DNAJC1 - DNAJC1

DNAJC1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CQQ, 2CQR
Идентификаторы
Псевдонимы	DNAJC1, DNAJL1, ERdj1, HTJ1, MTJ1, член семейства белков теплового шока DnaJ (Hsp40) C1
Внешние идентификаторы	OMIM: 611207 MGI: 103268 ГомолоГен: 7293 Генные карты: DNAJC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10п12.31 Начинать 21,756,548 бп[1] Конец 22,003,769 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 A3 Начинать 18,195,654 бп[2] Конец 18,392,830 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • Активность активатора АТФазы • привязка шаперона • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана органеллы • клеточная мембрана • не мембрана • мембрана эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • мембрана • ядро клетки • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • отрицательная регуляция протеолиза • сворачивание белка • регулирование перевода • регулирование секреции белка • положительная регуляция активности АТФазы • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64215	13418
Ансамбль	ENSG00000136770	ENSMUSG00000026740
UniProt	Q96KC8	Q61712
RefSeq (мРНК)	NM_022365	NM_001190817 NM_007869
RefSeq (белок)	NP_071760	NP_001177746 NP_031895
Расположение (UCSC)	Chr 10: 21.76 - 22 Мб	Chr 2: 18,2 - 18,39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DnaJ гомолог подсемейства C член 1 это белок что у людей кодируется DNAJC1 ген.^[5]

Взаимодействия

Было показано, что DNAJC1 взаимодействовать с Альфа-1-антихимотрипсин.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136770 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026740 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: ДНКJC1, гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, член 1».
6. Kroczynska B, Evangelista CM, Samant SS, Elguindi EC, Blond SY (2004). «Домен SANT2 человеческого гомолога DnaJ-подобного белка 1 опухолевой клетки мыши взаимодействует с альфа1-антихимотрипсином и кинетически препятствует его ингибирующей активности серпина». J. Biol. Chem. 279 (12): 11432–43. Дои:10.1074 / jbc.M310903200. ЧВК  1553221. PMID  14668352.

дальнейшее чтение

• Крочинска Б., Кинг-Симмонс Л., Аллоза Л. и др. (2006). «Ко-шаперон BIP MTJ1 / ERDJ1 взаимодействует с тяжелой цепью 4 интер-альфа-трипсина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 338 (3): 1467–77. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.10.101. PMID  16271702.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID  15164054.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Крочинска Б., Евангелиста С.М., Самант С.С. и др. (2004). «Домен SANT2 человеческого гомолога DnaJ-подобного белка 1 опухолевой клетки мыши взаимодействует с альфа1-антихимотрипсином и кинетически препятствует его ингибирующей активности серпина». J. Biol. Chem. 279 (12): 11432–43. Дои:10.1074 / jbc.M310903200. ЧВК  1553221. PMID  14668352.
• Ленер Б., Семпл Дж. И., Браун С. Е. и др. (2004). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID  14667819.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Chevalier M, Rhee H, Elguindi EC, Blond SY (2000). «Взаимодействие мышиного BiP / GRP78 с гомологом DnaJ MTJ1». J. Biol. Chem. 275 (26): 19620–7. Дои:10.1074 / jbc.M001333200. ЧВК  1534116. PMID  10777498.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для гомолога DnaJ человека подсемейства C член 1