CD1E - CD1E

CD1E
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3S6C
Идентификаторы
Псевдонимы	CD1E, CD1A, R2, молекула CD1e
Внешние идентификаторы	OMIM: 188411 ГомолоГен: 69475 Генные карты: CD1E
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.1 Начните 158,353,696 бп[1] Конец 158,357,553 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание бета-2-микроглобулина • связывание эндогенного липида с антигеном • связывание экзогенного липида с антигеном • липопептидное связывание • связывание липидов Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • Мембрана Гольджи • эндосома • поздняя эндосома • клеточная мембрана • лизосома • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • ранняя эндосома • просвет лизосомы • аппарат Гольджи • мембрана • поверхность клетки • внеклеточный • внешняя сторона плазматической мембраны Биологический процесс • процессинг и презентация антигена, экзогенный липидный антиген через MHC класса Ib • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • иммунная реакция • положительная регуляция цитотоксичности, опосредованной Т-клетками • процессинг и презентация антигена, эндогенный липидный антиген через MHC класса Ib Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	913	н / д
Ансамбль	ENSG00000158488	н / д
UniProt	P15812	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001042583 NM_001042584 NM_001042585 NM_001042586 NM_001042587 NM_001185107 NM_001185108 NM_001185110 NM_001185112 NM_001185113 NM_001185114 NM_001185115 NM_030893	н / д
RefSeq (белок)	NP_001036048 NP_001036049 NP_001036050 NP_001036051 NP_001036052 NP_001172036 NP_001172037 NP_001172039 NP_001172041 NP_001172042 NP_001172043 NP_001172044 NP_112155	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 158.35 - 158.36 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Т-клеточный поверхностный гликопротеин CD1e, мембранно-связанный это белок что у людей кодируется CD1E ген.^[3][4]

Этот ген кодирует члена семейства CD1 трансмембранных гликопротеинов, которые структурно связаны с белками главного комплекса гистосовместимости (MHC) и образуют гетеродимеры с бета-2-микроглобулином. Белки CD1 опосредуют представление Т-лимфоцитам в первую очередь липидных и гликолипидных антигенов собственного или микробного происхождения. Геном человека содержит пять генов семейства CD1, организованных в кластер на хромосоме 1. Считается, что члены семейства CD1 различаются по своей клеточной локализации и специфичности в отношении определенных липидных лигандов. Белок, кодируемый этим геном, находится в компартментах Гольджи, эндосомах и лизосомах и расщепляется до стабильной растворимой формы. Растворимая форма необходима для внутриклеточного преобразования некоторых гликолипидов в форму, которая может быть представлена ​​другими членами семейства CD1. Описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. Были обнаружены дополнительные варианты транскриптов; однако их биологическая ценность не была определена.^[4]

Смотрите также

• Кластер дифференциации

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158488 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Angenieux C, Salamero J, Fricker D, Cazenave JP, Goud B, Hanau D, de La Salle H (декабрь 2000 г.). «Характеристика CD1e, третьего типа молекулы CD1, экспрессируемой в дендритных клетках». J Biol Chem. 275 (48): 37757–64. Дои:10.1074 / jbc.M007082200. PMID  10948205.
4. «Ген Энтреза: CD1E молекула CD1e».

дальнейшее чтение

• Бригл М., Бреннер МБ (2004). «CD1: презентация антигена и функция Т-клеток». Анну. Rev. Immunol. 22 (1): 817–90. Дои:10.1146 / annurev.immunol.22.012703.104608. PMID  15032598.
• Калаби Ф., Джарвис Дж. М., Мартин Л., Мильштейн С. (1989). «Два класса генов CD1». Евро. J. Immunol. 19 (2): 285–92. Дои:10.1002 / eji.1830190211. PMID  2467814.
• Ю. CY, Мильштейн C (1990). «Физическая карта, связывающая пять генов антигена дифференцировки тимоцитов человека CD1». EMBO J. 8 (12): 3727–32. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08548.x. ЧВК  402056. PMID  2583117.
• Альбертсон Д.Г., Фишпул Р., Шеррингтон П. и др. (1988). «Чувствительная гибридизация in situ с высоким разрешением с хромосомами человека с использованием зондов, меченных биотином: отнесение генов антигена CD1 тимоцитов человека к хромосоме 1». EMBO J. 7 (9): 2801–5. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1988.tb03135.x. ЧВК  457071. PMID  3053166.
• Мартин Л.Х., Калаби Ф., Мильштейн С. (1987). «Выделение генов CD1: семейство дифференцировочных антигенов, связанных с основным комплексом гистосовместимости». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (23): 9154–8. Дои:10.1073 / пнас.83.23.9154. ЧВК  387093. PMID  3097645.
• Адамс, доктор медицины, Керлаваж А.Р., Флейшманн, Р.Д. и др. (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID  7566098.
• Хан М., Ханник Л., ДиБрино М., Робинсон М.А. (2000). «Полиморфизм генов CD1 человека». Тканевые антигены. 54 (2): 122–7. Дои:10.1034 / j.1399-0039.1999.540202.x. PMID  10488738.
• Миронес I, Отео М, Парра-Куадрадо Дж. Ф., Мартинес-Навес Э (2001). «Идентификация двух новых аллелей CD1E человека». Тканевые антигены. 56 (2): 159–61. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2000.560208.x. PMID  11019917.
• Тамуза Р., Сгири Р., Рамасавми Р. и др. (2003). «Два новых аллеля CD1 E идентифицированы у чернокожих африканцев». Тканевые антигены. 59 (5): 417–20. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2002.590509.x. PMID  12144626.
• Анженье К., Саламеро Дж., Фрикер Д. и др. (2003). «Общие характеристики молекул CD1e человека и макаки-резус: сохранение биохимических и биологических свойств в процессе эволюции приматов». Иммуногенетика. 54 (12): 842–9. Дои:10.1007 / s00251-003-0538-0. PMID  12671734.
• Angénieux C, Fraisier V, Maître B и др. (2005). «Клеточный путь CD1e в незрелых и созревающих дендритных клетках». Движение. 6 (4): 286–302. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2005.00272.x. PMID  15752135.
• де ла Салле Х., Мариотти С., Анженье С. и др. (2005). «Содействие процессингу микробного гликолипидного антигена с помощью CD1e». Наука. 310 (5752): 1321–4. Дои:10.1126 / science.1115301. PMID  16311334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Caporale CM, Papola F, Fioroni MA и др. (2006). «Восприимчивость к синдрому Гийена-Барре связана с полиморфизмом генов CD1». J. Neuroimmunol. 177 (1–2): 112–8. Дои:10.1016 / j.jneuroim.2006.05.018. PMID  16820217.

внешняя ссылка

• CD1E + антиген в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек CD1A расположение генома и CD1A страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Человек CD1E расположение генома и CD1E страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.