DNAJC3 - DNAJC3

DNAJC3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Y4T, 2Y4U
Идентификаторы
Псевдонимы	DNAJC3, ERdj6, HP58, P58, P58IPK, PRKRI, ACPHD, член C3, p58 (IPK) семейства белков теплового шока DnaJ (Hsp40)
Внешние идентификаторы	OMIM: 601184 MGI: 107373 ГомолоГен: 2486 Генные карты: DNAJC3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q32.1 Начните 95,677,139 бп[1] Конец 95,794,988 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 E4 Начните 118,937,976 бп[2] Конец 118,981,697 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • привязка шаперона • неправильно свернутый белок • связывание протеинкиназы • активность ингибитора протеинкиназы • развернутое связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточный пузырек • просвет эндоплазматического ретикулума • мембрана • гладкая эндоплазматическая сеть • эндоплазматический ретикулум Sec комплекс • внеклеточная экзосома • эндоплазматический ретикулум • цитозоль • внеклеточная область • просвет азурофильных гранул Биологический процесс • отрицательная регуляция апоптотического процесса • ответ на развернутый белок • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • защитный ответ на вирус • протеолиз, участвующий в катаболическом процессе клеточного белка • регулирование перевода • клеточный ответ на холод • негативная регуляция индуцированного стрессом эндоплазматического ретикулума фосфорилирования eIF2-альфа • положительная регуляция инициации трансляции в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • дегрануляция нейтрофилов • посттрансляционная модификация • метаболический процесс клеточного белка • сворачивание белка в эндоплазматическом ретикулуме • реакция на стресс эндоплазматического ретикулума Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5611	100037258
Ансамбль	ENSG00000102580	ENSMUSG00000022136
UniProt	Q13217	Q91YW3
RefSeq (мРНК)	NM_006260	NM_008929
RefSeq (белок)	NP_006251	NP_032955
Расположение (UCSC)	Chr 13: 95.68 - 95.79 Мб	Chr 14: 118.94 - 118.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DnaJ гомолог подсемейства C член 3 это белок что у людей кодируется DNAJC3 ген.^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит несколько мотивов тетратрикопептидных повторов (TPR), а также высококонсервативный J-домен, обнаруженный в членах семейства шаперонов DNAJ. Он является членом семейства белков тетратрикопептидных повторов и действует как ингибитор интерферон-индуцированной, активируемой дцРНК протеинкиназы (PKR).^[7]

Клиническое значение

Белок DNAJC3 является важным компонентом апоптоза. Во время нормального эмбриологический процессов или во время повреждения клеток (например, ишемия-реперфузия во время сердечные приступы и удары ) или во время разработки и процессов в рак, апоптотическая клетка претерпевает структурные изменения, включая сжатие клеток, образование пузырей плазматической мембраны, ядерную конденсацию и фрагментацию ДНК и ядро. Далее следует фрагментация на апоптотические тельца, которые быстро удаляются фагоциты, тем самым предотвращая воспалительный ответ.^[8] Это способ гибели клеток, определяемый характерными морфологическими, биохимическими и молекулярными изменениями. Сначала он был описан как «усадочный некроз», а затем этот термин был заменен на апоптоз, чтобы подчеркнуть его противоположную роль. митоз в кинетике тканей. На более поздних стадиях апоптоза вся клетка становится фрагментированной, образуя ряд апоптотических телец, связанных с плазматической мембраной, которые содержат ядерные и / или цитоплазматические элементы. Ультраструктурный вид некроз Совершенно иначе, основными признаками которого являются набухание митохондрий, разрушение плазматической мембраны и распад клеток. Апоптоз встречается во многих физиологический и патологический процессы. Он играет важную роль во время эмбриональный развитие как запрограммированная гибель клеток и сопровождает множество нормальных инволюционных процессов, в которых оно служит механизмом для удаления «нежелательных» клеток.

Более того, важную роль DNAJC3 приписывают сахарному диабету, а также мультисистемной нейродегенерации.^[9][10] Сахарный диабет и нейродегенерация - распространенные заболевания, общие генетические факторы для которых все еще известны лишь частично. Было показано, что потеря BiP (связывающий тяжелую цепь иммуноглобулина) ко-шаперон DNAJC3 приводит к сахарному диабету и широко распространенной нейродегенерации. Соответственно, трое братьев и сестер были обследованы с ювенильным диабетом и центральной и периферической нейродегенерацией, включая атаксия, повреждение верхнего мотонейрона, периферическая невропатия, потеря слуха и церебральная атрофия. Впоследствии секвенирование экзома выявило гомозиготный остановить мутацию в DNAJC3. Дальнейший скрининг базы данных диабета с 226 194 людьми дал восемь фенотипически схожие люди и одна семья, несущая гомозиготную делецию DNAJC3. DNAJC3 отсутствовал в фибробласты от всех затронутых субъектов в обеих семьях. Чтобы очертить фенотипический и мутационный спектр, а также генетическую изменчивость DNAJC3, дополнительно проанализировали 8603 экзома, в том числе 506 экзома из семей, страдающих диабетом, атаксией, повреждением верхних мотонейронов, периферической невропатией или потерей слуха. Этот анализ выявил только один дальнейший аллель потери функции в DNAJC3 и никаких дальнейших ассоциаций у субъектов, обладающих лишь подмножеством признаков основного фенотипа.^[9] Примечательно, что белок DNAJC3 также считается важным маркером стресса в эндоплазматический ретикулум. ^[10]

Взаимодействия

Было показано, что DNAJC3 взаимодействовать с:

• EIF2AK2,^[11][12]
• EIF2AK3,^[13] и
• ПРКРИР.^[12]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102580 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022136 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ли Т.Г., Тан Н., Томпсон С., Миллер Дж., Катце М.Г. (апрель 1994 г.). «Клеточный ингибитор 58000 дальтон индуцированной интерфероном двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы (PKR) является членом семейства белков тетратрикопептидных повторов». Молекулярная и клеточная биология. 14 (4): 2331–42. Дои:10.1128 / mcb.14.4.2331. ЧВК  358600. PMID  7511204.
6. Scherer SW, Duvoisin RM, Kuhn R, Heng HH, Belloni E., Tsui LC (январь 1996 г.). «Локализация двух генов метаботропных рецепторов глутамата, GRM3 и GRM8, на хромосоме 7q человека». Геномика. 31 (2): 230–3. Дои:10.1006 / geno.1996.0036. PMID  8824806.
7. «Ген Entrez: ДНКJC3, гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, член 3».
8. Керр Дж. Ф., Уилли А. Х., Карри А. Р. (август 1972 г.). «Апоптоз: основной биологический феномен с широким спектром влияния на кинетику тканей». Британский журнал рака. 26 (4): 239–57. Дои:10.1038 / bjc.1972.33. ЧВК  2008650. PMID  4561027.
9. Synofzik M, Haack TB, Kopajtich R, Gorza M, Rapaport D, Greiner M, Schönfeld C, Freiberg C, Schorr S, Holl RW, Gonzalez MA, Fritsche A, Fallier-Becker P, Zimmermann R, Strom TM, Meitinger T, Züchner S, Schüle R, Schöls L, Prokisch H (декабрь 2014 г.). «Отсутствие ко-шаперона BiP DNAJC3 вызывает сахарный диабет и мультисистемную нейродегенерацию». Американский журнал генетики человека. 95 (6): 689–97. Дои:10.1016 / j.ajhg.2014.10.013. ЧВК  4259973. PMID  25466870.
10. Lin Y, Sun Z (апрель 2015 г.). «Экспрессия гена против старения Klotho, специфическая для β-клеток поджелудочной железы in vivo: новый подход к сохранению β-клеток при диабете 2 типа». Сахарный диабет. 64 (4): 1444–58. Дои:10.2337 / db14-0632. ЧВК  4375073. PMID  25377875.
11. Поляк С.Дж., Тан Н., Вамбах М., Парикмахер Г.Н., Катце М.Г. (январь 1996 г.). «Комплексы клеточного ингибитора P58 с интерферон-индуцированной двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназой, PKR, для регулирования ее аутофосфорилирования и активности». Журнал биологической химии. 271 (3): 1702–7. Дои:10.1074 / jbc.271.3.1702. PMID  8576172.
12. Гейл М., Блейкли К.М., Хопкинс Д.А., Мелвилл М.В., Вамбах М., Романо П.Р., Катце М.Г. (февраль 1998 г.). «Регулирование интерферон-индуцированной протеинкиназы PKR: модуляция ингибирующей функции P58IPK новым белком P52rIPK». Молекулярная и клеточная биология. 18 (2): 859–71. Дои:10.1128 / mcb.18.2.859. ЧВК  108797. PMID  9447982.
13. Ян В., Франк К.Л., Корт М.Дж., Софер Б.Л., Новоа И., Рон Д., Катце М.Г. (декабрь 2002 г.). «Контроль активности киназы PERK eIF2alpha с помощью стресс-индуцированного молекулярного шаперона P58IPK эндоплазматического ретикулума». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (25): 15920–5. Дои:10.1073 / pnas.252341799. ЧВК  138540. PMID  12446838.

дальнейшее чтение

• Поляк С.Дж., Тан Н., Вамбах М., Парикмахер Г.Н., Катце М.Г. (январь 1996 г.). «Комплексы клеточного ингибитора P58 с интерферон-индуцированной двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназой, PKR, для регулирования ее аутофосфорилирования и активности». Журнал биологической химии. 271 (3): 1702–7. Дои:10.1074 / jbc.271.3.1702. PMID  8576172.
• Korth MJ, Lyons CN, Wambach M, Katze MG (май 1996 г.). «Клонирование, экспрессия и клеточная локализация онкогенного ингибитора 58 кДа РНК-активированной протеинкиназы человека и мыши». Ген. 170 (2): 181–8. Дои:10.1016/0378-1119(95)00883-7. PMID  8666242.
• Korth MJ, Edelhoff S, Disteche CM, Katze MG (январь 1996 г.). «Хромосомное отнесение гена, кодирующего человеческий ингибитор 58 кДа (PRKRI) интерферон-индуцированной дцРНК-активируемой протеинкиназы к хромосоме 13q32». Геномика. 31 (2): 238–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0038. PMID  8824808.
• Гейл М., Блейкли К.М., Хопкинс Д.А., Мелвилл М.В., Вамбах М., Романо П.Р., Катце М.Г. (февраль 1998 г.). «Регулирование интерферон-индуцированной протеинкиназы PKR: модуляция ингибирующей функции P58IPK новым белком P52rIPK». Молекулярная и клеточная биология. 18 (2): 859–71. Дои:10.1128 / mcb.18.2.859. ЧВК  108797. PMID  9447982.
• Мелвилл М.В., Тан С.Л., Вамбах М., Сонг Дж., Моримото Р.И., Катце М.Г. (февраль 1999 г.). «Клеточный ингибитор протеинкиназы PKR, P58 (IPK), представляет собой ко-шаперон, активируемый вирусом гриппа, который модулирует активность белка теплового шока 70».. Журнал биологической химии. 274 (6): 3797–803. Дои:10.1074 / jbc.274.6.3797. PMID  9920933.
• Оцука К., Хата М. (апрель 2000 г.). «Гомологи HSP40 / DNAJ млекопитающих: клонирование новых кДНК и предложение по их классификации и номенклатуре». Клеточный стресс и шапероны. 5 (2): 98–112. Дои:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0098: MHDHCO> 2.0.CO; 2. ЧВК  312896. PMID  11147971.
• Хорнг Т., Бартон Г.М., Меджитов Р. (сентябрь 2001 г.). «TIRAP: адаптерная молекула в пути передачи сигналов Toll». Иммунология природы. 2 (9): 835–41. Дои:10.1038 / ni0901-835. PMID  11526399.
• Ян В., Гейл М.Дж., Тан С.Л., Катце М.Г. (апрель 2002 г.). «Инактивация протеинкиназы PKR и стимуляция трансляции мРНК клеточным ко-шапероном P58 (IPK) не требует функции J-домена». Биохимия. 41 (15): 4938–45. Дои:10.1021 / bi0121499. PMID  11939789.
• Ladiges W, Morton J, Hopkins H, Wilson R, Filley G, Ware C, Gale M (март 2002 г.). «Экспрессия протеинкиназы PKR человека у трансгенных мышей». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 22 (3): 329–34. Дои:10.1089/107999002753675758. PMID  12034040.
• Ян В., Франк К.Л., Корт М.Дж., Софер Б.Л., Новоа И., Рон Д., Катце М.Г. (декабрь 2002 г.). «Контроль активности киназы PERK eIF2alpha с помощью стресс-индуцированного молекулярного шаперона P58IPK эндоплазматического ретикулума». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (25): 15920–5. Дои:10.1073 / pnas.252341799. ЧВК  138540. PMID  12446838.
• ван Хьюзен Р., Мартиндейл Дж. Л., Горосп М., Холбрук, штат Нью-Джерси (май 2003 г.). «P58IPK, новый стресс-индуцируемый белок эндоплазматического ретикулума и потенциальный негативный регулятор передачи сигналов eIF2alpha». Журнал биологической химии. 278 (18): 15558–64. Дои:10.1074 / jbc.M212074200. PMID  12601012.