KCNK9 - KCNK9

KCNK9
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3П1Н, 3P1O, 3П1П, 3P1Q, 3П1Р, 3П1С, 3СМК, 3SML, 3СММ, 3СМН, 3СМО, 3SPR, 3UX0, 4FR3, 3SP5
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNK9, K2p9.1, KT3.2, TASK-3, TASK3, калиевый двухпоровый канал подсемейства K член 9
Внешние идентификаторы	OMIM: 605874 MGI: 3521816 ГомолоГен: 56758 Генные карты: KCNK9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q24.3 Начните 139,600,838 бп[1] Конец 139,704,109 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 D3 Начните 72,501,089 бп[2] Конец 72,546,340 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность потенциалзависимого калиевого канала • активность гомодимеризации белков • активность гетеродимеризации белков • активность калиевого канала • активность канала утечки ионов калия Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • синаптический пузырек • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • транспорт ионов калия • ионный транспорт • стабилизация мембранного потенциала • трансмембранный транспорт ионов калия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51305	223604
Ансамбль	ENSG00000169427	ENSMUSG00000036760
UniProt	Q9NPC2	Q3LS21
RefSeq (мРНК)	NM_001282534	NM_001033876
RefSeq (белок)	NP_001269463	NP_001029048
Расположение (UCSC)	Chr 8: 139,6 - 139,7 Мб	Chr 15: 72,5 - 72,55 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Подсемейство калиевых каналов K член 9 это белок что у людей кодируется KCNK9 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует K_2P9.1, один из членов суперсемейства белков калиевых каналов, содержащих два порообразующих P домена. Этот открытый канал сильно выражен в мозжечке. Он подавляется внеклеточным закислением и арахидоновая кислота, и сильно ингибируется форбол 12-миристат 13-ацетатом.^[7][8] Форбол 12-миристат 13-ацетат также известен как 12-О-тетрадеканоилфорбол-13-ацетат (TPA). Каналы TASK дополнительно ингибируются гормонами и передатчиками, которые передают сигнал через GqPCR. Полагают, что возникающая в результате клеточная деполяризация регулирует такие процессы, как моторный контроль и альдостерон секреция. Несмотря на ранние споры о точном механизме, лежащем в основе этого торможения, текущая точка зрения такова, что Диацил-глицерин, возникшие в результате разрушения Фосфатидилинозитол-4,5-бис-фосфат от Фосфолипаза Cβ вызывает закрытие канала. ^[9]

Выражение

Ген KCNK9 экспрессируется как ионный канал, более известный как TASK 3. Этот канал имеет разнообразный паттерн экспрессии. ЗАДАЧА 3 совместно выражается с ЗАДАЧЕЙ 1 (KCNK3 ) в гранулярных клетках мозжечка, голубом пятне, мотонейронах, ядрах моста, некоторых клетках неокортекса, хабенулах, гранулярных клетках обонятельной луковицы и клетках внешнего плексиформного слоя обонятельной луковицы.^[10] Каналы TASK-3 также экспрессируются в гиппокампе; как на пирамидных клетках, так и на интернейронах.^[11] Считается, что эти каналы могут образовывать гетеродимеры, где их выражения локализуются совместно.^[12][13]

Функция

У мышей, у которых был удален ген TASK-3, наблюдалась пониженная чувствительность к ингаляционным анестетикам, повышенная ночная активность и когнитивный дефицит, а также значительно повышенный аппетит и увеличение веса.^[14][15] Также была описана роль каналов TASK-3 в колебаниях нейронной сети: у мышей с нокаутом TASK-3 отсутствует чувствительная к атропину галотан-индуцированная тета-осцилляция (4-7 Гц) из гиппокампа и они не могут поддерживать тета-осцилляции во время быстрых глаз движение (REM) сон.^[15]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Активность никотина на дофаминергических нейронах редактировать ]]

Активность никотина на дофаминергические нейроны редактировать

1. Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «НикотинДопаминергический_WP1602».

Смотрите также

• Калиевый канал с тандемными поровыми доменами

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169427 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036760 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ким И, Банг Х, Ким Ди (май 2000 г.). «ТАСК-3, новый представитель семейства тандемных каналов K (+)». J Biol Chem. 275 (13): 9340–7. Дои:10.1074 / jbc.275.13.9340. PMID  10734076.
6. Гольдштейн С.А., Бейлисс Д.А., Ким Д., Лесаж Ф., Плант Л.Д., Раджан С. (декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. LV. Номенклатура и молекулярные отношения двух-P калиевых каналов". Pharmacol Rev. 57 (4): 527–40. Дои:10.1124 / пр.57.4.12. PMID  16382106. S2CID  7356601.
7. «Entrez Gene: калиевый канал KCNK9, подсемейство K, член 9».
8. "UniProtKB - Q9NPC2 (KCNK9_HUMAN)". Uniprot. Получено 2019-05-29.
9. Wilke, Bettina U .; Линднер, Мориц; Грайфенберг, Ли; Альбус, Александра; Кронимус, Янник; Бюнеманн, Мориц; Leitner, Michael G .; Оливер, Доминик (25 ноября 2014 г.). «Диацилглицерин опосредует регуляцию калиевых каналов TASK с помощью рецепторов, связанных с Gq». Nature Communications. 5 (1): 5540. Дои:10.1038 / ncomms6540. ISSN  2041-1723. PMID  25420509.
10. Бейлисс Д.А., Сироис Дж. Э., Талли Е. М. (июнь 2003 г.). «Семейство TASK: двухпористые доменные фоновые K + каналы». Молекулярные вмешательства. 3 (4): 205–19. Дои:10.1124 / mi 3.4.205. PMID  14993448.
11. Торборг С.Л., Берг А.П., Джеффрис Б.В., Бейлисс Д.А., МакБейн С.Дж. (12 июля 2006 г.). «TASK-подобные проводимости присутствуют в субпопуляциях интернейронов слоя CA1 гиппокампа». Журнал неврологии. 26 (28): 7362–7. Дои:10.1523 / jneurosci.1257-06.2006. ЧВК  6674194. PMID  16837582.
12. Берг А.П., Тэлли Э.М., Мангер JP, Бейлисс Д.А. (28 июля 2004 г.). «Мотонейроны экспрессируют гетеромерные TWIK-связанные кислоточувствительные K + (TASK) каналы, содержащие субъединицы TASK-1 (KCNK3) и TASK-3 (KCNK9)». Журнал неврологии. 24 (30): 6693–702. Дои:10.1523 / jneurosci.1408-04.2004. ЧВК  6729708. PMID  15282272.
13. Канг Д., Хан Дж., Талли Э.М., Бейлисс Д.А., Ким Д. (1 января 2004 г.). «Функциональная экспрессия гетеромеров TASK-1 / TASK-3 в гранулярных клетках мозжечка». Журнал физиологии. 554 (Чт 1): 64–77. Дои:10.1113 / jphysiol.2003.054387. ЧВК  1664745. PMID  14678492.
14. Linden AM, Aller MI, Leppä E, Rosenberg PH, Wisden W, Korpi ER (октябрь 2008 г.). «Мыши с нокаутом K + канала TASK-1 демонстрируют повышенную чувствительность к атаксическим и снотворным эффектам лигандов рецептора ГАМК (А)». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 327 (1): 277–86. Дои:10.1124 / jpet.108.142083. PMID  18660435. S2CID  31086459.
15. Панг Д.С., Робледо С.Дж., Карр Д.Р., Гент Т.К., Высоцкий А.Л., Кейли А., Захария А.Ю., Висден В., Брикли С.Г., Фрэнкс Н.П. (13 октября 2009 г.). «Неожиданная роль калиевых каналов TASK-3 в колебаниях сети с последствиями для механизмов сна и анестезирующего действия» (PDF). Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (41): 17546–51. Дои:10.1073 / pnas.0907228106. ЧВК  2751655. PMID  19805135.

дальнейшее чтение

• Гольдштейн С.А., Бокенхауэр Д., О'Келли I, Зильберберг Н. (2001). «Каналы утечки калия и семейство двух-P-доменных субъединиц KCNK». Nat. Преподобный Neurosci. 2 (3): 175–84. Дои:10.1038/35058574. PMID  11256078. S2CID  9682396.
• Раджан С., Вишмайер Э., Синь Лю Г., Прейзиг-Мюллер Р., Даут Дж., Каршин А., Дерст С. (2000). «TASK-3, новый чувствительный к кислоте K + канал тандемного порового домена. Внеклеточный гистидинг в качестве датчика pH». J. Biol. Chem. 275 (22): 16650–7. Дои:10.1074 / jbc.M000030200. PMID  10747866.
• Чепмен К. Г., Медоуз Х. Дж., Годден Р. Дж., Кэмпбелл Д. А., Дакворт М., Келселл Р. Э., Мердок П. Р., Рэндалл А. Д., Ренни Г. И., Глогер И. С. (2001). «Клонирование, локализация и функциональная экспрессия нового человеческого, специфичного для мозжечка, двухпорового калиевого канала». Brain Res. Мол. Мозг Res. 82 (1–2): 74–83. Дои:10.1016 / S0169-328X (00) 00183-2. PMID  11042359.
• Вега-Саенс де Миера Э, Лау Д.Х., Жадина М., Паунтни Д., Кутзи В.А., Руди Б. (2001). «KT3.2 и KT3.3, два новых двухпоровых K (+) канала человека, тесно связанных с TASK-1». J. Neurophysiol. 86 (1): 130–42. Дои:10.1152 / ян.2001.86.1.130. PMID  11431495.
• Талли Э.М., Бейлисс Д.А. (2002). «Модуляция калиевых каналов TASK-1 (Kcnk3) и TASK-3 (Kcnk9): летучие анестетики и нейротрансмиттеры имеют общий молекулярный сайт действия». J. Biol. Chem. 277 (20): 17733–42. Дои:10.1074 / jbc.M200502200. PMID  11886861.
• Раджан С., Прейзиг-Мюллер Р., Вишмайер Э., Неринг Р., Хэнли П.Дж., Ренигунта В., Мюссет Б., Шлихторл Г., Дерст С., Каршин А., Даут Дж. (2003). «Взаимодействие с белками 14-3-3 способствует функциональной экспрессии калиевых каналов TASK-1 и TASK-3». J. Physiol. 545 (Пт 1): 13–26. Дои:10.1113 / jphysiol.2002.027052. ЧВК  2290646. PMID  12433946.
• Mu D, Chen L, Zhang X, See LH, Koch CM, Yen C, Tong JJ, Spiegel L, Nguyen KC, Servoss A, Peng Y, Pei L, Marks JR, Lowe S, Hoey T, Jan LY, McCombie WR , Виглер М.Х., Пауэрс С. (2003). «Геномная амплификация и онкогенные свойства гена калиевого канала KCNK9». Раковая клетка. 3 (3): 297–302. Дои:10.1016 / S1535-6108 (03) 00054-0. PMID  12676587.
• Пей Л., Мудрый О, Славин А., Мю Д., Пауэрс С., Ян Л. Я., Хои Т. (2003). «Онкогенный потенциал TASK3 (Kcnk9) зависит от функции K + канала». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (13): 7803–7. Дои:10.1073 / pnas.1232448100. ЧВК  164668. PMID  12782791.
• Rusznák Z, Pocsai K, Kovács I, Pór A, Pál B, Bíró T, Szücs G (2004). «Дифференциальное распределение иммунореактивностей TASK-1, TASK-2 и TASK-3 в мозжечке крысы и человека». Cell. Мол. Life Sci. 61 (12): 1532–42. Дои:10.1007 / s00018-004-4082-3. PMID  15197476. S2CID  11439105.
• Кларк CE, Вил Э.Л., Грин П.Дж., Мидоуз Х.Дж., Мати А (2005). «Селективный блок калиевого канала 2-P домена человека, TASK-3, и естественного калиевого тока утечки, IKSO, цинком». J. Physiol. 560 (Пт 1): 51–62. Дои:10.1113 / jphysiol.2004.070292. ЧВК  1665210. PMID  15284350.
• Ким СиДжей, Чо Й.Г., Чжон С.В., Ким Ю.С., Ким СИ, Нам СВ, Ли С.Х., Ю Н.Дж., Ли Джи, Пак В.С. (2005). «Измененная экспрессия KCNK9 при колоректальном раке». APMIS. 112 (9): 588–94. Дои:10.1111 / j.1600-0463.2004.apm1120905.x. PMID  15601307. S2CID  41751315.
• Почаи К., Коштка Л., Баконди Г., Гёнци М., Фодор Дж., Диенес Б., Сентези П., Ковач И., Фенигер-Бариш Р., Копф Е., Жархары Д., Сзуч Г., Чернох Л., Рушнак З. (2006). «Клетки меланомы проявляют сильную внутриклеточную TASK-3-специфическую иммунопозитивность как в срезах ткани, так и в культуре клеток». Cell. Мол. Life Sci. 63 (19–20): 2364–76. Дои:10.1007 / s00018-006-6166-8. PMID  17013562. S2CID  30705845.
• Zuzarte M, Rinné S, Schlichthörl G, Schubert A, Daut J, Preisig-Müller R (2007). «Мотив двухкислой последовательности усиливает поверхностную экспрессию калиевого канала TASK-3». Движение. 8 (8): 1093–100. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2007.00593.x. PMID  17547699. S2CID  9662403.

внешняя ссылка

• KCNK9 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9NPC2 (Калиевый канал подсемейства K член 9) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.