ДНКJB6 - DNAJB6

ДНКJB6
Идентификаторы
Псевдонимы	ДНКJB6, Dnajb6, Mrj, mDj4, DJ4, DnaJ, HHDJ1, HSJ-2, HSJ2, LGMD1D, LGMD1E, MSJ-1, DnaJ, член семейства белков теплового шока (Hsp40) B6, LGMDD1
Внешние идентификаторы	OMIM: 611332 MGI: 1344381 ГомолоГен: 38058 Генные карты: ДНКJB6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q36.3 Начните 157,335,381 бп[1] Конец 157,417,439 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 B1 Начните 29,735,688 бп[2] Конец 29,818,134 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • привязка шаперона • связывание с белками теплового шока • развернутое связывание с белками • GO: 0001948 связывание с белками • Активность активатора АТФазы • идентичное связывание с белками • Связывание ДНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • нуклеоплазма • Z диск • перинуклеарная область цитоплазмы • ядро клетки Биологический процесс • организация промежуточной нити • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • отрицательное регулирование сборки тела включения • регулирование локализации белка • сворачивание белка • регуляция клеточного ответа на тепло • положительная регуляция активности АТФазы • организация актинового цитоскелета • организация внеклеточного матрикса • локализация белка в ядре • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • хорио-аллантоисный синтез • дифференцировка клеток синцитиотрофобластов, участвующих в развитии лабиринтного слоя • развитие хориона Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10049	23950
Ансамбль	ENSG00000105993	ENSMUSG00000029131
UniProt	O75190	O54946
RefSeq (мРНК)	NM_005494 NM_058246 NM_001363676	NM_001037940 NM_001037941 NM_001127367 NM_011847 NM_001359198 NM_001378835
RefSeq (белок)	NP_005485 NP_490647 NP_001350605	NP_001033029 NP_001033030 NP_001120839 NP_035977 NP_001346127 NP_001365764
Расположение (UCSC)	Chr 7: 157.34 - 157.42 Мб	Chr 5: 29,74 - 29,82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DnaJ гомолог подсемейства B член 6 это белок что у людей кодируется ДНКJB6 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков DNAJ. Члены семейства DNAJ характеризуются высококонсервативным аминокислотным участком, называемым «J-доменом», и функционируют как один из двух основных классов молекулярных шаперонов, участвующих в широком диапазоне клеточных событий, таких как сворачивание белка и сборка олигомерного белкового комплекса. Этот член семейства может также играть роль в агрегации полиглутамина в определенных нейронах. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскрипта; однако не все варианты описаны полностью.^[7]

Взаимодействия

Было показано, что DNAJB6 взаимодействовать с участием Кератин 18.^[8] Также было показано, что агрегация Aβ42 (процесс, связанный, например, с болезнью Альцгеймера) замедляется DNAJB6 в зависимости от концентрации, что распространяется до очень низких субстехиометрических молярных соотношений шаперона к пептиду.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105993 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000029131 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Секи Н., Хаттори А., Хаяси А., Кодзума С., Миядзима Н., Сайто Т. (июнь 1999 г.). «Клонирование, тканевая экспрессия и хромосомная принадлежность гена MRJ человека для члена семейства белков DNAJ». J Hum Genet. 44 (3): 185–9. Дои:10.1007 / с100380050139. PMID  10319584.
6. Пей Л. (март 1999 г.). «Ген-белок, трансформирующий опухоль гипофиза, ассоциируется с рибосомным белком S10 и новым человеческим гомологом DnaJ в клетках яичек». J Biol Chem. 274 (5): 3151–8. Дои:10.1074 / jbc.274.5.3151. PMID  9915854.
7. «Ген Entrez: ДНКJB6, гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, член 6».
8. Идзава I, Нисидзава М., Отакара К., Оцука К., Инада Х, Инагаки М. (2000). «Идентификация Mrj, белка семейства DnaJ / Hsp40, в качестве регуляторного белка кератина 8/18 филаментов». J. Biol. Chem. 275 (44): 34521–7. Дои:10.1074 / jbc.M003492200. PMID  10954706.
9. Månsson, C; Arosio, P; Hussein, R; Кампинга, H H; Хашем, R M; Boelens, W C; Эмануэльссон, К. (2014). «Взаимодействие молекулярного шаперона DNAJB6 с растущими агрегатами бета-амилоида 42 (Aβ42) приводит к субстехиометрическому ингибированию образования амилоида». J. Biol. Chem. 289 (45): 31066–76. Дои:10.1074 / jbc.M114.595124. ЧВК  4223311. PMID  25217638.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Идзава И., Нисидзава М., Отакара К. и др. (2000). «Идентификация Mrj, белка семейства DnaJ / Hsp40, в качестве регуляторного белка кератина 8/18 филаментов». J. Biol. Chem. 275 (44): 34521–7. Дои:10.1074 / jbc.M003492200. PMID  10954706.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Оцука К., Хата М. (2001). «Гомологи HSP40 / DNAJ млекопитающих: клонирование новых кДНК и предложение по их классификации и номенклатуре». Шапероны клеточного стресса. 5 (2): 98–112. Дои:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0098: MHDHCO> 2.0.CO; 2. ISSN  1466-1268. ЧВК  312896. PMID  11147971.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Чуанг Дж. З., Чжоу Х., Чжу М. и др. (2002). «Характеристика обогащенного головным мозгом шаперона MRJ, который независимо ингибирует агрегацию и токсичность Хантингтина». J. Biol. Chem. 277 (22): 19831–8. Дои:10.1074 / jbc.M109613200. PMID  11896048.
• Фаринья С.М., Ногейра П., Мендес Ф. и др. (2002). «Гомолог DnaJ человека (Hdj) -1 / белок теплового шока (Hsp) 40 ко-шаперон необходим для стабилизации in vivo регулятора трансмембранной проводимости муковисцидоза с помощью Hsp70». Biochem. J. 366 (Pt 3): 797–806. Дои:10.1042 / BJ20011717. ЧВК  1222832. PMID  12069690.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК  2882961. PMID  12690205.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Ханай Р., Машима К. (2004). «Характеристика двух изоформ гомолога DnaJ человека, HSJ2». Мол. Биол. Представитель. 30 (3): 149–53. Дои:10.1023 / А: 1024916223616. PMID  12974469. S2CID  24105834.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Лю Ю., Чжу М.С., Ван Ю.Дж. и др. (2004). «[Клонирование шаперона PBP гомолога DnaJ и его субклеточная локализация]». Си Бао Ю Фен Цзы Миан И Сюэ За Чжи. 19 (6): 531–4. PMID  15182641.
• Беррути Дж., Мартегани Э. (2005). «Деубиквитинирующий фермент mUBPy взаимодействует со специфическим для сперматозоидов молекулярным шапероном MSJ-1: связь с протеасомой, акросомой и центросомой в мужских половых клетках мыши». Биол. Репрод. 72 (1): 14–21. Дои:10.1095 / биолрепрод.104.030866. PMID  15342353.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Дай Ю.С., Сюй Дж., Молькентин Д.Д. (2005). «Связанный с DnaJ фактор Mrj взаимодействует с ядерным фактором активированных Т-клеток c3 и опосредует репрессию транскрипции посредством привлечения гистон-деацетилазы класса II». Мол. Cell. Биол. 25 (22): 9936–48. Дои:10.1128 / MCB.25.22.9936-9948.2005. ЧВК  1280278. PMID  16260608.

внешние ссылки

• ДНКJB6 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• ДНКJB6 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.