UBE2V1 - UBE2V1 - Wikipedia

UBE2V1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2A4D, 2C2V, 2HLW
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2V1, CIR1, CROC-1, CROC1, UBE2V, UEV-1, UEV1, UEV1A, убиквитин-конъюгированный фермент E2 V1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602995 MGI: 1913839 ГомолоГен: 81888 Генные карты: UBE2V1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.13 Начинать 50,081,124 бп[1] Конец 50,115,959 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H3 | 2 87,44 см Начинать 167,607,638 бп[2] Конец 167,632,095 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • связывание убиквитин-протеин-лигазы • активность фермента, конъюгированного с убиквитином Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • комплекс ферментов, конъюгированных с убиквитином • Комплекс UBC13-UEV1A • убиквитинлигазный комплекс • внеклеточная экзосома • ядро клетки • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • полиубиквитинирование белков • Сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон • убиквитинирование, связанное с белком K63 • нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий сигнальный путь • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • стимулирующий сигнальный путь рецептора лектина С-типа • регулирование репарации ДНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • дифференциация клеток • пострепликационный ремонт • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • активация активности MAPK • Каскад JNK • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-1 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7335	66589
Ансамбль	ENSG00000244687	ENSMUSG00000078923
UniProt	Q13404	Q9CZY3
RefSeq (мРНК)	NM_001032288 NM_001257393 NM_001257394 NM_001257395 NM_001257396 NM_001257397 NM_001257398 NM_001257399 NM_001282575 NM_001282576 NM_001282577 NM_001282578 NM_001282579 NM_001282580 NM_021988 NM_022442 NM_199144	NM_023230 NM_001311131 NM_001311146
RefSeq (белок)	NP_001027459 NP_001244322 NP_001244323 NP_001244324 NP_001244325 NP_001244326 NP_001244327 NP_001244328 NP_001269504 NP_001269505 NP_001269506 NP_001269507 NP_001269508 NP_001269509 NP_068823 NP_071887 NP_954595 NP_954673	NP_001298060 NP_001298075 NP_075719
Расположение (UCSC)	Chr 20: 50.08 - 50.12 Мб	Chr 2: 167.61 - 167.63 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-конъюгированный фермент E2 вариант 1 это белок что у людей кодируется UBE2V1 ген.^[5][6][7]

Функция

Белки вариантов фермента E2, конъюгированные с убиквитином, составляют отдельное подсемейство в семействе белков E2. У них есть сходство последовательностей с другими убиквитин-конъюгирующими ферментами, но отсутствует консервативный остаток цистеина, который имеет решающее значение для каталитической активности E2s. Кодируемый этим геном белок расположен в ядре и может вызывать активацию транскрипции протоонкогена FOS человека. Считается, что он участвует в контроле дифференцировки, изменяя поведение клеточного цикла. Для этого гена описаны множественные альтернативно сплайсированные транскрипты, кодирующие разные изоформы. Был идентифицирован псевдоген, который также расположен на хромосоме 20. Совместная транскрипция этого гена и соседнего вышестоящего гена генерирует редкий транскрипт (Kua-UEV), который кодирует слитый белок, состоящий из последовательностей, идентичных каждому индивидуальному продукту гена.^[7]

Взаимодействия

UBE2V1 был показан взаимодействовать с UBE2N.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000244687 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078923 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Санчо Э., Вила М.Р., Санчес-Пулидо Л., Лозано Дж. Дж., Пачуччи Р., Надаль М., Фокс М., Харви С., Беркович Б., Лукили Н., Цехановер А., Лин С.Л., Санс Ф., Эстивилл Х, Валенсия А., Томсон TM ( Январь 1998 г.). «Роль UEV-1, неактивного варианта E2 убиквитин-конъюгированных ферментов, в дифференцировке in vitro и поведении клеточного цикла мукосекреторных клеток кишечника HT-29-M6». Mol Cell Biol. 18 (1): 576–89. Дои:10.1128 / mcb.18.1.576. ЧВК  121525. PMID  9418904.
6. Ротхофски М.Л., Лин С.Л. (октябрь 1997 г.). «CROC-1 кодирует белок, который опосредует активацию транскрипции человеческого промотора FOS». Ген. 195 (2): 141–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00097-8. PMID  9305758.
7. "Ген Entrez: UBE2V1 убиквитин-конъюгированный фермент E2 вариант 1".
8. Дэн Л., Ван С., Спенсер Э, Ян Л., Браун А., Ю Дж, Слотер С., Пикарт С., Чен З. Дж. (Октябрь 2000 г.). «Активация киназного комплекса IkappaB с помощью TRAF6 требует наличия димерного комплекса убиквитин-конъюгированного фермента и уникальной полиубиквитиновой цепи». Клетка. 103 (2): 351–61. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00126-4. PMID  11057907. S2CID  18154645.

дальнейшее чтение

• Лонг М (2001). «Новая функция возникла в результате слияния генов». Genome Res. 10 (11): 1655–7. Дои:10.1101 / гр.165700. PMID  11076848.
• Томсон TM, Халид Х., Лозано Дж. Дж., Санчо Е., Ариньо Дж. (1998). «Роль UEV-1A, гомолога белка-супрессора опухолей TSG101, в защите от повреждения ДНК». FEBS Lett. 423 (1): 49–52. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00060-X. PMID  9580084. S2CID  28536857.
• Сяо В., Линь С.Л., Брумфилд С., Чоу Б.Л., Вэй Ю.Ф. (1998). «Продукты дрожжевого MMS2 и двух человеческих гомологов (hMMS2 и CROC-1) определяют структурно и функционально консервативное семейство Ubc-подобных белков». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (17): 3908–14. Дои:10.1093 / nar / 26.17.3908. ЧВК  147796. PMID  9705497.
• Ма Л., Брумфилд С., Лавери С., Лин С.Л., Сяо В., Баккетти С. (1998). «Повышающая регуляция экспрессии CIR1 / CROC1 после иммортализации клеток и в линиях клеток человека, полученных из опухоли». Онкоген. 17 (10): 1321–6. Дои:10.1038 / sj.onc.1202058. PMID  9771976.
• Хофманн Р.М., Пикарт С.М. (1999). «Неканонический MMS2-кодируемый убиквитин-конъюгированный фермент выполняет функции сборки новых полиубиквитиновых цепей для репарации ДНК». Клетка. 96 (5): 645–53. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80575-9. PMID  10089880. S2CID  17117789.
• Дэн Л., Ван С., Спенсер Э, Ян Л., Браун А., Ю Дж, Слотер С., Пикарт С., Чен З. Дж. (2000). «Активация киназного комплекса IkappaB с помощью TRAF6 требует наличия димерного комплекса убиквитин-конъюгированного фермента и уникальной полиубиквитиновой цепи». Клетка. 103 (2): 351–61. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00126-4. PMID  11057907. S2CID  18154645.
• Томсон TM, Лозано Дж. Дж., Лукили Н., Каррио Р., Серрас Ф., Корман Б., Валери М., Диас В. М., Абрил Дж., Бурсет М., Мерино Дж., Макая А., Короминас М., Гиго Р. (2001). «Слияние человеческого гена коэффектора полиубиквитинирования UEV1 с недавно идентифицированным геном Kua». Genome Res. 10 (11): 1743–56. Дои:10.1101 / гр. GR-1405R. ЧВК  310942. PMID  11076860.
• Ито М., Ситидзё С., Цуда Н., Очи М., Харашима Н., Сайто Н., Ито К. (2001). «Молекулярные основы опосредованного Т-клетками распознавания раковых клеток поджелудочной железы». Рак Res. 61 (5): 2038–46. PMID  11280764.
• Андерсен П.Л., Чжоу Х., Пастушок Л., Мораес Т., МакКенна С., Зиола Б., Эллисон М.Дж., Диксит В.М., Сяо В. (2005). «Четкая регуляция функций Ubc13 двумя вариантами убиквитин-конъюгированного фермента Mms2 и Uev1A». J. Cell Biol. 170 (5): 745–55. Дои:10.1083 / jcb.200502113. ЧВК  2171356. PMID  16129784.
• Хау Д.Д., Льюис М.Дж., Салтибус Л.Ф., Пастушок Л., Сяо В., Спайракопулос Л. (2006). «Структура и взаимодействия убиквитин-конъюгированного варианта фермента человека Uev1a: значение для ферментативного синтеза полиубиквитиновых цепей». Биохимия. 45 (32): 9866–77. Дои:10.1021 / bi060631r. PMID  16893187.
• Сайед Н.А., Андерсен П.Л., Уоррингтон Р.К., Сяо В. (2007). «Uev1A, вариант фермента, конъюгирующего убиквитин, ингибирует вызванный стрессом апоптоз посредством активации NF-kappaB». Апоптоз. 11 (12): 2147–57. Дои:10.1007 / s10495-006-0197-3. PMID  17041755. S2CID  6078250.
• Петроски, доктор медицины, Чжоу X, Донг Г., Даниэль-Иссакани С., Паян Д. Г., Хуанг Дж. (2007). «Модификация субстрата с помощью лизин-63-связанных цепей убиквитина с помощью фермента, конъюгированного с убиквитином UBC13-UEV1A». J. Biol. Chem. 282 (41): 29936–45. Дои:10.1074 / jbc.M703911200. PMID  17709375.