SLAMF1 - SLAMF1

SLAMF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1М27, 1KA7, 1I3Z, 1D4T, 1D4W, 1KA6
Идентификаторы
Псевдонимы	SLAMF1, CD150, CDw150, SLAM, член семейства сигнальных молекул активации лимфоцитов 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603492 MGI: 1351314 ГомолоГен: 48162 Генные карты: SLAMF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.3 Начинать 160,608,106 бп[1] Конец 160,647,295 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 H3 | 1 79,54 см Начинать 171,767,127 бп[2] Конец 171,801,184 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание антигена • активность рецептора вируса • GO: 0001948 связывание с белками • активность трансмембранного сигнального рецептора • идентичное связывание с белками • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • внеклеточная область • поверхность клетки • фагоцитарный пузырек • внеклеточная экзосома • внешняя сторона плазматической мембраны Биологический процесс • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • естественная пролиферация клеток-киллеров • Производство цитокинов Т-хелпером 1 клеткой • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-6 • положительное регулирование каскада JNK • клеточная адгезия • отрицательная регуляция сигнального пути CD40 • отрицательная регуляция выработки цитокинов Т-клетками • активация миелоидных дендритных клеток, участвующих в иммунном ответе • регуляция слияния везикул • положительное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • фагоцитоз • активация лимфоцитов • вирусное проникновение • отрицательная регуляция выработки фактора некроза опухоли • врожденная иммунная система • GO: 0048552 регуляция каталитической активности • GO: 0022415 вирусный процесс • положительное регулирование пролиферации активированных Т-клеток • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-12 • естественная дифференцировка клеток-киллеров • преобразование сигнала • хемотаксис лейкоцитов, участвующих в воспалительной реакции • положительная регуляция хемотаксиса макрофагов • положительная регуляция хемотаксиса дендритных клеток Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6504	27218
Ансамбль	ENSG00000117090	ENSMUSG00000015316
UniProt	Q13291	Q9QUM4
RefSeq (мРНК)	NM_003037 NM_001330754	NM_013730 NM_001360898
RefSeq (белок)	NP_001317683 NP_003028	NP_038758 NP_001347827
Расположение (UCSC)	Chr 1: 160.61 - 160.65 Мб	Chr 1: 171.77 - 171,8 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Молекула активации лимфоцитов 1 это белок что у людей кодируется SLAMF1 ген.^[5][6] Недавно SLAMF1 также был обозначен CD150 (кластер дифференциации 150).

SLAMF1 принадлежит сигнальная молекула активации лимфоцитов семья. Взаимодействие промотора и энхансеров SLAMF1 с ранним B-клеточным фактором 1 (EBF1) необходимо для экспрессии гена SLAMF1 в B-клетках. Факторы STAT6, IRF4 и NF-kB, участвующие в передаче сигналов от рецептора B-клетки, его корецепторов и IL-4R, также играют важную роль в регуляции экспрессии SLAMF1.^[7]

Взаимодействия

SLAMF1 был показан взаимодействовать с ПТПН11,^[8][9] SH2D1A^[8][10] и SH2D1B.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117090 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015316 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Cocks BG, Chang CC, Carballido JM, Yssel H, de Vries JE, Aversa G (август 1995). «Новый рецептор, участвующий в активации Т-клеток». Природа. 376 (6537): 260–3. Дои:10.1038 / 376260a0. PMID  7617038. S2CID  4319295.
6. «Ген Entrez: член 1 семейства сигнальных молекул активации лимфоцитов SLAMF1».
7. Шварц, Антон М .; Путляева, Лидия В .; Кович, Милица; Клепикова, Анна В .; Акулич, Ксения А .; Воронцов, Илья Е .; Корнеев, Кирилл В .; Дмитриев, Сергей Е .; Полановский, Олег Л. (2016-10-01). «Ранний B-клеточный фактор 1 (EBF1) имеет решающее значение для транскрипционного контроля гена SLAMF1 в человеческих B-клетках». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов. 1859 (10): 1259–1268. Дои:10.1016 / j.bbagrm.2016.07.004. PMID  27424222.
8. Хауи Д., Симарро М., Сайос Дж., Гирадо М., Санчо Дж., Терхорст К. (февраль 2002 г.). «Молекулярное рассечение сигнальных и костимулирующих функций CD150 (SLAM): связывание CD150 / SAP и костимуляция, опосредованная CD150». Кровь. 99 (3): 957–65. Дои:10.1182 / кровь.V99.3.957. PMID  11806999.
9. Морра М., Лу Дж., Пой Ф, Мартин М., Сайос Дж., Кальпе С., Гулло С., Хауи Д., Ритдейк С., Томпсон А., Койл А. Дж., Денни С., Яффе МБ, Энгель П., Эк MJ, Терхорст С. (ноябрь 2001 г. ). «Структурная основа взаимодействия свободного SH2-домена EAT-2 с рецепторами SLAM в гемопоэтических клетках». EMBO J. 20 (21): 5840–52. Дои:10.1093 / emboj / 20.21.5840. ЧВК  125701. PMID  11689425.
10. Морра М., Симарро-Гранде М., Мартин М., Чен А.С., Ланьи А., Силандер О, Кальпе С., Дэвис Дж., Поусон Т., Эк MJ, Сумеги Дж., Энгель П., Ли С.К., Терхорст С. (сентябрь 2001 г.). «Характеристика миссенс-мутаций SH2D1A, выявленных у пациентов с Х-сцепленным лимфопролиферативным заболеванием». J. Biol. Chem. 276 (39): 36809–16. Дои:10.1074 / jbc.M101305200. PMID  11477068.

дальнейшее чтение

• Пуннонен Дж., Кокс Б.Г., Карбаллидо Дж. М., Беннетт Б., Петерсон Д., Аверса Дж., Де Фрис Дж. Э. (1997). «Растворимые и мембраносвязанные формы сигнальной молекулы активации лимфоцитов (SLAM) вызывают пролиферацию и синтез Ig активированными человеческими В-лимфоцитами». J. Exp. Med. 185 (6): 993–1004. Дои:10.1084 / jem.185.6.993. ЧВК  2196230. PMID  9091591.
• Sayos J, Wu C, Morra M, Wang N, Zhang X, Allen D, van Schaik S, Notarangelo L, Geha R, Roncarolo MG, Oettgen H, De Vries JE, Aversa G, Terhorst C (1998). «Продукт гена Х-сцепленного лимфопролиферативного заболевания SAP регулирует сигналы, индуцируемые через корецептор SLAM». Природа. 395 (6701): 462–9. Дои:10.1038/26683. PMID  9774102. S2CID  4324402.
• Михалап С.В., Шлапацкая Л.М., Бердова А.Г., Закон С.Л., Кларк Е.А., Сидоренко С.П. (1999). «CDw150 связывается с src-homology 2-содержащей инозитолфосфатазой и модулирует CD95-опосредованный апоптоз». J. Immunol. 162 (10): 5719–27. PMID  10229804.
• Ли С.К., Гиш Дж., Ян Д., Коффи А.Дж., Форман-Кей Д.Д., Эрнберг И., Кей Л.Е., Поусон Т. (2000). «Новый способ связывания лиганда с помощью домена SH2 продукта гена болезни XLP человека SAP / SH2D1A». Curr. Биол. 9 (23): 1355–62. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 80080-9. PMID  10607564.
• Rogge L, Bianchi E, Biffi M, Bono E, Chang SY, Alexander H, Santini C, Ferrari G, Sinigaglia L, Seiler M, Neeb M, Mous J, Sinigaglia F, Certa U (2000). «Транскрипт визуализации развития человеческих Т-хелперов с использованием массивов олигонуклеотидов». Nat. Genet. 25 (1): 96–101. Дои:10.1038/75671. PMID  10802665. S2CID  5449948.
• Тацуо Х, Оно Н, Танака К., Янаги Й. (2000). «SLAM (CDw150) - клеточный рецептор вируса кори». Природа. 406 (6798): 893–7. Дои:10.1038/35022579. PMID  10972291. S2CID  4409405.
• Льюис Дж., Эйбен Л.Дж., Нельсон Д.Л., Коэн Дж. И., Николс К.Э., Охс HD, Нотаранджело Л.Д., Дакетт С.С. (2001). «Отчетливые взаимодействия продукта гена Х-сцепленного лимфопролиферативного синдрома SAP с цитоплазматическими доменами членов семейства рецепторов CD2». Clin. Иммунол. 100 (1): 15–23. Дои:10.1006 / clim.2001.5035. PMID  11414741.
• Kruse M, Meinl E, Henning G, Kuhnt C, Berchtold S, Berger T, Schuler G, Steinkasserer A (2001). «Сигнальная молекула активации лимфоцитов экспрессируется на зрелых дендритных клетках CD83 + и активируется IL-1 бета». J. Immunol. 167 (4): 1989–95. Дои:10.4049 / jimmunol.167.4.1989. PMID  11489980.
• Блехарски-младший, Ниази К.Р., Сиелинг П.А., Ченг Дж., Модлин Р.Л. (2001). «Сигнальная молекула активации лимфоцитов экспрессируется на дендритных клетках, активируемых лигандом CD40, и непосредственно увеличивает выработку воспалительных цитокинов». J. Immunol. 167 (6): 3174–81. Дои:10.4049 / jimmunol.167.6.3174. PMID  11544303.
• Мурабаяси Н., Курита-Танигучи М., Аята М., Мацумото М., Огура Н., Сея Т. (2002). «Восприимчивость дендритных клеток (ДК) человека к вирусу кори (МВ) зависит от стадий их активации в сочетании с уровнем CDw150: роль стимуляторов Toll в созревании ДК и амплификации МВ». Микробы заражают. 4 (8): 785–94. Дои:10.1016 / S1286-4579 (02) 01598-8. PMID  12270725.
• Ли Ц., Иосеф Ц., Цзя Ц.Й., Хан В.К., Ли С.С. (2003). «Двойная функциональная роль продукта гена Х-сцепленного лимфопролиферативного синдрома SAP / SH2D1A в передаче сигналов через семейство сигнальных молекул активации лимфоцитов (SLAM) иммунных рецепторов». J. Biol. Chem. 278 (6): 3852–9. Дои:10.1074 / jbc.M206649200. PMID  12458214.
• Хам Б., Арбор Н., Наниче Д., Хоманн Д., Манчестер М., Олдстон МБ (2003). «Вирус кори инфицирует и подавляет пролиферацию Т-лимфоцитов трансгенных мышей, несущих человеческую сигнальную молекулу активации лимфоцитов». Дж. Вирол. 77 (6): 3505–15. Дои:10.1128 / JVI.77.6.3505-3515.2003. ЧВК  149525. PMID  12610126.
• Дель Валле Дж. М., Энгель П., Мартин М. (2003). «Экспрессия SAP-связывающего рецептора CD229 на клеточной поверхности регулируется посредством его взаимодействия с клатрин-связанным адаптерным комплексом 2 (AP-2)». J. Biol. Chem. 278 (19): 17430–7. Дои:10.1074 / jbc.M301569200. PMID  12621057.
• Ферран V, Ли Ц., Ромео Г., Инь Л. (2003). «Отсутствие мутаций SLAM у пациентов с EBV-ассоциированными лимфопролиферативными заболеваниями». J. Med. Вирол. 70 (1): 131–6. Дои:10.1002 / jmv.10373. PMID  12629654.
• Лааксонен К., Юникка М., Лахесмаа Р., Терхо Е.О., Саволайнен Дж. (2004). «Индуцированная аллергеном экспрессия мРНК in vitro сигнальной молекулы активации лимфоцитов с помощью PBMC пациентов с аллергическим ринитом увеличивается во время специфической иммунотерапии пыльцой». J. Allergy Clin. Иммунол. 112 (6): 1171–7. Дои:10.1016 / j.jaci.2003.08.043. PMID  14657878.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q13291 (Сигнальная молекула активации лимфоцитов) на PDBe-KB.