SEMA7A - SEMA7A

SEMA7A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3NVQ
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, семафорин 7A (группа крови Джона Милтона Хагена)
Внешние идентификаторы	OMIM: 607961 MGI: 1306826 ГомолоГен: 2678 Генные карты: SEMA7A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q24.1 Начните 74,409,289 бп[1] Конец 74,433,958 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 млрд Начните 57,940,112 бп[2] Конец 57,962,865 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание интегрина • связывание нейропилина • связывание рецептора семафорина • хеморепеллентная активность Сотовый компонент • мембрана • клеточная мембрана • закрепленный компонент мембраны • внеклеточный • внешняя сторона плазматической мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • дифференциация клеток • положительная регуляция фосфорилирования белков • развитие нервной системы • развитие многоклеточного организма • дифференцировка остеобластов • иммунная реакция • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • расширение аксона • развитие обонятельной доли • интегрин-опосредованный сигнальный путь • положительная регуляция удлинения аксонов • воспалительная реакция • развитие проекции нейрона • регуляция воспалительного ответа • отрицательный хемотаксис • положительное регулирование выработки цитокинов макрофагами • миграция клеток нервного гребня • положительное регулирование миграции клеток • отрицательная регуляция удлинения аксонов, участвующих в ведении аксонов • семафорин-плексиновый сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8482	20361
Ансамбль	ENSG00000138623 ENSG00000288455	ENSMUSG00000038264
UniProt	O75326	Q9QUR8
RefSeq (мРНК)	NM_003612 NM_001146029 NM_001146030	NM_011352
RefSeq (белок)	NP_001139501 NP_001139502 NP_003603	NP_035482
Расположение (UCSC)	Chr 15: 74.41 - 74.43 Мб	Chr 9: 57.94 - 57.96 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Семафорин 7А, мембранный анкер GPI (Группа крови Джона Милтона Хагена) (SEMA7A) также известный как CD108 (Cблеск Differentiation 108), человек ген.^[5]

SEMA7A - это связанный с мембраной семафорин, который связывается с клеточными поверхностями через связь гликозилфосфатидилинозитола (GPI). SEMA7A также известен как антиген группы крови Джона-Милтона-Хагена (JMH), гликопротеин массой 80 кДа, экспрессируемый на активированных лимфоцитах и ​​эритроцитах. [Поставляется OMIM]^[5] SEMA7A экспрессируется в различных тканях взрослого человека, таких как жировая ткань, толстая кишка, пищевод, сердце, мозг, селезенка, семенники, легкие, яичники и матка.^[6]

Разработка

SEMA7A способствует росту аксонов и участвует в мезодерма производное образование сомита. Экспрессия Sema7A в эмбрионах мышей наивысшая на 7 день, что указывает на его роль в дифференцировке структуры зародышевого листка.^[7] Эмбриональная экспрессия Sema7A заметна на всех стадиях развития, а также в тимусе новорожденных и взрослых, что указывает на роль Т-клеток в развитии.^[7] В нейронах дикого типа добавление Sema7A под in vitro условия способствуют удлинению и разветвлению в зависимости от дозы.^[8] В отличие от большинства семафоринов, SEMA7A усиливает рост аксонов и необходим для правильного формирования аксонального тракта эмбриона.^[9] Ограниченная экспрессия SEMA7A обнаруживается в заднем мозге в противоположность обильной экспрессии SEMA7A, обнаруживаемой как в краниальных, так и в стволовых клетках нервного гребня, что указывает на участие в миграции и дифференцировке.^[10] У мышей Sema7A - / - обнаруживаются дефекты развития обонятельного тракта.^[11]

Опухолеобразование

В нормальной ткани молочной железы экспрессия мРНК SEMA7A низкая или не экспрессируется, но активация повторной экспрессии SEMA7A происходит в этих взрослых тканях, вызывая плейотропные эффекты, которые усиливают онкогенез.^[12][13] Рост опухолевых клеток, EMT, метастазирование в легкие и ангиогенез были связаны с повышенной экспрессией Sema7a на мышиных моделях.^[14][15][16] Повышенная экспрессия SEMA7A коррелирует с плохим прогнозом у пациентов с раком груди.^[13] Опухоли увеличивают экспрессию SEMA7A в инволюционной среде, но нокаут SEMA7a в моделях мышей, подвергающихся инволюции, снижает лимфангиогенез.^[17]

Генетика

Известно, что этот белок имеет восемь вариантов во внеклеточной области: семь лежат в домене Sema, а один - в домене PSI.

Молекулярная биология

Этот белок образует димеры.

Примечания

Этот белок действует как рецептор малярийного паразита. Плазмодий falciparum.

Смотрите также

• Кластер дифференциации

Рекомендации

1. ENSG00000288455 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138623, ENSG00000288455 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038264 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: семафорин 7A SEMA7A, мембранный якорь GPI (группа крови Джона Милтона Хагена)».
6. «Тканевая экспрессия SEMA7A - Резюме - Атлас белков человека». www.proteinatlas.org. Получено 2020-04-14.
7. Шахта, Т .; Harada, K .; Matsumoto, T .; Yamana, H .; Shirouzu, K .; Ито, К .; Ямада, А. (май 2000 г.). «Экспрессия CDw108 во время развития Т-клеток». Тканевые антигены. 55 (5): 429–436. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2000.550505.x. ISSN  0001-2815. PMID  10885563.
8. Мореско, Э. М. Я. (2005). «Интегрин-опосредованное поддержание ветвей дендрита требует киназ семейства Abelson (Abl)». Журнал неврологии. 25 (26): 6105–6118. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.1432-05.2005. ЧВК  6725048. PMID  15987940.
9. Скотт, Глинис А .; McClelland, Lindy A .; Фрике, Алекс Ф. (январь 2008 г.). «Семафорин 7a способствует распространению и дендричности в человеческих меланоцитах через β1-интегрины». Журнал следственной дерматологии. 128 (1): 151–161. Дои:10.1038 / sj.jid.5700974. PMID  17671519.
10. Бао, Чжэн-Чжэн; Цзинь, Чжэ (август 2006 г.). «Sema3D и Sema7A имеют разные паттерны экспрессии в эмбриональном развитии цыпленка». Динамика развития. 235 (8): 2282–2289. Дои:10.1002 / dvdy.20882. ISSN  1058-8388. ЧВК  1564195. PMID  16804892.
11. Jeroen Pasterkamp, ​​R .; Peschon, Jacques J .; Сприггс, Мелани К .; Колодкин, Алексей Л. (июль 2003 г.). «Семафорин 7A способствует разрастанию аксонов через интегрины и MAPK». Природа. 424 (6947): 398–405. Bibcode:2003Натура.424..398J. Дои:10.1038 / природа01790. ISSN  0028-0836. PMID  12879062.
12. Мозерле, Лидия; Казановас, Ориол (март 2012 г.). «Использование плейотропной активности семафоринов в качестве многоцелевой терапии рака». EMBO Молекулярная медицина. 4 (3): 168–170. Дои:10.1002 / emmm.201200206. ISSN  1757-4676. ЧВК  3376851. PMID  22323445.
13. Черный, S A; Нельсон, A C; Гурул, Нью-Джерси; Futscher, BW; Лион, Т. Р. (сентябрь 2016 г.). «Семафорин 7a оказывает плейотропное действие, способствуя прогрессированию опухоли груди». Онкоген. 35 (39): 5170–5178. Дои:10.1038 / onc.2016.49. ISSN  0950-9232. ЧВК  5720143. PMID  27065336.
14. Гарсия-Ареас, Рамон; Либрерос, Стефания; Амат, Саманта; Китинг, Патрисия; Каррио, Роберто; Робинсон, Филипп; Блиден, Клиффорд; Ирагаварапу-Чарюлу, Виджая (2014). «Семафорин7A способствует росту опухоли и оказывает проангиогенное действие на макрофаги мышей с опухолью молочной железы». Границы физиологии. 5: 17. Дои:10.3389 / fphys.2014.00017. ISSN  1664-042X. ЧВК  3914020. PMID  24550834.
15. Аллегра, Мэрилин; Зарагкулиас, Андреас; Ворджиа, Елена; Иоанну, Марина; Литос, Габриэле; Беуг, Хартмут; Мавроталасситис, Джордж (октябрь 2012 г.). Чернофф, Джонатан (ред.). «Семафорин-7a обращает на себя ERF-индуцированное ингибирование ЕМП в Ras-зависимых эпителиальных клетках молочной железы мышей». Молекулярная биология клетки. 23 (19): 3873–3881. Дои:10.1091 / mbc.e12-04-0276. ISSN  1059-1524. ЧВК  3459863. PMID  22875994.
16. Рингнер, Маркус; Фредлунд, Эрик; Хаккинен, Яри; Борг, Оке; Стааф, Йохан (21 марта 2011 г.). Крейтон, Чад (ред.). "GOBO: Результат лечения рака груди на основе экспрессии генов в Интернете". PLOS ONE. 6 (3): e17911. Bibcode:2011PLoSO ... 617911R. Дои:10.1371 / journal.pone.0017911. ISSN  1932-6203. ЧВК  3061871. PMID  21445301.
17. Старейшина, Алан М; Тамбурини, Бет А.Дж.; Крамп, Линдси С; Блэк, Сара А; Wessells, Veronica M; Щедин, Пеппер Дж; Borges, Virginia F .; Лайонс, Трэйси Р. (25 сентября 2018 г.). «Семафорин 7A способствует ремоделированию лимфатических сосудов, опосредованному макрофагами, во время послеродовой инволюции молочной железы и при раке груди». Исследования рака. 78 (22): 6473–6485. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-18-1642. ISSN  0008-5472. ЧВК  6239927. PMID  30254150.

дальнейшее чтение

• Сюй Х, Нг С., Ву З.Л. и др. (1998). «Человеческий семафорин K1 связан с гликозилфосфатидилинозитолом и определяет новое подсемейство вирусных семафоринов». J. Biol. Chem. 273 (35): 22428–34. Дои:10.1074 / jbc.273.35.22428. PMID  9712866.
• Ланге С., Лир Т., Гоен М. и др. (1998). «Новые эукариотические семафорины с близкой гомологией семафоринам ДНК-вирусов». Геномика. 51 (3): 340–50. Дои:10.1006 / geno.1998.5256. PMID  9721204.
• Ямада А., Кубо К., Такешита Т. и др. (1999). «Молекулярное клонирование гликозилфосфатидилинозит-заякоренной молекулы CDw108». J. Immunol. 162 (7): 4094–100. PMID  10201933.
• Ангелисова П., Дрбал К., Черны Дж. И др. (1999). «Характеристика GPI-заякоренного гликопротеина CDw108 лейкоцитов человека и его связь с другими подобными молекулами». Иммунобиология. 200 (2): 234–45. Дои:10.1016 / s0171-2985 (99) 80073-4. PMID  10416131.
• Tamagnone L, Artigiani S, Chen H и др. (1999). «Плексины представляют собой большое семейство рецепторов трансмембранных, секретируемых и GPI-закрепленных семафоринов у позвоночных». Клетка. 99 (1): 71–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID  10520995.
• Шахта Т., Харада К., Мацумото Т. и др. (2000). «Экспрессия CDw108 во время развития Т-клеток». Тканевые антигены. 55 (5): 429–36. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2000.550505.x. PMID  10885563.
• Холмс С., Даунс А.М., Фосберри А. и др. (2002). «Sema7A - мощный стимулятор моноцитов». Сканд. J. Immunol. 56 (3): 270–5. Дои:10.1046 / j.1365-3083.2002.01129.x. PMID  12193228.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Маурин Дж. К., Делорм Дж., Мачука-Гайе I и др. (2005). «Экспрессия одонтобласта семафорина 7А во время иннервации человеческого дентина». Матрикс Биол. 24 (3): 232–8. Дои:10.1016 / j.matbio.2005.03.005. PMID  15907379.
• Ху Y, Мэлоун Дж. П., Фаган А. М. и др. (2006). «Сравнительный протеомный анализ внутри- и межиндивидуальных вариаций спинномозговой жидкости человека». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (12): 2000–9. Дои:10.1074 / mcp.M500207-MCP200. PMID  16199891.
• Ко Дж. М., О Би, Ли Дж. Й. и др. (2006). «Исследование ассоциации полиморфизмов семафорина 7a (sema7a) с минеральной плотностью кости и риском переломов у корейских женщин в постменопаузе». J. Hum. Genet. 51 (2): 112–7. Дои:10.1007 / s10038-005-0331-z. PMID  16372136.

внешняя ссылка

• SEMA7A + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Система групп крови Джона Милтона Хагена в БГМУТ база данных мутаций гена антигена группы крови
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Human Semaphorin-7A

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.