UBE2L6 - UBE2L6

UBE2L6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WZV, 1WZW, 2KJH
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2L6, RIG-B, UBCH8, убиквитин-конъюгированный фермент E2 L6
Внешние идентификаторы	OMIM: 603890 MGI: 1914500 ГомолоГен: 3112 Генные карты: UBE2L6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q12.1 Начните 57,551,656 бп[1] Конец 57,568,284 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность убиквитин-подобной протеинтрансферазы • трансферазная активность • Активность трансферазы ISG15 • GO: 0001948 связывание с белками • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание убиквитина • связывание убиквитин-протеин-лигазы • активность фермента, конъюгированного с убиквитином Сотовый компонент • цитозоль • нуклеоплазма • убиквитинлигазный комплекс Биологический процесс • метаболический процесс клеточного белка • Конъюгация ISG15-белок • транслезионный синтез • отрицательная регуляция выработки интерферона I типа • зависимый от модификации белковый катаболический процесс • процесс модификации клеточного белка • убиквитинирование белков • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9246	56791
Ансамбль	ENSG00000156587	ENSMUSG00000027078
UniProt	O14933	Q9QZU9
RefSeq (мРНК)	NM_198183 NM_004223	NM_019949
RefSeq (белок)	NP_004214 NP_937826	NP_064333
Расположение (UCSC)	Chr 11: 57,55 - 57,57 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин / ISG15-конъюгированный фермент E2 L6 это белок что у людей кодируется UBE2L6 ген.^[4][5]

Модификация белков с убиквитин является важным клеточным механизмом для нацеливания на аномальные или короткоживущие белки для деградации. Убиквитинирование включает как минимум три класса ферменты: ферменты, активирующие убиквитин (E1S ), убиквитин-конъюгированные ферменты (E2S ) и убиквитин-протеин-лигазы (E3s). Этот ген кодирует член семейства E2-убиквитин-конъюгированных ферментов.

Этот фермент очень похож по первичной структуре на фермент, кодируемый UBE2L3 ген. Два альтернативно соединенных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы были обнаружены для этого гена.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000156587 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Кумар С., Као WH, Хоули П.М. (июль 1997 г.). «Физическое взаимодействие между специфическими ферментами E2 и Hect E3 определяет функциональную кооперативность». J Biol Chem. 272 (21): 13548–54. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13548. PMID  9153201.
5. «Ген Entrez: UBE2L6 убиквитин-конъюгированный фермент E2L 6».

дальнейшее чтение

• Канг Х.Й., Йе С., Фуджимото Н., Чанг С. (1999). «Клонирование и характеристика коактиватора простаты человека ARA54, нового белка, который связывается с рецептором андрогенов». J. Biol. Chem. 274 (13): 8570–6. Дои:10.1074 / jbc.274.13.8570. PMID  10085091.
• Мойнихан Т.П., Ардли Х.С., Нубер У. и др. (1999). «Убиквитин-конъюгирующие ферменты UbcH7 и UbcH8 взаимодействуют с доменами HHARI и H7-AP1, содержащими RING finger / IBR». J. Biol. Chem. 274 (43): 30963–8. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30963. PMID  10521492.
• Хуанг Л., Киннукан Э, Ван Г. и др. (1999). «Структура комплекса E6AP-UbcH7: понимание убиквитинирования ферментным каскадом E2-E3». Наука. 286 (5443): 1321–6. Дои:10.1126 / science.286.5443.1321. PMID  10558980.
• Нюман Т.А., Матикайнен С., Саренева Т. и др. (2000). «Протеомный анализ показывает, что убиквитин-конъюгированные ферменты представляют собой новое семейство генов, регулируемых интерфероном-альфа». Евро. J. Biochem. 267 (13): 4011–9. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01433.x. PMID  10866800.
• Ардли Х.С., Роуз С.А., Тан Н. и др. (2000). «Геномная организация человеческого гена убиквитин-конъюгированного фермента UBE2L6 на хромосоме 11q12». Cytogenet. Cell Genet. 89 (1–2): 137–40. Дои:10.1159/000015593. PMID  10894956. S2CID  502452.
• Чжан И, Гао Дж, Чунг К.К. и др. (2001). «Паркин функционирует как E2-зависимая убиквитин-протеиновая лигаза и способствует деградации белка, ассоциированного с синаптическими пузырьками, CDCrel-1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (24): 13354–9. Дои:10.1073 / pnas.240347797. ЧВК  27228. PMID  11078524.
• Нива Дж., Исигаки С., Дою М. и др. (2001). «Новый центросомный белок безымянного пальца, дорфин, опосредует активность убиквитинлигазы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 281 (3): 706–13. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4414. PMID  11237715.
• Уиллер Т.С., Чин Л.С., Ли И и др. (2002). «Регулирование деградации синаптофизина семерыми гомологами млекопитающих заочно». J. Biol. Chem. 277 (12): 10273–82. Дои:10.1074 / jbc.M107857200. PMID  11786535.
• Урано Т., Сайто Т., Цукуи Т. и др. (2002). «Efp нацелен на 14-3-3 сигма для протеолиза и способствует росту опухоли груди». Природа. 417 (6891): 871–5. Дои:10.1038 / природа00826. PMID  12075357. S2CID  4348545.
• Чин Л.С., Вавалле Дж. П., Ли Л. (2002). «Staring, новая убиквитин-протеиновая лигаза E3, которая нацелена на разложение синтаксина 1». J. Biol. Chem. 277 (38): 35071–9. Дои:10.1074 / jbc.M203300200. PMID  12121982.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Чуанг TH, Улевич RJ (2004). «Triad3A, убиквитин-протеинлигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Nat. Иммунол. 5 (5): 495–502. Дои:10.1038 / ni1066. PMID  15107846. S2CID  39773935.
• Чжао С., Боденон С.Л., Келли М.Л. и др. (2004). «Фермент UbcH8 убиквитин E2 также является ферментом E2 для ISG15, IFN-альфа / бета-индуцированного убиквитиноподобного белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (20): 7578–82. Дои:10.1073 / pnas.0402528101. ЧВК  419648. PMID  15131269.
• Трипати МК, Чаудхури Г. (2005). «Понижающая регуляция UCRP и UBE2L6 в клетках молочной железы человека, нокаутированных BRCA2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 328 (1): 43–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.12.142. ЧВК  3085986. PMID  15670748.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Ли Дж, Ван Дж, Ян Х и др. (2007). «Гомолог Spen Msx2-взаимодействующий ядерный белок-мишень взаимодействует с E2-убиквитин-конъюгированным ферментом UbcH8». Мол. Cell. Биохим. 288 (1–2): 151–7. Дои:10.1007 / s11010-006-9131-9. PMID  16583136. S2CID  24935755.