5) рецептора ВИЧ.[35] Это предотвратило проникновение вируса в лимфоциты периферической крови человека и первичные гемопоэтические стволовые клетки.[35][36] Аналогичный метод использовался для уменьшения количества обнаруживаемого вируса в гепатит Б и C. инфицированные клетки. При гепатите B подавление siRNA использовалось для нацеливания поверхностного антигена на вирус гепатита B и приводило к уменьшению количества вирусных компонентов.[37] Кроме того, методы siRNA, используемые при гепатите C, позволили снизить количество вируса в клетке на 98%.[38][39]

РНК-интерференция уже более 20 лет используется в коммерческих целях для борьбы с вирусными заболеваниями растений (см. Устойчивость к болезням растений ). В 1986–1990 годах были опубликованы многочисленные примеры «устойчивости, опосредованной белком оболочки» к вирусам растений, до открытия РНКи.[40] В 1993 году работа с вирусом травления табака впервые продемонстрировала, что организмы-хозяева могут нацеливаться на конкретные последовательности вирусов или мРНК для деградации, и что эта активность является механизмом, лежащим в основе некоторых примеров устойчивости к вирусам у трансгенных растений.[41][42] Открытие малых интерферирующих РНК (детерминанта специфичности в РНК-опосредованном сайленсинге генов) также использовало индуцированное вирусом посттранскрипционное молчание генов у растений.[43] К 1994 г. были созданы трансгенные разновидности кабачков, экспрессирующие гены белков оболочки трех различных вирусов, что дало гибриды кабачков с проверенной полевой устойчивостью к поливирусным препаратам, которые остаются в коммерческом использовании в настоящее время. Линии картофеля, экспрессирующие последовательности вирусных репликаз, которые придают устойчивость к вирусу скручивания листьев картофеля, продавались под торговыми наименованиями NewLeaf Y и NewLeaf Plus и были широко приняты в коммерческое производство в 1999–2001 годах, пока McDonald's Corp. не решила не покупать GM картофель и Monsanto решили закрыть свой картофельный бизнес в NatureMark.[44] Другой часто цитируемый пример устойчивости к вирусам, опосредованной замалчиванием генов, касается папайи, где гавайскую индустрию папайи спасли устойчивые к вирусам ГМ-папайи, произведенные и лицензированные университетскими исследователями, а не крупной корпорацией.[45] Эти папайи также используются в настоящее время, хотя и не без значительного общественного протеста.[46][47] что заметно менее очевидно в медицинских применениях подавления генов.

Методы подавления гена также использовались для нацеливания на другие вирусы, такие как вирус папилломы человека, то вирус Западного Нила и вирус Тулейн. Ген E6 в образцах опухолей, полученных от пациентов с вирусом папилломы человека, был мишенью и, как было установлено, вызывает апоптоз в инфицированных клетках.[48] Плазмидные векторы экспрессии siRNA, используемые для нацеливания на вирус Западного Нила, также были способны предотвращать репликацию вирусов в клеточных линиях.[49] Кроме того, было обнаружено, что siRNA успешно предотвращает репликацию вируса Тулейн, входящего в семейство вирусов. Caliciviridae, воздействуя как на его структурные, так и на неструктурные гены.[50] Путем нацеливания на ген NTPase было показано, что одна доза siRNA за 4 часа до заражения контролирует репликацию вируса Тулейн в течение 48 часов после заражения, снижая вирусную титр с точностью до 2,6 логарифма.[50] Хотя вирус Тулейн является видоспецифичным и не поражает людей, было показано, что он тесно связан с человеческим норовирус, что является наиболее частой причиной острый гастроэнтерит и болезнь пищевого происхождения вспышки в США.[51] Человеческие норовирусы печально известны тем, что их трудно изучать в лаборатории, но вирус Тулейн предлагает модель для изучения этого семейства вирусов с клинической целью разработки методов лечения, которые могут использоваться для лечения заболеваний, вызванных человеческим норовирусом.

Бактерии
Структура типичной грамположительной бактериальной клетки

В отличие от вирусов, бактерии не так восприимчивы к подавлению siRNA.[52] Во многом это связано с тем, как размножаются бактерии. Бактерии размножаются вне клетки-хозяина и не содержат необходимых механизмов для функционирования РНКи.[52] Однако бактериальные инфекции все еще можно подавлять с помощью siRNA, воздействуя на гены-хозяева, которые участвуют в иммунном ответе, вызванном инфекцией, или путем нацеливания на гены-хозяева, участвующие в опосредовании проникновения бактерий в клетки.[52][53] Например, миРНК использовалась для уменьшения количества провоспалительных цитокины экспрессируется в клетках мышей, получавших липополисахарид (ЛПС).[52][54] Сниженная экспрессия воспалительного цитокина, фактор некроза опухоли α (TNFα), в свою очередь, вызывало уменьшение септического шока, испытываемого мышами, получавшими LPS.[54] Кроме того, siRNA использовалась для предотвращения бактерий, Синегнойная палочка, от вторжения в эпителиальные клетки легких мышей путем нокаута гена кавеолина-2 (CAV2).[55] Таким образом, хотя бактерии не могут быть напрямую нацелены на механизмы миРНК, они все же могут подвергаться воздействию миРНК, когда нацелены на компоненты, участвующие в бактериальной инфекции.

Респираторные заболевания

Рибозимы, антисмысловые олигонуклеотиды и совсем недавно РНКи были использованы для нацеливания молекул мРНК, участвующих в астма.[53][56] Эти эксперименты показали, что siRNA можно использовать для борьбы с другими респираторными заболеваниями, такими как хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ) и кистозный фиброз.[53] ХОБЛ характеризуется: кубок гиперплазия и слизь гиперсекреция.[57] Было обнаружено, что секреция слизи снижается, когда трансформирующий фактор роста (TGF) -α мишенью siRNA в дыхательных путях человека NCI-H292 эпителиальные клетки.[58] Помимо гиперсекреции слизи, хроническое воспаление и поврежденная легочная ткань характерна для ХОБЛ и астмы. В трансформирующий фактор роста TGF-β считается, что играет роль в этих проявлениях.[59][60] В результате, когда интерферон (IFN) -γ использовался для подавления TGF-β, фиброз легких, вызванное повреждением и рубцеванием легочной ткани.[61][62]

Нейродегенеративные расстройства

болезнь Хантингтона
Кристаллографическая структура N-концевой области белка гентингтина человека.

Болезнь Хантингтона (HD) результат мутации в ген хантингтина что вызывает избыток CAG-повторов.[63] Затем ген образует мутировавший белок хантингтин с полиглутаминовыми повторами возле амино-конец.[64] Эта болезнь неизлечима и, как известно, вызывает моторную, познавательный, и поведенческие дефициты.[65] Исследователи рассматривали сайленсинг генов как потенциальное терапевтическое средство от HD.

Подавление гена можно использовать для лечения HD путем нацеливания на мутантный белок хантингтин. На мутантный белок хантингтин нацелено подавление гена, которое является аллельспецифичным, с использованием аллель-специфические олигонуклеотиды. В этом методе антисмысловые олигонуклеотиды используются для нацеливания однонуклеотидный полиморфизм (SNP), которые представляют собой однонуклеотидные изменения в последовательности ДНК, поскольку было обнаружено, что пациенты с HD имеют общие SNP, которые связаны с мутировавшим аллелем хантингтина. Было обнаружено, что примерно 85% пациентов с HD могут быть охвачены при нацеливании на три SNP. Кроме того, когда антисмысловые олигонуклеотиды использовались для нацеливания на HD-ассоциированный SNP у мышей, наблюдалось 50% снижение количества мутантного белка хантингтина.[63]

Неаллель-специфическое подавление гена с использованием молекул миРНК также использовалось для подавления мутантных белков хантингтина. Благодаря этому подходу, вместо нацеливания на SNP на мутированном белке, нацелены все нормальные и мутированные белки хантингтина. При исследовании на мышах было обнаружено, что миРНК может снижать нормальный и мутантный уровни хантингтина на 75%. На этом уровне они обнаружили, что у мышей улучшилось блок управления двигателем и более длинный процент выживаемости по сравнению с контролем.[63] Таким образом, методы сайленсинга генов могут оказаться полезными при лечении HD.

Боковой амиотрофический склероз

Боковой амиотрофический склероз (БАС), также называемая болезнью Лу Герига, заболевание двигательных нейронов что влияет на мозг и спинной мозг. Причины болезни двигательные нейроны дегенерировать, что в конечном итоге приводит к гибели нейронов и мышечной дегенерации.[66] Сотни мутаций в Cu / Zn супероксиддисмутаза Было обнаружено, что ген (SOD1) вызывает БАС.[67] Чтобы подавить мутант SOD1, характерный для БАС, использовали подавление гена.[67][68] В частности, молекулы миРНК успешно использовались для нацеливания на мутантный ген SOD1 и снижения его экспрессии за счет подавления аллель-специфического гена.[67][69]

Терапевтические проблемы

Основной механизм, используемый вирусными векторами для доставки генов к клеткам-мишеням. Показанный пример представляет собой лентивирусный вектор.

Есть несколько проблем, связанных с терапией сайленсинга генов, в том числе: Доставка и специфичность для клеток-мишеней. Например, для лечения нейродегенеративных нарушений молекулы для предполагаемой терапии подавления генов должны доставляться в мозг. В гематоэнцефалический барьер затрудняет доставку молекул в мозг через кровоток, препятствуя прохождению большинства молекул, которые вводятся или всасываются в кровь.[63][64] Таким образом, исследователи обнаружили, что они должны напрямую вводить молекулы или насосы имплантата, которые толкают их в мозг.[63]

Однако, оказавшись внутри мозга, молекулы должны перемещаться внутри клеток-мишеней. Чтобы эффективно доставлять молекулы миРНК в клетки, вирусные векторы может быть использован.[63][65] Тем не менее, этот способ доставки также может быть проблематичным, поскольку он может вызвать иммунный ответ против молекул. В дополнение к доставке было обнаружено, что специфичность также является проблемой для сайленсинга генов. Как антисмысловые олигонуклеотиды, так и молекулы миРНК потенциально могут связываться с неправильной молекулой мРНК.[63] Таким образом, исследователи ищут более эффективные методы доставки и разработки конкретных терапевтических средств, подавляющих гены, которые по-прежнему являются безопасными и эффективными.

Еда

Основная статья: Арктические яблоки

Arctic Apples - это набор товарных знаков[70] яблоки, которые содержат признак отсутствия коричневого цвета, созданный с помощью сайленсинга генов для снижения экспрессии полифенолоксидазы (PPO). Это первый одобренный пищевой продукт, в котором используется этот метод.[71]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Редберри, Грейс (2006). Подавление гена: новое исследование. Нью-Йорк: Nova Science Publishers. ISBN  9781594548321.
  2. ^ а б "Генное молчание". Национальный центр биотехнологической информации. Получено 11 ноября 2013.
  3. ^ а б c d Худ E (март 2004 г.). "RNAi: Что за шум насчет подавления гена?". Перспективы гигиены окружающей среды. 112 (4): A224–9. Дои:10.1289 / ehp.112-a224. ЧВК  1241909. PMID  15033605.
  4. ^ а б c Mocellin S, Provenzano M (ноябрь 2004 г.). «РНК-интерференция: изучение нокдауна гена из клеточной физиологии». Журнал трансляционной медицины. 2 (1): 39. Дои:10.1186/1479-5876-2-39. ЧВК  534783. PMID  15555080.
  5. ^ а б Коле Р., Крайнер А.Р., Альтман С. (февраль 2012 г.). «РНК-терапия: помимо РНК-интерференции и антисмысловых олигонуклеотидов». Обзоры природы. Открытие наркотиков. 11 (2): 125–40. Дои:10.1038 / nrd3625. ЧВК  4743652. PMID  22262036.
  6. ^ а б c d е ж Диас Н., Стейн CA (март 2002 г.). «Антисмысловые олигонуклеотиды: основные понятия и механизмы». Молекулярная терапия рака. 1 (5): 347–55. PMID  12489851.
  7. ^ а б c d Куррек Дж (март 2004 г.). «Антисмысловые и РНК-интерференционные подходы к целевой проверке в исследованиях боли». Текущее мнение в области открытия и разработки лекарств. 7 (2): 179–87. PMID  15603251.
  8. ^ а б c d е ж Филакту, Л. (1 сентября 1998 г.). «Рибозимы как терапевтические инструменты при генетических заболеваниях». Молекулярная генетика человека. 7 (10): 1649–1653. Дои:10.1093 / hmg / 7.10.1649. PMID  9735387.
  9. ^ Шампо М.А., Кайл Р.А., Стинсма Д.П. (октябрь 2012 г.). «Сидни Альтман - лауреат Нобелевской премии по работе с РНК». Труды клиники Мэйо. 87 (10): e73. Дои:10.1016 / j.mayocp.2012.01.022. ЧВК  3498233. PMID  23036683.
  10. ^ а б Доэрти Э.А., Дудна Дж. А. (1 июня 2001 г.). «Структуры и механизмы рибозима». Ежегодный обзор биофизики и структуры биомолекул. 30 (1): 457–75. Дои:10.1146 / annurev.biophys.30.1.457. PMID  11441810.
  11. ^ Толлефсбол, под редакцией Трюгве О. (2007). Методы и протоколы биологического старения. Тотова, Нью-Джерси: Humana Press. ISBN  9781597453615.CS1 maint: дополнительный текст: список авторов (связь)
  12. ^ а б c d е ж грамм час я «Информационный бюллетень по интерференции РНК». Национальные институты здоровья. Архивировано из оригинал 25 ноября 2013 г.. Получено 24 ноября 2013.
  13. ^ а б c d е Wilson RC, Doudna JA (2013). «Молекулярные механизмы РНК-интерференции». Ежегодный обзор биофизики. 42: 217–39. Дои:10.1146 / annurev-biophys-083012-130404. ЧВК  5895182. PMID  23654304.
  14. ^ «Превращение Big Pharma в RNAi показывает, что новые технологии не гарантируют успеха НИОКР». Forbes. Получено 2015-10-11.
  15. ^ "Второе пришествие RNAi | The Scientist Magazine®". Ученый. Получено 2015-10-11.
  16. ^ "Продукты | Персомика". www.persomics.com. Получено 2015-10-11.
  17. ^ miRBase.org
  18. ^ а б Friedman RC, Farh KK, Burge CB, Bartel DP (январь 2009 г.). «Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями для микроРНК». Геномные исследования. 19 (1): 92–105. Дои:10.1101 / гр.082701.108. ЧВК  2612969. PMID  18955434.
  19. ^ Лим LP, Лау NC, Гарретт-Энгеле П., Гримсон А., Шелтер Дж. М., Касл Дж., Бартель Д. П., Линсли П. С., Джонсон Дж. М. (февраль 2005 г.). «Анализ микроматрицы показывает, что некоторые микроРНК подавляют большое количество целевых мРНК». Природа. 433 (7027): 769–73. Bibcode:2005Натура.433..769L. Дои:10.1038 / природа03315. PMID  15685193. S2CID  4430576.
  20. ^ Зельбах М., Шванхойссер Б., Тирфельдер Н., Фанг З., Ханин Р., Раевский Н. (сентябрь 2008 г.). «Широко распространенные изменения в синтезе белков, вызванные микроРНК». Природа. 455 (7209): 58–63. Bibcode:2008Натура.455 ... 58С. Дои:10.1038 / природа07228. PMID  18668040. S2CID  4429008.
  21. ^ Бэк Д., Виллен Дж., Шин С., Камарго Ф. Д., Гиги С. П., Бартель Д. П. (сентябрь 2008 г.). «Влияние микроРНК на выход белка». Природа. 455 (7209): 64–71. Bibcode:2008Натура.455 ... 64Б. Дои:10.1038 / природа07242. ЧВК  2745094. PMID  18668037.
  22. ^ Palmero EI, de Campos SG, Campos M, de Souza NC, Guerreiro ID, Carvalho AL, Marques MM (июль 2011 г.). «Механизмы и роль нарушения регуляции микроРНК в возникновении и прогрессировании рака». Генетика и молекулярная биология. 34 (3): 363–70. Дои:10.1590 / S1415-47572011000300001. ЧВК  3168173. PMID  21931505.
  23. ^ Бернштейн C, Бернштейн H (май 2015 г.). «Эпигенетическое снижение репарации ДНК при прогрессировании рака желудочно-кишечного тракта». Всемирный журнал онкологии желудочно-кишечного тракта. 7 (5): 30–46. Дои:10.4251 / wjgo.v7.i5.30. ЧВК  4434036. PMID  25987950.
  24. ^ Maffioletti E, Tardito D, Gennarelli M, Bocchio-Chiavetto L (2014). «Микрошпионы от мозга к периферии: новые ключи к разгадке в исследованиях микроРНК при нервно-психических расстройствах». Границы клеточной неврологии. 8: 75. Дои:10.3389 / fncel.2014.00075. ЧВК  3949217. PMID  24653674.
  25. ^ Меллиос Н., Сур М. (2012). «Растущая роль микроРНК при шизофрении и расстройствах аутистического спектра». Границы в психиатрии. 3: 39. Дои:10.3389 / fpsyt.2012.00039. ЧВК  3336189. PMID  22539927.
  26. ^ Гиган М., Кэрнс MJ (август 2015 г.). «МикроРНК и посттранскрипционная дисрегуляция в психиатрии». Биологическая психиатрия. 78 (4): 231–9. Дои:10.1016 / j.biopsych.2014.12.009. PMID  25636176. S2CID  5730697.
  27. ^ а б Chen J, Wall NR, Kocher K, Duclos N, Fabbro D, Neuberg D, Griffin JD, Shi Y, Gilliland DG (июнь 2004 г.). «Стабильная экспрессия малой интерферирующей РНК сенсибилизирует TEL-PDGFbetaR к ингибированию иматинибом или рапамицином». Журнал клинических исследований. 113 (12): 1784–91. Дои:10.1172 / JCI20673. ЧВК  420507. PMID  15199413.
  28. ^ Мартинес Л.А., Нагибнева И., Лерманн Х., Вервиш А., Ченио Т., Лозано Г., Харель-Беллан А. (ноябрь 2002 г.). «Синтетические малые ингибирующие РНК: эффективные инструменты для инактивации онкогенных мутаций и восстановления путей p53». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (23): 14849–54. Bibcode:2002ПНАС ... 9914849М. Дои:10.1073 / pnas.222406899. ЧВК  137507. PMID  12403821.
  29. ^ Лаптева Н., Янг А.Г., Сандерс Д.Е., Штрубе Р.В., Чен С.Ю. (январь 2005 г.). «Нокдаун CXCR4 малыми интерферирующими РНК отменяет рост опухоли груди in vivo». Генная терапия рака. 12 (1): 84–9. Дои:10.1038 / sj.cgt.7700770. PMID  15472715. S2CID  23402257.
  30. ^ а б Июль Л.В., Беральди Э, Со А., Фазли Л., Эванс К., Инглиш Дж. К., Gleave ME (март 2004 г.).«Терапия на основе нуклеотидов, направленная на хемосенсибилизацию кластерина, повышает чувствительность клеток аденокарциномы легких человека как in vitro, так и in vivo». Молекулярная терапия рака. 3 (3): 223–32. PMID  15026542.
  31. ^ а б Нинг С., Фюссел С., Коцш М., Кремер К., Капплер М., Шмидт Ю., Тауберт Х., Вирт М. П., Мей А. (октябрь 2004 г.). «siRNA-опосредованное подавление сурвивина ингибирует рост клеток рака мочевого пузыря». Международный журнал онкологии. 25 (4): 1065–71. Дои:10.3892 / ijo.25.4.1065 (неактивно 01.09.2020). PMID  15375557.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на сентябрь 2020 г. (связь)
  32. ^ Verma UN, Surabhi RM, Schmaltieg A, Becerra C, Gaynor RB (апрель 2003 г.). «Малые интерферирующие РНК, направленные против бета-катенина, подавляют рост in vitro и in vivo клеток рака толстой кишки». Клинические исследования рака. 9 (4): 1291–300. PMID  12684397.
  33. ^ Дэйв Р.С., Померанц Р.Дж. (декабрь 2004 г.). «Противовирусные эффекты малых интерферирующих РНК, специфичных для вируса иммунодефицита человека типа 1, против мишеней, консервативных в выбранных нейротропных вирусных штаммах». Журнал вирусологии. 78 (24): 13687–96. Дои:10.1128 / JVI.78.24.13687-13696.2004. ЧВК  533941. PMID  15564478.
  34. ^ Уилсон Дж. А., Джаясена С., Хворова А., Сабатинос С., Родриг-Жерве И. Г., Арья С., Саранги Ф., Харрис-Брандтс М., Болье С., Ричардсон С. Д. (март 2003 г.). «РНК-интерференция блокирует экспрессию генов и синтез РНК из репликонов гепатита С, размножающихся в клетках печени человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (5): 2783–8. Bibcode:2003PNAS..100.2783W. Дои:10.1073 / pnas.252758799. ЧВК  151418. PMID  12594341.
  35. ^ а б Qin XF, An DS, Chen IS, Baltimore D (январь 2003 г.). «Ингибирование ВИЧ-1 инфекции в человеческих Т-клетках с помощью лентивирусной доставки малой интерферирующей РНК против CCR5». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (1): 183–8. Bibcode:2002PNAS..100..183Q. Дои:10.1073 / pnas.232688199. ЧВК  140921. PMID  12518064.
  36. ^ Ли MJ, Bauer G, Michienzi A, Yee JK, Lee NS, Kim J, Li S, Castanotto D, Zaia J, Rossi JJ (август 2003 г.). «Ингибирование ВИЧ-1 инфекции лентивирусными векторами, экспрессирующими Pol III-промотированные анти-ВИЧ РНК». Молекулярная терапия. 8 (2): 196–206. Дои:10.1016 / с1525-0016 (03) 00165-5. PMID  12907142.
  37. ^ Гилади Х., Кетцинель-Гилад М., Ривкин Л., Фелиг Й., Нуссбаум О., Галун Э. (ноябрь 2003 г.). «Малая интерферирующая РНК подавляет репликацию вируса гепатита В у мышей». Молекулярная терапия. 8 (5): 769–76. Дои:10.1016 / с1525-0016 (03) 00244-2. PMID  14599810.
  38. ^ Рэндалл Дж., Гракуи А., Райс К.М. (январь 2003 г.). «Удаление реплицирующихся РНК репликона вируса гепатита С в культуре клеток с помощью малых интерферирующих РНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (1): 235–40. Bibcode:2002ПНАС..100..235Р. Дои:10.1073 / pnas.0235524100. ЧВК  140937. PMID  12518066.
  39. ^ Рэндалл Дж., Райс К.М. (июнь 2004 г.). «Вмешательство в репликацию РНК вируса гепатита С». Вирусные исследования. 102 (1): 19–25. Дои:10.1016 / j.virusres.2004.01.011. PMID  15068876.
  40. ^ Бичи Р.Н., Леш-Фрис С., Тумер Н.Е. (1990). «Опосредованная белком оболочки устойчивость к вирусной инфекции». Ежегодный обзор фитопатологии. 28: 451–472. Дои:10.1146 / annurev.py.28.090190.002315.
  41. ^ Линдбо Дж. А., Догерти В. Г. (2005). «Патология растений и РНКи: краткая история». Ежегодный обзор фитопатологии. 43: 191–204. Дои:10.1146 / annurev.phyto.43.040204.140228. PMID  16078882.
  42. ^ Линдбо Дж. А., Сильва-Розалес Л., Пробстинг В. М., Догерти В. Г. (декабрь 1993 г.). «Индукция высокоспецифичного антивирусного состояния в трансгенных растениях: значение для регуляции экспрессии генов и устойчивости к вирусам». Растительная клетка. 5 (12): 1749–1759. Дои:10.1105 / tpc.5.12.1749. ЧВК  160401. PMID  12271055.
  43. ^ Гамильтон AJ, Баулкомб, округ Колумбия (октябрь 1999 г.). «Вид малой антисмысловой РНК в посттранскрипционном молчании генов у растений». Наука. 286 (5441): 950–2. Дои:10.1126 / science.286.5441.950. PMID  10542148.
  44. ^ Каневский В.К., Томас П.Е. (2004). «Картофельная история». AgBioForum. 7 (1&2): 41–46.
  45. ^ Ferreira, S.A .; Pitz, K. Y .; Manshardt, R .; Zee, F .; Fitch, M .; Гонсалвес, Д. (2002). «Трансгенная папайя с белком оболочки вируса обеспечивает практический контроль вируса кольцевой пятнистости папайи на Гавайях». Болезнь растений. 86 (2): 101–105. Дои:10.1094 / PDIS.2002.86.2.101. PMID  30823304.
  46. ^ «Папайя: история успеха ГМО». Архивировано из оригинал на 2015-06-10. Получено 2016-08-30.
  47. ^ «Папайя под прицелом: островная битва за ГМО - современный фермер». 19 декабря 2013 г.
  48. ^ Бутц К., Ристриани Т., Хенгстерманн А., Денк С., Шеффнер М., Хоппе-Зейлер Ф. (сентябрь 2003 г.). «Нацеливание siRNA на вирусный онкоген E6 эффективно убивает раковые клетки, положительные по вирусу папилломы человека». Онкоген. 22 (38): 5938–45. Дои:10.1038 / sj.onc.1206894. PMID  12955072. S2CID  21504155.
  49. ^ McCown M, Diamond MS, Pekosz A (сентябрь 2003 г.). «Применение транскриптов siRNA, продуцируемых РНК-полимеразой i, в подавлении экспрессии вирусных генов и репликации РНК-вирусов с отрицательной и положительной цепью». Вирусология. 313 (2): 514–24. Дои:10.1016 / с0042-6822 (03) 00341-6. PMID  12954218.
  50. ^ а б Fan Q, Wei C, Xia M, Jiang X (январь 2013 г.). «Ингибирование репликации вируса Тулейн in vitro с помощью РНК-интерференции». Журнал медицинской вирусологии. 85 (1): 179–86. Дои:10.1002 / jmv.23340. ЧВК  3508507. PMID  23154881.
  51. ^ «Обзор норовируса». Центр по контролю и профилактике заболеваний. 2018-12-21.
  52. ^ а б c d Либерман Дж., Сон Э., Ли СК, Шанкар П. (сентябрь 2003 г.). «Вмешательство в заболевание: возможности и препятствия на пути использования РНК-интерференции». Тенденции в молекулярной медицине. 9 (9): 397–403. Дои:10.1016 / с1471-4914 (03) 00143-6. ЧВК  7128953. PMID  13129706.
  53. ^ а б c Леунг Р.К., Уиттакер ПА (август 2005 г.). «РНК-интерференция: от подавления гена до генно-специфической терапии». Фармакология и терапия. 107 (2): 222–39. Дои:10.1016 / j.pharmthera.2005.03.004. ЧВК  7112686. PMID  15908010.
  54. ^ а б Соренсен Д. Р., Сиуд М. (2010). «Системная доставка синтетических миРНК». РНК-терапия. Методы молекулярной биологии. 629. С. 87–91. Дои:10.1007/978-1-60761-657-3_6. ISBN  978-1-60761-656-6. PMID  20387144.
  55. ^ Заас Д.В., Дункан М.Дж., Ли Дж., Райт-младший, Абрахам С.Н. (февраль 2005 г.). «Инвазия Pseudomonas в пневмоциты типа I зависит от экспрессии и фосфорилирования кавеолина-2». Журнал биологической химии. 280 (6): 4864–72. Дои:10.1074 / jbc.M411702200. PMID  15545264. S2CID  43122091.
  56. ^ Попеску Ф.Д., Попеску Ф. (сентябрь 2007 г.). «Обзор антисмысловых терапевтических вмешательств для молекулярно-биологических мишеней при астме». Биологические препараты. 1 (3): 271–83. ЧВК  2721314. PMID  19707336.
  57. ^ Пистелли Р., Ланге П., Миллер Д.Л. (май 2003 г.). «Детерминанты прогноза ХОБЛ у пожилых: гиперсекреция слизи, инфекции, сопутствующие сердечно-сосудистые заболевания». Европейский респираторный журнал. Добавка. 40: 10–14 с. Дои:10.1183/09031936.03.00403403. PMID  12762568. S2CID  19006320.
  58. ^ Шао М.Х., Наканага Т., Надель Дж.А. (август 2004 г.). «Сигаретный дым индуцирует гиперпродукцию муцина MUC5AC посредством фермента, преобразующего фактор некроза опухоли альфа в эпителиальных клетках дыхательных путей человека (NCI-H292)». Американский журнал физиологии. Клеточная и молекулярная физиология легких. 287 (2): L420–7. Дои:10.1152 / ajplung.00019.2004. PMID  15121636.
  59. ^ Реннард С.И. (ноябрь 1999 г.). «Воспаление и восстановительные процессы при хронической обструктивной болезни легких». Американский журнал респираторной медицины и реанимации. 160 (5, п. 2): S12–6. Дои:10.1164 / ajrccm.160.supplement_1.5. PMID  10556162.
  60. ^ Sacco O, Silvestri M, Sabatini F, Sale R, Defilippi AC, Rossi GA (2004). «Эпителиальные клетки и фибробласты: структурное восстановление и ремоделирование дыхательных путей». Педиатрические респираторные обзоры. 5 Дополнение A: S35–40. Дои:10.1016 / с1526-0542 (04) 90008-5. PMID  14980241.
  61. ^ "Легочный фиброз". Клиника Майо. Получено 13 декабря 2013.
  62. ^ Гуруджеялакшми Г., Гири С. Н. (сентябрь – октябрь 1995 г.). «Молекулярные механизмы антифибротического действия интерферона гамма в модели фиброза легких блеомицин-мыши: подавление экспрессии генов TGF-бета и проколлагена I и III». Экспериментальные исследования легких. 21 (5): 791–808. Дои:10.3109/01902149509050842. PMID  8556994.
  63. ^ а б c d е ж грамм "Генное молчание". НАДЕЖДА - Информационно-просветительский проект Хантингтона в области образования в Стэнфорде. Стэндфордский Университет. 2012-04-05. Получено 13 декабря 2013.
  64. ^ а б Mantha N, Das SK, Das NG (сентябрь 2012 г.). «Основанные на РНКи терапии болезни Хантингтона: проблемы доставки и возможности». Терапевтическая доставка. 3 (9): 1061–76. Дои:10.4155 / tde.12.80. PMID  23035592.
  65. ^ а б Harper SQ (август 2009 г.). «Прогресс и проблемы в интерференционной терапии РНК при болезни Хантингтона». Архив неврологии. 66 (8): 933–8. Дои:10.1001 / archneurol.2009.180. PMID  19667213.
  66. ^ "Что такое БАС?". Ассоциация ALS.
  67. ^ а б c Гэн СМ, Дин Х.Л. (февраль 2008 г.). «Дважды несовпадающие siRNA усиливают селективное подавление гена мутантного аллеля, вызывающего БАС». Acta Pharmacologica Sinica. 29 (2): 211–6. Дои:10.1111 / j.1745-7254.2008.00740.x. PMID  18215350. S2CID  24809180.
  68. ^ Булис, Николас. «Генная терапия болезни двигательных нейронов». Общество неврологии. Получено 13 декабря 2013.
  69. ^ Динг Х., Шварц Д.С., Кин А., Аффар эль Б., Фентон Л., Ся Х, Ши Й., Заморе П. Д., Сюй З. (август 2003 г.). «Избирательное подавление РНКи доминантного аллеля, вызывающего боковой амиотрофический склероз». Ячейка старения. 2 (4): 209–17. Дои:10.1046 / j.1474-9728.2003.00054.x. PMID  12934714.
  70. ^ Петиция об определении нерегулируемого статуса: события Arctic ™ Apple (Malus x domestica) GD743 и GS784. Министерство сельского хозяйства США - Служба инспекции здоровья животных и растений. Проверено 3 августа 2012.
  71. ^ «Превращение яблока в яблоко». Фирменные фрукты Оканаган. Архивировано из оригинал на 2013-09-25. Получено 2012-08-03.

внешняя ссылка