Интегрин альфа 6 - Integrin alpha 6

ITGA6
Идентификаторы
Псевдонимы	ITGA6, CD49f, ITGA6B, VLA-6, субъединица интегрина альфа 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 147556 MGI: 96605 ГомолоГен: 20091 Генные карты: ITGA6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q31.1 Начинать 172,427,354 бп[1] Конец 172,506,459 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 C2-C3 | 2 42,79 см Начинать 71,745,616 бп[2] Конец 71,858,416 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • связывание интегрина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ламинина • связывание нейрегулина • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • связывание инсулиноподобного фактора роста I • связывание кадгерина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • очаговая адгезия • базальная часть клетки • клеточная мембрана • гемидесмосома • базальная мембрана • поверхность клетки • комплекс интегрина • базальная плазматическая мембрана • базолатеральная плазматическая мембрана • внешняя сторона плазматической мембраны • комплекс интегрина альфа6-бета4 • филоподий Биологический процесс • клеточный ответ на внеклеточный стимул • сборка гемидесмосом • развитие почечной системы • развитие ногтей • положительная регуляция межклеточной адгезии • сборка филоподиума • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • организация внеклеточного матрикса • одонтогенез дентинсодержащего зуба • адгезия клетки к субстрату • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • клеточная адгезия • клеточная адгезия, опосредованная интегрином • дифференцировка коричневых жировых клеток • положительная регуляция апоптотического процесса • узел соединения клетки с субстратом • интегрин-опосредованный сигнальный путь • положительная регуляция фосфорилирования • адгезия клеточного матрикса • развитие пищеварительного тракта • дифференцировка эктодермальных клеток • миграция лейкоцитов • развитие кожи • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • амелогенез • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • положительное регулирование адгезии клетки к субстрату • положительное регулирование миграции клеток • межклеточная адгезия • положительная регуляция развития проекции нейронов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3655	16403
Ансамбль	ENSG00000091409	ENSMUSG00000027111
UniProt	P23229	Q61739
RefSeq (мРНК)	NM_000210 NM_001079818 NM_001316306 NM_001365529 NM_001365530	NM_001277970 NM_008397
RefSeq (белок)	NP_000201 NP_001073286 NP_001303235 NP_001352458 NP_001352459	NP_001264899 NP_032423
Расположение (UCSC)	Chr 2: 172,43 - 172,51 Мб	Chr 2: 71,75 - 71,86 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Интегрин альфа-6 это белок что у людей кодируется ITGA6 ген.

Функция

Белковый продукт ITGA6 представляет собой альфа-цепь интегрина 6. Интегрины представляют собой интегральные белки клеточной поверхности, состоящие из альфа-цепи и бета-цепи. Данная цепь может объединяться с несколькими партнерами, что приводит к получению разных интегринов. Например, альфа 6 может сочетаться с бета 4 в интегрине, называемом TSP180, или с бета 1 в интегрине VLA-6. Интегрины, как известно, участвуют в клеточной адгезии, а также в передаче сигналов, опосредованной клеточной поверхностью. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[5] Специфическая потеря этой цепи интегрина в кишечном эпителии и, следовательно, их гемидесмосом, вызывает длительный колит и инфильтрирующие аденокарциномы.^[6]

Взаимодействия

ITGA6 был показан взаимодействовать с TSPAN4^[7] и GIPC1.^[8]

Смотрите также

• Кластер дифференциации
• Интегрины

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000091409 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027111 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: интегрин ITGA6, альфа 6».
6. Де Арканджелис А, Хамаде Х, Альпы Ф, Норманд С, Брюйер Э, Лефевр О и др. (Октябрь 2017 г.). «Целостность гемидесмосом защищает толстую кишку от колита и колоректального рака». Кишечник. 66 (10): 1748–1760. Дои:10.1136 / gutjnl-2015-310847. ЧВК  5595104. PMID  27371534.
7. Тачибана И., Бодорова Дж., Бердичевский Ф., Зуттер М.М., Хемлер М.Э. (ноябрь 1997 г.). «NAG-2, новый белок суперсемейства трансмембран-4 (TM4SF), который образует комплекс с интегринами и другими белками TM4SF». Журнал биологической химии. 272 (46): 29181–9. Дои:10.1074 / jbc.272.46.29181. PMID  9360996.
8. Тани TT, Mercurio AM (сентябрь 2001 г.). «Сайты взаимодействия PDZ в альфа-субъединицах интегрина. T14853, TIP / GIPC связывается с последовательностью распознавания типа I в альфа 6A / альфа 5 и новой последовательностью в альфа 6B». Журнал биологической химии. 276 (39): 36535–42. Дои:10.1074 / jbc.M105785200. PMID  11479315.

дальнейшее чтение

• Липскомб EA, Mercurio AM (сентябрь 2005 г.). «Мобилизация и активация сигнального компетентного alpha6beta4integrin лежит в основе его вклада в прогрессирование карциномы». Отзывы о метастазах рака. 24 (3): 413–23. Дои:10.1007 / s10555-005-5133-4. PMID  16258729. S2CID  26150860.

внешняя ссылка

• CD49f + антиген в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• ITGA6 Информация со ссылками в Шлюз миграции ячеек