CD6 - CD6

CD6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5A2E
Идентификаторы
Псевдонимы	CD6, TP120, молекула CD6
Внешние идентификаторы	OMIM: 186720 MGI: 103566 ГомолоГен: 4893 Генные карты: CD6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q12.2 Начните 60,971,680 бп[1] Конец 61,020,377 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 А | 19 7,16 см Начните 10,789,341 бп[2] Конец 10,830,058 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • липополисахаридное связывание • связывание липотейхоевой кислоты • активность рецептора поглотителя • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • внутренний компонент плазматической мембраны • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • Т-клеточный рецепторный комплекс • внеклеточная область • иммунологический синапс • внешняя сторона плазматической мембраны Биологический процесс • положительное регулирование выработки цитокинов, участвующих в воспалительной реакции • гетерофильная клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • острый воспалительный ответ на антигенный раздражитель • рецептор-опосредованного эндоцитоза • ответ на липополисахарид • клеточная адгезия • положительное регулирование пролиферации Т-клеток • врожденная иммунная система • формирование иммунологического синапса • липополисахарид-опосредованный сигнальный путь • везикулярный транспорт • эндоцитоз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	923	12511
Ансамбль	ENSG00000013725	ENSMUSG00000024670
UniProt	P30203	Q61003
RefSeq (мРНК)	NM_001254750 NM_001254751 NM_006725	NM_001037801 NM_009852
RefSeq (белок)	NP_001241679 NP_001241680 NP_006716	NP_001032890 NP_033982
Расположение (UCSC)	Chr 11: 60.97 - 61.02 Мб	Chr 19: 10.79 - 10.83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CD6 (Cблеск Dифференциация 6) человек белок закодировано CD6 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, обнаруженный на внешней мембране Т-лимфоциты а также некоторые другие иммунные клетки. Кодируемый белок содержит три богатые цистеином (SRCR) домены рецептора поглотителя и сайт привязки для активированного молекула адгезии лейкоцитарных клеток. Продукт гена важен для продолжения Активация Т-клеток.^[5]

Клиническое значение

Некоторые аллели этого гена могут быть связаны с восприимчивостью к рассеянный склероз.^[7][8]

Смотрите также

• Кластер дифференциации

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000013725 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024670 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Энтреза: CD6 молекула CD6».
6. Боуэн М.А., Патель Д.Д., Ли Х, Модрелл Б., Малако А.Р., Ван В.К., Марквардт Х., Нойбауэр М., Песандо Д.М., Франк У. (1995). «Клонирование, картирование и характеристика активированной молекулы адгезии лейкоцитов к клеткам (ALCAM), лиганда CD6». J. Exp. Med. 181 (6): 2213–20. Дои:10.1084 / jem.181.6.2213. ЧВК  2192054. PMID  7760007.
7. Де Ягер П.Л., Цзя Х, Ван Дж., Де Баккер П.И., Оттобони Л., Аггарвал Н.Т., Пиччио Л., Райчаудхури С., Тран Д., Обин С., Брискин Р., Романо С., Баранзини С.Е., МакКоли Д.Л., Перикак-Ванс М.А., Хейнс Дж. Л., Гибсон Р. А., Нэглин И., Уитдехааг Б., Мэтьюз П. М., Каппос Л., Полман К., Макардл В. Л., Страчан Д. П., Эванс Д., Кросс А. Х., Дали М. Дж., Компстон ​​А., Соцер С. Дж., Вайнер Г. Л., Хаузер С. Л., Хафлер Д. А., Оксенберг-младший (2009). «Мета-анализ сканирования генома и репликации идентифицирует CD6, IRF8 и TNFRSF1A как новые локусы восприимчивости к рассеянному склерозу». Nat. Genet. 41 (7): 776–82. Дои:10,1038 / нг. 401. ЧВК  2757648. PMID  19525953.
8. Кофлер Д.М., Северсон КА, Мусиссиан Н., Де Ягер П.Л., Хафлер Д.А. (2011). «Аллель предрасположенности к рассеянному склерозу CD6 связан с изменениями пролиферации CD4 + Т-клеток». J. Immunol. 187 (6): 3286–91. Дои:10.4049 / jimmunol.1100626. PMID  21849685.

дальнейшее чтение

• Аруффо А., Мельник М.Б., Линсли П.С., Семя В (1991). «Гликопротеин CD6 лимфоцитов содержит повторяющуюся доменную структуру, характерную для нового семейства клеточной поверхности и секретируемых белков». J. Exp. Med. 174 (4): 949–52. Дои:10.1084 / jem.174.4.949. ЧВК  2118957. PMID  1919444.
• Swack JA, Mier JW, Romain PL, Hull SR, Rudd CE (1991). «Биосинтез и посттрансляционная модификация CD6, молекулы, передающей сигнал Т-клетки». J. Biol. Chem. 266 (11): 7137–43. PMID  2016320.
• Цуге И., Уцуми К.Р., Уэда Р., Такамото С., Такахаши Т. (1985). «Отнесение гена, кодирующего антиген дифференцировки Т-клеток человека, Tp120, к хромосоме 11». Сомат. Cell Mol. Genet. 11 (3): 217–22. Дои:10.1007 / BF01534678. PMID  3923629. S2CID  39343360.
• Уитни Г.С., Старлинг Г.С., Боуэн М.А., Модрелл Б., Сиадак А.В., Аруффо А (1995). «Богатый цистеином домен CD6, проксимальный к мембране рецептора скавенджера, содержит активированный сайт связывания молекулы адгезии лейкоцитов». J. Biol. Chem. 270 (31): 18187–90. Дои:10.1074 / jbc.270.31.18187. PMID  7543097.
• Робинсон У.Х., Нойман де Вегвар Х.Э., Прохаска СС, Ри Дж. У., Парнес-младший (1995). «Человеческий CD6 обладает большим цитоплазматическим доменом с альтернативным сплайсингом». Евро. J. Immunol. 25 (10): 2765–9. Дои:10.1002 / eji.1830251008. PMID  7589069.
• Wee S, Schieven GL, Kirihara JM, Tsu TT, Ledbetter JA, Aruffo A (1993). «Фосфорилирование CD6 тирозином путем стимуляции CD3: увеличение за счет корецепторов CD4 и CD2». J. Exp. Med. 177 (1): 219–23. Дои:10.1084 / jem.177.1.219. ЧВК  2190871. PMID  7678115.
• Bowen MA, Whitney GS, Neubauer M, Starling GC, Palmer D, Zhang J, Nowak NJ, Shows TB, Aruffo A (1997). «Структура и хромосомное расположение гена CD6 человека: обнаружение пяти изоформ CD6 человека». J. Immunol. 158 (3): 1149–56. PMID  9013954.
• Кобарг Дж., Уитни Г.С., Палмер Д., Аруффо А, Боуэн М.А. (1998). «Анализ фосфорилирования тирозина и притока кальция изоформ CD6 человека с различными цитоплазматическими доменами». Евро. J. Immunol. 27 (11): 2971–80. Дои:10.1002 / eji.1830271133. PMID  9394826.
• Певица NG, Mitra R, Lialios F, Richardson BC, Marks RM, Pesando JM, Fox DA, Nickoloff BJ (1998). «CD6-зависимые взаимодействия Т-клеток и кератиноцитов: функциональное доказательство наличия второго лиганда CD6 на кератиноцитах, активированных гамма-интерфероном». Иммунол. Латыш. 58 (1): 9–14. Дои:10.1016 / S0165-2478 (97) 02707-7. PMID  9436462.
• Гимферрер I, Фарнос М., Кальво М., Миттельбрунн М., Энрих С., Санчес-Мадрид Ф., Вивес Дж., Лозано Ф. (2003). «Дополнительные молекулы CD5 и CD6 связываются на мембране лимфоидных Т-клеток». J. Biol. Chem. 278 (10): 8564–71. Дои:10.1074 / jbc.M209591200. PMID  12473675.
• Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М., Ле Наур Ф., Брихори Ф., Джанг Дж.Х., Чжао Р., Пуравс Э., Тра Дж., Майкл К.В., Мисек Д.Э., Ханаш С.М. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток раскрывает множество белков с функцией шаперона». J. Biol. Chem. 278 (9): 7607–16. Дои:10.1074 / jbc.M210455200. PMID  12493773.
• Гимферрер И., Ибаньес А., Фарнос М., Сарриас М.Р., Фенутрия Р., Роселло С., Циммерманн П., Дэвид Г., Вивес Дж., Серра-Пажес С., Лозано Ф. (2005). «Рецептор лимфоцитов CD6 взаимодействует с синтенином-1, каркасным белком, содержащим домены PDZ». J. Immunol. 175 (3): 1406–14. Дои:10.4049 / jimmunol.175.3.1406. PMID  16034076.
• Като Й, Танака Й, Хаяси М., Окава К., Минато Н. (2006). «Участие CD166 в активации человеческих гамма-дельта Т-клеток опухолевыми клетками, сенсибилизированными непептидными антигенами». J. Immunol. 177 (2): 877–84. Дои:10.4049 / jimmunol.177.2.877. PMID  16818742.
• Ибаньес А., Сарриас М.Р., Фарнос М., Гимферрер И., Серра-Пажес С., Вивес Дж., Лозано Ф. (2006). "Активация митоген-активируемого пути протеинкиназы поверхностным рецептором лимфоцитов CD6". J. Immunol. 177 (2): 1152–9. Дои:10.4049 / jimmunol.177.2.1152. PMID  16818773.
• Хасан Н.Дж., Симмондс С.Дж., Кларксон Н.Г., Ханрахан С., Пуклавец М.Дж., Бомба М., Барклай А.Н., Браун М.Х. (2006). «CD6 регулирует ответы Т-клеток посредством зависимого от активации набора позитивного регулятора SLP-76». Мол. Cell. Биол. 26 (17): 6727–38. Дои:10.1128 / MCB.00688-06. ЧВК  1592849. PMID  16914752.
• Кастро М.А., Оливейра М.И., Нуньес Р.Дж., Фабр С., Барбоса Р., Пейшото А., Браун М.Х., Парнес-младший, Висмут Г., Морейра А., Роча Б., Кармо А.М. (2007). «Внеклеточные изоформы CD6, полученные в результате альтернативного сплайсинга, регулируют нацеливание CD6 на иммунологический синапс». J. Immunol. 178 (7): 4351–61. Дои:10.4049 / jimmunol.178.7.4351. PMID  17371992.
• Сарриас М.Р., Фарнос М., Мота Р., Санчес-Барберо Ф., Ибанес А., Гимферрер И., Вера Дж., Фенутрия Р., Казальс С., Йеламос Дж., Лозано Ф. (2007). «CD6 связывается с молекулярными патогенами, связанными с патогенами, и защищает от септического шока, вызванного ЛПС». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (28): 11724–9. Дои:10.1073 / pnas.0702815104. ЧВК  1913855. PMID  17601777.

внешняя ссылка

• CD6 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек CD6 расположение генома и CD6 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P30203 (Антиген дифференцировки Т-клеток человека CD6) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.