Интегрин альфа 4 - Integrin alpha 4

ITGA4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4HKC, 3V4P, 3V4V, 5FPI, 5C7Z
Идентификаторы
Псевдонимы	ITGA4, CD49D, IA4, субъединица интегрина альфа 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 192975 MGI: 96603 ГомолоГен: 37364 Генные карты: ITGA4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q31.3 Начинать 181,457,202 бп[1] Конец 181,538,940 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 C3 | 2 47,38 см Начинать 79,255,426 бп[2] Конец 79,333,123 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание антигена с белком • связывание ионов металлов • связывание антигена • связывание фибронектина • связывание молекул клеточной адгезии • корецепторная активность • Связывание хемокинов C-X3-C • активность гетеродимеризации белков Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • очаговая адгезия • поверхность клетки • комплекс интегрина альфа4-бета7 • комплекс интегрина • клеточная мембрана • конус роста • тело нейрональной клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • дифференцировка энтодермальных клеток • Дифференцировка В-клеток • положительная регуляция миграции Т-клеток • организация внеклеточного матрикса • гетеротипическая межклеточная адгезия • распространение клеток в зависимости от адгезии субстрата • клеточный ответ на цитокиновый стимул • адгезия клеточного матрикса, участвующая в миграции амебоидных клеток • адгезия клеточного матрикса • связывание или перекатывание лейкоцитов • Лейкоцитарная экстравазация • регуляция иммунного ответа • интегрин-опосредованный сигнальный путь • миграция лейкоцитов • положительное регулирование связывания или скатывания лейкоцитов • положительная регуляция клеточной адгезии лейкоцитов • положительная регуляция миграции лейкоцитов • импортировать в ячейку • лейкоцитарная клеточная адгезия • отрицательная регуляция активности гомодимеризации белков • клатрин-зависимый внеклеточный эндоцитоз экзосом • клеточная адгезия • кластеризация рецепторов • межклеточная адгезия, опосредованная интегрином • аксоногенез, участвующий в иннервации • межклеточная адгезия в ответ на внеклеточный стимул • клеточный ответ на амилоид-бета • положительная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток сосудов • расширение проекции нейрона • положительная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3676	16401
Ансамбль	ENSG00000115232	ENSMUSG00000027009
UniProt	P13612	Q00651
RefSeq (мРНК)	NM_000885 NM_001316312	NM_010576
RefSeq (белок)	NP_000876 NP_001303241	NP_034706
Расположение (UCSC)	Chr 2: 181,46 - 181,54 Мб	Chr 2: 79,26 - 79,33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CD49d является интегрин альфа-субъединица. Составляет половину α4β1 рецептор самонаведения лимфоцитов.

Функция

Продукт этого гена принадлежит к семейству белков интегриновой альфа-цепи. Интегрины представляют собой гетеродимерные интегральные мембранные белки, состоящие из альфа-цепи и бета-цепи. Этот ген кодирует цепь альфа-4. В отличие от других альфа-цепей интегрина, альфа-4 не содержит I-домена и не подвергается дисульфидному расщеплению. Цепь альфа-4 ассоциируется с цепью бета-1 или бета-7.^[5]

Взаимодействия

CD49d был показан взаимодействовать с LGALS8^[6] и Паксиллин.^[7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115232 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027009 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: интегрин ITGA4, альфа 4 (антиген CD49D, альфа 4 субъединица рецептора VLA-4)».
6. Хадари Ю. Р., Арбель-Горен Р., Леви Ю., Амстердам А., Алон Р., Закут Р., Зик И. (2000). «Связывание галектина-8 с интегринами ингибирует клеточную адгезию и вызывает апоптоз». J. Cell Sci. 113 (Pt 13): 2385–97. PMID  10852818.
7. Хан Дж., Лю С., Роуз Д.М., Шлепфер Д.Д., Макдональд Х., Гинзберг М.Х. (ноябрь 2001 г.). «Фосфорилирование цитоплазматического домена интегрина альфа 4 регулирует связывание паксиллина». J. Biol. Chem. 276 (44): 40903–9. Дои:10.1074 / jbc.M102665200. PMID  11533025.
8. Лю С., Киосес В.Б., Роуз Д.М., Слепак М., Салгия Р., Гриффин Д.Д., Тернер К.Э., Шварц М.А., Гинзберг М.Х. (июнь 2002 г.). «Фрагмент паксиллина связывает цитоплазматический домен интегрина альфа 4 (хвост) и селективно ингибирует опосредованную альфа 4 миграцию клеток». J. Biol. Chem. 277 (23): 20887–94. Дои:10.1074 / jbc.M110928200. PMID  11919182.

дальнейшее чтение

• Хамфрис MJ, Шеридан J, Mold AP, Newham P (1995). «Механизмы связывания VCAM-1 и фибронектина с интегрином альфа 4 бета 1: последствия для функции интегрина и рационального дизайна лекарств». Ciba Найдено. Symp. Симпозиумы Фонда Новартис. 189: 177–91, обсуждение 191–9. Дои:10.1002 / 9780470514719.ch13. ISBN  9780470514719. PMID  7587632.
• Остендорп Р.А., Дёрмер П. (1997). «VLA-4-опосредованные взаимодействия между нормальными гематопоэтическими предшественниками человека и стромальными клетками». Лейк. Лимфома. 24 (5–6): 423–35. Дои:10.3109/10428199709055581. PMID  9086434.
• Портер Дж. К., Хогг Н. (1999). «Интегрины принимают партнеров: перекрестное взаимодействие интегринов с другими мембранными рецепторами». Тенденции Cell Biol. 8 (10): 390–6. Дои:10.1016 / S0962-8924 (98) 01344-0. PMID  9789327.
• Роуз Д.М., Хан Дж., Гинзберг М.Х. (2003). «Интегрины Alpha4 и иммунный ответ». Иммунол. Rev. 186 (1): 118–24. Дои:10.1034 / j.1600-065X.2002.18611.x. PMID  12234367. S2CID  37850994.
• О'Коннор П. (2007). «Натализумаб и роль антагонизма альфа-4-интегрина в лечении рассеянного склероза». Мнение эксперта по биологической терапии. 7 (1): 123–36. Дои:10.1517/14712598.7.1.123. PMID  17150024. S2CID  73319319.
• Чан Б.М., Элисес М.Дж., Мерфи Э., Хемлер М.Э. (1992). «Адгезия к молекуле адгезии сосудистых клеток 1 и фибронектину. Сравнение альфа 4 бета 1 (VLA-4) и альфа 4 бета 7 на линии В-клеток человека JY». J. Biol. Chem. 267 (12): 8366–70. PMID  1373725.
• Фернандес-Руис Э., Пардо-Мануэль де Вильена Ф., Рубио М.А., Корби А.Л., Родригес де Кордова С., Санчес-Мадрид Ф. (1992). «Картирование человеческого гена VLA-alpha 4 на хромосоме 2q31-q32». Евро. J. Immunol. 22 (2): 587–90. Дои:10.1002 / eji.1830220243. PMID  1537388.
• Рубио М., Нуеда А., Вара А., Корби Лопес А.Л. (1992). «Одна мРНК кодирует формы альфа 150 и альфа 80/70 альфа-субъединицы VLA4». Евро. J. Immunol. 22 (4): 1099–102. Дои:10.1002 / eji.1830220434. PMID  1551405.
• Зонненберг А., Линдерс С.Дж., Моддерман П.В., Дамский С.Х., Аумайли М., Timpl R (1990). «Распознавание интегрином различных клеточно-связывающих фрагментов ламинина (P1, E3, E8) и доказательства того, что альфа 6 бета 1, но не альфа 6 бета 4, функционирует в качестве основного рецептора для фрагмента E8». J. Cell Biol. 110 (6): 2145–55. Дои:10.1083 / jcb.110.6.2145. ЧВК  2116116. PMID  1693624.
• Тейксидо Дж, Паркер К.М., Касснер П.Д., Хемлер М.Э. (1992). «Функциональный и структурный анализ расщепления альфа-4-субъединицы интегрина VLA-4». J. Biol. Chem. 267 (3): 1786–91. PMID  1730718.
• Rosemblatt M, Vuillet-Gaugler MH, Leroy C, Coulombel L (1991). «Коэкспрессия двух рецепторов фибронектина, VLA-4 и VLA-5, незрелыми клетками-предшественниками эритробластов человека». J. Clin. Вкладывать деньги. 87 (1): 6–11. Дои:10.1172 / JCI115002. ЧВК  294977. PMID  1824634.
• Розен Г.Д., Биркенмайер TM, Декан округ Колумбия (1991). «Характеристика промотора гена интегрина альфа 4». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (10): 4094–8. Дои:10.1073 / пнас.88.10.4094. ЧВК  51604. PMID  2034655.
• Такада Y, Elices MJ, Crouse C, Hemler ME (1989). «Первичная структура альфа-4-субъединицы VLA-4: гомология с другими интегринами и возможная функция межклеточной адгезии». EMBO J. 8 (5): 1361–8. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb03516.x. ЧВК  400962. PMID  2788572.
• Takada Y, Strominger JL, Hemler ME (1987). «Гетеродимеры семейства очень поздних антигенов являются частью суперсемейства молекул, участвующих в адгезии и эмбриогенезе». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (10): 3239–43. Bibcode:1987PNAS ... 84.3239T. Дои:10.1073 / pnas.84.10.3239. ЧВК  304844. PMID  3033641.
• Хемлер М.Э., Хуанг С., Шварц Л. (1987). «Семейство белков VLA. Характеристика пяти различных гетеродимеров клеточной поверхности, каждый из которых имеет общую бета-субъединицу с молекулярной массой 130 000». J. Biol. Chem. 262 (7): 3300–9. PMID  3546305.
• Гайлит Дж., Пиршбахер М, Кларк Р.А. (1993). «Экспрессия функционального интегрина альфа 4 бета 1 дермальными фибробластами человека». J. Invest. Дерматол. 100 (3): 323–8. Дои:10.1111 / 1523-1747.ep12470011. PMID  8440915.
• Pujades C, Teixidó J, Bazzoni G, Hemler ME (1996). «Интегрин альфа-4 цистеины 278 и 717 модулируют связывание лиганда VLA-4, а также способствуют образованию альфа 4/180». Biochem. J. 313. (Pt 3) (3): 899–908. Дои:10.1042 / bj3130899. ЧВК  1216996. PMID  8611173.
• Сабо М., Макинтайр Б.В. (1996). «Идентификация двух вариантов альфа-4-субъединицы человеческого интегрина». Мол. Иммунол. 32 (17–18): 1453–4. Дои:10.1016/0161-5890(96)00001-6. PMID  8643114.
• Маннион Б.А., Бердичевский Ф., Крафт С.К., Чен Л.Б., Хемлер М.Э. (1996). «Трансмембранные-4 белки суперсемейства CD81 (ТАРА-1), CD82, CD63 и CD53, специфически связанные с интегрином альфа 4 бета 1 (CD49d / CD29)». J. Immunol. 157 (5): 2039–47. PMID  8757325.

внешняя ссылка

• CD49d + антиген в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• ITGA4 Информация со ссылками в Шлюз миграции ячеек
• Человек ITGA4 расположение генома и ITGA4 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P13612 (Интегрин человека альфа-4) в PDBe-KB.