KCNK2 - KCNK2

KCNK2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4TWK
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNK2, K2p2.1, TPKC1, TREK, TREK-1, TREK1, hTREK-1c, hTREK-1e, калиевый двухпоровый доменный канал подсемейства K член 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603219 MGI: 109366 ГомолоГен: 7794 Генные карты: KCNK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q41 Начните 215,005,775 бп[1] Конец 215,237,093 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 H6 Начните 189,207,930 бп[2] Конец 189,402,273 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность калиевого канала • активность потенциалзависимого калиевого канала • активность ингибитора калиевых каналов • активность выходного выпрямительного калиевого канала • активность канала утечки ионов калия Сотовый компонент • конец аксона • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • комплекс потенциалзависимых калиевых каналов • клеточная мембрана • проекция астроцитов • чашечка Хельда • поверхность клетки • аксон • тело нейрональной клетки • апикальная плазматическая мембрана • эндоплазматический ретикулум • проекция нейрона • ядро клетки • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • развитие улитки • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • положительное регулирование гибели клеток • положительная регуляция клеточного ответа на гипоксию • регулирование мембранного потенциала • развитие сердечного желудочка • ответ на механический раздражитель • объем памяти • ионный транспорт • транспорт ионов калия • ответ на повреждение аксона • трансмембранный транспорт ионов калия • отрицательная регуляция пролиферации клеток сердечной мышцы • клеточный ответ на гипоксию • отрицательная регуляция процесса биосинтеза ДНК • стабилизация мембранного потенциала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3776	16526
Ансамбль	ENSG00000082482	ENSMUSG00000037624
UniProt	O95069	P97438
RefSeq (мРНК)	NM_001017424 NM_001017425 NM_014217	NM_001159850 NM_001281847 NM_001281848 NM_010607 NM_001357119
RefSeq (белок)	NP_001017424 NP_001017425 NP_055032	NP_001153322 NP_001268776 NP_001268777 NP_034737 NP_001344048
Расположение (UCSC)	Chr 1: 215.01 - 215.24 Мб	Chr 1: 189.21 - 189,4 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Подсемейство калиевых каналов K член 2 это белок что у людей кодируется KCNK2 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует K_2P2.1, а липидно-управляемый ионный канал принадлежащий к семейству белков двухпористого фонового калиевого канала. Этот тип калиевого канала образован двумя гомодимерами, которые создают канал, который высвобождает калий из клетки для управления мембранным потенциалом покоя. Канал открывается анионным липидом, некоторыми анестетиками, растяжением мембраны, внутриклеточным ацидозом и теплом. Для этого гена были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Функция в нейронах

Другое название этого канала - ТРЕК-1. ТРЭК-1 входит в подсемейство механокрытых калиевые каналы которые присутствуют в нейронах млекопитающих. Они могут быть закрыты как химическими, так и физическими способами и могут открываться как физическими, так и химическими стимулами. Каналы TREK-1 обнаруживаются во множестве тканей, но особенно много в мозге и сердце и обнаруживаются в различных типах нейронов.^[8] В C-терминал каналов ТРЕК-1 играет роль в механочувствительности каналов.^[9]

В нейронах Центральная нервная система, Каналы TREK-1 играют важную роль в физиологических, патофизиологических и фармакологических процессах, в том числе играют роль в электрогенез, ишемия, и анестезия. ТРЕК-1 играет важную роль в нейропротекции против эпилепсия и мозг и спинной мозг ишемия и рассматривается как потенциальная цель для новых разработок терапевтических средств для неврологии и анестезиологии.^[10]

При отсутствии исправного цитоскелет, Каналы ТРЭК-1 могут открываться с помощью механического затвора.^[9] В клеточная мембрана функционирует независимо от цитоскелета, а толщина и кривизна мембраны способны модулировать активность каналов TREK-1.^[11] Считается, что изменение толщины ощущается по амфипатической спирали, идущей от внутренней створки мембраны.^[12]

Введение некоторых соединений в мембрану, включая ингаляционные анестетики и пропофол, активирует TREK-1 через фермент фосфолипазу D2 (PLD2). До добавления анестетика PLD2 связывается с липидными рафтами GM-1. После анестезии фермент или комплекс фермента и канала направляются к доменам PIP2, где фермент производит фосфатидную кислоту, открывающую канал.^[13]

Смотрите также

• Калиевый канал с тандемными поровыми доменами

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000082482 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037624 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лесаж Ф, Лаздунски М. (октябрь 1998 г.). «Картирование генов калиевых каналов человека TREK-1 (KCNK2) и TASK (KCNK3) на хромосомы 1q41 и 2p23». Геномика. 51 (3): 478–9. Дои:10.1006 / geno.1998.5397. PMID  9721223.
6. Гольдштейн С.А., Бейлисс Д.А., Ким Д., Лесаж Ф., Плант Л.Д., Раджан С. (декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. LV. Номенклатура и молекулярные отношения двух-P калиевых каналов". Pharmacol Rev. 57 (4): 527–40. Дои:10.1124 / пр.57.4.12. PMID  16382106. S2CID  7356601.
7. «Ген Entrez: калиевый канал KCNK2, подсемейство K, член 2».
8. Финк, М .; Duprat, F .; Lesage, F .; Reyes, R .; Romey, G .; Heurteaux, C .; Лаздунский, М. (1996). «Клонирование, функциональная экспрессия и локализация в мозге нового нетрадиционного выпрямительного канала K +». Журнал EMBO. 15 (24): 6854–6862. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb01077.x. ЧВК  452511. PMID  9003761.
9. Patel, A.J .; Оноре, E .; Maingret, F .; Lesage, F .; Финк, М .; Duprat, F .; Лаздунский, М. (1998). «Двухпоровый домен млекопитающих, механозависимый S-подобный K + канал». Журнал EMBO. 17 (15): 4283–4290. Дои:10.1093 / emboj / 17.15.4283. ЧВК  1170762. PMID  9687497.
10. Giorda, R .; Weisberg, E.P .; Ip, T. K .; Трукко, М. (1992). «Геномная структура и штамм-специфическая экспрессия рецептора естественных клеток-киллеров NKR-P1». Журнал иммунологии. 149 (6): 1957–1963. PMID  1517565.
11. Патель, AJ; Лаздунский, М; Оноре, Э (2001). «Липидные и механозависимые K (+) каналы 2P домена». Curr Opin Cell Biol. 13 (4): 422–428. Дои:10.1016 / s0955-0674 (00) 00231-3. PMID  11454447.
12. Найебосадри, Арман; Петерсен, Э. Николас; Кабанос, Черроне; Хансен, Скотт Б. (2018). «Датчик толщины мембраны в каналах ТРЕК-1 преобразовывает механическую силу». Сеть исследований в области социальных наук. SSRN  3155650.
13. Павел, Массачусетс; Петерсен, EN; Wang, H; Лернер, РА; Хансен, С.Б. (28 мая 2020 г.). «Исследования механизма общей анестезии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 117 (24): 13757–13766. Дои:10.1073 / pnas.2004259117. PMID  32467161.

дальнейшее чтение

• Гольдштейн С.А., Бокенхауэр Д., О'Келли I, Зильберберг Н. (2001). «Каналы утечки калия и семейство двух-P-доменных субъединиц KCNK». Nat. Преподобный Neurosci. 2 (3): 175–84. Дои:10.1038/35058574. PMID  11256078. S2CID  9682396.
• Оноре Э (2007). «Нейронные фоновые каналы K2P: фокус на TREK1». Nat. Преподобный Neurosci. 8 (4): 251–61. Дои:10.1038 / nrn2117. PMID  17375039. S2CID  21421846.
• Финк М., Дюпрат Ф., Лесаж Ф. и др. (1997). «Клонирование, функциональная экспрессия и локализация в мозге нового нетрадиционного выпрямительного канала K +». EMBO J. 15 (24): 6854–62. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb01077.x. ЧВК  452511. PMID  9003761.
• Патель А.Дж., Оноре Э., Лесаж Ф. и др. (1999). «Ингаляционные анестетики активируют двухпоровые фоновые K + каналы». Nat. Неврологи. 2 (5): 422–6. Дои:10.1038/8084. PMID  10321245. S2CID  23092576.
• Meadows HJ, Benham CD, Cairns W. и др. (2000). «Клонирование, локализация и функциональная экспрессия человеческого ортолога калиевого канала TREK-1». Арка Пфлюгерса. 439 (6): 714–22. Дои:10.1007 / s004240050997. PMID  10784345.
• Мэйли Дж, Адельман Дж. П. (2001). «Просвети меня, Скотти! Каналы ТРЕК качаются в обе стороны». Nat. Неврологи. 4 (5): 457–8. Дои:10.1038/87402. PMID  11319549. S2CID  5982574.
• Бокенхауэр Д., Зильберберг Н., Гольдштейн С.А. (2001). «KCNK2: обратимое преобразование утечки калия в гиппокампе в потенциал-зависимый канал». Nat. Неврологи. 4 (5): 486–91. Дои:10.1038/87434. PMID  11319556. S2CID  7658182.
• Enyeart JJ, Xu L, Danthi S, Enyeart JA (2003). «Регулируемый АКТГ и АТФ фоновый K + канал в адренокортикальных клетках - это TREK-1». J. Biol. Chem. 277 (51): 49186–99. Дои:10.1074 / jbc.M207233200. PMID  12368289.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Имабаяси Х., Мори Т., Годзё С. и др. (2003). «Повторная дифференцировка дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID  12878157.
• Миллер П., Сверстники С., Кемп П.Дж. (2004). «Полимодальная регуляция hTREK1 с помощью pH, арахидоновой кислоты и гипоксии: физиологическое воздействие при ацидозе и алкалозе». Am. J. Physiol., Cell Physiol.. 286 (2): C272–82. Дои:10.1152 / ajpcell.00334.2003. PMID  14522822.
• Фу Г.К., Ван Дж. Т., Ян Дж. И др. (2005). «Циклическая быстрая амплификация концов кДНК для клонирования частичных генов с высокой пропускной способностью». Геномика. 84 (1): 205–10. Дои:10.1016 / j.ygeno.2004.01.011. PMID  15203218.
• Кеннард Л. Е., Чамбли Дж. Р., Ранатунга К. М. и др. (2005). «Ингибирование двухпорового калиевого канала человека, TREK-1, флуоксетином и его метаболитом норфлуоксетином». Br. J. Pharmacol. 144 (6): 821–9. Дои:10.1038 / sj.bjp.0706068. ЧВК  1576064. PMID  15685212.
• Миллер П., Кемп П.Дж., коллеги С. (2005). «Структурные требования для определения O2 каналом тандемного домена P человека, hTREK1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 331 (4): 1253–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.04.042. PMID  15883010.
• Мурбартиан Дж., Лей К., Сандо Дж. Дж., Бейлисс Д.А. (2005). «Последовательное фосфорилирование опосредует индуцированное рецептором и киназой ингибирование фоновых калиевых каналов TREK-1». J. Biol. Chem. 280 (34): 30175–84. Дои:10.1074 / jbc.M503862200. PMID  16006563.
• Хьюз С., Магней Дж., Форман М. и др. (2006). «Экспрессия механочувствительного 2PK + канала TREK-1 в человеческих остеобластах». J. Cell. Физиол. 206 (3): 738–48. Дои:10.1002 / jcp.20536. PMID  16250016. S2CID  1788790.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.

внешние ссылки

• KCNK2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.