Фармакоэпигенетика - Pharmacoepigenetics - Wikipedia

Фармакоэпигенетика это развивающаяся область, изучающая основные эпигенетический паттерны маркировки, которые приводят к вариации реакции человека на лечение.[1]

Фон

Из-за генетическая гетерогенность, факторы окружающей среды и патофизиологический причин, люди, которые демонстрируют сходные проявления болезни, могут по-разному реагировать на идентичные лекарства. Было показано, что выбор лечения на основе таких факторов, как возраст, площадь поверхности тела, вес, пол или стадия заболевания, не полностью решает эту проблему, поэтому медицинские работники переходят на использование геномных данных пациента для выбора оптимального лечения. Сейчас появляется все больше свидетельств того, что эпигенетика также играет важную роль в определении безопасности и эффективности медикаментозного лечения пациентов.[2] Эпигенетика - это мост, который соединяет индивидуальную генетику и факторы окружающей среды для объяснения некоторых аспектов экспрессии генов. В частности, факторы окружающей среды могут изменить эпигенетические механизмы, чтобы повлиять на экспрессию генов. Например, курение сигарет может изменить состояние метилирования ДНК генов и, следовательно, экспрессию генов посредством различных механизмов.

Эпигенетические изменения генов, вызванные такими факторами, как окружающая среда, могут приводить к аномальной экспрессии генов и возникновению заболеваний. Прогрессирование болезней еще больше изменяет эпигенетические паттерны всего геном. Хотя эпигенетические изменения, как правило, продолжительны, а в некоторых случаях необратимы, все же существует возможность изменить эпигенетическое состояние гена. Таким образом, были разработаны лекарства, нацеленные на аберрантные эпигенетические паттерны в клетках, чтобы либо активировать, либо подавить эпигенетически модифицированную экспрессию гена экспрессии генов. Это известно как эпигенетическая терапия. Помимо того, что они являются мишенями для лекарств, эпигенетические изменения также используются как диагностический и прогностический индикаторы для прогнозирования риска и прогрессирования заболевания, и это может быть полезно для улучшения персонализированной медицины.

Развитие Проект человеческого эпигенома и достижения в эпигеномика дала начало развивающейся области, известной как фармакоэпигенетика. Первоначально фармакоэпигенетика была разработана для изучения того, как эпигенетические паттерны переносчиков лекарств, ферментов, метаболизирующих лекарственные средства, и ядерных рецепторов влияют на реакцию людей на лекарство. Теперь у фармакоэпигенетики есть дополнительный фокус: разработка терапевтических эпидемических препаратов, которые могут вносить изменения в эпигеном, чтобы уменьшить причину или симптомы заболевания у человека. Несмотря на то, что все еще остается большой разрыв между знаниями об эпигенетических модификациях механизмов метаболизма лекарств и их клиническим применением, фармакоэпигенетика стала быстрорастущей областью, которая может сыграть важную роль в персонализированной медицине.

Чтобы разработать эффективные эпигенетические методы лечения, важно понять лежащие в основе эпигенетические механизмы и задействованные белки. Различные механизмы и модификации играют роль в эпигенетическом ремоделировании и передаче сигналов, в том числе: Метилирование ДНК, гистоновая модификация, ковалентный модификации, транскрипты РНК, микроРНК, мРНК, миРНК, и позиционирование нуклеосом. В частности, ученые всесторонне изучили ассоциации метилирования ДНК, модификаций гистонов, регуляторных микроРНК с развитием заболеваний.[3][4][5]

Метилирование ДНК - наиболее изученный эпигенетический механизм. Большинство из них происходит на сайтах CpG. ДНК-метилтрансфераза набирается на сайт и добавляет метильные группы к цитозин динуклеотидов CpG. Это позволяет связывающим метил-CpG белкам связываться с метилированным сайтом и вызывать подавление генов.[6] Модификация гистонов в основном достигается за счет модификации N-концевой хвосты гистонов. Механизмы включают ацетилирование, метилирование, фосфорилирование, унибиквитинирование и т. д. Они влияют на уплотнение структуры хроматина, доступность ДНК и, следовательно, на уровень транскрипции конкретных генов.

Кроме того, микроРНК представляет собой тип некодирующей РНК, которая отвечает за изменение экспрессии генов путем нацеливания и маркировки транскриптов мРНК для деградации. Поскольку этот процесс представляет собой посттранскрипционную модификацию, он не включает изменений в последовательности ДНК. Экспрессия микроРНК также регулируется другими эпигенетическими механизмами. Аберрантная экспрессия микроРНК способствует развитию заболеваний, что делает их хорошими мишенями для эпигенетической терапии. Эпигенетические белки, участвующие в регуляции транскрипции генов, делятся на три категории: писатели, стирающие и читатели. Как писатели, так и стиратели обладают ферментативной активностью, которая позволяет им ковалентно модифицировать ДНК или гистоновые белки. Читатели обладают способностью распознавать и связываться с определенными участками хроматина для изменения эпигенетических сигнатур.

Как только будут поняты лежащие в основе эпигенетические механизмы, становится возможным разработать новые способы изменения эпигенетических меток, таких как «эпидемические препараты» или редактирование эпигенома, который представляет собой перезапись эпигенетических паттернов с использованием искусственных сигналов для направления эпигенетических белков к локусам-мишеням.[2] Кроме того, основываясь на уникальных эпигенетических паттернах пациентов, медицинские работники могут более точно назначить безопасное и эффективное лечение, включая соответствующие эпигенетические препараты, адаптированные к пациенту.

Реакция на лекарства и метаболизм

Индивидуальные различия в метаболизме лекарств и ответной реакции частично можно объяснить эпигенетическими изменениями.[7][8] Эпигенетические изменения в генах, которые кодируют мишени лекарств, ферменты или транспортные белки, которые влияют на способность организма поглощать, метаболизировать, распределять и выводить чужеродные для организма вещества (Ксенобиотики ) может привести к изменению уровня токсичности и реакции на лекарства.[7][8] Изменяется один из основных эффектов воздействия наркотиков в раннем возрасте. ADME (Поглощение, распределение, метаболизм и экскреция) экспрессия генов.[7] Есть свидетельства того, что эти гены контролируются метилированием ДНК, ацетилированием гистонов и миРНК.[9][8]

Об этих механизмах необходимо больше узнать, но есть надежда, что это может привести к правильному выбору лекарств и их дозировке.[10] Кроме того, лекарственная устойчивость может быть приобретена посредством эпигенетических механизмов. Это особенно характерно для химиотерапии, когда клетки, у которых развивается устойчивость к лечению, продолжают делиться и выживать.[7] Планы фармакоэпигенетического лечения могут состоять из одного класса эпидемических препаратов или сочетать несколько в уникальной терапии. Ниже приведены примеры того, как белки, связанные с лекарственным ответом или метаболизмом, регулируются эпигенетическими механизмами:

Cyp2e1, метилирование ДНК и ацетилирование гистонов

Возрастные изменения эпигенетических модификаций регуляторных областей мыши Cyp2e1 был связан с метаболизмом, опосредованным кодируемым им белком. Cyp2e1 опосредует гидроксилирование своего пробного лекарственного препарата хлорзоксазон до его метаболита, 6-гидроксихлорзоксазона, отрицательно коррелирует с метилированием ДНК и положительно с ацетилированием гистонов в экстрактах микросом мышей.[11]

CXCR4 и метилирование ДНК

CXCR4 - это белок, который действует как корецептор для проникновения ВИЧ. Он был разработан как лекарственная мишень для терапии против ВИЧ. Исследование показало, что его экспрессия не регулируется аномальными паттернами метилирования при некоторых видах рака. Таким образом, это может повлиять на эффективность и лекарственный ответ на терапию против ВИЧ.[1]

CYP1A1 метилирование и модификация гистонов

CYP1A1 - это белок, который хорошо известен своей ролью в химических соединениях и метаболизме лекарств.[12] Исследование рака простаты показало, что регуляторная область белка находится под контролем модификации гистона. H3K4me3, что обычно указывает на активную экспрессию гена в незлокачественных клетках.[1] Это аномальное метилирование обычно вызывает модификацию гистонов и изменения структуры хроматина на локальном уровне, тем самым влияя на экспрессию генов.[13]

ABCG2 и миРНК

ABCG2 - это белок, который отвечает за множественную лекарственную устойчивость при химиотерапии рака. Повышенная экспрессия ABCG2 обнаруживается в различных линиях устойчивых к лекарствам раковых клеток и опухолевых тканях. Одна из модификаций микроРНК изменяет экспрессию гена и белка, дестабилизируя его мРНК.[14]

Эпигенетика и болезни человека

Эпигенетика при раке

Дальнейшая информация: Эпигенетика рака

Несмотря на то, что предстоит еще много работы по эпигенетическим модификациям конкретных видов рака на различных стадиях развития опухоли, существует общее понимание эпигенетических модификаций генов, которые приводят к аномальной экспрессии и различным типам рака. Эти эпигенетические биомаркеры рассматриваются в клинической практике в качестве инструмента для обнаружения заболеваний, классификации опухолей и понимания реакции лекарств на такие виды лечения, как целевые соединения, традиционные химиотерапевтические агенты и эпигенетические препараты. Рак человека обычно характеризуется гиперметилированием специфических промоторов, которое обычно предотвращает экспрессию генов репарации ДНК и подавления опухоли, а также потерю метилирования ДНК в глобальном масштабе.[15] что может позволить экспрессию онкогенов или привести к потере импринтинга.[16] Модификации гистонов играют важную роль в регуляции клеточных процессов, таким образом, эпигенетические изменения, приводящие к изменению структуры, могут привести к аномальной транскрипции, репарации ДНК и репликации.[16] Ниже приведены несколько примеров, а затем обзор способов, которыми нацелены эти эпигенетические модификации.

Ориентация на эпигенетические модификации рака

Эпигенетические изменения широко распространены при раке, поэтому это хорошая модель для оценки различных способов использования эпигенетических препаратов для внесения изменений, которые повышают и снижают экспрессию генов.[7]

Нацелены на эпигенетические мутации, связанные с усилением функции

Ингибиторы ДНК-метилтрансферазы исследуются из-за гиперметилирования генов-супрессоров опухолей и увеличения DNMT, наблюдаемого в раковых клетках. Введение этих ингибиторов может привести к снижению метилирования промотора и экспрессии ранее подавленных генов-супрессоров опухолей. Азацитидин и децитабин, которые включаются в ДНК и ковалентно захватывают метилтрансферазы, одобрены FDA для миелодиспластический синдром (группа раковых заболеваний, при которых клетки крови из костного мозга не созревают должным образом в здоровые клетки крови) и в настоящее время исследуются на предмет других видов рака, таких как лейкемия. Разрабатываются и другие типы лекарств, например ненуклеозидные аналоги, которые могут ковалентно связываться с DNMT.[17]

Некоторые примеры включают прокаин, гидралазин и прокаинимид, но им не хватает специфичности и эффективности, что затрудняет их клинические испытания. Ингибиторы ДНК-метилтранферазы обычно используются на низком уровне из-за их недостаточной специфичности и токсического воздействия на нормальные клетки. Ингибиторы HDAC также используются из-за изменений ацетилирования гистонов и наблюдаемого увеличения HDAC. Хотя механизм все еще исследуется, считается, что добавление ингибиторов HDAC приводит к усилению ацетилирования гистонов и, следовательно, к реактивации транскрипции генов-супрессоров опухолей.[17]

Более того, HDAC могут также удалять ацетильные группы из белков, которые не являются гистоном, поэтому считается, что добавление ингибиторов HDAC может привести к изменениям активности фактора транскрипции. Около 14 различных ингибиторов HDAC изучаются в клинических испытаниях для гематологических и солидных опухолей, но необходимо провести дополнительные исследования специфичности и механизмов, с помощью которых они ингибируют. Другой способ изменить эпигенетические модификации - это использование ингибиторов гистонметилтрансферазы.[17]

Устранение эпигенетических мутаций с потерей функции

Утрата функции генов, кодирующих ДНК-деметилазы, или сверхэкспрессия ДНК-метилтрансфераз может привести к гиперметилированию промоторов ДНК.[17] Потеря функции метилтрансфераз ДНК может привести к гипометилированию. Потеря функции генов ремоделирования хромосом, репарации ДНК и регуляции клеточного цикла может привести к неконтролируемому росту клеток, вызывающему рак.[17] Паттерны модификации гистонов также могут приводить к изменениям в геномах, которые могут отрицательно влиять на эти и другие системы, повышая вероятность рака.

Клетки, несущие мутации потери функции, могут быть нацелены на лекарства, которые вызывают синтетическая летальность генетическое / белковое взаимодействие, при котором потеря одного компонента вызывает незначительные изменения, но потеря обоих компонентов приводит к гибели клеток. В раковых клетках, где одна часть взаимодействия испытывает мутацию потери функции, другая часть может быть прервана медикаментозным лечением, чтобы вызвать гибель раковых клеток. Синтетическая летальность - привлекательный вариант лечения больных раком, поскольку он не должен оказывать минимального воздействия на здоровые клетки.

Например, с SWI / SNF мутации потери функции, репликация и репарация ДНК отрицательно сказываются и могут привести к опухолям, если рост клеток не будет остановлен. Мутации этих генов - частые причины рака. Эти мутации не являются мишенями для прямого воздействия, но противораковые препараты могут использовать несколько синтетических летальных взаимодействий для подавления раннего роста рака.[17]

Кроме того, мутации с потерей функции могут быть нацелены на использование динамических состояний модификаций гистонов. Мутации с потерей функции в деметилазах, такие как KDMK6A распространены при раке.[17] Вызывая повышающую регуляцию ингибиторов метилтрансферазы, можно смягчить эффекты мутации потери функции.[17]

Разработка лекарств, нацеленных на эпигенетические сигнатуры генов-мишеней или изменяющих их, растет, особенно по мере того, как биоинформатический анализ расширяет наши знания о геноме человека и ускоряет поиск синтетических летальных взаимодействий. Наиболее широко для оценки потенциальных синтетических летальных взаимодействий используют миРНК и CRISPR-Cas9 для модификации целевых генов. CRISPRi и CRISPRa Технология позволяет исследователям активировать или деактивировать гены-мишени.

Рак легких

При раке легкого наблюдалась активация как доминантных, так и рецессивных онкогенов и инактивация генов-супрессоров опухоли.[16] При раке легких часто наблюдается метилирование промоторов генов, которые участвуют в важнейших функциях, таких как контроль клеточного цикла, восстановление ДНК, адгезия клеток, пролиферация, апоптоз и подвижность. Некоторые из часто наблюдаемых общих генов: APC, CDH1, CDKN2A, MGMT и RASSF1A (опухолевый супрессор).[15] В случае ДНК CDKN2A и RASSF1A эти гены метилированы, что приводит к потере генов-супрессоров опухоли.[16]

Различные стратегии, такие как употребление наркотиков, таких как энтиностат и азацитидин наблюдались в клинических испытаниях немелкоклеточного рака легкого. Идея состоит в том, что этиностат, ингибитор гистондеацетилазы, может предотвращать замалчивание генов, делая их доступными для транскрипционного аппарата. Азацитидин может метаболизироваться и включаться в ДНК, а затем распознаваться в качестве субстрата для ДНК-метилтрансфераз, но поскольку фермент связан, метилтрансфераза не может добавлять метки метилирования и, таким образом, заставлять ключевые гены заглушать.

Сердечная недостаточность

Было обнаружено, что модификации гистонов, метилирование ДНК и микроРНК играют важную роль в сердечных заболеваниях.[18] Ранее ацетилирование гистонового хвоста было связано с гипертрофией сердца или аномальным утолщением сердечной мышцы, что обычно связано с увеличением размера кардиомиоцитов или другими изменениями сердечной мышцы.[19] Гипертрофические изменения, происходящие в клетках сердечной мышцы, являются результатом необходимого ацетилирования гистоновых хвостов с помощью ацетилтрансфераз. Помимо ацетилтрансфераз, гистоновые деацетилазы (HDAC) также способствуют регуляции мышечных клеток. HDAC 5 и 9 класса II подавляют активность фактора, известного как фактор усиления миоцитов 2 (MEF2 ), который не может связываться, предотвращает экспрессию генов, вызывающих гипертрофические эффекты.

Кроме того, такие локусы, как PECAM1, AMOTL2 и ARHGAP24 были замечены различные паттерны метилирования, которые коррелируют с измененной экспрессией генов в сердечной ткани.[18]

Растет количество научных публикаций, в которых обнаруживается, что miRNA играет ключевую роль в различных аспектах сердечной недостаточности.[18] Примеры функций miRNA включают регуляцию клеточного цикла кардиомиоцитов и регуляцию роста клеток кардиомиоцитов.[20][21] Знание эпигенетических модификаций позволяет использовать лекарственные препараты для изменения эпигенетического статуса целевой последовательности. Возможно, можно было бы нацелить miRNA с помощью антагомиров. Антагомиры представляют собой комплементарные однонитевые РНК, которые были химически сконструированы олигонуклеотидами, которые заглушают миРНК, так что они не могут разрушать мРНК, которая необходима для нормальных уровней экспрессии.

Метилирование ДНК CpG может приводить к снижению экспрессии генов, а в некоторых случаях это уменьшение продукта гена может способствовать развитию болезни. Следовательно, в таких случаях важно иметь потенциальные лекарства, которые могут изменить статус метилирования гена и повысить уровни экспрессии. Чтобы увеличить экспрессию гена, можно попытаться уменьшить метилирование CpG, используя лекарство, которое действует как ингибитор ДНК-метитрансферазы, такое как децитабин или 5-аза-2'-дезоксицитидин.[1]

С другой стороны, некоторые заболевания возникают в результате снижения активности ацетилазы, что приводит к снижению экспрессии генов. Некоторые исследования показали, что подавление активности HDAC может уменьшить гипертрофию сердца.[18] трихостатин А и бутират натрия являются двумя ингибиторами HDAC. Трихостатин А известен своей способностью ингибировать HDAC класса I и II от удаления ацетилазы и снижения экспрессии генов. Бутират натрия представляет собой другое химическое вещество, которое ингибирует HDAC класса I, что приводит к способности факторов транскрипции легко получать доступ и экспрессировать ген.

Проблемы в развитии эпигенетической терапии

Существует ряд проблем, связанных с развитием эпигенетических методов лечения, которые широко используются в медицине. Хотя лабораторные результаты показывают взаимосвязь между генами и потенциальными лекарственными взаимодействиями, которые могут смягчить последствия мутаций, сложность генома и эпигенома человека затрудняет разработку безопасных, эффективных и последовательных методов лечения. Эпигенетическое изменение может повлиять на большее количество систем, чем на гены-мишени, что дает возможность возникновения пагубных последствий лечения. Кроме того, эпигенетические мутации могут быть результатом родословной.[5]

Поскольку экспрессия тканевых генов в значительной степени регулируется эпигенетическими взаимодействиями, определенные тканеспецифические виды рака трудно нацелить на эпигенетические методы лечения. Кроме того, гены, кодирующие элементы, предотвращающие один тип рака в клетке, могут изменить функцию другого и привести к другому типу рака. Попытка изменить эти белки, такие как EZH2, может вызвать другие типы рака. Селективность - еще одно препятствие на пути к развитию терапии. Поскольку многие белки структурно похожи, особенно в пределах одного семейства белков, ингибиторы широкого спектра действия не всегда могут быть использованы, поскольку изменение регуляции одного белка может делать то же самое с другими в семействе.[5]

Основываясь на различиях в этих эпигенетических паттернах, ученые и врачи могут дополнительно предсказать реакцию каждого пациента на лекарство. Одним из наиболее убедительных примеров является метилирование гена-супрессора опухоли по промоторной последовательности, которая кодирует MGMT.[22] MGMT представляет собой белок репарации ДНК, ответственный за перенос метильных групп от O (6) -алкилгуанина в ДНК к самой себе, чтобы бороться с мутагенезом и накоплением токсичных соединений, которые образуются в результате действия алкилирующих агентов.[23]

Таким образом, MGMT отвечает за восстановление участков, поврежденных токсинами. Было обнаружено, что этот промоторный участок MGMT сильно метилирован и, таким образом, подавлен у пациентов с различными типами рака.[23] Некоторые препараты, такие как прокарбазин, стрептозотоцин, BCNU (кармустин ), и темозоламид предназначены для ремоделирования ДНК, чтобы обратить эту аномальную модификацию метилирования, чтобы MGMT мог нормально экспрессироваться и восстанавливать ДНК. Статус метилирования промотора стал лучшим предиктором ответов на BCNU и темозоламид у пациентов с раком мозга.

Эпигенетические ингибиторы и методы лечения

Бромодомен и ингибиторы (ингибитор БЭТ)

Белки, содержащие бромодомены признать и связать ацетилированный лизин остатки в гистоны, вызывая модификацию структуры хроматина и последующий сдвиг в уровнях экспрессии генов. Бромодомен и экстра-терминальные (BET) белки связывают ацетильные группы и работают с RNAPII помочь с транскрипция и удлинение хроматина. Ингибиторы БЭТ смогли предотвратить успешное взаимодействие между белками BET и ацетилированными гистонами.[17] Использование ингибитора BET может снизить избыточную экспрессию белков бромодомена, что может вызвать аберрантное ремоделирование хроматина, регуляцию транскрипции и ацетилирование гистонов.[17]

Ингибиторы гистонацетилазы

Несколько исследований показали, что гистонацетилтрансфераза (HAT) ингибиторы полезны для повторной индукции экспрессии генов супрессии опухоли путем остановки активности гистонацетилтрансферазы для предотвращения конденсации хроматина.[24]

Протеин метилтрансфераза (PMT) ингибиторы: PMT играют ключевую роль в метилировании остатков лизина и аргинина, влияя на уровни транскрипции генов. Было высказано предположение, что их ферментативная активность играет роль в развитии рака, а также нейродегенеративных и воспалительных заболеваний.[24]

Ингибиторы гистон-деацетилазы

С помощью Гистоновая деацетилаза (HDAC) ингибиторы позволяет генам оставаться транскрипционно активными. HDACi использовались при различных аутоиммунных заболеваниях, таких как системная красная волчанка, ревматоидный артрит и ювенильный идиопатический артрит с системным началом.[7] Они также оказались полезными для лечения рака, поскольку они структурно разнообразны и влияют только на 2-10% экспрессируемых генов.[24] Использование ингибиторов HDAC для лечения психических и нейродегенеративных заболеваний показало многообещающие результаты в ранних исследованиях.[24] Кроме того, исследования показали, что HDACi полезны для минимизации повреждений после инсульта и стимулирования ангиогенеза и миогенеза в эмбриональных клетках.[24]

Ингибиторы ДНК-метилтрансферазы

Одной из общих характеристик различных типов рака является гиперметилирование гена, подавляющего опухоль. Подавление этого действия метилтрансферазы в локусах-мишенях может предотвратить повторяющийся перенос метильных групп в эти сайты и держать их открытыми для транскрипционного аппарата, позволяя создавать больше генов, подавляющих опухоль. Эти препараты обычно цитидин производные. Эти препараты привязывают DNMT к ДНК и предотвращают их дальнейшее действие. Лечения, которые подавляют функцию DNMT без присоединения к ДНК (что может вызывать токсические эффекты), показывают, что они могут быть эффективными вариантами лечения, но они недостаточно разработаны, чтобы найти широкое применение.[7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c d Gomez, A .; Ингельман-Сундберг, М. (25 февраля 2009 г.). «Фармакоэпигенетика: ее роль в индивидуальных различиях в реакции на лекарства». Клиническая фармакология и терапия. 85 (4): 426–430. Дои:10.1038 / clpt.2009.2. PMID  19242404.
  2. ^ а б Иванов, Максим; Барраган, Изабель; Ингельман-Сундберг, Магнус (2014). «Эпигенетические механизмы, важные для лечения лекарств». Тенденции в фармакологических науках. 35 (8): 384–96. Дои:10.1016 / j.tips.2014.05.004. PMID  24993164.
  3. ^ Келли, Тереза ​​К.; Де Карвалью, Даниэль Д.; Джонс, Питер А (октябрь 2010 г.). «Эпигенетические модификации как терапевтические цели». Природа Биотехнологии. 28 (10): 1069–1078. Дои:10.1038 / nbt.1678. ISSN  1087-0156. ЧВК  3022972. PMID  20944599.
  4. ^ Портела, Анна; Эстеллер, Манель (октябрь 2010 г.). «Эпигенетические модификации и болезни человека». Природа Биотехнологии. 28 (10): 1057–1068. Дои:10.1038 / nbt.1685. ISSN  1087-0156. PMID  20944598.
  5. ^ а б c Вебер, Венделл (2010). «Перспективы эпигенетики в персонализированной медицине». Молекулярные вмешательства. 10 (6): 363–370. Дои:10.1124 / миль 10.6.5. PMID  21263162.
  6. ^ Tammen, Stephanie A .; Фризо, Симонетта; Чой, Санг-Вун (2013). «Эпигенетика: связь между природой и воспитанием». Молекулярные аспекты медицины. 34 (4): 753–764. Дои:10.1016 / j.mam.2012.07.018. ISSN  0098-2997. ЧВК  3515707. PMID  22906839.
  7. ^ а б c d е ж грамм Лаушке, Фолькер; Барраган, Изабель; Ингельман-Сундберг, Магнус (2018). Фармакоэпигенетика и токсикоэпигенетика: новые взгляды на механизмы и терапевтические возможности (58-е изд.). Пало-Альто: Ежегодные обзоры. С. 161–185.
  8. ^ а б c Баер-Дубовска, Ванда; Майхрзак-Целинска, Александра; Cichocki, Михал (2011). «Фармокоэпигенетика: новый подход к прогнозированию индивидуальных реакций на лекарства и нацеливание на новые лекарства». Фармакологические отчеты. 63 (2): 293–304. Дои:10.1016 / S1734-1140 (11) 70498-4. PMID  21602587.
  9. ^ Ингельман-Сундберг, М; Каскорби, I (2016). «Фармакогеномные или -эпигеномные биомаркеры в лекарственной терапии: две стороны одной медали?». Клиническая фармакология и терапия. 99 (5): 478–480. Дои:10.1002 / cpt.351. PMID  26874931.
  10. ^ Чжун, Сяо-бо; Лидер, Стивен (2013). «Эпигенетическая регуляция генов, связанных с ADME: фокус на метаболизм и транспорт лекарств». Метаболизм и утилизация лекарств. 41 (10): 1721–1724. Дои:10.1124 / dmd.113.053942. ЧВК  3920173. PMID  23935066.
  11. ^ Кронфол, ММ; Яр, FM; Дозморов, МГ; Фансалкар, ПС; Xie, LY; Aberg, KA; McRae, M; Цена, ET; Slattum, PW; Герк, ПМ; Макклей, Дж. Л. (27 марта 2020 г.). «Метилирование ДНК и ацетилирование гистонов изменяют регуляцию цитохрома P450 2E1 при нормальном старении и влияют на скорость метаболизма лекарств в печени». Геронаука. Дои:10.1007 / s11357-020-00181-5. ЧВК  7287002. PMID  32221779.
  12. ^ Уолш, Агнес А .; Szklarz, Grazyna D .; Скотт, Эмили Э. (3 мая 2013 г.). «Структура человеческого цитохрома P450 1A1 и его полезность для понимания метаболизма лекарств и ксенобиотиков». Журнал биологической химии. 288 (18): 12932–12943. Дои:10.1074 / jbc.M113.452953. ISSN  1083-351X. ЧВК  3642336. PMID  23508959.
  13. ^ Ким, Ин-Ва; Хан, Наён; Burckart, Gilbert J .; О, Чон Ми (2014). «Эпигенетические изменения в экспрессии генов для ферментов, метаболизирующих лекарственные средства, и переносчиков». Фармакотерапия. 34 (2): 140–150. Дои:10.1002 / phar.1362. PMID  24166985.
  14. ^ Мо, Вэй; Чжан, Цзянь-Тин (30 марта 2011 г.). «Человеческий ABCG2: структура, функции и его роль в множественной лекарственной устойчивости». Международный журнал биохимии и молекулярной биологии. 3 (1): 1–27. ISSN  2152-4114. ЧВК  3325772. PMID  22509477.
  15. ^ а б Лопомо, Анджела; Коппеде, Фабио (2018). Глава 12 - Эпигенетические сигнатуры в диагностике и прогнозе рака. Трансляционная эпигенетика. Эпигенетические механизмы рака. С. 313–343. Дои:10.1016 / B978-0-12-809552-2.00012-7. ISBN  9780128095522.
  16. ^ а б c d Герцег, Зденко; Вессьер, Томас (2011). «Эпигенетические механизмы и рак: интерфейс между окружающей средой и геномом». Эпигенетика. 6 (7): 804–819. Дои:10.4161 / epi.6.7.16262. PMID  21758002.
  17. ^ а б c d е ж грамм час я j Пфистер, София Сяо; Ашворт, Алан (2017). «Метка смерти: нацеливание на эпигенетические изменения рака». Обзоры природы Drug Discovery. 16 (4): 241–263. Дои:10.1038 / nrd.2016.256. PMID  28280262.
  18. ^ а б c d Ирен, Матео Лич; ван дер Харст, Пим; де Бур, Рудольф А (июнь 2010 г.). «Фармакоэпигенетика при сердечной недостаточности». Текущие отчеты о сердечной недостаточности. 7 (2).
  19. ^ «Гипертрофия сердца». Nature.com. Macmillan Publishers Limited. Получено 10 апреля 2018.
  20. ^ Чжао, Юн; Рэнсом, Джошуа Ф .; Ли, Анькан; Vedantham, Vasanth .; фон Дреле, Моргон; Muth, Alecia N .; Цучихаси, Такатоши; Макманус, Майкл Т .; Шварц, Роберт Дж .; Шривастава, Дипак (20 апреля 2007 г.). «Нарушение регуляции кардиогенеза, сердечной проводимости и клеточного цикла у мышей, лишенных miRNA-1-2». Клетка. 129 (2): 303–317. Дои:10.1016 / j.cell.2007.03.030. PMID  17397913.
  21. ^ Икеда, S; Он, А; Kong, S.W; Лу, Дж; Bejar, R; Бодак, Н; Ли, К.-Х; Ма, Q; Канг, П. М.; Голуб Т. Р; Пу, В. Т (15 апреля 2009 г.). «МикроРНК-1 негативно регулирует экспрессию связанных с гипертрофией генов кальмодулина и Mef2a». Молекулярная и клеточная биология. 29 (8): 2193–2204. Дои:10.1128 / MCB.01222-08. ЧВК  2663304. PMID  19188439.
  22. ^ Эстеллер, Манель (2003). «Актуальность метилирования ДНК в лечении рака». Ланцет онкологии. 4 (6): 351–358. Дои:10.1016 / S1470-2045 (03) 01115-X. PMID  12788407.
  23. ^ а б «MGMT O-6-метилгуанин-ДНК-метилтрансфераза [Homo sapiens (человек)]». NCBI. Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США. Получено 13 апреля 2018.
  24. ^ а б c d е Хеербот, Сара; Лапинская, Каролина; Снайдер, Николь; Лири, Меган; Роллинсон, Сара; Саркар, Сибаджи (2014). «Использование эпигенетических препаратов при заболеваниях: обзор». Генетика и эпигенетика. 6: 9–19. Дои:10.4137 / GEG.S12270. ЧВК  4251063. PMID  25512710.