UBE2J1 - UBE2J1

UBE2J1
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2J1, HSPC153, HSPC205, HSU93243, NCUBE-1, NCUBE1, UBC6, Ubc6p, CGI-76, UBC6E, убиквитин-конъюгированный фермент E2 J1
Внешние идентификаторы	OMIM: 616175 MGI: 1926245 ГомолоГен: 41090 Генные карты: UBE2J1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q15 Начинать 89,326,625 бп[1] Конец 89,352,722 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A5 Начинать 33,031,416 бп[2] Конец 33,052,363 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • Связывание АТФ • связывание убиквитин-протеин-лигазы • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • активность фермента, конъюгированного с убиквитином Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • N-связанное гликозилирование белка через аспарагин • убиквитинирование белков • убиквитин-зависимый путь ERAD • развитие сперматид • отрицательная регуляция ретроградного транспорта белков, ER в цитозоль Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51465	56228
Ансамбль	ENSG00000198833	ENSMUSG00000028277
UniProt	Q9Y385	Q9JJZ4
RefSeq (мРНК)	NM_016021	NM_019586 NM_001355494
RefSeq (белок)	NP_057105	NP_062532 NP_001342423
Расположение (UCSC)	Chr 6: 89.33 - 89.35 Мб	Chr 4: 33.03 - 33.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-конъюгированный фермент E2 J1 это белок что у людей кодируется UBE2J1 ген.^[5][6]

Модификация белков с помощью убиквитин является важным клеточным механизмом для нацеливания на аномальные или короткоживущие белки для деградации. Убиквитинирование включает по крайней мере три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1s, убиквитин-конъюгированные ферменты или E2s, и убиквитин-протеиновые лигазы, или E3s.

Этот ген кодирует член семейства E2-убиквитин-конъюгированных ферментов. Этот фермент находится в мембране эндоплазматический ретикулум (ER) и может способствовать деградации, связанной с контролем качества. убиквитин-протеасомная система.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198833 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028277 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лестер Д., Фаркухарсон С., Рассел Г., Хьюстон Б. (апрель 2000 г.). «Идентификация семейства неканонических убиквитин-конъюгированных ферментов, структурно связанных с дрожжевым UBC6». Biochem Biophys Res Commun. 269 (2): 474–80. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2302. PMID  10708578.
6. «Ген Entrez: UBE2J1 убиквитин-конъюгированный фермент E2, J1 (гомолог UBC6, дрожжи)».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY и др. (2000). «Идентификация новых эволюционно консервативных генов человека у Caenorhabditis elegans с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Ленк У, Ю Х, Уолтер Дж и др. (2002). «Роль гомологов Ubc6 млекопитающих в ER-ассоциированной деградации белка». J. Cell Sci. 115 (Pt 14): 3007–14. PMID  12082160.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ву CJ, Conze DB, Li X и др. (2005). «TNF-α индуцировал транслокацию комплекса c-IAP1 / TRAF2 в компартмент, содержащий Ubc6, и убиквитинирование TRAF2». EMBO J. 24 (10): 1886–98. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600649. ЧВК  1142588. PMID  15861135.
• О, RS, Бай Х, Ромменс Дж. М. (2006). «Человеческие гомологи Ubc6p убиквитин-конъюгированного фермента и фосфорилирование HsUbc6e в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума». J. Biol. Chem. 281 (30): 21480–90. Дои:10.1074 / jbc.M601843200. PMID  16720581.