USP6 - USP6

USP6
Идентификаторы
Псевдонимы	USP6, HRP1, TRE17, TRE2, TRESMCR, Tre-2, USP6-short, убиквитинспецифическая пептидаза 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 604334 ГомолоГен: 136783 Генные карты: USP6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.2 Начните 5,116,032 бп[1] Конец 5,175,034 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • пептидазная активность • активность эндопептидазы цистеинового типа • активность пептидазы цистеинового типа • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • Связывание Rab GTPase • связывание кальмодулина Сотовый компонент • цитоплазма • переработка эндосомы • эндосома • клеточная мембрана • лизосома • мембрана Биологический процесс • деубиквитинирование белков • регуляция опосредованного пузырьками транспорта • процесс модификации клеточного белка • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • протеолиз • внутриклеточный транспорт белка • регуляция слияния везикул • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9098	н / д
Ансамбль	ENSG00000129204	н / д
UniProt	P35125	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001304284 NM_004505 NM_005152	н / д
RefSeq (белок)	NP_001291213 NP_004496	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 17: 5.12 - 5.18 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Убиквитинкарбоксил-концевая гидролаза 6 является фермент что у людей кодируется USP6 ген.^[3][4][5]

Аневризматическая киста кости можно связать с TRE17 /USP6 транслокация.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000129204 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат Рев Жене. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
4. Hoogendijk JE, Hensels GW, Gabreels-Festen AA, Gabreels FJ, Janssen EA, de Jonghe P, Martin JJ, van Broeckhoven C, Valentijn LJ, Baas F, et al. (Май 1992 г.). «Мутация De-novo при наследственной моторной и сенсорной нейропатии I типа». Ланцет. 339 (8801): 1081–2. Дои:10.1016 / 0140-6736 (92) 90668-С. PMID  1349106. S2CID  35908066.
5. «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 6 USP6 (онкоген Tre-2)».
6. Йе Й, Прингл Л.М., Лау А.В. и др. (Июнь 2010 г.). «Онкоген TRE17 / USP6, перемещенный в аневризму костной кисты, индуцирует продукцию матриксной металлопротеиназы через активацию NFκB». Онкоген. 29 (25): 3619–29. Дои:10.1038 / onc.2010.116. ЧВК  2892027. PMID  20418905.

дальнейшее чтение

• Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол. 33 (5): 337–52. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
• Накамура Т., Хиллова Дж., Мариаж-Самсон Р. и др. (1992). «Новая транскрипционная единица треонкогена, широко экспрессируемая в раковых клетках человека». Онкоген. 7 (4): 733–41. PMID  1565468.
• Папа Ф. Р., Хохштрассер М (1993). «Ген дрожжевого DOA4 кодирует деубиквитинирующий фермент, родственный продукту онкогена tre-2 человека». Природа. 366 (6453): 313–9. Дои:10.1038 / 366313a0. PMID  8247125. S2CID  4273807.
• Онно М., Накамура Т., Хиллова Дж., Хилл М. (1993). «Идентификация новых последовательностей в репертуаре гипервариабельных генов TRE17 из иммортализованных незлокачественных и злокачественных кератиноцитов человека». Ген. 131 (2): 209–15. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90295-Е. PMID  8406013.
• Онно М., Накамура Т., Мариаж-Самсон Р. и др. (1993). «Онкоген TRE17 человека генерируется из семейства гомологичных полиморфных последовательностей путем изменения одного основания». ДНК клетки биол. 12 (2): 107–18. Дои:10.1089 / dna.1993.12.107. PMID  8471161.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Полдинг CA, Руволо М., Хабер Д.А. (2003). «Онкоген Tre2 (USP6) представляет собой ген, специфичный для гоминоидов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (5): 2507–11. Дои:10.1073 / pnas.0437015100. ЧВК  151371. PMID  12604796.
• Масуда-Робенс Дж. М., Кутни С. Н., Ци Х., Чжоу М. М. (2003). «Онкоген TRE17 кодирует компонент нового эффекторного пути для Rho GTPases Cdc42 и Rac1 и стимулирует ремоделирование актина». Мол. Cell. Биол. 23 (6): 2151–61. Дои:10.1128 / MCB.23.6.2151-2161.2003. ЧВК  149457. PMID  12612085.
• Бизимунгу С., Де Неве Н., Берни А. и др. (2003). «Экспрессия в мутанте дрожжей RabGAP двух гомологов человека, один из которых является онкогеном». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 310 (2): 498–504. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.09.051. PMID  14521938.
• Oliveira AM, Hsi BL, Weremowicz S et al. (2004). «Онкогены слияния USP6 (Tre2) в аневризматической костной кисте». Рак Res. 64 (6): 1920–3. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-2827. PMID  15026324.
• Oliveira AM, Perez-Atayde AR, Inwards CY, et al. (2004). «Онкогены USP6 и CDH11 идентифицируют неопластические клетки в первичных аневризматических костных кистах и ​​отсутствуют в так называемых вторичных аневризматических костных кистах». Am. Дж. Патол. 165 (5): 1773–80. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63432-3. ЧВК  3278819. PMID  15509545.
• Мартину Л., Масуда-Робенс Дж. М., Робертсон С. Е. и др. (2004). «Белок TRE17 домена TBC (Tre-2 / Bub2 / Cdc16) регулирует перенос плазматической мембраны-эндосомы посредством активации Arf6». Мол. Cell. Биол. 24 (22): 9752–62. Дои:10.1128 / MCB.24.22.9752-9762.2004. ЧВК  525471. PMID  15509780.
• Oliveira AM, Perez-Atayde AR, Dal Cin P и др. (2005). «Транслокации вариантов аневризматической костной кисты усиливают транскрипцию USP6 за счет замены промотора генами ZNF9, COL1A1, TRAP150 и OMD». Онкоген. 24 (21): 3419–26. Дои:10.1038 / sj.onc.1208506. PMID  15735689.
• Бизимунгу К., Ванденбол М. (2005). «По крайней мере, две области онкопротеина Tre2 вовлечены в отсутствие активности GAP». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 335 (3): 883–90. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.07.159. PMID  16099424.
• Шен С., Йе Й, Робертсон С.Е. и др. (2006). «Кальций / кальмодулин регулирует убиквитинирование убиквитин-специфической протеазы TRE17 / USP6». J. Biol. Chem. 280 (43): 35967–73. Дои:10.1074 / jbc.M505220200. PMID  16127172.
• Dechamps C, Bach S, Portetelle D, Vandenbol M (2006). «Онкопротеин Tre2, связанный с саркомой Юинга, взаимодействует с двумя компонентами цитоскелета». Biotechnol. Латыш. 28 (4): 223–31. Дои:10.1007 / s10529-005-5523-2. PMID  16555005. S2CID  25625056.