Сюжет для скрипки - Violin plot

Пример скрипичного сюжета
Пример скрипичного сюжета в научном издании в г. Патогены PLOS.

А скрипичный сюжет это метод построения числовых данных. Это похоже на коробчатый сюжет, с добавлением повернутого график плотности ядра с каждой стороны.[1]

Сюжеты для скрипки похожи на коробчатые участки, за исключением того, что они также показывают плотность вероятности данных при разных значениях, обычно сглаженных оценщик плотности ядра. Обычно график скрипки будет включать все данные, которые есть в прямоугольной диаграмме: маркер для медианы данных; прямоугольник или маркер, указывающий межквартильный размах; и, возможно, все точки выборки, если количество выборок не слишком велико.

Недавно было показано, что график скрипки, называемый графиком зеркальной плотности (MD plot), превосходит обычные графики скрипки с точки зрения идентификации интересных структур в данных на языках программирования R и Python.[2] Сюжеты для скрипки доступны как расширения к ряду программных пакетов, таких как DataVisualization on CRAN. [3] и пакет md-plot на PyPI.[4]

Сюжет для скрипки более информативен, чем сюжет из простой коробки. В то время как прямоугольная диаграмма показывает только сводную статистику, такую ​​как среднее / медианное значение и межквартильный размах, диаграмма скрипки показывает полное распределение данных. Это различие особенно полезно, когда распределение данных является мультимодальным (более одного пика). В этом случае график скрипки показывает наличие разных пиков, их положение и относительную амплитуду.

Подобно коробчатым диаграммам, скрипичные диаграммы используются для представления сравнения распределения переменных (или распределения выборок) по разным «категориям» (например, распределение температуры по сравнению с днем ​​и ночью или распределение цен на автомобили по сравнению с разными производителями автомобилей).

Сюжет скрипки может состоять из нескольких слоев. Например, внешняя форма представляет все возможные результаты. Следующий слой внутри может представлять значения, которые встречаются в 95% случаев. Следующий слой (если он существует) внутри может представлять значения, которые встречаются в 50% случаев.

Хотя они более информативны, чем коробчатые диаграммы, они менее популярны. Из-за их непопулярности их значение может быть труднее понять многим читателям, не знакомым с сюжетом скрипки. В этом случае более доступной альтернативой может быть построение серии составных гистограмм или распределения плотности ядра.

Сюжеты для скрипки доступны как расширения ряда программных пакетов, включая р пакеты vioplot, wvioplot, caroline, UsingR, lattice и ggplot2, то Stata надстройка команды vioplot,[5] и Python библиотеки matplotlib[6], Сюжетно[7], КОРЕНЬ[8] и Сиборн[9], тип графика в Источник [10], ИГОРЬ ПРО [11],Юля пакет статистического построения StatsPlots.jl[12] и Распределение в Mathematica.

Рекомендации

  1. ^ "Сюжет для скрипки". NIST DataPlot. Национальный институт стандартов и технологий. 2015-10-13.
  2. ^ Thrun, Michael C .; Гелерт, Тино; Ульч, Альфред (2020-10-14). Vafaee, Fatemeh (ред.). «Анализ тонкой структуры распределений». PLOS ONE. 15 (10): e0238835. Дои:10.1371 / journal.pone.0238835. ISSN  1932-6203.
  3. ^ «CRAN - Визуализация данных пакета».
  4. ^ "мд-сюжет. PyPI".
  5. ^ Hintze, Jerry L .; Нельсон, Рэй Д. (1998). "Скрипичные сюжеты: синергизм следа плотностной коробки". Американский статистик. 52 (2): 181–4. Дои:10.1080/00031305.1998.10480559.
  6. ^ "скрипичные сюжеты". Что нового в matplotlib.
  7. ^ «Сюжеты для скрипки на Python». Справочник по библиотеке API Plotly Python.
  8. ^ «Вариант для скрипки». Получено 2020-05-05.
  9. ^ Васком, Михаил. «Скрипка из широкого набора данных». Seaborn: визуализация статистических данных.
  10. ^ «Сюжет для скрипки в Origin 2019». Получено 2018-10-29.
  11. ^ "Игорь Про 8 Основные моменты". Волновые метрики. Получено 2019-07-28.
  12. ^ "коробчатый сюжет, точечный сюжет и скрипка". Получено 2020-08-15.

внешняя ссылка

Эта статья включаетматериалы общественного достояния от Национальный институт стандартов и технологий документ: «Справочник по Dataplot: Сюжет для скрипки».