UBE2B - UBE2B

UBE2B
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1JAS, 2Y4W, 2YB6, 2YBF
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2B, E2-17kDa, HHR6B, HR6B, RAD6B, UBC2, убиквитин-конъюгирующий фермент E2 B
Внешние идентификаторы	OMIM: 179095 MGI: 102944 ГомолоГен: 101298 Генные карты: UBE2B
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 5 (человек)
Конец	134,392,108 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	52,000,762 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• трансферазная активность; • связывание нуклеотидов; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы; • активность убиквитин-протеинтрансферазы; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание АТФ; • активность фермента, конъюгированного с убиквитином; • связывание убиквитин-протеин-лигазы;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • мембрана; • клеточная мембрана; • вилка репликации; • Комплекс HULC; • нуклеоплазма; • XY тело; • хроматин; • ядро клетки; • ядерный хроматин;
Биологический процесс	• собрание хиазмы; • убиквитинирование гистона H2A; • отрицательная регуляция передачи сигналов с помощью цАМФ; • пострепликационный ремонт; • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • убиквитинирование, связанное с белком K63; • кластеризация мейотических теломер; • положительная регуляция реципрокной мейотической рекомбинации; • стабилизация белка; • полиубиквитинирование белков; • отрицательная регуляция апоптотического процесса; • внутриутробное эмбриональное развитие; • моноубиквитинирование белков; • сборка аксонемы спермы; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК; • убиквитинирование, связанное с белком K11; • деметилирование лизина гистонов; • убиквитинирование, связанное с белком K48; • отрицательная регуляция фосфорилирования гистонов; • регуляция модификации гистонов; • сперматогенез; • канонический путь передачи сигналов Wnt; • организация синаптонемного комплекса; • ответ на УФ; • ответ на наркотик; • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • аутоубиквитинирование белков; • Ответ на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК; • Ремонт ДНК; • убиквитинирование белков; • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7320
	22210
	ENSG00000119048
	ENSMUSG00000020390
	P63146
	P63147
	NM_003337
	NM_009458; NM_001362685; NM_001362686
	NP_003328
	NP_033484; NP_001349614; NP_001349615
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-конъюгированный фермент E2 B это белок что у людей кодируется UBE2B ген.^[5]^[6]

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом нацеливания на аномальные или короткоживущие белки для деградации. Убиквитинирование включает по крайней мере три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1, ферменты, конъюгирующие с убиквитином, или E2, и лигазы убиквитин-протеин, или E3. Этот ген кодирует член семейства E2-убиквитин-конъюгированных ферментов. Этот фермент необходим для восстановления повреждений ДНК после репликации. Его белковая последовательность на 100% идентична гомологам мыши, крысы и кролика, что указывает на высокую консервативность этого фермента в эволюции эукариот.^[6]

Взаимодействия

UBE2B был показан взаимодействовать с RAD18.^[7]^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119048 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020390 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Кокен М.Х., Смит Е.М., Ясперс-Деккер И., Оостра Б.А., Хагемейер А., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х. (май 1992 г.). «Локализация двух человеческих гомологов, HHR6A и HHR6B, гена репарации дрожжевой ДНК RAD6 в хромосомах Xq24-q25 и 5q23-q31». Геномика. 12 (3): 447–53. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90433-С. HDL:1765/3036. PMID 1559696.
^ ^а ^б «Ген Entrez: UBE2B убиквитин-конъюгированный фермент E2B (гомолог RAD6)».
^ Xin, H; Lin W; Суманасекера W; Zhang Y; Wu X; Ван З (июль 2000 г.). «Продукт гена RAD18 человека взаимодействует с HHR6A и HHR6B». Нуклеиновые кислоты Res. АНГЛИЯ. 28 (14): 2847–54. Дои:10.1093 / nar / 28.14.2847. ЧВК 102657. PMID 10908344.
^ Татейши, S; Сакураба Й; Masuyama S; Иноуэ Х; Ямаидзуми М (июль 2000 г.). «Дисфункция человеческого Rad18 приводит к нарушению пострепликационной репарации и гиперчувствительности к множественным мутагенам». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 97 (14): 7927–32. Bibcode:2000PNAS ... 97.7927T. Дои:10.1073 / pnas.97.14.7927. ISSN 0027-8424. ЧВК 16647. PMID 10884424.

дальнейшее чтение

Кокен М.Х., Рейнольдс П., Ясперс-Деккер И. и др. (1991). «Структурная и функциональная консервация двух человеческих гомологов гена репарации дрожжевой ДНК RAD6». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (20): 8865–9. Bibcode:1991PNAS ... 88.8865K. Дои:10.1073 / pnas.88.20.8865. ЧВК 52611. PMID 1717990.
Воффендин С., Чен З.Й., Стаскус К. и др. (1991). «МРНК млекопитающих, кодирующие белок, тесно связанный с убиквитин-конъюгированным ферментом, кодируемым геном репарации дрожжевой ДНК RAD6». Биохим. Биофиз. Acta. 1090 (1): 81–5. Дои:10.1016 / 0167-4781 (91) 90039-о. PMID 1883845.
Schneider R, Eckerskorn C, Lottspeich F, Schweiger M (1990). «Белок-носитель убиквитина человека Е2 (Mr = 17000) гомологичен гену репарации дрожжевой ДНК RAD6». EMBO J. 9 (5): 1431–5. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08259.x. ЧВК 551831. PMID 2158443.
Koken MH, Hoogerbrugge JW, Jasper-Dekker I, et al. (1996). «Экспрессия убиквитин-конъюгированных ферментов репарации ДНК HHR6A и B предполагает их роль в сперматогенезе и модификации хроматина». Dev. Биол. 173 (1): 119–32. Дои:10.1006 / dbio.1996.0011. PMID 8575614.
Татейши С., Сакураба Й., Масуяма С. и др. (2000). «Дисфункция человеческого Rad18 приводит к нарушению пострепликационной репарации и гиперчувствительности к множественным мутагенам». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (14): 7927–32. Bibcode:2000PNAS ... 97.7927T. Дои:10.1073 / pnas.97.14.7927. ЧВК 16647. PMID 10884424.
Xin H, Lin W., Sumanasekera W. и др. (2000). «Продукт гена RAD18 человека взаимодействует с HHR6A и HHR6B». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (14): 2847–54. Дои:10.1093 / nar / 28.14.2847. ЧВК 102657. PMID 10908344.
Миура Т., Клаус В., Росс А. и др. (2003). «Структура ЯМР человеческого убиквитин-конъюгированного фермента 2b класса I». J. Biomol. ЯМР. 22 (1): 89–92. Дои:10.1023 / А: 1013807519703. PMID 11885984. S2CID 27799378.
Шехар М.П., Ляхович А., Висшер Д.В. и др. (2002). «Сверхэкспрессия Rad6 вызывает многоядерность, амплификацию центросом, аномальный митоз, анеуплоидию и трансформацию». Рак Res. 62 (7): 2115–24. PMID 11929833.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Kwon YT, Xia Z, An JY и др. (2003). «Летальность самок и апоптоз сперматоцитов у мышей, лишенных убиквитинлигазы UBR2 пути правила N-конца». Мол. Cell. Биол. 23 (22): 8255–71. Дои:10.1128 / MCB.23.22.8255-8271.2003. ЧВК 262401. PMID 14585983.
Ляхович А, Шехар М.П. (2004). «Сверхэкспрессия RAD6B придает химиорезистентность: экспрессия RAD6 во время клеточного цикла и его перераспределение в хроматин во время реакции, вызванной повреждением ДНК». Онкоген. 23 (17): 3097–106. Дои:10.1038 / sj.onc.1207449. PMID 14981545.
Ватанабе К., Татейши С., Кавасудзи М. и др. (2005). «Rad18 направляет полета к сайтам остановки репликации посредством физического взаимодействия и моноубиквитинирования PCNA». EMBO J. 23 (19): 3886–96. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600383. ЧВК 522788. PMID 15359278.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Шекхар М.П., Тейт Л., Жерар Б. (2007). «Важная роль Т-клеточного фактора / бета-катенина в регуляции Rad6B: потенциальный механизм сверхэкспрессии Rad6B в клетках рака груди». Мол. Рак Res. 4 (10): 729–45. Дои:10.1158 / 1541-7786.MCR-06-0136. PMID 17050667.

Эта статья о ген на хромосома человека 5 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119048 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020390 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1559696-5] Кокен М.Х., Смит Е.М., Ясперс-Деккер И., Оостра Б.А., Хагемейер А., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х. (май 1992 г.). «Локализация двух человеческих гомологов, HHR6A и HHR6B, гена репарации дрожжевой ДНК RAD6 в хромосомах Xq24-q25 и 5q23-q31». Геномика. 12 (3): 447–53. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90433-С. HDL:1765/3036. PMID 1559696.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: UBE2B убиквитин-конъюгированный фермент E2B (гомолог RAD6)».

[pmid10908344-7] Xin, H; Lin W; Суманасекера W; Zhang Y; Wu X; Ван З (июль 2000 г.). «Продукт гена RAD18 человека взаимодействует с HHR6A и HHR6B». Нуклеиновые кислоты Res. АНГЛИЯ. 28 (14): 2847–54. Дои:10.1093 / nar / 28.14.2847. ЧВК 102657. PMID 10908344.

[pmid10884424-8] Татейши, S; Сакураба Й; Masuyama S; Иноуэ Х; Ямаидзуми М (июль 2000 г.). «Дисфункция человеческого Rad18 приводит к нарушению пострепликационной репарации и гиперчувствительности к множественным мутагенам». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 97 (14): 7927–32. Bibcode:2000PNAS ... 97.7927T. Дои:10.1073 / pnas.97.14.7927. ISSN 0027-8424. ЧВК 16647. PMID 10884424.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]