KCNA4 - KCNA4

KCNA4
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNA4, HBK4, HK1, HPCN2, HUKII, KCNA4L, KCNA8, KV1.4, PCN2, калиевый потенциалзависимый канал, член подсемейства A 4, MCIDDS
Внешние идентификаторы	OMIM: 176266 MGI: 96661 ГомолоГен: 20514 Генные карты: KCNA4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п14.1 Начните 30,009,730 бп[1] Конец 30,017,030 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 E3 | 2 56,12 см Начните 107,290,639 бп[2] Конец 107,298,502 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность калиевого канала • связывание ионов калия • активность потенциалзависимого ионного канала • активность ионного канала • GO: 0001948 связывание с белками • активность потенциалзависимого калиевого канала • задержка активности калиевого канала выпрямителя Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • проекция клетки • мембрана • комплекс потенциалзависимых калиевых каналов • клеточная мембрана • аксон • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • дендритный позвоночник Биологический процесс • регуляция трансмембранного транспорта ионов • ионный транспорт • транспорт ионов калия • трансмембранный транспорт • трансмембранный транспорт ионов калия • гомоолигомеризация белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3739	16492
Ансамбль	ENSG00000182255	ENSMUSG00000042604
UniProt	P22459	Q61423
RefSeq (мРНК)	NM_002233	NM_021275
RefSeq (белок)	NP_002224	NP_067250
Расположение (UCSC)	Chr 11: 30.01 - 30.02 Мб	Chr 2: 107.29 - 107.3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Калиевый канал Kv1.4 тандемный домен инактивации
структура раствора тандемного домена инактивации (остатки 1-75) калиевого канала rck4 (kv1.4)
Идентификаторы
Символ	K_channel_TID
Pfam	PF07941
ИнтерПро	IPR012897
SCOP2	1kn7 / Объем / СУПФАМ
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Калий потенциалзависимый канал подсемейства A член 4 также известен как K_v1.4 это белок что у людей кодируется KCNA4 ген.^[5][6][7] Это способствует кардиальный транзиторный выходящий калиевый ток (Я_to1), основной ток, вносящий вклад в переполяризация фаза 1 сердечного потенциала действия.^[8]

Описание

Калиевые каналы представляют собой наиболее сложный класс потенциалзависимых ионных каналов как с функциональной, так и с структурной точки зрения. Их разнообразные функции включают регулирование высвобождения нейромедиаторов, частоты сердечных сокращений, секреции инсулина, возбудимости нейронов, транспорта электролитов эпителия, сокращения гладких мышц и объема клеток. Четыре связанных с последовательностью гена калиевых каналов - shaker, shaw, shab и shal - были идентифицированы у дрозофилы, и было показано, что каждый имеет гомолог (ы) человека. Этот ген кодирует член подсемейства, зависимого от напряжения, связанного с шейкерной системой, калиевого канала. Этот член содержит шесть трансмембранных доменов с повтором шейкерного типа в четвертом сегменте. Он принадлежит к классу калиевого тока А-типа, члены которого могут играть важную роль в регуляции быстрой реполяризующей фазы потенциалов действия в сердце и, таким образом, могут влиять на продолжительность сердечного потенциала действия. Кодирующая область этого гена не имеет интронов, и этот ген сгруппирован с генами KCNA3 и KCNA10 на хромосоме 1 у человека.^[7]

KCNA4 (Kv1.4) содержит тандемный домен инактивации в N конечная. Он состоит из двух поддоменов. Домен инактивации 1 (ID1, остатки 1-38) состоит из гибкого N-конца, закрепленного на 5-витке. спираль, и считается, что он работает, перекрывая путь иона, как в случае с классическим шаровым доменом. Домен инактивации 2 (ID2, остатки 40-50) представляет собой спираль на 2,5 витка с высокой долей гидрофобных остатков, которые, вероятно, служат для присоединения ID1 к цитоплазматический лицо канала. Таким образом, он может способствовать быстрому доступу ID1 к рецепторному участку в открытом канале. ID1 и ID2 функционируют вместе, чтобы вызвать быструю инактивацию канала Kv1.4, что важно для роли канала в краткосрочной пластичности.^[9]

Взаимодействия

KCNA4 показал взаимодействовать с участием DLG4,^{[10][11][12][13]} KCNA2^[14] и DLG1.^[10][12][15]

Смотрите также

• Калиевый канал с регулируемым напряжением
• Калиевый канал с напряжением-регулировкой Kv1.4 IRES

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182255 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042604 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Philipson LH, Schaefer K, LaMendola J, Bell GI, Steiner DF (декабрь 1990 г.). «Последовательность кДНК калиевого канала скелетных мышц плода человека, родственная RCK4». Исследования нуклеиновых кислот. 18 (23): 7160. Дои:10.1093 / nar / 18.23.7160. ЧВК  332806. PMID  2263489.
6. Гутман Г.А., Чанди К.Г., Гриссмер С., Лаздунски М., Маккиннон Д., Пардо Л.А. и др. (Декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. LIII. Номенклатура и молекулярные отношения потенциалзависимых калиевых каналов". Фармакологические обзоры. 57 (4): 473–508. Дои:10.1124 / пр.57.4.10. PMID  16382104. S2CID  219195192.
7. «Ген Entrez: потенциал-зависимый канал KCNA4, связанное с шейкером подсемейство, член 4».
8. Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (май 2001 г.). «Молекулярная физиология сердечного транзиторного выходящего калиевого тока (I (to)) в нормальном и больном миокарде». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 33 (5): 851–72. Дои:10.1006 / jmcc.2001.1376. PMID  11343410. S2CID  829154.
9. Виссманн Р., Бильдл В., Оливер Д., Бейерманн М., Калбицер Х.Р., Бентроп Д., Факлер Б. (май 2003 г.). «Структура раствора и функция« тандемного домена инактивации »нейронального калиевого канала A-типа Kv1.4». Журнал биологической химии. 278 (18): 16142–50. Дои:10.1074 / jbc.M210191200. PMID  12590144.
10. Инанобе А., Фудзита А., Ито М., Томоике Х., Инагеда К., Курачи Ю. (июнь 2002 г.). «Внутренний выпрямительный K + канал Kir2.3 локализован на постсинаптической мембране возбуждающих синапсов». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология. 282 (6): C1396-403. Дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID  11997254.
11. Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95 / SAP90». Нейрон. 20 (4): 693–707. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID  9581762. S2CID  16068361.
12. Ким Э, Шэн М. (1996). «Дифференциальная кластерная активность K + каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембран-ассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. Дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID  8938729. S2CID  23755452.
13. Элдстром Дж., Дёрксен К.В., Стил Д.Ф., Федида Д. (ноябрь 2002 г.). «N-концевой PDZ-связывающий домен в калиевых каналах Kv1». Письма FEBS. 531 (3): 529–37. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03572-X. PMID  12435606. S2CID  40689829.
14. Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж. О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека». Журнал нейрохимии. 73 (2): 849–58. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID  10428084. S2CID  20632070.
15. Элдстром Дж, Чой В.С., Стил Д.Ф., Федида Д. (июль 2003 г.). «SAP97 увеличивает токи Kv1,5 посредством непрямого N-терминального механизма». Письма FEBS. 547 (1–3): 205–11. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00668-9. PMID  12860415. S2CID  34857270.

дальнейшее чтение

• Скотт Х. С., Литдженс Т., Хопвуд Дж. Дж., Моррис С. П. (ноябрь 1992 г.). «Обнаружение ПЦР двух RFLP в экзоне I гена альфа-L-идуронидазы (IDUA)». Генетика человека. 90 (3): 327. Дои:10.1007 / bf00220095. PMID  1362562. S2CID  22700269.
• Гесслер М., Группа А, Гжещик К.Х., Понгс О. (ноябрь 1992 г.). «Ген калиевого канала HK1 отображается на хромосоме 11p14.1 человека, близкой к гену FSHB». Генетика человека. 90 (3): 319–21. Дои:10.1007 / bf00220091. PMID  1487251. S2CID  10237322.
• Philipson LH, Hice RE, Schaefer K, LaMendola J, Bell GI, Nelson DJ, Steiner DF (январь 1991 г.). «Последовательность и функциональная экспрессия в ооцитах Xenopus инсулиномы человека и островковых калиевых каналах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (1): 53–7. Bibcode:1991ПНАС ... 88 ... 53П. Дои:10.1073 / pnas.88.1.53. ЧВК  50746. PMID  1986382.
• Тамкун М.М., Кнот К.М., Уолбридж Д.А., Кремер Х., Роден Д.М., Гловер Д.М. (март 1991 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика двух потенциал-зависимых кДНК K + канала из человеческого желудочка». Журнал FASEB. 5 (3): 331–7. Дои:10.1096 / fasebj.5.3.2001794. PMID  2001794. S2CID  23737559.
• Ким Е., Нитхаммер М., Ротшильд А., Ян Ю.Н., Шенг М. (ноябрь 1995 г.). «Кластеризация K + каналов шейкерного типа путем взаимодействия с семейством мембраносвязанных гуанилаткиназ». Природа. 378 (6552): 85–8. Bibcode:1995 Натур.378 ... 85K. Дои:10.1038 / 378085a0. PMID  7477295. S2CID  4362906.
• Клоке Р., Робердс С.Л., Тамкун М.М., Гронемайер М., Огюстен А., Альбрехт Б. и др. (Декабрь 1993 г.). «Хромосомное картирование у мыши восьми генов K (+) - канала, представляющих четыре Shaker-подобных подсемейства Shaker, Shab, Shaw и Shal». Геномика. 18 (3): 568–74. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80358-1. PMID  7905852.
• Филипсон Л. Х., Эдди Р. Л., Показывает ТБ, Белл Г. И. (февраль 1993 г.). «Отнесение гена калиевого канала человека KCNA4 (Kv1.4, PCN2) к хромосоме 11q13.4 -> q14.1». Геномика. 15 (2): 463–4. Дои:10.1006 / geno.1993.1094. PMID  8449523.
• Niethammer M, Kim E, Sheng M (апрель 1996). «Взаимодействие между С-концом субъединиц рецептора NMDA и множеством членов семейства PSD-95 мембраносвязанных гуанилаткиназ». Журнал неврологии. 16 (7): 2157–63. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-07-02157.1996. ЧВК  6578538. PMID  8601796.
• Ким Э, Шэн М. (1997). «Дифференциальная кластерная активность K + каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембран-ассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. Дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID  8938729. S2CID  23755452.
• Ким Э., Нейсбитт С., Сюэ Ю.П., Рао А., Ротшильд А., Крейг А.М., Шэн М. (февраль 1997 г.). «GKAP, новый синаптический белок, который взаимодействует с гуанилаткиназоподобным доменом семейства PSD-95 / SAP90 канальных кластерных молекул». Журнал клеточной биологии. 136 (3): 669–78. Дои:10.1083 / jcb.136.3.669. ЧВК  2134290. PMID  9024696.
• Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95 / SAP90». Нейрон. 20 (4): 693–707. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID  9581762. S2CID  16068361.
• Brenman JE, Topinka JR, Cooper EC, McGee AW, Rosen J, Milroy T. и др. (Ноябрь 1998 г.). «Локализация постсинаптической плотности-93 в дендритных микротрубочках и взаимодействие с белком 1A, связанным с микротрубочками». Журнал неврологии. 18 (21): 8805–13. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.18-21-08805.1998. ЧВК  6793550. PMID  9786987.
• Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж. О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека». Журнал нейрохимии. 73 (2): 849–58. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID  10428084. S2CID  20632070.
• D'Adamo MC, Imbrici P, Sponcichetti F, Pessia M (август 1999). «Мутации в гене KCNA1, связанные с синдромом эпизодической атаксии типа 1, нарушают функцию гетеромерного потенциалзависимого канала K (+)». Журнал FASEB. 13 (11): 1335–45. Дои:10.1096 / fasebj.13.11.1335. PMID  10428758. S2CID  12876970.
• Hogan A, Shepherd L, Chabot J, Quenneville S, Prescott SM, Topham MK, Gee SH (июль 2001 г.). «Взаимодействие гамма-1-синтрофина с диацилглицерин киназой-дзета. Регуляция ядерной локализации посредством взаимодействий PDZ». Журнал биологической химии. 276 (28): 26526–33. Дои:10.1074 / jbc.M104156200. PMID  11352924.
• Чукович Д., Лу Г. В., Вибл Б., Стил Д. Ф., Федида Д. (июнь 2001 г.). «Дискретный аминоконцевой домен калиевых каналов Kv1.5 и Kv1.4 взаимодействует со спектриновыми повторами альфа-актинина-2». Письма FEBS. 498 (1): 87–92. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02505-4. PMID  11389904. S2CID  20622483.
• Имамура Ф., Маэда С., Дои Т., Фудзиёси Й. (февраль 2002 г.). «Связывание лиганда второго домена PDZ регулирует кластеризацию PSD-95 с калиевым каналом Kv1.4». Журнал биологической химии. 277 (5): 3640–6. Дои:10.1074 / jbc.M106940200. PMID  11723117.
• Piserchio A, Pellegrini M, Mehta S, Blackman SM, Garcia EP, Marshall J, Mierke DF (март 2002 г.). «Домен PDZ1 SAP90. Характеристика структуры и связывания». Журнал биологической химии. 277 (9): 6967–73. Дои:10.1074 / jbc.M109453200. PMID  11744724.

внешние ссылки

• Kv1.4 + Калий + Канал в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• KCNA4 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P15385 (Крыса, калиевый потенциалзависимый канал подсемейства А член 4) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR012897