DNAJC10 - DNAJC10

DNAJC10
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3APO, 3APQ, 3APS
Идентификаторы
Псевдонимы	DNAJC10, ERdj5, JPDI, MTHr, PDIA19, член C10 семейства белков теплового шока DnaJ (Hsp40)
Внешние идентификаторы	OMIM: 607987 MGI: 1914111 ГомолоГен: 10358 Генные карты: DNAJC10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q32.1 Начинать 182,716,041 бп[1] Конец 182,794,464 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 C3 Начинать 80,315,466 бп[2] Конец 80,354,043 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание АТФазы • неправильно свернутый белок • Связывание с белком Hsp70 • GO: 0001948 связывание с белками • оксидоредуктазная активность • привязка шаперона • Активность активатора АТФазы • активность дисульфид оксидоредуктазы • оксидоредуктазная активность, действующая на серную группу доноров, дисульфид в качестве акцептора • активность дисульфид-оксидоредуктазы протеина Сотовый компонент • мембрана • шаперонный комплекс эндоплазматического ретикулума • просвет эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток • реакция на стресс эндоплазматического ретикулума • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • убиквитин-зависимый путь ERAD • окислительно-восстановительный процесс • положительная регуляция активности АТФазы • сворачивание белка в эндоплазматическом ретикулуме Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54431	66861
Ансамбль	ENSG00000077232	ENSMUSG00000027006
UniProt	Q8IXB1	Q9DC23
RefSeq (мРНК)	NM_001271581 NM_018981	NM_024181
RefSeq (белок)	NP_001258510 NP_061854	NP_077143
Расположение (UCSC)	Chr 2: 182,72 - 182,79 Мб	Chr 2: 80.32 - 80.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DnaJ гомолог подсемейства C член 10 это белок что в люди является закодированный посредством DNAJC10 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077232 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027006 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Cunnea PM, Miranda-Vizuete A, Bertoli G, Simmen T., Damdimopoulos AE, Hermann S, Leinonen S., Huikko MP, Gustafsson JA, Sitia R, Spyrou G (январь 2003 г.). «ERdj5, белок, резидентный в эндоплазматическом ретикулуме (ER), содержащий домены DnaJ и тиоредоксина, экспрессируется в секреторных клетках или после стресса ER». J Biol Chem. 278 (2): 1059–66. Дои:10.1074 / jbc.M206995200. PMID  12411443.
6. Хосода А., Кимата Ю., Цуру А., Коно К. (январь 2003 г.). «JPDI, новый резидентный белок эндоплазматического ретикулума, содержащий как BiP-взаимодействующий J-домен, так и тиоредоксиноподобные мотивы». J Biol Chem. 278 (4): 2669–76. Дои:10.1074 / jbc.M208346200. PMID  12446677.
7. «Ген Entrez: ДНКJC10, гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, член 10».

дальнейшее чтение

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Гу Ш., Чен Дж. З., Инь К. и др. (2004). «Клонирование и идентификация новой кДНК, которая кодирует предполагаемый белок с доменом DnaJ и активным мотивом тиоредоксина, макротиоредоксин человека». Biochem. Genet. 41 (7–8): 245–53. Дои:10.1023 / А: 1025510502147. PMID  14587667. S2CID  13635128.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для члена 10 гомолога DnaJ мыши подсемейства C (DNAJC10)