Киназа рецептора тропомиозина B - Tropomyosin receptor kinase B

НТРК2
Белок NTRK2 PDB 1hcf.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыНТРК2, GP145-TrkB, TRKB, trk-B, нейротрофический рецептор тирозинкиназы 2, OBHD, EIEE58
Внешние идентификаторыOMIM: 600456 MGI: 97384 ГомолоГен: 4504 Генные карты: НТРК2
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение для NTRK2
Геномное расположение для NTRK2
Группа9q21.33Начинать84,668,551 бп[1]
Конец85,027,070 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NTRK2 221795 в fs.png

PBB GE NTRK2 214680 в формате fs.png

PBB GE NTRK2 207152 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001025074
NM_008745
NM_001282961

RefSeq (белок)

NP_001020245
NP_001269890
NP_032771

Расположение (UCSC)Chr 9: 84.67 - 85.03 МбChr 13: 58.81 - 59.13 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Киназа рецептора тропомиозина B (TrkB),[5] также известный как киназа тирозиновых рецепторов B,[5] или же Рецептор факторов роста BDNF / NT-3 или же нейротрофическая тирозинкиназа, рецептор, тип 2 это белок что у людей кодируется НТРК2 ген.[5][6] TrkB является рецептором для нейротрофический фактор головного мозга (БДНФ).

Функция

Киназа рецептора тропомиозина B имеет высокое сродство каталитический рецептор для нескольких "нейротрофины ", которые представляют собой небольшие белковые факторы роста, которые вызывают выживание и дифференциацию отдельных популяций клеток. Нейротрофины, активирующие TrkB, включают: BDNF (Нейротрофический фактор мозга), нейротрофин-4 (NT-4) и нейротрофин-3 (NT-3).[5] Таким образом, TrkB опосредует множественные эффекты этих нейротрофических факторов, включая дифференцировку и выживание нейронов. Исследования показали, что активация рецептора TrkB может привести к снижению регуляции KCC2 транспортер хлорида в клетках ЦНС.[7]

Рецептор TrkB является частью большого семейства рецепторных тирозинкиназ. Тирозин киназа «представляет собой фермент, который способен добавлять фосфатную группу к определенным тирозинам на целевых белках или« субстратах ». Рецепторная тирозинкиназа представляет собой« тирозинкиназу », которая расположена на клеточной мембране и активируется связыванием лиганда к внеклеточному домену рецептора. Другие примеры рецепторов тирозинкиназы включают рецептор инсулина рецептор IGF1, Белок MuSK рецептор, рецептор фактора роста эндотелия сосудов (или VEGF) и т. д.

Сигнализация TrkB

В настоящее время существует три изоформы TrkB в ЦНС млекопитающих. Полноразмерная изоформа (TK +) является типичным рецептором тирозинкиназы и передает сигнал BDNF через Ras-ERK, PI3K и PLCγ. Напротив, две усеченные изоформы (TK-: T1 и T2) обладают тем же внеклеточным доменом, трансмембранным доменом и первыми 12 внутриклеточными аминокислотными последовательностями, что и TK +. Однако С-концевые последовательности являются изоформ-специфичными (11 и 9 аминокислот соответственно). T1 имеет оригинальный сигнальный каскад, который участвует в регуляции морфологии клеток и притока кальция.

Члены семьи

TrkB является частью подсемейства протеинкиназ, которое также включает TrkA и TrkC. Также существуют другие нейротрофические факторы, структурно связанные с BDNF: NGF (для Фактор роста нервов ), NT-3 (для нейротрофина-3) и NT-4 (для нейротрофина-4). Хотя TrkB опосредует эффекты BDNF, NT-4 и NT-3, TrkA связывается и, таким образом, активируется только NGF. Кроме того, TrkC связывается и активируется NT-3.

TrkB связывает BDNF и NT-4 сильнее, чем NT-3. TrkC связывает NT-3 сильнее, чем TrkB.


СПГФР

Помимо TrkB существует еще один рецептор BDNF, называемый «LNGFR» (для «рецептор фактора роста нервов с низким сродством "). В отличие от TrkB, LNGFR играет несколько менее очевидную роль в биологии BDNF. Некоторые исследователи показали, что LNGFR связывается и служит" приемником "для нейротрофинов. Клетки, которые экспрессируют как LNGFR, так и рецепторы Trk, могут поэтому иметь большее значение. активности - поскольку они имеют более высокую «микроконцентрацию» нейротрофина. Однако было также показано, что LNGFR может сигнализировать клетке о смерти через апоптоз - поэтому клетки, экспрессирующие LNGFR в отсутствие рецепторов Trk, могут скорее умирать, чем живут в присутствии нейротрофина.

Роль в раке

Первоначально идентифицированный как онкогенное слияние в 1982 году,[8] только недавно возобновился интерес к семейству Trk, поскольку оно связано с его ролью в раковых заболеваниях человека из-за идентификации слияния генов NTRK1 (TrkA), NTRK2 (TrkB) и NTRK3 (TrkC) и других онкогенных изменений в ряде типы опухолей. Номер Ингибиторы Trk находятся (в 2015 г.) в клинических испытаниях и показали первые результаты в уменьшении опухолей человека.[9]

Как мишень для наркотиков

Энтректиниб (ранее RXDX-101) - исследуемый препарат, разработанный Ignyta, Inc., обладающий потенциальной противоопухолевой активностью. Это селективный рецептор pan-trk. ингибитор тирозинкиназы (TKI) нацелены на слияние генов в trkA, trkB (этот ген) и trkC (соответственно закодированы НТРК1, НТРК2 и НТРК3 гены), который в настоящее время проходит фазу 2 клинических испытаний.[10]

Лиганды

Агонисты

Антагонисты

Другие

Взаимодействия

TrkB был показан взаимодействовать с:

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148053 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055254 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d Маленка Р.К., Нестлер Э.Дж., Хайман С.Е. (2009). «Глава 8: Атипичные нейротрансмиттеры». В Sydor A, Brown RY (ред.). Молекулярная нейрофармакология: основа клинической неврологии (2-е изд.). Нью-Йорк: McGraw-Hill Medical. ISBN  9780071481274. Другой общей особенностью нейротрофинов является то, что они оказывают свое физиологическое действие посредством семейства рецепторов рецепторной киназы тропомиозина (Trk) (также известного как семейство рецепторов тирозиновых киназ). ... Рецепторы Trk Все нейротрофины связываются с классом высокогомологичных рецепторных тирозинкиназ, известных как рецепторы Trk, из которых известны три типа: TrkA, TrkB и TrkC. Эти трансмембранные рецепторы представляют собой гликопротеины с молекулярными массами от 140 до 145 кДа. Каждый тип рецептора Trk имеет тенденцию связывать определенные нейротрофины: TrkA является рецептором для NGF, TrkB является рецептором для BDNF и NT-4, а TrkC является рецептором для NT-3. Однако было отмечено некоторое совпадение специфичности этих рецепторов. .
  6. ^ Накагавара А., Лю XG, Икегаки Н., Уайт PS, Ямаширо Д. Д., Найкум Л. М., Бигель Д. А., Бродер GM (январь 1995 г.). «Клонирование и хромосомная локализация гена рецептора тирозинкиназы человека TRK-B (NTRK2)». Геномика. 25 (2): 538–46. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80055-Q. PMID  7789988.
  7. ^ «BDNF-индуцированная активация TrkB подавляет K + -Cl- котранспортер KCC2 и нарушает экструзию нейронов Cl-». ЧВК  2173387.
  8. ^ Пульчиани С., Сантос Э., Ловер А.В., Лонг Л.К., Ааронсон С.А., Барбакид М. (декабрь 1982 г.). «Онкогены в солидных опухолях человека». Природа. 300 (5892): 539–42. Bibcode:1982Натура. 300..539П. Дои:10.1038 / 300539a0. PMID  7144906. S2CID  30179526.
  9. ^ Добеле Р.С., Дэвис Л.Э., Вайшнави А., Ле А.Т., Эстрада-Бернал А., Кейсар С., Джимено А., Варелла-Гарсия М., Айснер Д.Л., Ли Й., Стивенс П.Дж., Морозини Д., Туч Б.Б., Фернандес М., Нанда Н., Лоу JA (октябрь 2015 г.). «Онкогенное слияние NTRK у пациента с саркомой мягких тканей с ответом на ингибитор тропомиозин-родственной киназы LOXO-101». Открытие рака. 5 (10): 1049–57. Дои:10.1158 / 2159-8290.CD-15-0443. ЧВК  4635026. PMID  26216294.
  10. ^ «Многообещающие данные клинических исследований энтректиниба». ScienceDaily. 18 апреля 2016 г.
  11. ^ Лю X, Чан CB, Jang SW, Pradoldej S, Huang J, He K, Phun LH, France S, Xiao G, Jia Y, Luo HR, Ye K (ноябрь 2010 г.). «Синтетическое производное 7,8-дигидроксифлавона способствует нейрогенезу и проявляет мощный антидепрессивный эффект». J. Med. Chem. 53 (23): 8274–86. Дои:10.1021 / jm101206p. ЧВК  3150605. PMID  21073191.
  12. ^ Чан С.В., Лю X, Чан CB, Вайншенкер Д., Холл РА, Сяо Г., Е К. (2009). «Амитриптилин является агонистом рецепторов TrkA и TrkB, который способствует гетеродимеризации TrkA / TrkB и обладает сильной нейротрофической активностью». Chem. Биол. 16 (6): 644–56. Дои:10.1016 / j.chembiol.2009.05.010. ЧВК  2844702. PMID  19549602.
  13. ^ Lazaridis I, Charalampopoulos I, Alexaki VI, Avlonitis N, Pediaditakis I, Efstathopoulos P, Calogeropoulou T, Castanas E, Gravanis A (2011). «Нейростероид дегидроэпиандростерон взаимодействует с рецепторами фактора роста нервов (NGF), предотвращая апоптоз нейронов». ПЛОС Биол. 9 (4): e1001051. Дои:10.1371 / journal.pbio.1001051. ЧВК  3082517. PMID  21541365.
  14. ^ Чан С.В., Лю X, Чан CB, France SA, Sayeed I, Tang W, Lin X, Xiao G, Andero R, Chang Q, Ressler KJ, Ye K (2010). «Дезоксигедунин, натуральный продукт с сильной нейротрофической активностью у мышей». PLOS ONE. 5 (7): e11528. Bibcode:2010PLoSO ... 511528J. Дои:10.1371 / journal.pone.0011528. ЧВК  2903477. PMID  20644624.
  15. ^ Лю Ц., Чан ЦБ, Е К. (2016). «7,8-дигидроксифлавон, низкомолекулярный агонист TrkB, полезен для лечения различных заболеваний человека, связанных с BDNF». Перевод Neurodegener. 5: 2. Дои:10.1186 / s40035-015-0048-7. ЧВК  4702337. PMID  26740873.
  16. ^ Чен Ч, Ван З, Чжан З, Лю Х, Кан СС, Чжан И, Е К. (январь 2018 г.). «Разработка пролекарства 7,8-дигидроксифлавона и терапевтическая эффективность для лечения болезни Альцгеймера». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 115 (3): 578–583. Дои:10.1073 / pnas.1718683115. ЧВК  5777001. PMID  29295929.
  17. ^ Прото Р.А., Кларк Б.Дж., Клиндж К.М. (2016). «Новые механизмы действия DHEA». J. Mol. Эндокринол. 56 (3): R139–55. Дои:10.1530 / JME-16-0013. PMID  26908835.
  18. ^ Педиадитакис I, Илиопулос I, Теологидис I, Деливаноглу Н., Маргиорис А.Н., Харалампопулос I, Граванис А. (2015). «Дегидроэпиандростерон: предковый лиганд нейротрофиновых рецепторов». Эндокринология. 156 (1): 16–23. Дои:10.1210 / en.2014-1596. PMID  25330101.
  19. ^ Ханиу М., Монтеструк С., Буреш Э. Дж., Тальвенхеймо Дж., Тосо Р., Льюис-Сэнди С., Велчер А. А., Роде М. Ф. (октябрь 1997 г.). «Взаимодействие между нейротрофическим фактором мозга и рецептором TRKB. Идентификация двух лигандсвязывающих доменов в растворимом TRKB путем разделения аффинности и химического перекрестного связывания». J. Biol. Chem. 272 (40): 25296–303. Дои:10.1074 / jbc.272.40.25296. PMID  9312147.
  20. ^ Нейлор Р.Л., Робертсон А.Г., Аллен С.Дж., Сешнс РБ, Кларк А.Р., Мейсон Г.Г., Бёрстон Дж.Дж., Тайлер С.Дж., Уилкок Г.К., Доубарн Д. (март 2002 г.). «Дискретный домен рецептора TrkB человека определяет сайты связывания для BDNF и NT-4». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (3): 501–7. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6468. PMID  11855816.
  21. ^ Ивасаки Ю., Гей Б., Вада К., Коидзуми С. (июль 1998 г.). «Ассоциация тирозинкиназы Fyn семейства Src с TrkB». J. Neurochem. 71 (1): 106–11. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1998.71010106.x. PMID  9648856. S2CID  9012343.
  22. ^ а б c Сузуки С., Мизутани М., Сузуки К., Ямада М., Кодзима М., Хатанака Н., Коидзуми С. (июнь 2002 г.). «Нейротрофический фактор головного мозга способствует взаимодействию адапторного белка Nck2 с рецептором тирозинкиназы TrkB». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 294 (5): 1087–92. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00606-X. PMID  12074588.
  23. ^ Мекин С.О., Макдональд Д.И., Грыз Е.А., Кубу С.Дж., Верди Дж.М. (апрель 1999 г.). «Адаптер передачи сигналов FRS-2 ​​конкурирует с Shc за связывание с рецептором фактора роста нервов TrkA. Модель для различения пролиферации и дифференцировки». J. Biol. Chem. 274 (14): 9861–70. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9861. PMID  10092678.
  24. ^ Гита Т., Вутен М.В. (февраль 2003 г.). «Ассоциация атипичного белка p62 / ZIP, взаимодействующего с протеинкиназой С, с рецептором фактора роста нервов TrkA регулирует перенос рецепторов и передачу сигналов Erk5». J. Biol. Chem. 278 (7): 4730–9. Дои:10.1074 / jbc.M208468200. PMID  12471037.
  25. ^ Накамура Т., Мураока С., Санокава Р., Мори Н. (март 1998 г.). «N-Shc и Sck, два нейронально экспрессируемых гомолога адаптера Shc. Их дифференциальная региональная экспрессия в головном мозге и роль в передаче сигналов нейротрофина и Src». J. Biol. Chem. 273 (12): 6960–7. Дои:10.1074 / jbc.273.12.6960. PMID  9507002.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка