Пенам - Penam

Пенам
Penam.svg
Имена
Название ИЮПАК
(5R) -4-тиа-1-азабицикло [3.2.0] гептан-7-он
Другие имена
1-Аза-7-оксо-4-тиабицикло [3.2.0] гептан
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ЧЭБИ
ChemSpider
Характеристики
C5ЧАС7NОS
Молярная масса129.18 г · моль−1
Родственные соединения
Родственные соединения
Clavam
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Ссылки на инфобоксы
Бензилпенициллин, пример пенама

Пенамы являются первичными каркасными структурами, которые определяют Пенициллин подкласс более широкого β-лактам семья антибиотики и родственные соединения. Они представляют собой бициклические кольцевые системы, содержащие β-лактамный фрагмент, слитый с пятичленным тиазолидин звенеть. [1] Из-за напряжения кольца и ограничений амидного резонанса структура нестабильна и очень восприимчива к каталитическому расщеплению по амидной связи.[2] Бензилпенициллин (Пенициллин G) является исходным натуральным продуктом, который содержит структуру пенама.


Структура и связь

Пенамы не имеют гибких структур из-за их состава из жестких маленьких колец. Четырехчленное кольцо и пятичленное кольцо не компланарны. Вместо этого структура заблокирована в сморщенной (т. Е. Изогнутой) форме из-за пирамидальной геометрии азота плацдарма. Пирамидализация (χ = 54 °) и скручивание связи C-N (τ = 18 °) вызваны деформацией из-за исключения неподеленной пары из планарности с циклическими кольцами и эффектами электростатического отталкивания. В результате искаженная связь C-N вызывает несовпадение орбиталей карбонильного углерода и неподеленной пары азота, что допускает резонансное перекрытие. Длина амидной связи C-N составляет 1,406 Å и имеет более выраженный характер одинарной связи, чем в нециклических третичных амидах. Длина связи C-O составляет 1,205 Å, что короче, чем связи C-O в нециклических третичных амидах.[3]

Характеристики

Стабильность

Общая термодинамическая стабильность Penam основана на суммировании напряжение кольца эффекты дестабилизации (RSE) и амид резонанс эффекты стабилизации (АР). Поскольку эффекты дестабилизации намного перевешивают эффекты стабилизации, пенамы термодинамически нестабильны и реагируют на нуклеофильные реакции, которые способствуют расщеплению β-лактамного кольца.[4]

Кольцевой эффект деформации

Пенамы в первую очередь дестабилизированы из-за больших углов и деформаций кручения, которые связаны с четырехчленным β-лактамным кольцом, внутренние валентные углы которого составляют 90º.[5] Основываясь на схожих энергиях деформации, наблюдаемых в пенамах и автономных β-лактамных кольцах, конденсированное пятичленное кольцо, вероятно, не вносит вклад в общий эффект деформации, в отличие от его шестичленного кольцевого аналога в цефамах, которые помогают снизить напряжение кольца.[4] В результате реакции раскрытия кольца, например гидролиз, термодинамически благоприятны для снятия напряжения их кольца.[5]

Амидный резонансный эффект

Пенамы стабилизируются за счет амидных резонансных эффектов. В отличие от традиционных третичных амидов, которые делокализируют неподеленную пару азота на кислород карбонильной группы и приводят к образованию двойной связи у связи CN, амидный резонанс в пенаме в основном возникает между азотом и карбонильным углеродом, что частично положительно из-за индуктивного эффекта карбонильной группы. кислород. Это результат перекрывающихся взаимодействий между неподеленной парой ВЗМО на азоте и НСМО углерода. Однако из-за пирамидализации азота и искаженной связи C-N степень стабилизации амидного резонанса снижается по сравнению с планарными амидами, такими как β-лактамный фрагмент, которые имеют выровненные орбитали для перекрытия.[6][3]

Реакции

Пенамы реактивны по отношению к каталитическому расщеплению посредством гидролиза из-за склонности карбонильного углерода к нуклеофильной атаке.[5] Это объясняется его частичным положительным (электрофильным) характером, который возникает из-за того, что электронная плотность слегка поглощается карбонильным атомом кислорода и, следовательно, отсутствием сопряжения между азотом и карбонильной группой. Хотя амидные связи обычно не реагируют на расщепление из-за своего характера частичной двойной связи, пирамидализация и искажение связи C-N делают амидную связь в пенамах характерной одинарной связью, которая более реактивна к расщеплению.[4][6][3] Кроме того, разрыв связи C-N является термодинамически благоприятным, поскольку раскрытие β-лактамного кольца снижает напряжение кольца. [5]

Катализированное расщепление

Раскрытие кольца пенамов может быть катализировано кислотой или основанием гидролиз. [4][6]В кислых условиях вода действует как нуклеофил, который атакует электрофильный углерод карбонильной группы. В основных условиях гидроксид действует как нуклеофил. В ферментах гидроксильная группа остатка серина действует как нуклеофил.[5] Независимо от того, какие нуклеофильные частицы атакуют электрофильный углерод карбонильной группы, нуклеофил связывается, образуя промежуточный третичный углерод. Электроны переносятся по связи C-N на атом азота, который действует как уходящая группа. В результате связь C-N разрывается, образуя карбоновую кислоту и вторичный амин.[5]

Рекомендации

  1. ^ Новак, Игорь; Чуа, Пей Хуан (01.09.2006). «Вычислительное исследование фармакофоров: β-лактамы». Журнал физической химии A. 110 (35): 10521–10524. Дои:10.1021 / jp063162b. ISSN  1089-5639. PMID  16942059.
  2. ^ Патрик, Грэм (2017-03-23), «5. Фармацевтика и медицинская химия», Органическая химия: очень краткое введение, Oxford University Press, стр. 71–89, Дои:10.1093 / actrade / 9780198759775.003.0005, ISBN  978-0-19-875977-5
  3. ^ а б c Гловер, Стивен А .; Россер, Адам А. (14.06.2012). «Надежное определение амидности ациклических амидов и лактамов». Журнал органической химии. 77 (13): 5492–5502. Дои:10.1021 / jo300347k. ISSN  0022-3263. PMID  22646836.
  4. ^ а б c d Новак, Игорь; Чуа, Пей Хуан (01.09.2006). «Вычислительное исследование фармакофоров: β-лактамы». Журнал физической химии A. 110 (35): 10521–10524. Дои:10.1021 / jp063162b. ISSN  1089-5639. PMID  16942059.
  5. ^ а б c d е ж Патрик, Грэм (2017-03-23), «5. Фармацевтика и медицинская химия», Органическая химия: очень краткое введение, Oxford University Press, стр. 71–89, Дои:10.1093 / actrade / 9780198759775.003.0005, ISBN  978-0-19-875977-5
  6. ^ а б c Ху, Фэн; Лаланцет, Роджер; Шостак, Михал (2016-03-08). «Структурная характеристика N-алкилированных скрученных амидов: последствия для резонанса амидной связи и N-C-расщепления». Angewandte Chemie International Edition. 55 (16): 5062–5066. Дои:10.1002 / anie.201600919. ISSN  1433-7851. PMID  26953809.