Регукалцин - Regucalcin

RGN
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3G4E, 3G4H, 4GNB, 4GNC
Идентификаторы
Псевдонимы	RGN, GNL, HEL-S-41, RC, SMP30, регукалцин
Внешние идентификаторы	OMIM: 300212 MGI: 108024 ГомолоГен: 3437 Генные карты: RGN
Номер ЕС	3.1.1.17
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp11.3 Начинать 47,078,355 бп[1] Конец 47,093,314 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X A1.3 Начинать 20,549,787 бп[2] Конец 20,562,089 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • глюконолактоназная активность • связывание ионов цинка • GO: 0010576 ферментный регулятор активности • связывание ионов металлов • гидролазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • ядро клетки • внеклеточная область Биологический процесс • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • положительная регуляция процесса биосинтеза триглицеридов • положительная регуляция активности АТФазы • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • развитие почек • отрицательная регуляция подвижности жгутиковых сперматозоидов • старение • положительная регуляция протеолиза, участвующего в катаболическом процессе клеточного белка • клеточный гомеостаз ионов кальция • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция процесса обмена глюкозы • положительная регуляция процесса биосинтеза жирных кислот • отрицательная регуляция развития костей • положительная регуляция активности дифосфатазы dUTP • положительная регуляция активности фосфатазы • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • регенерация печени • GO: 0034259 отрицательная регуляция активности GTPase • отрицательная регуляция процесса биосинтеза оксида азота • отрицательная регуляция процесса биосинтеза РНК • сперматогенез • регуляция опосредованной кальцием передачи сигналов • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • отрицательная регуляция активности лейцин-тРНК лигазы • отрицательная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы • развитие печени • отрицательная регуляция активности циклической нуклеотидной фосфодиэстеразы • отрицательная регуляция катаболического процесса ДНК • отрицательная регуляция процесса биосинтеза ДНК • положительная регуляция активности кальций-транспортной АТФазы • отрицательная регуляция кальций-зависимой активности АТФазы • положительная регуляция активности супероксиддисмутазы • Процесс биосинтеза L-аскорбиновой кислоты Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9104	19733
Ансамбль	ENSG00000130988	ENSMUSG00000023070
UniProt	Q15493	Q64374
RefSeq (мРНК)	NM_001282848 NM_001282849 NM_004683 NM_152869	NM_009060
RefSeq (белок)	NP_001269777 NP_001269778 NP_004674 NP_690608	NP_033086
Расположение (UCSC)	Chr X: 47.08 - 47.09 Мб	Chr X: 20,55 - 20,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регукалцин это белок что у людей кодируется RGN ген^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является высококонсервативным, кальций-связывающий белок, что предпочтительно выражается в печень, почка и другие ткани.^{[8][9][10][11]} Это может сыграть важную роль в кальциевый гомеостаз. Исследования на крысах показывают, что этот белок также может играть роль в старении, поскольку показывает, что он связан с возрастом. понижающее регулирование. Этот ген является частью кластер генов на хромосоме Xp11.3-Xp11.23. Альтернатива сращивание приводит к двум варианты расшифровки имеющие разные 5 'UTR, но кодирующие один и тот же белок.^[7]

Регукалцин - это предлагаемое название для кальций-связывающий белок что было обнаружено в 1978 году ^{[12][13][14][15]} Этот белок также известен как Белок-маркер старения-30 (SMP30).^[16][17] Регукалцин отличается от кальмодулин и другие Ca²⁺-связанные белки, поскольку он не содержит EF-мотив Ca²⁺-связывающий домен.^[13][18] Может регулировать действие Ca²⁺ на функции клеток печени.^[15] Во многих исследованиях было показано, что регукалцин играет многофункциональную роль во многих типах клеток в качестве регуляторного белка во внутриклеточной сигнальной системе.

Ген

Регукальцин и его ген (rgn) идентифицированы у 16 ​​видов, состоящих из семейства регукальцинов.^[11][18] Регукальцин в значительной степени экспрессируется в печени крыс, хотя в небольших количествах белок содержится в других тканях и клетках. Ген регукальцина крысы состоит из семи экзонов и шести интронов, а также нескольких консенсусных регулирующие элементы существуют выше 5’-флангового региона.^[19] Ген локализован на проксимальном конце хромосомы Xq11.1-12 крысы и Xp11.3-Xp11.23 человека. АП-1, НФИ-А1, РГПР-p117, а Wnt / β-катенин / TCF4 может связываться с промоутер регион крысиного гена регукальцина для опосредования Са2 + и других сигнальных ответов с различными гормонами и цитокинами для активации транскрипции.^[20]

Функция

Регукальцин играет ключевую роль в сохранении внутриклеточного Ca²⁺ гомеостаз за счет активации Са²⁺ закачивать ферменты в плазматическая мембрана (базолатеральная мембрана), микросомы (эндоплазматический ретикулум) и митохондрии многих клеток. Регукальцин локализуется в цитоплазме, митохондриях, микросомах и ядре. Регукальцин перемещается из цитоплазмы в ядро ​​при гормональной стимуляции. Регукалцин угнетающе действует на кальциевая сигнализация от цитоплазмы к ядру в пролиферативных клетках. Кроме того, было продемонстрировано, что регукальцин транспортируется в ядра клеток и может ингибировать ядерное протеинкиназа, протеинфосфатаза, и дезоксирибонуклеиновая кислота и рибонуклеиновая кислота синтез. Регукалцин может контролировать усиление распространение клеток за счет гормональной стимуляции. Кроме того, было показано, что регукальцин оказывает ингибирующее действие на аминоацил-т-РНК-синтетазу, фермент, ограничивающий скорость трансляции синтез белка и активирующее действие на цистеин-протеазу и супероксиддисмутазу в клетках печени и почек.

Регукалцин экспрессируется в нейронах тканей головного мозга, а уменьшение содержания регукальцина в головном мозге вызывает накопление кальция в микросомах мозга. Регукальцин оказывает ингибирующее действие на активность протеинкиназы и протеинфосфатазы, зависящую от передачи сигналов Са. Было показано, что регукальцин оказывает активирующее действие на фермент, перекачивающий кальций (Са-АТФазу) в сердце. саркоплазматический ретикулум. Регукалцин играет роль в стимулировании транспорта кальция с мочой в эпителиальные клетки из кора почек. Сверхэкспрессия регукальцина подавляет смерть клетки и апоптоз в клонированных клетках гепатомы крысы и нормальных эпителиальных клетках почек крысы (NRK52E), индуцированный различными сигнальными факторами.

Таким образом, регукальцин играет многофункциональную роль в регуляции функций клеток печени, коры почек, сердца и мозга. Таким образом, регукальцин играет ключевую роль в поддержании гомеостаза и функции клеток.^[21] Регукальцин играет ключевую роль в качестве белка-супрессора для клеточных сигнальных систем во многих типах клеток.

Патофизиологическая роль

Было показано, что сверхэкспрессия регукальцина у крыс (трансгенных крыс) вызывает потеря костной массы и гиперлипидемия с возрастом, что указывает на патофизиологическую роль. Трансгенная крыса с регукальцином может быть полезным инструментом в качестве модель животных в остеопороз и гиперлипидемия.^[22] Также известно, что мыши с нокаутом регукальцина / SMP30 вызывают подавление аскорбиновая кислота биосинтез. Было высказано предположение, что нарушение экспрессии регукальцина вызвано раком, функцией мозга, повреждением сердца, почечная недостаточность, остеопороз и гиперлипидемия.^[23][24]. Регукальцин играет новую роль в качестве супрессора в канцерогенезе у людей с различными типами рака, включая рак поджелудочной железы, рак груди, гепатому и рак легких.^[25][26][23] Следует отметить, что был проведен систематический поиск для выявления кандидатов-биомаркеров для панели биомаркеров слабости. Базы данных по экспрессии генов должны были идентифицировать гены, регулируемые старением, долголетием и возрастными заболеваниями, с акцентом на секретируемые факторы или молекулы, обнаруживаемые в жидкостях тела как потенциальные биомаркеры слабости. Всего было оценено 44 маркера в семи перечисленных выше категориях, 19 получили высокий балл, 22 - средний приоритет и три - низкий приоритет. В каждой категории были определены маркеры высокого и среднего приоритета. Регукальцин (RGN) был предложен в качестве основного гена (белка) с высоким приоритетом биомаркеров дряхлости с целью определения их диагностического, прогностического и терапевтического потенциала.^[27]Примечательно, что было показано, что эпигенетические модификации сурвивина и регукальцина в тканях немелкоклеточного рака легкого способствуют развитию злокачественных новообразований.^[28]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130988 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023070 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Симокава Н., Мацуда Ю., Ямагути М. (октябрь 1995 г.). «Геномное клонирование и хромосомное отнесение крысиного гена регукальцина». Молекулярная и клеточная биохимия. 151 (2): 157–63. Дои:10.1007 / BF01322338. PMID  8569761. S2CID  20648596.
6. Фудзита Т., Мандель Дж. Л., Ширасава Т., Хино О, Шираи Т., Маруяма Н. (сентябрь 1995 г.). «Выделение клона кДНК, кодирующего человеческий гомолог белка-маркера старения-30 (SMP30), и его расположение на Х-хромосоме». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1263 (3): 249–52. Дои:10.1016/0167-4781(95)00120-6. PMID  7548213.
7. «Ген Entrez: Регукальцин RGN (белок-маркер старения-30)».
8. Ямагути М., Исогай М., Като С., Мори С. (июнь 1991 г.). «Иммуногистохимическая демонстрация кальций-связывающего белка регукальцина в тканях крыс: белок локализуется в печени и головном мозге». Химико-фармацевтический бюллетень. 39 (6): 1601–3. Дои:10.1248 / cpb.39.1601. PMID  1934180.
9. Симокава Н., Ямагути М. (июнь 1992 г.). «Введение кальция стимулирует экспрессию мРНК кальций-связывающего белка регукальцина в печени крысы». Письма FEBS. 305 (2): 151–4. Дои:10.1016 / 0014-5793 (92) 80884-Дж. PMID  1618342. S2CID  24974683.
10. Ямагути М., Исогай М. (май 1993 г.). «Тканевая концентрация кальцийсвязывающего белка регукальцина у крыс с помощью иммуноадсорбентного анализа с ферментной связью». Молекулярная и клеточная биохимия. 122 (1): 65–8. Дои:10.1007 / BF00925738. PMID  8350865. S2CID  22140722.
11. Мисава Х., Ямагути М. (август 2000 г.). «Ген Са2 + -связывающего белка регукальцина высоко консервативен у позвоночных». Международный журнал молекулярной медицины. 6 (2): 191–6. Дои:10.3892 / ijmm.6.2.191. PMID  10891565.
12. Ямагути М., Ямамото Т. (июнь 1978 г.). «Очистка кальцийсвязывающего вещества из растворимой фракции нормальной печени крысы». Химико-фармацевтический бюллетень. 26 (6): 1915–8. Дои:10.1248 / cpb.26.1915. PMID  699201.
13. Ямагути М., Сугии К. (февраль 1981 г.). «Свойства кальций-связывающего белка, выделенного из растворимой фракции нормальной печени крысы». Химико-фармацевтический бюллетень. 29 (2): 567–70. Дои:10.1248 / cpb.29.567. PMID  7273253.
14. Ямагути М., Мори С. (январь 1988 г.). «Влияние Ca2 + и Zn2 + на активность 5'-нуклеотидазы в плазматических мембранах печени крыс: кальций-связывающий белок печени (регукалцин) обращает действие Ca2 +». Химико-фармацевтический бюллетень. 36 (1): 321–325. Дои:10.1248 / cpb.36.321. PMID  2837338.
15. Ямагути М. (1992). «Новый Са2 + -связывающий белок регукальцин и ингибирование кальция. Регуляторная роль в функции клеток печени». Подавление кальция. Бока-Ратон: CRC Press. С. 19–41.
16. Фудзита Т., Учида К., Маруяма Н. (апрель 1992 г.). «Очистка маркера старения белка-30 (SMP30) и его андроген-независимое уменьшение с возрастом в печени крыс». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Общие предметы. 1116 (2): 122–8. Дои:10.1016/0304-4165(92)90108-7. PMID  1581340.
17. Фудзита Т., Ширасава Т., Учида К., Маруяма Н. (октябрь 1992 г.). «Выделение клона кДНК, кодирующего белок маркера старения крысы-30 (SMP30), и его распределение в тканях». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1132 (3): 297–305. Дои:10.1016 / 0167-4781 (92) 90164-у. PMID  1420310.
18. Симокава Н., Ямагути М. (август 1993 г.). «Молекулярное клонирование и секвенирование кДНК, кодирующей кальций-связывающий белок регукальцин из печени крысы». Письма FEBS. 327 (3): 251–5. Дои:10.1016 / 0014-5793 (93) 80998-а. PMID  8348951. S2CID  1303220.
19. Ямагути М., Макино Р., Симокава Н. (декабрь 1996 г.). «5'-концевые последовательности и организация экзонов в гене регукальцина крысы». Молекулярная и клеточная биохимия. 165 (2): 145–50. Дои:10.1007 / bf00229476. PMID  8979263. S2CID  10508949.
20. Ямагути М. (январь 2011 г.). «Транскрипционная регуляция экспрессии гена регукальцина». Молекулярная и клеточная биохимия. 346 (1–2): 147–71. Дои:10.1007 / s11010-010-0601-8. PMID  20936536. S2CID  22077914.
21. Ямагути М. (март 2005 г.). «Роль регукальцина в поддержании гомеостаза и функции клеток (обзор)». Международный журнал молекулярной медицины. 15 (3): 371–89. Дои:10.3892 / ijmm.15.3.371. PMID  15702226.
22. Ямагути М. (август 2010 г.). «Регукалцин и метаболические нарушения: у трансгенных крыс с регукальцином индуцируются остеопороз и гиперлипидемия». Молекулярная и клеточная биохимия. 341 (1–2): 119–33. Дои:10.1007 / s11010-010-0443-4. PMID  20349117. S2CID  12577305.
23. Ямагути М (2017). Роль Регукальцина в гомеостазе и нарушениях клетки. Нью-Йорк: Nova Science Publishers. С. 1–288. ISBN  978-3-319-39855-6.
24. Ямагути М., изд. (2019). Регукальцин: регуляция метаболизма и заболевание. Нью-Йорк: Nova Science Publishers. С. 1–176. ISBN  978-1536161724.
25. Ямагути М. (август 2015 г.). «Участие регукальцина в качестве белка-супрессора в канцерогенезе человека: взгляд на генную терапию». Журнал исследований рака и клинической онкологии. 141 (8): 133–1341. Дои:10.1007 / s00432-014-1831-z. PMID  25230901. S2CID  25371567.
26. Ямагути М., Осука С., Вайцманн М.Н., Эль-Райес Б.Ф., Сёдзи М., Мурата Т. (май 2016 г.). «Увеличенная выживаемость у пациентов с раком поджелудочной железы с повышенной экспрессией гена регукальцина: сверхэкспрессия регукальцина подавляет пролиферацию в клетках MIA PaCa-2 рака поджелудочной железы человека in vitro». Международный журнал онкологии. 48 (5): 1955–1964. Дои:10.3892 / ijo.2016.3409. PMID  26935290.
27. Cardosoa AL, Fernandes A, Aguilar-Pimentelc JA, de Angelisd MH, Guedes JR, Britob MA, Ortolano S, Pani G, Athanasopoulou S, Gonos ES, Schosserer M, Grillari J, Peterson P, Tuna BG, Dogan S, Meyer A , ван Ос Р., Тренделенбург, Австралия (июль 2018 г.). «К биомаркерам слабости: кандидаты из генов и путей, регулируемых при старении и возрастных заболеваниях». Журнал исследований рака и клинической онкологии. 47: 214–277. Дои:10.1016 / j.arr.2018.07.004. PMID  30071357.
28. Nitschkowski D, Marwitz S, Kotanidou SA, Reck M, Kugler C, Rabe KF, Ammerpohl O, Goldmann T. (ноябрь 2019 г.). «Живи и дай умереть: эпигенетические модификации сурвивина и регукальцина в тканях немелкоклеточного рака легкого способствуют развитию злокачественных новообразований». Клиническая эпигенетика. 11 (1): 157. Дои:10.1186 / s13148-019-0770-6. ЧВК  6852724. PMID  31718698.

дальнейшее чтение

• Ямагути М. (сентябрь 1998 г.). «Роль кальций-связывающего белка регукальцина в регенерации печени крысы». Журнал гастроэнтерологии и гепатологии. 13 Suppl (Дополнение): S106–12. Дои:10.1111 / jgh.1998.13.s1.106. PMID  9792043.
• Фудзита Т., Ширасава Т., Иноуэ Н., Китамура Т., Маруяма Н. (сентябрь 1998 г.). «Печеночная и почечная экспрессия белка-маркера старения-30 и его биологическое значение». Журнал гастроэнтерологии и гепатологии. 13 Suppl (Дополнение): S124–31. Дои:10.1111 / jgh.1998.13.s1.124. PMID  9792046.
• Ямагути М. (март 2000 г.). «Роль регукальцина в передаче сигналов кальция». Науки о жизни. 66 (19): 1769–80. Дои:10.1016 / S0024-3205 (99) 00602-5. PMID  10809175.
• Ямагути М. (сентябрь 2000 г.). «Роль регукальцина в ядерной регуляции регенерирующей печени». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 276 (1): 1–6. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3359. PMID  11006072.
• Фудзита Т., Ширасава Т., Маруяма Н. (март 1999 г.). «Экспрессия и структура белка-маркера старения-30 (SMP30) и его биологическое значение». Механизмы старения и развития. 107 (3): 271–80. Дои:10.1016 / S0047-6374 (98) 00136-5. PMID  10360682. S2CID  11023394.
• Лаурентино С.С., Коррейя С., Кавако Дж. Э., Оливейра П. Ф., де Соуза М., Баррос А., Сокорро С. (апрель 2012 г.). "Регукальцин, кальций-связывающий белок, играющий роль в мужской репродуктивной системе?". Молекулярная репродукция человека. 18 (4): 161–70. Дои:10,1093 / мольхр / gar075. PMID  22121208.
• Ямагути М. (август 2012 г.). «Роль регукальцина в передаче сигналов кальция в мозге: участие в старении». Интегративная биология. 4 (8): 825–37. Дои:10.1039 / c2ib20042b. PMID  22652898.
• Ямагути М., Мурата Т. (август 2013 г.). «Вовлечение регукальцина в липидный обмен и диабет». Метаболизм. 62 (8): 1045–51. Дои:10.1016 / j.metabol.2013.01.023. PMID  23453039.
• Ямагути М. (июнь 2013 г.). «Подавляющая роль регукальцина в пролиферации клеток печени: участие в канцерогенезе». Распространение клеток. 46 (3): 243–53. Дои:10.1111 / cpr.12036. ЧВК  6496855. PMID  23692083.
• Ямагути М. (октябрь 2013 г.). «Антиапоптотический эффект регукальцина опосредуется мультисигнальными путями». Апоптоз. 18 (10): 1145–53. Дои:10.1007 / s10495-013-0859-x. ЧВК  3775152. PMID  23670020.
• Ямагути М. (ноябрь 2013 г.). «Роль регукальцина в регуляции ядра клетки: участие в качестве фактора транскрипции». Исследования клеток и тканей. 354 (2): 331–41. Дои:10.1007 / s00441-013-1665-z. PMID  23793546. S2CID  14658076.
• Marques R, Maia CJ, Vaz C, Correia S, Socorro S (январь 2014 г.). «Разнообразные роли кальций-связывающего белка регукальцина в клеточной биологии: от тканевой экспрессии и передачи сигналов до болезни». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 71 (1): 93–111. Дои:10.1007 / s00018-013-1323-3. PMID  23519827. S2CID  12820341.
• Ямагути М. (март 2014 г.). «Роль регукальцина в гомеостазе костей: участие в качестве нового цитокина». Интегративная биология. 6 (3): 258–66. Дои:10.1039 / c3ib40217g. PMID  24458249.
• Ямагути М. (май 2014 г.). «Регулирующая роль регукальцина в передаче сигналов сердечного кальция: понимание сердечной недостаточности (обзор)». Биомедицинские отчеты. 2 (3): 303–308. Дои:10.3892 / br.2014.245. ЧВК  3990221. PMID  24748964.
• Ямагути М. (июнь 2014 г.). «Регукальцин как потенциальный биомаркер метаболических и нейрональных заболеваний». Молекулярная и клеточная биохимия. 391 (1–2): 157–66. Дои:10.1007 / s11010-014-1998-2. PMID  24599745. S2CID  10777127.
• Ямагути М. (ноябрь 2015 г.). «Потенциальная роль регукальцина в регуляции клеток почек: участие в почечной недостаточности (обзор)». Международный журнал молекулярной медицины. 36 (5): 1191–9. Дои:10.3892 / ijmm.2015.2343. PMID  26398287.
• CV Vaz, Correia S, Cardoso HJ, Figueira MI, Marques R, Maia CJ, Socorro S (июль 2016 г.). «Растущая роль Регукалцина в качестве супрессора опухолей: факты и взгляды». Современная молекулярная медицина. 16 (7): 607–619. Дои:10.2174/1566524016666160714124550. PMID  27411833.