SEMA4D - SEMA4D

SEMA4D
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1OLZ, 3OL2
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA4D, C9orf164, CD100, M-sema-G, SEMAJ, coll-4, семафорин 4D, COLL4, A8, GR3, BB18
Внешние идентификаторы	OMIM: 601866 MGI: 109244 ГомолоГен: 21282 Генные карты: SEMA4D
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q22.2 Начните 89,360,787 бп[1] Конец 89,498,130 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A5 Начните 51,685,529 бп[2] Конец 51,793,747 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • рецепторное связывание • активность трансмембранного сигнального рецептора • GO: 0001948 связывание с белками • связывание рецептора семафорина • связывание нейропилина • идентичное связывание с белками • сигнальная активность рецептора • хеморепеллентная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана • клеточная мембрана • внеклеточный Биологический процесс • регуляция морфогенеза дендритов • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • развитие многоклеточного организма • агрегация лейкоцитов • развитие нервной системы • отрицательная регуляция клеточной адгезии • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина • положительная регуляция аксоногенеза • семафорин-плексиновый сигнальный путь, участвующий в морфогенезе костной трабекулы • регулирование организации проекции клеток • отрицательная регуляция дифференцировки остеобластов • положительное регулирование побочного прорастания • регулировка формы клеток • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина • дифференциация клеток • положительная регуляция фосфорилирования белков • семафорин-плексиновый сигнальный путь • клеточная адгезия • иммунная реакция • окостенение, участвующее в созревании костей • положительное регулирование миграции клеток • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • отрицательная регуляция активности щелочной фосфатазы • отрицательный хемотаксис • миграция клеток нервного гребня • отрицательная регуляция удлинения аксонов, участвующих в ведении аксонов • положительная регуляция тормозной сборки синапсов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10507	20354
Ансамбль	ENSG00000187764	ENSMUSG00000021451
UniProt	Q92854	O09126
RefSeq (мРНК)	NM_001142287 NM_006378 NM_182635 NM_001371194 NM_001371195 NM_001371196 NM_001371197 NM_001371198 NM_001371199 NM_001371200 NM_001371201 NM_001371202	NM_001281880 NM_013660
RefSeq (белок)	NP_001135759 NP_006369 NP_001358123 NP_001358124 NP_001358125 NP_001358126 NP_001358127 NP_001358128 NP_001358129 NP_001358130 NP_001358131	NP_001268809 NP_038688 NP_001365242 NP_001365243 NP_001365246 NP_001365247 NP_001365248 NP_001365249 NP_001365251 NP_001365252 NP_001365253 NP_001365244 NP_001365245 NP_001365250 NP_001365254
Расположение (UCSC)	Chr 9: 89,36 - 89,5 Мб	Chr 13: 51.69 - 51.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Семафорин-4Д (SEMA4D) также известен как Cблеск Dдифференциация 100 (CD100), это белок из семафорин семья, которая у людей кодируется SEMA4D ген.^[5]

Функция

Семафорин 4D (Sema 4D) - это управление аксоном молекула, которая секретируется олигодендроциты и побуждает конус роста коллапс в Центральная нервная система. Путем привязки рецептор плексина B1 он функционирует как белок, активирующий ГТФазу R-Ras (GAP), и отталкивает конусы роста аксонов в зрелой центральной нервной системе.^[6]

В иммунной системе CD100 связывает CD72 активировать В-клетки и дендритные клетки, хотя многое в этом взаимодействии все еще исследуется.^[7][8]

В течение кожа ремонт повреждений, SEMA4D взаимодействует с Плексин В2 на гамма-дельта-Т-клетки играть роль в процессе заживления.^[9]

Смотрите также

• Кластер дифференциации

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187764 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021451 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: сема-домен SEMA4D, иммуноглобулиновый домен (Ig), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазматический домен (семафорин) 4D».
6. Ито Й, Ойнума И., Катох Х, Кайбути К., Негиси М. (июль 2006 г.). «Sema4D / plexin-B1 активирует GSK-3β посредством активности R-Ras GAP, вызывая коллапс конуса роста». EMBO отчеты. 7 (7): 704–9. Дои:10.1038 / sj.embor.7400737. ЧВК  1500830. PMID  16799460.
7. Куманого А., Ватанабе С., Ли И., Ван Х, Ши В., Араки Х, Хирата Х, Ивахори К., Учида Дж., Ясуи Т., Мацумото М., Йошида К., Якура Х, Пан С., Парнес-младший, Кикутани Х (ноябрь 2000 г. ). «Идентификация CD72 как рецептора лимфоцитов для семафорина CD100 класса IV: новый механизм регуляции передачи сигналов В-клеток». Иммунитет. 13 (5): 621–31. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 00062-5. PMID  11114375.
8. Исида И., Куманогох А., Сузуки К., Акахани С., Нода К., Кикутани Х. (август 2003 г.). «Участие CD100, семафорина лимфоцитов, в активации иммунной системы человека через CD72: последствия для регуляции иммунных и воспалительных реакций». Int. Иммунол. 15 (8): 1027–34. Дои:10.1093 / intimm / dxg098. PMID  12882840.
9. Дебора А. Уизерден; Мэгуми Ватанабэ; Оливия Гарио; Стефани Э. Ридер; Гор Саркисян; Шейн Дж. Ф. Кронин; Петра Вердино; Ян А. Уилсон; Ацуши Куманогох; Хитоши Кикутани; Люк Тейтон; Вольфганг Х. Фишер; Венди Л. Хавран (август 2012 г.). «Рецептор CD100 взаимодействует со своим лигандом плексин B2, регулируя функцию эпидермальных γδ Т-клеток». Иммунитет. 37 (2): 314–25. Дои:10.1016 / j.immuni.2012.05.026. ЧВК  3430606. PMID  22902232.

дальнейшее чтение

• Bougeret C, Mansur IG, Dastot H, et al. (1992). «Повышенная поверхностная экспрессия недавно идентифицированного димера 150 кДа сразу после активации Т-лимфоцитов человека». J. Immunol. 148 (2): 318–23. PMID  1530858.
• Hall KT, Boumsell L, Schultze JL, et al. (1996). «Человеческий CD100, новый лейкоцитарный семафорин, который способствует агрегации и дифференцировке В-клеток». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (21): 11780–5. Дои:10.1073 / пнас.93.21.11780. ЧВК  38135. PMID  8876214.
• Герольд С., Эльхабази А., Висмут Г. и др. (1997). «CD100 связан с CD45 на поверхности Т-лимфоцитов человека. Роль в гомотипической адгезии Т-клеток». J. Immunol. 157 (12): 5262–8. PMID  8955171.
• Фуруяма Т., Инагаки С., Косуги А. и др. (1997). «Идентификация нового трансмембранного семафорина, экспрессируемого на лимфоцитах». J. Biol. Chem. 271 (52): 33376–81. Дои:10.1074 / jbc.271.52.33376. PMID  8969198.
• Tamagnone L, Artigiani S, Chen H и др. (1999). «Плексины представляют собой большое семейство рецепторов трансмембранных, секретируемых и GPI-закрепленных семафоринов у позвоночных». Ячейка. 99 (1): 71–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID  10520995. S2CID  17386412.
• Эльхабази А., Делер С., Бенсуссан А. и др. (2001). «Биологическая активность растворимого CD100. I. Внеклеточная область CD100 высвобождается с поверхности Т-лимфоцитов за счет регулируемого протеолиза». J. Immunol. 166 (7): 4341–7. Дои:10.4049 / jimmunol.166.7.4341. PMID  11254687.
• Делер С., Биллард С., Торджман Р. и др. (2001). «Биологическая активность растворимого CD100. II. Растворимый CD100, подобно H-SemaIII, подавляет миграцию иммунных клеток». J. Immunol. 166 (7): 4348–54. Дои:10.4049 / jimmunol.166.7.4348. PMID  11254688.
• Викис Х.Г., Ли В., Гуань К.Л. (2002). «Взаимодействие Plexin-B1 / Rac ингибирует активацию PAK и усиливает связывание лиганда Sema4D». Genes Dev. 16 (7): 836–45. Дои:10.1101 / gad.966402. ЧВК  186329. PMID  11937491.
• Granziero L, Circosta P, Scielzo C и др. (2003). «Взаимодействия CD100 / плексин-B1 поддерживают пролиферацию и выживание нормальных и лейкемических лимфоцитов CD5 + B». Кровь. 101 (5): 1962–9. Дои:10.1182 / кровь-2002-05-1339. PMID  12406905.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Измайлова Э., Бертли Ф.М., Хуанг Ц. и др. (2003). «ВИЧ-1 Tat перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов». Nat. Med. 9 (2): 191–7. Дои:10,1038 / нм 822. PMID  12539042. S2CID  26145639.
• Лав К.А., Харлос К., Маваддат Н. и др. (2003). «Связывающая лиганд сторона семафоринов, выявленная кристаллической структурой SEMA4D с высоким разрешением». Nat. Struct. Биол. 10 (10): 843–8. Дои:10.1038 / nsb977. PMID  12958590. S2CID  24468463.
• Жираудон П., Винсент П., Вуайа С. и др. (2004). «Семафорин CD100 из активированных Т-лимфоцитов вызывает коллапс расширения процесса в олигодендроцитах и ​​гибель незрелых нервных клеток». J. Immunol. 172 (2): 1246–55. Дои:10.4049 / jimmunol.172.2.1246. PMID  14707103.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Деаглио С., Вайзитти Т., Бергуи Л. и др. (2005). «CD38 и CD100 возглавляют сеть поверхностных рецепторов, передающих положительные сигналы для роста и выживания B-CLL». Кровь. 105 (8): 3042–50. Дои:10.1182 / кровь-2004-10-3873. PMID  15613544.
• Конротто П., Вальдембри Д., Корсо С. и др. (2005). «Sema4D индуцирует ангиогенез за счет привлечения Met с помощью плексина B1». Кровь. 105 (11): 4321–9. Дои:10.1182 / кровь-2004-07-2885. PMID  15632204.
• Базиль Дж. Р., Афхами Т., Гуткинд Дж. С. (2005). «Семафорин 4D / Plexin-B1 индуцирует миграцию эндотелиальных клеток посредством активации PYK2, Src и пути фосфатидилинозитол-3-киназы-Akt». Мол. Cell. Биол. 25 (16): 6889–98. Дои:10.1128 / MCB.25.16.6889-6898.2005. ЧВК  1190270. PMID  16055703.
• Левандровски У., Мебиус Дж., Вальтер У., Сикманн А (2006). «Выяснение сайтов N-гликозилирования на белках тромбоцитов человека: гликопротеомный подход». Мол. Cell. Протеомика. 5 (2): 226–33. Дои:10.1074 / mcp.M500324-MCP200. PMID  16263699.
• Нкиимбенг-Такви Э. Х., Чаповал С. П. (2011). «Биология и функция нейроиммунных семафоринов 4A и 4D». Иммунол. Res. 50 (1): 10–21. Дои:10.1007 / s12026-010-8201-y. ЧВК  3366695. PMID  21203905.
• Смит Е.П., Шанкс К., Липски М.М., ДеТолла Л.Дж., Киган А.Д., Чаповал С.П. (2011). «Экспрессия нейроиммунных семафоринов 4A и 4D и их рецепторов в легких усиливается аллергеном и фактором роста эндотелия сосудов». BMC Immunol. 12: 30. Дои:10.1186/1471-2172-12-30. ЧВК  3118960. PMID  21595947.
• Шанкс К., Нкиимбенг-Такви Э.Х., Смит Э.П., Липски М.М., ДеТолла Л.Дж., Киган А.Д., Чаповал С.П. (2013). «Нейроиммунный семафорин 4D необходим для оптимального аллергического воспаления легких». Мол. Иммунол. 56 (4): 480–7. Дои:10.1016 / j.molimm.2013.05.228. ЧВК  3783523. PMID  23911404.

внешние ссылки

• SEMA4D + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)