LGR6 - LGR6

LGR6
Идентификаторы
Псевдонимы	LGR6, GPCR, VTS20631, богатый лейцином повтор, содержащий рецептор, связанный с G-белком 6, богатый лейцином повтор, содержащий рецептор, связанный с G-белком 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 606653 MGI: 2441805 ГомолоГен: 49680 Генные карты: LGR6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q32.1 Начинать 202,193,901 бп[1] Конец 202,319,781 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 E4 Начинать 134,983,301 бп[2] Конец 135,105,276 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Активность рецепторов, связанных с G-белками • активность трансмембранного сигнального рецептора • активность преобразователя сигнала • активность рецепторов белков-гормонов • связывание гепарина • Обвязка с круговым движением Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • везикул • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана транс-сети Гольджи • мембрана • внеклеточный Биологический процесс • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • положительная регуляция сигнального пути Wnt • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • Сигнальный путь Wnt • преобразование сигнала • положительное регулирование миграции клеток • регенерация тканей • костная регенерация • управление аксоном • отрицательный хемотаксис Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	59352	329252
Ансамбль	ENSG00000133067	ENSMUSG00000042793
UniProt	Q9HBX8	Q3UVD5
RefSeq (мРНК)	NM_001017403 NM_001017404 NM_021636	NM_001033409
RefSeq (белок)	NP_001017403 NP_001017404 NP_067649	NP_001028581
Расположение (UCSC)	Chr 1: 202.19 - 202.32 Мб	Chr 1: 134.98 - 135.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор 6, связанный с G-белком, содержащий богатые лейцином повторы это белок что у людей кодируется LGR6 ген.^[5][6] Наряду с другими Рецепторы, сопряженные с G-белком LGR4 и LGR5, LGR6 - это Сигнальный путь Wnt посредник. LGR6 также действует как маркер эпителиальных стволовых клеток в плоскоклеточная карцинома в мышах in vivo.^[7]

Этот ген кодирует член богатый лейцином повтор -содержащая подгруппа суперсемейства 7-трансмембранных белков, связанных с G-белком. Кодируемый белок представляет собой гликопротеин рецептор гормона с большим N-концевой внеклеточный домен, содержащий богатые лейцином повторы, важные для образования подковообразного мотива взаимодействия для лиганд привязка. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множественным варианты расшифровки.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133067 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042793 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сюй С.Ю., Кудо М., Чен Т., Накабаяши К., Бхалла А., ван дер Спек П.Дж., ван Дуин М., Сюэ А.Дж. (январь 2001 г.). «Три подсемейства рецепторов, связанных с G-белком, содержащих богатые лейцином повторы (LGR): идентификация LGR6 и LGR7 и механизм передачи сигналов для LGR7». Мол Эндокринол. 14 (8): 1257–71. Дои:10.1210 / мэ.14.8.1257. PMID  10935549.
6. "Ген Entrez: LGR6-богатый лейцином повтор, содержащий рецептор 6, связанный с G-белком".
7. Huang, Phillips Y .; Кандыба, Ева; Жабуй, Арно; Шолунд, Йонас; Кумар, Атул; Халливилл, Кайл; Маккрири, Мелисса; ДельРосарио, Рейно; Канг, Хио Чунг (2017). «Lgr6 является маркером стволовых клеток плоскоклеточного рака кожи мыши». Природа Генетика. 49 (11): 1624–1632. Дои:10,1038 / нг.3957. ЧВК  5662105. PMID  28945253.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Такеда С., Кадоваки С., Хага Т. и др. (2002). «Идентификация генов рецепторов, связанных с G-белком, из последовательности генома человека». FEBS Lett. 520 (1–3): 97–101. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 02775-8. PMID  12044878. S2CID  7116392.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), крупномасштабная попытка выявления новых секретируемых и трансмембранных белков человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.