CD1b - CD1b

CD1B
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCD1B, CD1, CD1A, R1, молекула CD1b
Внешние идентификаторыOMIM: 188360 ГомолоГен: 129921 Генные карты: CD1B
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение CD1B
Геномное расположение CD1B
Группа1q23.1Начинать158,327,951 бп[1]
Конец158,331,531 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001764

н / д

RefSeq (белок)

NP_001755

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 158.33 - 158.33 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Т-клеточный поверхностный гликопротеин CD1b это белок что у людей кодируется CD1B ген.

CD1b принадлежит к группе 1 CD1 семейство трансмембранных гликопротеинов. Молекулы CD1 экспрессируются на поверхности множества различных человеческих антигенпрезентирующие клетки (DC, моноциты и немного тимоциты ). Эта специализированная группа гликопротеинов представляет собственные и чужие липидные антигены специфическим αβ Т-клеткам.[3] Молекулы CD1 структурно связаны с главный комплекс гистосовместимости (MHC), принадлежащий к генам, подобным MHC класса I. CD1 человека локус находится на хромосоме 1 и содержит пять неполиморфных генов (CD1a, CD1b, CD1c, CD1d и CD1e).[4][5]

Структура и функции

Т-клеточный поверхностный гликопротеин CD1b
Джин локус 1q23.1
Молекулярная масса (Да ) 36939
Ag -связывающая щель размером (Å ) 2,3
Длина антигенов (атомов углерода) 25-80

Молекулы CD1b (а также другие CD1 и классический MHC I молекулы) образованы связанным с мембраной гликопротеином, состоящим из трех внеклеточных доменов (α1, α2, α3). Эти внеклеточные домены нековалентно связаны с β2-микроглобулином (который выполняет функцию стабилизации белка). Эта организация образует узкую гидрофобную связывающую бороздку, которая вмещает липидные антигены. Связующая канавка состоит из четырех широко соединенных между собой карманов, которые заняты алкильными цепями гликолипида и двумя молекулами детергента.[6][7] По сравнению с другими молекулами CD1 это уникальное расположение CD1b обеспечивает возможность связывания широкого спектра антигенов с различной длиной алкильной цепи. Алкильные компоненты антигенов прикрепляются к гидрофобной бороздке, а гидрофильная часть выделяется из молекулы CD1b и, таким образом, предоставляет TCR место для связывания.[8]

Молекула CD1b имеет самую большую антигенсвязывающую щель в семействе CD1. Принимая во внимание, что микробные липиды, как правило, имеют более длинные алкильные цепи, чем собственные эндогенные липиды, кажется, что CD1b специально адаптирован для представления микробных липидов (а не эндогенных) Т-клеткам.[7] В отсутствие более длинных микробных липидов CD1b представляет собой как эндогенный липид, так и липид (ы) каркаса / спейсера.[9]

Клиническое значение

Когда иммунная система не различает собственные и чужие антигены, это приводит к аутореактивному Т-клеточному ответу. Аутореактивный CD1b может распознавать, например, фосфатидилглицерин, который является общим для бактерий, но также и для митохондрий млекопитающих. Этот аутоантиген высвобождается во время бактериальной инфекции или митохондриального стресса. CD1b также представляет эндогенные ганглиозиды специфическим Т-клеткам, поэтому они могут вызывать аутоиммунные заболевания, такие как рассеянный склероз.

В отличие от основных комплексов гистосовместимости, молекулы CD1 имеют ограниченное разнообразие, это может быть интересным маркером для иммунотерапии и мишенью для разработки новых лекарств.[10]

Ссылка

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158485 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Гра С., Ван Рейн И., Шахин А., Ченг Т. Ю., Бхати М., Тан Л. Л. и др. (Октябрь 2016 г.). «Распознавание Т-клеточным рецептором CD1b, представляющего микобактериальный гликолипид». Nature Communications. 7: 13257. Bibcode:2016НатКо ... 713257G. Дои:10.1038 / ncomms13257. ЧВК  5095289. PMID  27807341.
  4. ^ «Молекула CD1B CD1b [Homo sapiens (человек)]». NCBI Gene. Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США. Получено 2019-02-06.
  5. ^ Джекман Р.М., Стенджер С., Ли А., Муди ДБ, Роджерс Р.А., Ниази К.Р. и др. (Март 1998 г.). «Тирозинсодержащий цитоплазматический хвост CD1b необходим для его эффективной презентации бактериальных липидных антигенов». Иммунитет. 8 (3): 341–51. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80539-7. PMID  9529151.
  6. ^ "CD1B - предшественник CD1b гликопротеина Т-клеточной поверхности - Homo sapiens (человек) - ген и белок CD1B". Универсальный протеиновый ресурс (UniProt). Получено 2019-02-06.
  7. ^ а б Гадола С.Д., Заккаи Н.Р., Харлос К., Шеперд Д., Кастро-Паломино Дж. К., Риттер Г. и др. (Август 2002 г.). «Структура человеческого CD1b со связанными лигандами на 2,3 A, лабиринт для алкильных цепей». Иммунология природы. 3 (8): 721–6. Дои:10.1038 / ni821. PMID  12118248.
  8. ^ Батувангала Т., Пастух Д., Гадола С.Д., Гибсон К.Дж., Заккаи Н.Р., Фершт А.Р. и др. (Февраль 2004 г.). «Кристаллическая структура человеческого CD1b со связанным бактериальным гликолипидом». Журнал иммунологии. 172 (4): 2382–8. Дои:10.4049 / jimmunol.172.4.2382. PMID  14764708.
  9. ^ Шахин, Адам (2018). «Тонкости презентации собственного липидного антигена с помощью CD1b». Молекулярная иммунология. 104: 27–36. Дои:10.1016 / j.molimm.2018.09.022.
  10. ^ Ван Рейн И., ван Берло Т., Хильменюк Т., Ченг Т.Ю., Вольф Б.Дж., Татитури Р.В. и др. (Январь 2016 г.). «Аутореактивные Т-клетки человека распознают CD1b и фосфолипиды». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (2): 380–5. Bibcode:2016ПНАС..113..380В. Дои:10.1073 / pnas.1520947112. ЧВК  4720340. PMID  26621732.

дальнейшее чтение

  • Мерфи К., Уивер К. (2016). Иммунобиология Джейнвей (9-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Garland Science / Taylor & Francis Group. ISBN  978-0-8153-4551-0.

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P29016 (Гликопротеин CD1b поверхности Т-клеток) на PDBe-KB.